Klinické Výkon Roche Cobas 4800 HPV Test | Jiotower

TEXT

Lidský papilomavirus (HPV) je jedním z nejčastějších sexuálně přenosných virů po celém světě a jedna z hlavních příčin rakoviny, způsobuje téměř 60 000 nových případů rakoviny ročně v Evropě (1) a vede k rozvoji rakoviny děložního čípku u žen. HPV16 a HPV18 jsou nejvíce karcinogenní (2, 3), protože přibližně 70% všech karcinomů děložního čípku je přítomno s infekcemi HPV16 nebo HPV18 (4). Téměř 30% případů rakoviny děložního čípku jsou vynechal počáteční cervikální cytologie screening (5), tak přesné a objektivní testy na HPV spojené s rakovinou děložního čípku, které používají více citlivé molekulární techniky jsou nezbytné k zajištění účinné prevence a léčby snížit budoucí rizika a výskyt rakoviny děložního hrdla.

test Roche Cobas 4800 HPV (Cobas) je nová molekulární metoda založená na PCR v reálném čase (RT-PCR) (6, 7) s plně automatizovaným systémem umožňujícím rychlé a efektivní zpracování vzorků. Cobas může odhalit HPV16, HPV18, 12 dalších vysoce rizikových Hpv (hrHPVs) (HPV31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, a -68, jako sdružených výsledek), a β-globin ovládat nezávisle na sobě ve stejném PCR. Primárním účelem naší studie bylo vyhodnotit technické a klinické výkonnostní charakteristiky Cobas. Cervikální vzorky z 6,056 ženy uvedené na Oddělení Patologie v Icahn School of Medicine na Hoře Sinaj pro rutinní vyšetření cervikální léze mezi listopadem 2011 a únorem 2012 byly shromážděny v lbc média (roztoku PreservCyt; Hologic, Marlborough, MA) a uchovávány při teplotě 4°C až do použití.

sto osmdesát vzorky byly testovány pro hrHPV genotypů obou Roche Cobas 4800 HPV test a Digene Hybrid Capture 2 (HC2) hrHPV DNA test (Tabulka 1), se všemi rozpory řeší pomocí Lineární Pole (LA) HPV genotypizace test (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) (8). Podle Pearsonova chí-kvadrátového testu byl významný rozdíl v počtu pozitivních a negativních vzorků identifikovaných dvěma HPV testy (P < 0,001). Nicméně, shoda mezi oběma testy byl statisticky silný, s dohodou úroveň 88.33% (P = 0.0218) a cohenův kappa koeficient 0.767 (95% interval spolehlivosti , 0.674 na 0.860; P < 0.001), kde 95% intervaly spolehlivosti kappa hodnoty byly odvozeny z binomického rozdělení.

V nesouhlasných vzorků, LA HPV test detekuje low-risk HPV (lrHPV) genotypů v 50% (2/4) vzorky, které byly HC2 pozitivní a Cobas negativní a ve 13,33% (2/15) vzorků, které byly HC2 negativní a Cobas pozitivní. HPV53 byl nalezen ve dvou vzorků, které byly HC2 pozitivní a Cobas negativní, což naznačuje, že sondy v Digene kit cross-reagoval s tím HPV genotypu. Toto pozorování není překvapivé, protože zkřížená reaktivita testu HC2 s genotypy LRHPV, konkrétně HPV53, byla pozorována dříve (9). Důsledkem zkřížené reaktivity genotypu lrHPV v HPV testu je zvýšený počet falešně pozitivních výsledků. To by mohlo vést k overinvestigation a overtreatment přes následné testování žen, které mají jen lrHPV genotypy a jsou vlastně na nízké riziko vzniku rakoviny děložního čípku. Ve dvou HC2-negativní/Cobas-pozitivní vzorky, HPV62 a HPV89 (CP6108) byly zjištěny v obou vzorcích a HPV42, HPV54, HPV55, HPV61, HPV70, a HPV84 byla zjištěna v jednom vzorku, což naznačuje, že smíšené infekce HPV vede k falešně pozitivní výsledky na HPV test Cobas.

LA HPV test detekuje hrHPV genotypů v žádném ze vzorků, které byly HC2 pozitivní a Cobas negativní (0/4) a v 80% (12/15) vzorky, které byly HC2 negativní a pozitivní Cobas. V HC2 testu se nepodařilo odhalit hrHPV v těchto vzorků, což indikuje, že test HC2 vynechal více hrHPV genotypů než Cobas test, což znamená, že Cobas je potenciálně více efektivní screening test kvůli lepší citlivosti a přesnosti. Naproti tomu HPV nebyl detekován LA HPV testem u 6,67% (1/15) HC2-negativních/Cobas-pozitivních vzorků. Celkově byl však rozdíl v detekci hrHPV mezi HC2 a Cobas testy stále statisticky nevýznamný (χ2 = 2.901, P = 0.0885).

pak bylo použito šedesát osm vzorků ke stanovení reprodukovatelnosti testu Cobas HPV. Reprodukovatelnost mezi počáteční a opakované testy, které jsou vypočteny s standardní 2-by-2 kontingenční tabulce, byl 93.55%, kappa koeficient mezi výsledky prvního a druhého kola Cobas testování bylo 0.869 (95% CI, 0.744 na 0.993; P < 0.001). Síla této dohody je považována za velmi dobrou, což naznačuje, že test je vysoce spolehlivý.

sto osmdesát sedm vzorků, které byly testovány na HPV testu Cobas určit rozdíl v HPV detekce mezi prealiquoted a postaliquoted vzorků. Pouze 7 vzorků byly neodpovídající, pro sazbu 3,74% (95% CI 1.02% 6.46%). Statistická analýza ukázala, že rozdíl mezi prealiquoted a postaliquoted vzorků nebyl významný (χ2 = 0.233, P = 0.36290). Od té doby žádné zvýšení HPV-pozitivní sazba byla pozorována před i po cytologie proces (prealiquot versus postaliquot), cross-kontaminace vzorků během cytologie zpracování je velmi vzácné. HPV testování po cytologii může výrazně zlepšit pracovní postup a snížit zbytečné alikvotování, pokud je zamýšlen reflexní HPV test na abnormální cytologii.

Konečně, 5,621 vzorky byly testovány pomocí Cobas HPV test pro stanovení účinků míchání ve vortexové třepačce a vířící (před Cobas testování) na selhání sazby. Mezi 1380 vzorky zpracovanými vortexingem byla poruchovost 4.57% (95% CI, 3,65% až 5,91%). Naproti tomu u 4 241 vzorků zpracovaných vířením byla míra selhání 1,16% (95% CI, 0,84% až 1,48%). Pearson ‘s chi-square test ukázal, že rozdíly v poruchovosti mezi červí dírou a jemně krouží vzorky byly velmi významné (χ2 = 59.983, P < 0.0001), s jemným krouživým je doporučeno snížit Cobas’ poruchovost.

Závěrem lze říci, že test Cobas 4800 HPV prokázal větší stupeň citlivosti a specificity při detekci genotypů hrHPV než test Digene HC2 hrHPV. Cobasův test měl také nižší úroveň zkřížené reaktivity s genotypy lrHPV než test HC2, o čemž svědčí méně falešně pozitivních případů. Rozdíl v celkovém výkonu mezi těmito dvěma testy však není statisticky významný.