DNA kondenzace
V virusesEdit
viry a bakteriofágy, DNA nebo RNA je obklopen kapsidový protein, někdy dále obaleny lipidovou membránou. Double-stranded DNA je uložen uvnitř kapsidový v podobě cívky, která může mít různé typy vinutí vede na různé typy tekutého krystalického balení. Toto balení se může změnit z hexagonálního na cholesterický na izotropní v různých fázích fungování fágu. Přestože jsou dvojité šroubovice vždy lokálně zarovnány, DNA uvnitř virů nepředstavuje skutečné tekuté krystaly, protože postrádá tekutost. Na druhé straně DNA kondenzovaná in vitro, např. pomocí polyaminů přítomných také ve virech, je lokálně uspořádaná i tekutá.
v bakteriieditovat
Bakteriální DNA je balena s pomocí polyaminy a proteiny zvané nukleoid-asociovaných proteinů. Protein-associated DNA zabírá asi 1/4 intracelulární objem tvoří koncentrovaný viskózní fáze kapalné krystalické vlastnosti, tzv. nukleoid. Podobné balení DNA existuje také v chloroplastech a mitochondriích. Bakteriální DNA je někdy označována jako bakteriální chromozom. Bakteriální nukleoid evoluční představuje střední technické řešení mezi protein-free DNA v balení virů a bílkovin-určuje balení v eukaryot.
sesterské chromozomy v bakterii Escherichia coli jsou indukovány stresovými podmínkami, aby kondenzovaly a podstoupily párování. Ke kondenzaci vyvolané stresem dochází náhodnou konvergencí sesterských chromozomů podobnou zipu. Toto sbližování se zdá, že závisí na schopnosti totožné dvouvláknové DNA molekuly specificky identifikovat se navzájem, proces, který vrcholí v blízkosti homologních míst podél párových chromozomů. Různorodé stresové podmínky se zdají prime bakterie, aby se účinně vyrovnat s těžkou DNA škody, jako je double-strand breaks. Apozici homologních místech spojených se stresem-indukované chromozomu, kondenzace pomáhá vysvětlit, jak opravu dvojitých zlomů a jiných škod.
v eukaryotyeditovat
Eukaryotické DNA s typickou délku desítky centimetrů by mělo být řádné zabalené, aby byly snadno přístupné uvnitř mikrometr-velikost jádra. Ve většině eukaryot je DNA uspořádána v buněčném jádru pomocí histonů. V tomto případě, základní úroveň DNA zhutnění je nucleosome, kde dvojité šroubovice je omotané kolem histonů octamer obsahující dvě kopie každého z histonů H2A, H2B, H3 a H4. Linker Histon H1 váže DNA mezi nukleosomy a usnadňuje balení 10 nm “kuliček na řetězci” nukleosomálního řetězce do kondenzovanějšího vlákna 30 nm. Většinu času, mezi mobilní divize, chromatin je optimalizován tak, aby umožňují snadný přístup transkripčních faktorů k aktivní geny, které jsou charakterizovány méně kompaktní konstrukce tzv. euchromatin, a zmírnit bílkovin přístup ve více zhutnění regionů tzv. heterochromatin. Během buněčného dělení, chromatin zhutnění zvyšuje ještě více k formě chromozomů, které se dokáže vyrovnat s velkými mechanické síly přetažením do každé ze dvou dceřiných buněk. Mnoho aspektů transkripce je řízeno chemickou modifikací na histonových proteinech, známých jako histonový kód.
chromozomové lešení má důležitou roli při udržování chromatinu v kompaktním chromozomu. Chromozom lešení je vyroben z bílkoviny, včetně condensin, topoizomerázy IIa a kinesin člena rodiny 4 (KIF4)
Dinoflagellates jsou velmi odlišné eukaryot z hlediska, jak se balíček jejich DNA. Jejich chromozomy jsou baleny v kapalném krystalickém stavu. Ztratili mnoho zachovaných histonů geny, s použitím převážně dinoflagellate virové nukleoproteiny (DVNPs) nebo bakterie-odvozené dinoflagellate histon-like proteiny (Hips) pro balení místo. Není známo, jak řídí přístup k genům; ty si ponechávají Histon, mají speciální histonový kód.
V archaeaEdit
v Závislosti na organismu, archaeon může použít bakterie jako HU systém nebo eukaryote-like nucleosome systém pro balení.
