Identifikace, prevalence a patogenity Colletotrichum druhů způsobuje anthracnose Capsicum annuum v Asii

Morfologická pozorování a fylogenetická data rovnou druhů conidia jasně identifikovány tři nové druhy, dva z Indonésie a jeden z Tchaj-wanu. Podrobné morfologické popisy jsou uvedeny níže pro všechny druhy Colletotrichum související s chilli anthracnose (Tabulka 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Novum. MycoBank MB826936.

obrázek 6 etymologie: pojmenovaný po Jávě, ostrově v Indonésii, kde byl druh sbírán.

Diagnóza: Colletotrichum javanense se liší od C. brisbanense při formování odlišných chlamydospores a acervular conidiomata na všechna média testovány. Naproti tomu C. brisbanense produkovala pouze Conidiomata na kmeni Anthriscus, ale nebyly pozorovány žádné bazální buňky. Kromě toho, C. javanense roste rychleji než C. brisbanense (C. javanense na OA, MEA a SNA 60, 55 a 66 mm průměr v 7. d, v tomto pořadí, C. brisbanense na OA a SNA 18.5, 20 mm průměr v 7. d, v tomto pořadí). Colletotrichum javanense je fylogeneticky odlišné od C. brisbanense se oba druhy liší v sekvencích chs-1 a nejúčinněji s gapdh (rozdíl 7 bp) a his3(rozdíl 4 bp).

Typ: Indonésie: Západní Jáva, Purwakata regency, na ovoci Capsicum annuum, Prosinec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotyp; CBS 144963 = UOM 1115 = ewindo 3 – ex-type cultures).

popis: sexuální morph nebyl pozorován. Asexuální morf na PDA. Vegetativní mycelium 1-5 µm diam, hyalinní, hladké stěny, septát, rozvětvené hyfy. Chlamydospory kulovité nebo protáhlé, světle hnědé, hladké stěny, 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervular, setae nebyl pozorován. Konidiofory hyalinní, septát, rozvětvený. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové nebo ampulliformní, 7-17, 5 µm, vrchol 1-3 µm diam. Konidie hyalinní, aseptát, hladké stěny, většinou fusiformní, jeden konec zaoblený, druhý konec akutní nebo oba konce akutní (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Konidie v masově žluté až oranžové barvě. Appressoria jedné nebo ve volných skupinách, středně hnědá, s hladkým povrchem, subglobose nebo eliptické, celokrajné nebo vlnit rozpětí, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

asexuální morph na SNA. Vegetativní mycelium 1-7 µm diam, hyalinní, hladké stěny, septát, rozvětvené hyfy. Chlamydospory kulovité nebo protáhlé, světle hnědé, hladké stěny, 4,5-28 × 4-8 µm. Conidiomata acervular, setae nebyl pozorován. Konidiofory hyalinní, septát, rozvětvený, 20-35 µm dlouhý. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové nebo ampulliformní, 5-20 µm, vrchol, 1-3 µm diam. Konidie hyalinní, aseptátová, hladkostěnná, válcová s oběma konci ostrými nebo jedním koncem kulatými a jedním koncem akutními, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Konidie ve hmotě žluté až oranžové barvy.

Kultura charakteristika: Kolonie na PDA 48-54 mm průměr v 7 d (6.5–7.5 mm/d), byt s celou rozpětí; povrch pokrytý šedé až olivově zelené krátké vzdušné mycelium, rozpětí bílé až světle šedé, reverzní většinou bělavý krém, olivaceous šedé až černé v centru. Žlutá až oranžová acervular conidiomata. Kolonie na SNA byly 60-66 mm průměr v 7 d (8-9.5 mm/d), byt s celou rozpětí, hyalinní až světle hnědé, povrch pokrytý krátké šedé vzdušné mycelium, reverzní stejné barvy. Oranžová acervular conidiomata ve středu kultury. Kolonie na OA byly 55-60 mm průměr v 7 d (7.8–8.5 mm/d), byt s celou rozpětí; povrch pokrytý s krémem na šedé krátké vzdušné mycelium, okraj bílý, reverzní většinou světle oranžové, hnědé pigmenty. Oranžová acervulární konidiomata. Kolonie na povrchu MEA světle šedé krátké vzdušné mycelium, obráceně světle oranžové.

Poznámky: nejbližší zápas v blastn vyhledávání s gapdh byla sekvence GenBank JQ948617, C. sloanei kmen IMI 364297 s 98% identitu (4 bp rozdíly), zatímco nejbližší zápasy s his3 sekvence s 99% identitu (2 bp rozdíly) byly GenBank JQ949279 C. indonesiense kmen CBS 127551 a GenBank KJ947248 C. guajavae izolují OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Novum. MycoBank MB827691.

Obrázek 7 Etymologie: jméno po Makassar, město v Jižní Sulawesi, Indonésie, kde byl druh shromážděny.

diagnóza: Colletotrichum makassarense je fylogeneticky blízce příbuzný s C. tropicale. Sekvenční data z JEHO nelze oddělit dva druhy, ale mohou být rozlišeny všechny ostatní geny testovány a nejefektivněji pomocí ApMat (22 bp rozdíly) a gs (18 bp rozdíly) posloupnost údajů.

Typ: Indonésie: Makassar, z ovoce léze Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & a. Nasruddin (CBS H-143664-holotyp; CBS 143664 = CPC 28612-ex-type cultures).

popis: Sexuální morph nebyl pozorován. Asexuální morf na OA. Vegetativní mycelium se skládá z hyalinní, hladké-zděné, septate, rozvětvené hyfy, 2-3 µm průměr. Chlamydospory nebyly pozorovány. Setae přítomné, středně hnědé, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-septát, zužující se na akutní vrcholky. Conidiomata acervular, průměr 100-200 µm, s oranžovými konidiálními hmotami. Konidiofory subcylindrické, pružné, 1-4-septátové, hyalinní, hladké, rozvětvené, 15-45 × 3-4 µm. Konidiogenní buňky subcylindrické, hyalinní, hladké, phialidické s periklinálním zahušťováním, 7-25 × 3-4 µm. Konidie hyalinní, hladké, aseptate, subcylindrical, rovné, vrchol čepele tupý, zužující se na základně na vyčnívající zkrátit hilu, 1 µm průměr, výrazně guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria osamělý, středně hnědá, s hladkým povrchem, subglobose, elipsoidní až vejčité, celé rozpětí, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

Kultura charakteristika: Kolonie na PDA 45 mm průměr po 7 d (6,5 mm/d), kolonie ploché, s mírným vzdušné mycelium, na OA povrch kouře-šedá. Na povrchu PDA kouřově šedá, obráceně olivově šedá. Na povrchu mea špinavě bílá, obráceně okrová.

Poznámky: nejbližší zápas v blastn vyhledávání s ApMat byla sekvence GenBank KU923732, C. queenslandicum kmen AUS22 s 98% identitu (16 bp rozdíly), zatímco nejbližší zápas s gs sekvence s 99% identitu (7 bp rozdíly) byla GenBank KJ947286 C. siamense izolovat OBP24. Nejlepší zápasy s gapdh sekvence GenBank byly KX578784 C. siamense (99% identitu, 3 bp rozdíly) a GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identita, 3 bp rozdíly).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Novum. MycoBank MB827692.

Obrázek 8 etymologie: pojmenováno po Tainanu, městě na Tchaj-wanu, kde byl druh sbírán.

Diagnóza: Colletotrichum tainanense se liší od svých nejbližších fylogenetický soused C. salsolae v kultuře vlastnosti na PDA, řídké, vzdušné mycelium a světle myš-šedá povrch mycelia, C. vzhledem k tomu, že salsolae vytváří vrstvu acervuli-jako struktury, s hlubokou oranžová hnědá nepohlavní stádia masy a mnoho štětin. Oba druhy jsou oddělitelné pomocí všech testovaných genů s výjimkou its a nejúčinněji se sekvencemi gapdh (rozdíl 7 bp), tub2 (rozdíl 6 bp) a act (rozdíl 5 bp). Existuje pouze jeden rozdíl bp v sekvenci chs-1 mezi těmito dvěma druhy.

Typ: Tchaj-wan: Tainan: on fruit of Capsicum annuum, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666-holotyp; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Sb 1298-ex-type cultures).

popis: sexuální morph nebyl pozorován. Asexuální morf na PDA. Vegetativní mycelium rozvětvené, hyalinní, hladké stěny, septát, hyfy 2-3 µm diam, melanizované s časem. Jeden konidiom nalezený na desce PDA, sterilní na SNA, MEA a OA. Chlamydospory a setae nebyly pozorovány. Konidiofory subcylindrické, ohebné, 1-2-septátové, hyalinní, hladké až světle hnědé, rozvětvené. Konidiogenní buňky subcylindrické, hyalinní, hladké, phialidické s periklinálním zahušťováním. Konidie hyalinní, hladké, aseptate, subcylindrical na subclavate, rovné nebo mírně zakřivené, vrchol čepele tupý, zužující se na základně na vyčnívající zkrátit hilu, 1.5–2 µm, průměr, výrazně guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria jedné nebo ve volných skupinách, často úzké-cylindrických, středně hnědé až tmavě hnědé, často zužující se směrem k vrcholu, okraj celý nebo vlnit někdy nepravidelně laločnaté (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

Kultura charakteristika: Kolonie na PDA 45 mm průměr po 7 d (6,5 mm/d), kolonie ploché, s mírným vzdušné mycelium. Na povrchu OA bledá myš-šedá. Na povrchu PDA bledá myš-šedá, obrácená myš-šedá. Na povrchu je světle šedá, obráceně olivově šedá.

poznámky: nejbližší shoda ve vyhledávání blastn se sekvencí gapdh s 99% identitou (rozdíl 2 bp) byla GenBank Kc790761 Colletotrichum sp. kmen MTCC 9664 zatímco nejbližší shoda se sekvencí act s 99% identitou (rozdíl 2 bp) byla GenBank KY995522 C. siamense kmen LJDY1–2. Nejbližší shoda se sekvencí tub2 s 99% identitou (rozdíl 7 bp) byla GenBank MF143931 C.siamense kmen 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fungu. Rozmanitost 61: 112 (2013); jako “endophytica”.

Popis: Kolonie na PDA 42 mm průměr po 7 d (5,5 mm/d), světle oranžové až bílé vzdušné mycelium; reverzní světle bílé až oranžové a černé ve středu a četné oranžové conidiomata roztroušeny po povrchu. Chlamydospory nebyly pozorovány. Konidiomata přítomné, konidiofory vytvořené přímo na hyfách. Setae přítomné, středně hnědé, 47-95 × 3-6 µm, 3-4-septát, zužující se akutní vrcholky. Konidiofory hyalinní, hladké stěny a nerozvětvené. Konidiogenní buňky hyalinní, hladkostěnné, aseptátové, subcylindrické, 12-21 × 3-4 µm. Konidie hyalinní, hladkostěnné, aseptátové, rovné, válcové se dvěma konci tupé, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria jednoduchá nebo ve volných skupinách, hnědá, mírně laločnatá, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

Poznámky: Colletotrichum endophyticum byl poprvé popsán jako tráva endophyte z Pennisetum purpureum ze severního Thajska (Manamgoda et al. 2013). Později byla hlášena z několika dalších hostitelských druhů, včetně papriky v Číně (Diao et al. 2017). Délka konidie izolátu z Thajska (UOM 1137) byla o něco kratší než délka ex-typu (LC0324) C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

Materiál zkoumal: Thajsko: Kanchanaburi: z ovoce léze Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultura MJ 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al., Fungu. Rozmanitost 39: 158 (2009).

popis: Kolonie na PDA 65 mm průměr po 7 d (8.5–11 mm/d), ploché s rovnými okraji, vzdušné mycelium husté, bavlněný, světle šedé až bílé vzdušné mycelium a četné černé stroma rozptýleny po povrchu, šedá v centru, bílá v rozpětí; reverzní šedavě zelené. Chlamydospory nebyly pozorovány. Conidiomata acervular, Setae byl pozorován, hnědý, hladkostěnný, 1-2-septát, 60 µm dlouhý, zužující se akutní vrcholky. Konidiofory hyalinní, septát, rozvětvený. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové nebo ampulliformní, 7-17, 5 µm. Konidie hyalinní, aseptátová, hladkostěnná, válcovitá, oba konce tupé, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria nebyla pozorována.

poznámky: sexuální morf těchto izolátů nebyl v kultuře pozorován. Nepohlavní stádia délka izolovat KSČ 28644 byl o něco delší, než je ex-typ ICMP (18581 = BPD-I16) C. fructicola (konidie 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

zkoumaný materiál: Thajsko: Chiang Mai: z ovocné léze Capsicum annuum, 7.Června. 2015, P. W. J. Taylor & o. Mongkolporn (kultury CPC 28644 a CPC 28645). Tchaj-wan: Cyonglin, Hsinchu, z ovoce léze zralého červeného ovoce Capsicum sp. (sladká paprika), 22. Dubna. 2015, Z. M. Sheu (kultura UOM 1139 = Sb 1318); Nantou, Renai, z ovocné léze zeleného ovoce Capsicum sp. (sladká paprika), 4. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (kultura UOM 1138 = Sb-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); jako “karstii”.

popis: kolonie na PDA 65 mm diamu po 7 d (6.5-10.5 mm/d), ploché s rovnými okraji, oranžové až bílé vzdušné mycelium a četné oranžové nepohlavní stádia masy rozptýleny po povrchu, bílá v rozpětí; reverzní žluté až oranžové. Chlamydospory nebyly pozorovány. Byly pozorovány konidiomata acervulární, setae, hnědé, hladké stěny, 2-4-septát, 60 µm dlouhé, základna ponořená, zúžená směrem k vrcholu, špička většinou akutní. Konidiofory hyalinní, septát, rozvětvený, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové nebo ampulliformní, 7-15, 5 µm. Konidie hyalinní, aseptate, s hladkým povrchem, krátký, válcovitý, na obou koncích tupé nebo jeden konec mírně akutní nebo zkrátit na základně, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria jednoduchá nebo ve volných skupinách, hnědá, subglobóza, kruhový obrys, 6-12, 5 × 3,5-8 µm.

Poznámky: čtyři izoláty identifikovány z Indonésie v boninense komplex vyrábí odlišné krátké konidie ve srovnání s ex-epitype kultury C karsti (14.5–17 × 5-6.5 µm; Yang et al. 2011). Vysoká variabilita velikosti konidií mezi různými kmeny C. karsti byly hlášeny Damm et al. (2012a, 2012b), kde conidia měření CBS 129833 byly (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, průměr ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm; a CBS 111998 měl conidium délce až 18,5 µm, L/W ratio = 2.8. Tyto izoláty netvořily sexuální morf v kultuře. I když tyto čtyři izoláty tvořily plně podporovány (100% BS/1 PP) subclade v C. karsti, všechny jednotlivé genové stromy (údaje nejsou uvedeny) neměly poskytovat významnou podporu pro ospravedlnění zavedení kryptických druhů u těchto izolátů.

zkoumaný materiál: Indonésie: Jeneponto, z ovocných lézí Capsicum annuum, 7.Června. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur KSČ 28553, CPC 28554); z ovoce léze zralého červeného ovoce a stopky lézí Capsicum sp. Červen. 2015, P. W. J. Taylor & a. Nasruddin (cultures CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Stud. Mycol. 92: 31 (2019).

popis: kolonie na PDA 63 mm diam po 7 d (8 mm/d), šedé až tmavě hnědé vzdušné mycelium; reverzní šedé až světle hnědé s žluté-oranžové v centru s bohatou acervular conidiomata, že sliz bledě oranžové nepohlavní stádia masy v centru, Chlamydospores není pozorován. Conidiomata přítomný (v blízkosti inokulačního bodu), konidiofory vytvořené přímo na hyfách. Sklerotie přítomná. Setae přítomné, středně hnědé, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-septát, zužující se směrem k akutním vrcholům, často se zúžením na vrcholu. Konidiofory hyalinní až světle hnědé, hladkostěnné, přepážkové a rozvětvené. Konidiogenní buňky hyalinní, hladkostěnné, aseptátové, subcylindrické, rovné až jemně zakřivené, 26-48 × 3-4 µm, phialidické, periklinální zahušťování nápadné. Konidie hyalinní, hladkostěnné, aseptátové, rovné, válcové se dvěma konci tupé nebo jeden konec mírně akutní, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria jedné nebo ve volných skupinách, středně hnědá, nepravidelný tvar, vroubkované nebo laločnaté osnovy, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Sexuální morph na PDA. Ascomata perithecia, vytvořená po 2 wk., solitární, poloponořené nebo ponořené do agarového média, nestromatické, subsférické až vejčité, ostiolate, Lysé, středně hnědé, 96-130 × 160-200 µm. Peridium o tloušťce 10-12,5 µm, složené z bledě až středně hnědých zploštělých hranatých buněk 3,5-10 µm diamu. Ascogenní hyfy hyalinní, hladké stěny, jemné, zřídka viditelné. Interascal tkáň nebyla pozorována. Asci unitunicate, 8-spored, válcový, zužující se na vrchol a základnu, hladké stěny, 51-65 × 9,5-13 µm, základna zkrácená. Ascospores biseriately uspořádány, aseptate, hyalinní, hladké-zděné, vřetenovité, mírně zakřivené, báze zaoblená, apex akutní nebo zaoblené, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

Poznámky: nepohlavní stádia délka zkoumaných izolátů (CPC 28638, CPC 28639) byl variabilní a spadl v rozsahu ex-typ izolovat (CBS 125474) C. plurivorum (15-17 × 5.5 µm; Damm et al. 2019).

zkoumaný materiál: Thajsko: Chiang Rai, z listových lézí Capsicum annuum, 7. Června. 2015, P. W. J. Taylor (cultures CPC 28638 a CPC 28639); Bangkok, restaurace v oblasti Phaya Thai, infikovaná tkáň Capsicum sp. Červen. 2015, P. W. J. Taylor (kultura UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Stud. Mycol. 73: 100 (2012).

Popis: Kolonie na PDA 20-38 mm průměr po 7 d (5-6.2 mm/d), byt s celou rozpětí; povrch pokrytý krátké světle růžové až oranžové vzdušné mycelium, obrátit šedá s časem, okraj bělavý až světle růžové, reverzní růžové buff, olivaceous šedá až hnědá-šedá v centru; reverzní oranžová-lososová, tmavě v centru. Chlamydospory nebyly pozorovány. Conidiomata acervular, setae nebyl pozorován, Conidiophores hyaline, septate, rozvětvený. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové nebo ampulliformní, 7-17, 5 µm, vrchol 1-3 µm diam. Konidie hyalinní, aseptate, s hladkým povrchem, mostely vřetenovité, jeden konec zaoblený, jeden konec akutní, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Konidie ve hmotě s lososovou až oranžovou barvou. Appressoria jedné nebo ve volných skupinách, středně hnědé, vejčité, celokrajné až vroubkovaně rozpětí, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

poznámky: většina izolátů identifikovaných jako C. scovillei měl podobný spor tvar a spore velikosti, ve srovnání s typem vzorku (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, popsal Damm et al. (2012a, 2012b). Některé izoláty však měly různou barvu kolonie, různé rychlosti růstu kolonií a malé rozdíly v měření spór.

zkoumaný materiál: Indonésie: Gowa, z ovocných lézí Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & a. Nasruddin (cultures CPC 28577 and CPC 28579); Západní Jáva: from fruit léze of Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thajsko: Chiang Mai: z ovocných lézí Capsicum sp. 2008, o. Mongkolporn (kultury UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al., Fungu. Rozmanitost 39: 98 (2009)

Popis: Kolonie na PDA 79 mm průměr v 7 d (5.5–6 mm/d). Světle žluto-bílá, šedá, husté bavlněné vzdušné mycelium s oranžovou acervulární conidiomata uprostřed; reverzní světle nažloutlý. Chlamydospory nebyly pozorovány. Conidiomata acervular, konidiofory vytvořené na polštáři kulatých a středně hnědých buněk. Setae nebyly pozorovány. Konidiofory hyalinní, rozvětvené. Konidiogenní buňky hyalinní, válcové až ampulliformní, 6,5-16 µm. Konidie hyalinní, aseptátová, hladkostěnná, fusiformní až válcová, oba konce tupě zaoblené, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria tmavě hnědá, solitérní, kruhová, celokrajná až křenovitá, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

poznámky: izoláty Colletotrichum siamense z různých zemí vykazovaly variace morfologických znaků, rychlosti růstu a morfologie kultury na PDA. Reprezentativní konidiální měření pro izoláty představující různé subclades ve fylogenetických stromech (obr. 2, 3) jsou: CPC 30233 (Gowa, Indonésie), 12.5–17 × 2.5–5.5 µm; MJ 1132 (Ratchaburi, Thajsko) 9.5–14.5 x 3,5–5 µm; MJ 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thajsko) 12-15 × 5-7 µm; MJ 1116 (Kandy, Srí Lanka) 10.5–16.5 × 3.5–5.5. Tyto morfologické znaky v podtřídě byly v každé zemi vysoce konzistentní. Druh byl popsán Prihastuti et al. (2009); konidie ex-holotypového vzorku (ICMP 18578/ BDP-I2) byly hlášeny jako 7-18.3 × 3-4,3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), což zahrnuje rozsah pozorovaný v našich izolátech. Tento druh byl údajně biologicky a geograficky různorodý a Nachází se na mnoha hostitelích v několika tropických a subtropických oblastech (Weir et al. 2012).

zkoumaný materiál: Indonésie: Gowa, z ovocné léze Capsicum annuum, 7.Června. 2015, P. W. J. Taylor & a. Nasruddin (kultura CPC 30233); Jeneponto, z ovoce léze Capsicum sp. 7.Června. 2015, P. W. J. Taylor & a. Nasruddin (kultura CPC 30209). Thajsko: Ratchaburi, z ovoce léze Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & o. Mongkolporn (kultura UOM 1132); Kanchanaburi, z ovoce léze Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & o. Mongkolporn (kultura UOM 1126 = F4-1C). Srí Lanka: Kandy, z ovoce léze Capsicum sp. Září. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (kultura UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

Popis: Kolonie na PDA 45 mm průměr v 7 d (6,5 mm/d). Kolonie ploché, šířící se, s mírným vzdušným myceliem, na povrchu OA kouřově šedé. Na povrchu PDA olivaceous grey až smoke grey, reverzní olivaceous grey, četné oranžové conidiomata rozptýlené po povrchu. Na povrchu mea špinavě bílá, obráceně okrová. Asexuální morf na OA. Vegetativní mycelium sestávající z hyalinního až světle hnědého, hladkostěnného, septa, rozvětveného, 2-2, 5 µm diamantu. Chlamydospory nebyly pozorovány. Setae vzácné (pouze dva vidět), rovný, středně hnědý, jemně verrukulosa, 2-3-septát, až 120 µm dlouhý, vrchol subobtusně zaoblený. Conidiomata acervular, 150-250 µm diam, s oranžovou konidiální hmotou. Konidiofory subcylindrické, pružné, 1-3-septátové, hyalinní, hladké, rozvětvené, 15-25 × 3,5-4,5 µm. Konidiogenní buňky subcylindrické, hyalinní, hladké, phialidické s periklinálním zahušťováním, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Konidie hyalinní, hladké, aseptate, subcylindrical, rovné, vrchol čepele tupý, zužující se na základně na vyčnívající zkrátit hilu, 1.5–2 µm, průměr, výrazně guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria nebyla pozorována. Sexuální morph nebyl pozorován.

zkoumaný materiál: Indonésie, Makassar, z ovocné léze Capsicum annuum, 7.Června. 2015, P. W.J. Taylor & a. Nasruddin (kultura CPC 28607).

Prevalence ve vzorku Colletotrichum druhů

Celkově, C. truncatum byl nejrozšířenější druhy (44%) izolovaných z infikovaných chilli ovoce (Obr. 9) a byl snadno identifikován svými spóry falcate a hojnými setae v nekrotických lézích. Z druhů s přímými konidiemi byl C. scovillei (acutatum complex) nejběžnějším druhem ve sledovaných zemích (35%), s výjimkou Srí Lanky, kde tento druh nebyl izolován. Colletotrichum siamense (komplex gloeosporioides) byl dalším nejčastějším druhem, který se vyskytoval v Thajsku, Srí Lance a Indonésii (11%). Zbývající druhy byly zastoupeny méně než 10% z celkového počtu izolátů.

V Indonésii, C. scovillei byl izolován z infikovaného chilli ovoce ve všech sledovaných regenciích Jižní Sulawesi, s výjimkou Makassaru, a v místě polního pokusu v západní Jávě. Colletotrichum siamense bylo také izolováno z celého regionu, od Gowa, Jeneponto a Makassar. Dva nové druhy, C. makassarense A C. javanense byly izolovány z Makassaru a západní Jávy.

V Thajsku, C. scovillei byl izolován především ze severní provincie Chiang Mai a Chiang Rai, ale byl také získán z infikovaných chilli ovoce ve zkušební stránky z Kasetsart University v Nakhon Pathom. Západní provincie měly vysoký výskyt C. siamense a jeden izolát C. endophyticum byl odebrán z Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum byl izolován z listů chilli s nekrotickými lézemi v Chiang Rai a od nekrotických lézí chilli ovoce nalezených v restauraci v oblasti Phaya Thai v Bangkoku. Kromě toho byla c. fructicola identifikována z ovoce shromážděného z Chiang Mai.

na Tchaj-wanu byl identifikován izolát jako nový druh, C. tainanense, odebraný z infikovaného chilli ovoce v provincii Tainan, A C. fructicola byla identifikována z ovoce v Hsinchu a Nantou na Tchaj-wanu. Colletotrichum plurivorum byl také identifikován z ovoce shromážděného v Johoru, Malajsie.

Patogenity

Všechny druhy Colletotrichum způsobené příznaky anthracnose na zraněné ovoce, ale tam byly významné rozdíly v závažnosti příznaků. Na zraněné ovoce, izoláty C. scovillei a C. javanense ukázal nejvyšší závažnosti onemocnění, produkující velké, nekrotické léze s tím léze velikosti 15.6–20.3 mm (Tabulka 5). Na non-zraněný ovoce, všechny druhy byly méně patogenní, s tím léze velikosti méně než 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale a C. plurivorum, vyrábí pouze velmi malé léze nebo žádné viditelné příznaky (průměr léze, velikost léze < 1 mm) 10 d po očkování non-zraněný ovoce. Colletotrichum javanense a C. scovillei izoláty byly nejvíce patogenní v non-zraněný ovoce a vyrábí lézí s velikostí 9.4 a 9,1 mm, resp. Léze způsobené C. scovillei byly významně větší než léze způsobené všemi ostatními druhy kromě C. javanense ve zraněném ovoci a C. endophyticum v nezraněném ovoci. Význam párových t-testů je silně závislá na počtu izolátů z každého druhu vzorku, tak skupin je uvedeno v Tabulce 5 jednoduše nemění s velikostí rozdílu z prostředků; velký rozdíl nemusí být významné, pokud tam jsou malé velikosti vzorků pro oba druhy, zatímco menší rozdíl může být významný. Zejména srovnání zahrnující C. javanense A C. endophyticum jsou velmi nepřesná, protože byl testován pouze jeden izolát každého druhu.