vyhodnocení vhodnosti COI a COII genové variace pro rekonstrukci fylogeneze, a identifikace kryptických druhů, anopheline komáři (Diptera Culicidae)

Jsme hodnotili praktičnost a efektivitu pomocí variací v mitochondriální COI a COII geny rozlišovat druhy a rekonstruovat fylogenezi anophelene komáři. Fylogenetické vztahy mezi podčeledí Anophelinae byly odvozeny z částí mitochondriálních COI (92 druhů) a coii genů (108 druhů). Fylogenetické stromy byly rekonstruovány na základě parsimonie, maximální pravděpodobnosti a Bayesovských metod. Vhodnost variace genu COI a COII pro identifikaci kryptických druhů byla porovnána porovnáním divergence sekvence v rámci skupin a komplexů druhů. Výsledky ukazují, že gen COI byl užitečnější pro identifikaci sourozenců a kryptických druhů, ale že fylogenetické vztahy rekonstruované pomocí genu COII byly více podobné vztahům založeným na morfologických datech. Došli jsme k závěru, že: (1) mezi An existuje významná molekulární divergence. sinensis; (2) COI a COII jsou platné genetických markerů pro řešení taxonomických vztahů mezi anopheline komáři a výsledné fylogeneze vyvolává některé otázky o taxonomické postavení anopheline druhů, skupin a komplexy; (3) rodu Anopheles není prokazatelně monophyletic s ohledem na rod Bironella; (4) podrodů Kerteszia a Nyssorhynchus jsou monophyletic; (5) níže na úrovni skupiny, ČOI data podporují existenci monophyletic taxonů v rámci Anopheles funestus, Anopheles maculipennis a Anopheles kráčel a Anopheles barbirostris podskupiny, a ve Anopheles nuneztovari složité, vzhledem k tomu, COII údaje podporují monophyletic taxonů v rámci Anopheles minimus a Anopheles oswaldoi podskupin, a Anopheles hyrcanus skupiny. Monofyletické taxony v komplexech Anopheles gambiae a Anopheles albitarsis jsou podporovány jak údaji COI, tak COII.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.