outputformat
på resultatsiden, for hver forespørgselssekvens navnet, længden og det naturlige netværk output score, som CTP/ikke-cTP-opgaven er baseretvil blive præsenteret. Jo højere score, jo mere sikkert er netværketat denne sekvens indeholder et N-terminal chloroplast transitpeptid (cTP).En potentiel CTP længde vil også blive præsenteret, sammen med den tilsvarende cleavage site score. Bemærk, at forudsigelsen af transitpeptidlængden udføres, selvom dens tilstedeværelse ikke forudsiges.Formålet er at give maksimal information i grænsesager.
hvis “detaljeret output” er valgt, vil det neurale netværk score for hverresidue også blive præsenteret. Jo højere denne score er, desto mere sikker ernetværket, at denne Rest er en del af en cTP. Et derivat af netværketscore er også præsenteret. Denne score bruges til at finde det område, hvor thecleavage site søges efter – nemlig blandt de 40 rester omkring theresidue med den højeste afledte score. Endelig præsenteres spaltningsstedets score (CS-score) for hver rest. Denne score beregnes ud fra ascoring matrice afledt af en automatisk motivfindingsalgoritme kaldet MEME. Cleavagesite-scoren er defineret således, at det forudsagte spaltningssted er direkte terminal for den højest scorende rest inden for de 40 rester. Der findes således en eller flere CS-score(er), der tilfældigvis er større endscore af den foreslåede cTP-længde, men da de er placeret uden for 40-resterne omkring den højeste afledte score, er den præsenterede cTP-længde stadighvad ChloroP betragter som den mest sandsynlige præsekvenslængde(dvs. svarer til det mest sandsynlige spaltningssted).
