identifikation, prævalens og patogenicitet af Colletotrichum-arter, der forårsager anthracnose af Capsicum annuum i Asien

morfologiske observationer og fylogenetiske data for de lige conidia-arter identificerede klart tre nye arter, to fra Indonesien og en fra Danmark. Detaljerede morfologiske beskrivelser er angivet nedenfor for alle Colletotrichum arter forbundet med chili anthracnose (Tabel 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. P. Crous & P. P. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB826936.

figur 6 etymologi: opkaldt efter Java, øen i Indonesien, hvor arten blev samlet.

diagnose: Colletotrichum javanense adskiller sig fra C. brisbanense ved dannelse af forskellige chlamydosporer og acervular conidiomata på alle de testede medier. I modsætning hertil producerede C. brisbanense kun Conidiomata på Anthriscusstammen, men der blev ikke observeret nogen basale celler. Derudover vokser C. javanense hurtigere end C. brisbanense (C. javanense på OA, Mea og SNA 60, 55 og 66 mm diam i henholdsvis 7 d, C. brisbanense på OA og SNA 18,5, 20 mm diam i henholdsvis 7 d). Colletotrichum javanense er fylogenetisk forskellig fra C. brisbanense, hvor begge arter er forskellige i sekvenserne af chs-1 og mest effektivt med gapdh (7 bp forskel) og his3 (4 bp forskel).

Type: Indonesien: Vestjava, Regency, på frugt af Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotype; CBS 144963 = UOM 1115 = EVINDO 3 – AB-type kulturer).

beskrivelse: seksuel morph ikke observeret. Aseksuel morph på PDA. Vegetativt mycelium 1-5 liter diam, hyalin, glatvægget, septat, forgrenet hyfer. Chlamydosporer kugleformet eller langstrakt, lysebrun, glatvægget, 5-25 liter 3-8 liter. Conidiomata acervular, setae ikke observeret. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 liter, spids 1-3 liter diam. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, for det meste fusiform, den ene ende afrundet, den anden ende akut eller begge ender akut (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) lortem. Conidia i masse gul til orange farve. Appressoria enkelt eller i løse grupper, mellembrun, glatvægget, subglobose eller elliptisk, med hel eller bølget kant, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) lortem.

aseksuel morph på SNA. Vegetativt mycelium 1-7 liter diam, hyalin, glatvægget, septat, forgrenet hyfer. Chlamydosporer kugleformet eller langstrakt, lysebrun, glatvægget, 4,5-28 liter 4-8 liter. Conidiomata acervular, setae ikke observeret. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet,20-35 liter lang. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 5-20 liter, spids, 1-3 liter diam. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, cylindrisk med begge ender akutte eller den ene ende runde og den ene ende akutte, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) lortem. Conidia i masse med gul til orange farve.

Kulturegenskaber: kolonier på PDA 48-54 mm diam i 7 d (6,5–7,5 mm/d), flad med hele margen; overflade dækket med grå til Olivengrøn kort luftmycelium, margin hvid til lysegrå, omvendt for det meste creme hvidlig, olivaceous grå til sort i midten. Gul til orange acervular conidiomata. Kolonier på SNA var 60-66 mm diam i 7 d (8-9, 5 mm/d), Flade med hele margen, hyaline til lysebrun, overflade dækket med kort grå luftmycelium, omvendt samme farver. Orange acervular conidiomata i centrum af kulturen. Kolonier på OA var 55-60 mm diam i 7 d (7,8-8,5 mm/d), Flade med hele margen; overflade dækket med creme til grå kort luftmycelium, margin hvid, omvendt for det meste lys orange, med brune pigmenter. Orange acervular conidiomata. Kolonier på MEA overflade lysegrå kort luftmycelium, omvendt lys orange.

bemærkninger: det nærmeste match i en blastn-søgning med GAPDH-sekvensen var GenBank JK948617, C. sloanei stamme IMI 364297 med 98% identitet (4 bp-forskelle), mens de nærmeste matcher med his3-sekvensen med 99% identitet (2 BP-forskelle) var GenBank JK949279 C. indonesiense stamme CBS 127551 og GenBank KJ947248 C. guajavae isolere OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. P. Crous & P. P. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827691.

Figur 7 etymologi: opkaldt efter Makassar, byen i Sydsulavesi, Indonesien, hvor arten blev samlet.

diagnose: Colletotrichum makassarense er fylogenetisk tæt beslægtet med C. tropicale. Sekvensdata fra ITS kunne ikke adskille de to arter, men de kan skelnes af alle andre testede gener og mest effektivt ved hjælp af apmat (22 BP-forskelle) og gs (18 bp-forskelle) sekvensdata.

Type: Indonesien: Makassar, fra frugtlæsion af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotype; CBS 143664 = CPC 28612 – kulturer fra tidligere type).

beskrivelse: Seksuel morph ikke observeret. Aseksuel morph på OA. Vegetativt mycelium bestående af hyalin, glatvægget, septat, forgrenet hyphae, 2-3 liter diam. Chlamydosporer ikke observeret. Setae til stede, medium brun, 40-55 liter 3-5 liter, 2-3-septat, aftagende til akutte spidser. Conidiomata acervular, 100-200 liter diam, med orange conidial masser. Conidiophores subcylindrisk, bøjelig, 1-4-septat, hyalin, glat, forgrenet, 15-45 liter 3-4 liter. Konidiogene celler subcylindriske, hyaline, glatte, phialidiske med periklinal fortykning, 7-25 liter 3-4 liter. Conidia hyalin, glat, aseptat, subcylindrisk, lige, spids stump, aftagende ved basen for at fremspringende trunkere hilum, 1 liter diam, fremtrædende guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 lortem. Appressoria ensom, medium brun, glatvægget, subglobose, ellipsoidal til obovat, hele margen, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) lortem.

Kulturkarakteristika: kolonier på PDA 45 mm diam efter 7 d (6,5 mm/d), kolonier Flade, med moderat luftmycelium, på OA-overfladen røggrå. På PDA overflade røggrå, omvendt olivaceous grå. På MEA overflade beskidt hvid, omvendt okker.

bemærkninger: det nærmeste match i en blastn-søgning med ApMat-sekvensen var GenBank KU923732, C. dronninglandicum stamme AUS22 med en 98% identitet (16 BP-forskelle), mens det nærmeste match med gs-sekvensen med 99% identitet (7 BP-forskelle) var GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24. De bedste kampe med GAPDH-sekvensen var GenBank KH 578784 C. siamense (99% identitet, 3 bp-forskelle) og GenBank KU221347 C. dronninglandicum (99%, identitet, 3 bp-forskelle).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. H. Crous & P. V. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827692.

figur 8 etymologi: opkaldt efter Tainan, byen, hvor arten blev indsamlet.

diagnose: Colletotrichum tainanense adskiller sig fra sin nærmeste fylogenetiske nabo C. salsolae i kulturkarakteristika på PDA, sparsomt luftmycelium og bleg musegrå overflademycelium, mens C. salsolae producerer et lag af acervuli-lignende strukturer med dybe orangebrune konidiale masser og adskillige setae. De to arter kan adskilles ved hjælp af alle de testede gener bortset fra dets og mest effektivt med GAPDH (7 bp forskel), tub2 (6 bp forskel) og act (5 bp forskel) sekvenser. Der er kun en BP-forskel i chs-1-sekvensen mellem de to arter.

Type: Tainan: på frugt af Capsicum annuum, Aug. 2014. Sheu (CBS H-143666 – holotype; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – AB-type kulturer).

beskrivelse: seksuel morph ikke observeret. Aseksuel morph på PDA. Vegetativt mycelium forgrenet, hyalin, glatvægget, septat, hyfer 2-3 liter diam, melaniseret med tiden. En enkelt conidioma fundet på en PDA plade, steril på SNA, MEA, og OA. Chlamydosporer og setae ikke observeret. Conidiophores subcylindrisk, bøjelig, 1-2-septat, hyalin, glat til lysebrun, forgrenet. Konidiogene celler subcylindriske, hyaline, glatte, phialidiske med periklinal fortykning. Conidia hyalin, glat, aseptat, subcylindrisk til subklavat, lige eller let buet, spids stump, tilspidset ved basen for at fremspringende trunkere hilum, 1,5-2 liter diam, fremtrædende guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 lortem. Appressoria enkelt eller i løse grupper, ofte smalcylindrisk, medium til mørkebrun, ofte aftagende mod toppen, kanten hel eller bølgende undertiden uregelmæssigt lobet (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) lortem.

Kulturegenskaber: kolonier på PDA 45 mm diam efter 7 d (6,5 mm/d), kolonier Flade, med moderat luftmycelium. På OA overflade bleg mus-grå. På PDA overflade bleg mus-grå, omvendt mus-grå. På MEA overflade bleg mus-grå, omvendt olivaceous grå.

noter: det nærmeste match i en blastn-søgning med gapdh-sekvensen med 99% identitet (2 bp-forskel) var GenBank KC790761 Colletotrichum sp. stamme MTCC 9664 mens den nærmeste kamp med act sekvens med 99% identitet (2 bp forskel) var GenBank KY995522 C. siamense stamme LJDY1–2. Det nærmeste match med tub2-sekvensen med 99% identitet (7 BP-forskel) var GenBank MF143931 C. siamense stamme 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al. Fung. Mangfoldighed 61: 112 (2013); som ‘endophytica’.

beskrivelse: kolonier på PDA 42 mm diam efter 7 d (5,5 mm/d), lys orange til hvid luftmycelium; omvendt bleg hvid til orange og sort i midten og talrige orange conidiomata spredt over overfladen. Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata til stede, conidiophores dannet direkte på hyfer. Setae til stede, moderat brun, 47-95 liter 3-6 liter, 3-4-septat, tilspidsende akutte spidser. Conidiophores hyalin, glatvægget og ikke forgrenet. Konidiogene celler hyalin, glatvægget, aseptat, subcylindrisk, 12-21 liter 3-4 liter. Conidia hyalin, glatvægget, aseptat, lige, cylindrisk med to ender stump, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) lortem. Appressoria enkelt eller i løse grupper, brun, let lobed, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) lortem.

noter: Colletotrichum endophyticum blev først beskrevet som en græsendophyte af Pennisetum purpureum fra det nordlige Thailand (Manamgoda et al. 2013). Senere blev det rapporteret fra flere andre værtsarter, herunder Capsicum i Kina (Diao et al. 2017). Længden af conidia af isolatet fra Thailand (UOM 1137) var lidt kortere end længden af C. ENDOPHYTICUM (conidia) tidligere (LC0324) 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 Hr.

materiale undersøgt: Thailand: Kanchanaburi: fra frugtlæsion af Capsicum annuum, 2010, P. V. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al. Fung. Mangfoldighed 39: 158 (2009).

beskrivelse: Kolonier på PDA 65 mm diam efter 7 d (8,5–11 mm/D), flad med hele kanten, luftmycelium tæt, bomuld, lysegrå til hvid luftmycelium og talrige sorte stroma spredt over overfladen, grå i midten, hvid ved kanten; omvendt grågrøn. Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata acervular, Setae blev observeret, brun, glatvægget, 1-2-septat, 60 liter lange, tilspidsede akutte apices. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 liter. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, cylindrisk, begge ender stump, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria ikke observeret.

noter: den seksuelle morf af disse isolater blev ikke observeret i kultur. Conidial længde isolere CPC 28644 blev lidt længere end ex-type (ICMP 18581 = BPD-I16) af C. fructicola (conidia 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

materiale undersøgt: Thailand: Chiang Mai: fra frugtlæsion af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulturer CPC 28644 og CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, fra frugtlæsion af moden rød frugt af Capsicum sp. (sød peber), 22 Apr. 2015, S. M. Sheu (kultur UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, fra frugtlæsion af grøn frugt af Capsicum sp. (sød peber), 4 Sep. 2008, S. M. Sheu & C. Vang (kultur UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); som ‘karstii’.

beskrivelse: kolonier på PDA 65 mm diam efter 7 d (6,5–10.5 mm / d), flad med hele kanten, orange til hvid luftmycelium og adskillige orange konidiale masser spredt over overfladen, hvid ved kanten; omvendt gul til orange. Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata acervular, setae blev observeret, brun, glatvægget, 2-4-septat, 60 liter lang, base nedsænket, tilspidset mod spids, spids for det meste akut. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) lortem. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-15, 5 liter. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, kort, cylindrisk, begge ender stump eller den ene ende let akut eller afkortet ved bunden, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) lortem. Appressoria enkelt eller i løse grupper, brun, subglobose, cirkulær omrids, 6-12, 5 liter 3,5–8 liter.

bemærkninger: de fire isolater identificeret fra Indonesien i boninense-komplekset producerede forskellige korte konidier sammenlignet med C. karsti ‘ s eks–epitypekultur (14,5-17 liter 5-6, 5 liter; Yang et al. 2011). Imidlertid høj variabilitet af conidia størrelse mellem forskellige stammer af C. karsti blev rapporteret af Damm et al. (2012a, 2012b), hvor conidia målinger af CBS 129833 var (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, mean ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm; og CBS 111998 havde en conidium længde på op til 18,5 mm L/W ratio = 2.8. Disse isolater dannede ikke en seksuel morf i kulturen. Selvom disse fire isolater dannede en fuldt understøttet (100% BS/1 PP) underklasse inden for C. karsti, gav alle de individuelle gentræer (data ikke vist) ikke signifikant støtte til at retfærdiggøre introduktion af en kryptisk art for disse isolater.

materiale undersøgt: Indonesien: Jeneponto, fra frugtlæsioner af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28553, CPC 28554); fra frugtlæsion af modne røde frugter og peduncle læsioner af Capsicum sp. Juni. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Stud. Mycol. 92: 31 (2019).

beskrivelse: kolonier på PDA 63 mm diam efter 7 d (8 mm / d), grå til mørkebrun luftmycelium; omvendt grå til lysebrun med gul-orange i midten med rigelige acervular conidiomata, der oser bleg orange conidial masser i midten, Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata til stede (nær inokulationspunktet), conidiophorer dannet direkte på hyfer. Sclerotia til stede. Setae til stede, medium brun, 94-125 liter 4-6 liter, 1-4-septat, aftagende mod akutte spidser, ofte med en indsnævring ved toppen. Conidiophores hyalin til lysebrun, glatvægget, septat og forgrenet. Konidiogene celler hyalin, glatvægget, aseptat, subcylindrisk, lige til forsigtigt buet, 26-48 liter 3-4 liter, phialidisk, periklinal fortykning iøjnefaldende. Conidia hyalin, glatvægget, aseptat, lige, cylindrisk med to ender stump eller den ene ende lidt akut, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) lortem. Appressoria enkelt eller i løse grupper, medium brun, uregelmæssig i form, crenate eller lobed omrids, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) lortem. Seksuel morph på PDA. Ascomata perithecia, dannet efter 2 uger., ensom, semi-nedsænket eller nedsænket i agarmediet, nonstromatisk, subsfærisk til ovoid, ostiolat, glabrous, medium brun, 96-130 liter 160-200 liter. Peridium 10-12, 5 liter tyk, sammensat af bleg til medium brune fladede vinkelceller 3,5–10 liter diam. Ascogen hyfer hyalin, glatvægget, delikat, sjældent synlig. Interascal væv ikke observeret. Asci unitunicate, 8-spored, cylindrisk, tilspidset til spids og base, glatvægget, 51-65 liter 9,5-13 liter, basen afkortes. Ascosporer, der er biseriat arrangeret, aseptat, hyalin, glatvægget, fusiform, let buet, afrundet, spids akut eller afrundet, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) larm,

bemærkninger: konidiallængden af de undersøgte isolater (CPC 28638, CPC 28639) var variabel og faldt inden for området for isolatet eks-type (CBS 125474) af C. plurivorum (15-17 liter 5,5 liter; Damm et al. 2019).

materiale undersøgt: Thailand: Chiang Rai, fra bladlæsioner af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor (kulturer CPC 28638 og CPC 28639); Bangkok, restaurant i Phaya Thai-området, inficeret væv af Capsicum sp. Juni. 2015, P. V. J. Taylor (kultur UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Stud. Mycol. 73: 100 (2012).

beskrivelse: kolonier på PDA 20-38 mm diam efter 7 d (5-6, 2 mm/d), Flade med hele margen; overflade dækket med kort lyserosa til orange luftmycelium, bliver grå med tiden, margin hvidlig til lyserød, omvendt rosenrød buff, olivaceous grå til brungrå i midten; omvendt orange til laks, mørk i midten. Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata acervular, setae ikke observeret, Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 liter, spids 1-3 liter diam. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, mest fusiform, den ene ende afrundet, den ene ende akut, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia i masse med laks til orange farve. Appressoria enkelt eller i løse grupper, medium brun, ovoid, hele til crenate margin, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) lortem.

bemærkninger: størstedelen af isolater identificeret som C. scovillei havde lignende sporeform og sporestørrelser sammenlignet med typeprøven (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) kristm, beskrevet af Damm et al. (2012a, 2012b). Imidlertid havde nogle isolater varierende kolonifarve, forskellige kolonivæksthastigheder og små forskelle i sporemålinger.

materiale undersøgt: Indonesien: Gova, fra frugtlæsioner af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28577 og CPC 28579); Vest Java: fra frugtlæsion af Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EVINDO 10. Thailand: Chiang Mai: fra frugt læsioner af Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (kulturer UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al. Fung. Mangfoldighed 39: 98 (2009)

beskrivelse: kolonier på PDA 79 mm diam i 7 d (5,5-6 mm/d). Lysegul-hvid, grå, tæt bomuldsfarvet luftmycelium med orange acervular conidiomata i midten; omvendt lysegul. Chlamydosporer ikke observeret. Conidiomata acervular, conidiophores dannet på en pude af runde og mellemstore brune celler. Setae ikke observeret. Conidiophores hyalin, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, cylindrisk til ampulliform, 6,5-16 liter. Conidia hyalin, aseptat, glatvægget, fusiform til cylindrisk, begge ender stumpt afrundet, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) lortem. Appressoria mørkebrun, ensom, cirkulær, Hel til crenate margin, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) lortem.

noter: Colletotrichum siamense isolater fra forskellige lande viste variation af morfologiske tegn, i vækstrater og kulturmorfologi på PDA. Repræsentative konidiale målinger for isolater, der repræsenterer forskellige underklasser i de fylogenetiske træer (Fig. 2, 3) er: CPC 30233 (Gowa, Indonesien), 12.5–17 × 2.5–5.5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thailand) 9.5–14.5 × 3.5–5 µm; UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thailand) 12-15 x 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10.5–16.5 x 3.5–5.5. Disse morfologiske tegn inden for en underklasse var meget konsistente inden for hvert land. Arten blev beskrevet af Prihastuti et al. (2009); conidia af den tidligere holotype (ICMP 18578/ BDP-I2) blev rapporteret som 7-18.3 til 3-4. 3 til = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), som omfatter det område, der observeres i vores isolater. Denne art blev rapporteret at være biologisk og geografisk forskelligartet og findes på mange værter på tværs af flere tropiske og subtropiske regioner. 2012).

materiale undersøgt: Indonesien: Gova, fra frugtlæsion af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30233); Jeneponto, fra frugtlæsion af Capsicum sp. 7 Jun. 2015, P. V. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30209). Thailand: Ratchaburi, fra frugtlæsion af Capsicum sp., Januar. 2010, P. V. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1132); Kanchanaburi, fra frugt læsion af Capsicum sp. Januar. 2010, P. V. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, fra frugt læsion af Capsicum sp. Sep. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (kultur UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

beskrivelse: kolonier på PDA 45 mm diam i 7 d (6,5 mm/d). Kolonier fladt, spredende, med moderat luftmycelium, på OA overflade røggrå. På PDA overflade olivaceous grå at ryge grå, omvendt olivaceous grå, talrige orange conidiomata spredt over overfladen. På MEA overflade beskidt hvid, omvendt okker. Aseksuel morph på OA. Vegetativt mycelium bestående af hyalin til lysebrun, glatvægget, septat, forgrenet, 2-2, 5 liter diam hyfer. Chlamydosporer ikke observeret. Setae sjælden (kun to set), lige, medium brun, fint verruculose, 2-3-septat, til 120 liter lang, spids subobtusely afrundet. Conidiomata acervular, 150-250 liter diam, med orange conidial masse. Conidiophores subcylindrisk, bøjelig, 1-3–septat, hyalin, glat, forgrenet, 15-25 liter 3,5-4,5 liter. Konidiogene celler subcylindriske, hyaline, glatte, phialidiske med periklinal fortykning, 7-15 liter 3,5–4,5 liter. Conidia hyalin, glat, aseptat, subcylindrisk, lige, spids stump, tilspidset ved basen for at fremspringende trunkere hilum, 1,5-2 liter diam, fremtrædende guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) lortem. Appressoria ikke observeret. Seksuel morph ikke observeret.

materiale undersøgt: Indonesien, Makassar, fra frugtlæsion af Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. V.J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 28607).

prævalens af Colletotrichum-arter

samlet set var C. truncatum den mest udbredte art (44%) isoleret fra inficeret chilifrugt (Fig. 9) og blev let identificeret ved sine falcate sporer og rigelige setae i de nekrotiske læsioner. Af arten med lige conidia var C. scovillei (acutatum-kompleks) den mest almindelige art i de undersøgte lande (35%) undtagen Sri Lanka, hvor denne art ikke var isoleret. Colletotrichum siamense (gloeosporioides-kompleks) var den næst mest almindelige art, der forekom i Thailand, Sri Lanka og Indonesien (11%). De resterende arter var repræsenteret med færre end 10% af det samlede antal isolater.

i Indonesien, C. scovillei blev isoleret fra inficeret chilifrugt i alle undersøgte regenser i Sydsulavesi undtagen i Makassar og på feltundersøgelsesstedet i vest Java. Colletotrichum siamense blev også isoleret fra hele regionen, fra Jeneponto og Makassar. De to nye arter, C. makassarense og C. javanense, blev isoleret fra henholdsvis Makassar og Vestjava.

i Thailand blev C. scovillei hovedsageligt isoleret fra de nordlige provinser Chiang Mai og Chiang Rai, men blev også opnået fra inficeret chilifrugt på et forsøgssted ved Kasetsart University i Nakhon Pathom. De vestlige provinser havde en høj forekomst af C. siamense og et isolat af C. endophyticum blev opsamlet fra Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum blev isoleret fra chiliblade med nekrotiske læsioner i Chiang Rai og fra nekrotiske læsioner af chilifrugt fundet i en restaurant i Phaya Thai-området i Bangkok. Derudover blev C. fructicola identificeret fra frugt indsamlet fra Chiang Mai.

et isolat blev identificeret som en ny art, C. tainanense, indsamlet fra inficeret chilifrugt i Tainan-provinsen, og C. fructicola blev identificeret fra frugt i Hsinchu og Nantou. Colletotrichum plurivorum blev også identificeret fra en frugt indsamlet i Johor, Malaysia.

patogenicitet

alle Colletotrichum-arter forårsagede anthracnose-symptomer på såret frugt, men der var signifikante forskelle i sværhedsgraden af symptomerne. På sårede frugter viste isolater af C. scovillei og C. javanense den højeste sygdomsgrad og producerede store, nekrotiske læsioner med gennemsnitlige læsionsstørrelser 15,6–20,3 mm (tabel 5). På ikke-sårede frugter var alle arter mindre patogene med gennemsnitlige læsionsstørrelser mindre end 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale og C. plurivorum producerede kun meget små læsioner eller ingen synlige symptomer (gennemsnitlig læsionsstørrelse < 1 mm) 10 d efter podning af ikke-sårede frugter. Colletotrichum javanense og C. scovillei isolater var de mest patogene I ikke-sårede frugter og producerede læsioner med gennemsnitlige størrelser på henholdsvis 9,4 og 9,1 mm. Læsioner forårsaget af C. scovillei var signifikant større end dem forårsaget af alle andre arter undtagen C. javanense i såret frugt og C. endophyticum i løs frugt. Betydningen af de parvise t-test er stærkt afhængig af antallet af isolater af hver art, der er udtaget prøver, så grupperingerne vist i tabel 5 ændres ikke blot med størrelsen af forskellen mellem midlerne; en stor forskel er muligvis ikke signifikant, hvis der er små prøvestørrelser for begge arter, mens en mindre forskel kan være signifikant. Især er sammenligninger, der involverer C. javanense og C. endophyticum, meget upræcise, da kun et isolat af hver art blev testet.