Transpozony: Typy Transpozonů | Genetika

Transpozony jsou dva typy, kompozitní transposon a komplexní transposon.

1. Kompozitní transpozony:

kompozitní transpozony jsou ty, které se skládají z centrální oblasti nesoucí geny rezistentní na antibiotika lemované na obou koncích identickými kopiemi prvku IS. 8.32 A). Jedná se o třídu větších transpozonů. Tři často studované kompozitní transpozony jsou Tn5, Tn9 a Tn10.

Tn5 prvek ukazuje, kanamycin rezistence (kanr) a skládá se z 5,400 pár bází segmentu s 1,450 bp obrácené opakuje na obou koncích segmentu. Může být transponován z fágu λ na chromozom E .coli a od lokusu chromozomu k coli k jinému lokusu. Pokud je vložen do genů, způsobuje mutace.

transpozon Tn9 se skládá z genu odvozeného z R faktoru pro rezistenci na chloramfemkol (camr). Enzym, který propůjčuje rezistenci na léčivo, sestává z 2 638 sekvencí uprostřed Tn lemovaných 768 bp dlouhým prvkem IS1 na obou stranách. Tn9 IS1 je přítomen v přímém pořadí s malým obráceným opakováním na koncích.

segment camr je translokován z R-faktoru na F-epizom, stejně jako fág λ přes fág P1. T9 se liší od ostatních transpozonů svou nestabilitou a může dojít k vysokofrekvenční ztrátě rezistence vůči antibiotikům.

Tn10 se skládá z tetracyklinových resitančních genů (tetr genů). Je dlouhá 9 300 bp sestávající z obrácených opakování, na obou stranách 1400 párů bází. Prvky IS jsou IS10. Tn10 může být translokován z R222 (plazmid resitance léčiva) na fág P22.

Struktura kompozitní transpozony:

V kompozitní transpozony, JE prvky mohou být v obrácené nebo přímé opakovat konfiguraci (Obr. 8.31 B). Oba konce prvků IS jsou samy o sobě obrácenými opakováními. Relativní orientace (přímá nebo obrácená) lemování je prvky kompozitního transpozonu nemění jeho koncové sekvence. Kompozitní transpozon s rameny přímých opakování má tedy strukturu: rameno L-centrální oblast-rameno R.

struktura se stává: rameno L-centrální oblast-rameno R, pokud jsou ramena obrácená opakování. Šipky ukazují orientaci ramen podle orientace genetické mapy transpozonu zleva (L) doprava (R) (obr. 8.31 B, i-ii). Vlastnosti kompozitních transpozonů jsou uvedeny v tabulce 8.4.

Navíc, tam jsou některé případy, kde moduly z kompozitu transposon jsou identické, například Tn9 (má přímé opakování IS1) nebo Tn903 (obrácené opakování JE 903 přítomni), vzhledem k tomu, že v některých případech jsou moduly úzce souvisí. Proto lze rozlišit moduly v Tn10 nebo Tn5. Pokud jsou však moduly identické, mohou oba sponzorovat pohyb transpozonu, jak je uvedeno v Tn9 Tn903.

pokud se moduly liší, mohou se také lišit ve funkčních schopnostech. Proto transpozice zcela závisí na jednom z modulů, například Tn10 nebo Tn5. Tedy modul IS, když je funkční, transponuje buď sám, nebo celý transpozon.

schopnost jednoho modulu transponovat celý kompozitní transpozon vysvětluje nedostatek selektivního tlaku, aby oba moduly zůstaly aktivní. Is elements kód pro transpozázovou aktivitu, která je zodpovědná jak za vytvoření cílového místa, tak za rozpoznání konců transpozonu. Pouze konce jsou potřebné k tomu, aby transpozon sloužil jako substrát pro transpozici.

2. Komplexní transpozony (rodina transpozonů TnA):

rodina transpozonů tna zahrnuje Tn1, Tn2 a Tn3. TnA se skládá z poměrně velkých prvků (asi 500 bp). Obsahují nezávislé jednotky nesoucí geny pro transpozici i pro rezistenci na léky. Nejedná se o kompozitní předávání na transpozičních modulech typu IS. Rodina TnA zahrnuje několik příbuzných transpozonů, z nichž Tn3 a Tn10 jsou nejlépe studované.

TnA rodina je také známý s názvem Tn3 rodinu, protože Tn3 transposon byl poprvé objeven v bakteriální plasmidy v roce 1974 živé Ploty a Jacob. Tn3 je příkladem komplexního transpozonu. Má modulární strukturu, jak je uvedeno v Tn10, a není založen na prvcích IS. Také nemá evoluční vazby na prvky IS. Základní struktura TN3 je popsána pro rodinu TnA.

jednou z jedinečných vlastností rodiny TnA je to, že omezuje vícenásobné vložení stejného transpozonu do plazmidu. Nejpřekvapivějším zjištěním je, že frekvence transpozice na jiné plazmidy ve stejné buňce není ovlivněna. Heffron (1979) dal analýzu DNA sekvence transposon Tn3.

Struktura Transpozony TnA rodina:

Transpozony TnA rodina se skládá z obrácené terminál opakuje (38 bp dlouho, ale nikdo je lemován JE-jako prvky), interní res stránky a tři známé geny např. tnpA, tnpR a ampr.

Gen tnpa kóduje transposázu a tnpr kóduje resolvázu. Gen ampr (dlouhý 5 bp) je generován v cílovém místě jako přímé opakování a kódy pro β-laktamázu, která propůjčuje rezistenci na ampicilin. Místo res se skládá ze tří podjednotek: I ,II a III (obr. 8.33)