Amphibia
Une taxonomie
La classe Amphibia est représentée par plus de 7000 espèces (http://amphibiaweb.org) contenues dans trois clades: Gymnophiona, Caudata et Anura. Les Caéciliens forment l’ordre des Gymnophiona et sont des amphibiens fouisseurs sans pattes qui habitent les régions tropicales humides d’Asie, d’Afrique et des Amériques. La plupart mesurent moins de 50 cm de long et ressemblent à des vers de terre, avec des têtes émoussées et fortement ossifiées, des yeux dégénérés et des rainures annulaires le long du corps (Zug, 1993; Vitt et Caldwell, 2009). Il y a environ 200 espèces de caéciliens décrites; cependant, en raison de leur nature secrète, on sait peu de choses sur la biologie caécilienne (Wells, 2007). Les cæciliens sont rarement utilisés dans un cadre de recherche.
Les salamandres sont dans l’ordre des Caudata. Il y a plus de 650 espèces dans Caudata, réparties en trois groupes: les sirènes (amphibiens ressemblant à des anguilles), les salamandres basales (primitives) (hellbenders et autres espèces apparentées) et les salamandres dérivées (mudpuppies, amphiumas, axolotls, tritons et de nombreuses espèces terrestres) (Zug, 1993; Vitt et Caldwell, 2009). Les sirènes ont des branchies externes, pas de membres postérieurs et des membres antérieurs réduits. Ils sont totalement aquatiques et habitent les cours d’eau lents du sud de l’Amérique du Nord. Il existe deux genres dans la famille des Sirenidae, Siren et Pseudobranchus, chacun avec deux espèces (Vitt et Caldwell, 2009). Il existe deux familles de salamandres basales, les Cryptobranchidae et les Hynobiidae. Les membres de la famille des Cryptobranchidae comprennent les hellbenders (Cryptobranchus sp.) des États-Unis et des salamandres géantes (Andrias sp.) d’Asie. Les cryptobranchidés sont des salamandres primitives et présentent un pédomorphisme (une condition où les salamandres conservent des caractéristiques larvaires tout en devenant pleinement fonctionnelles, reproduisant les adultes; cela était auparavant appelé néotonie). Ils sont aquatiques et vivent dans les ruisseaux de montagne froids. La respiration est presque exclusivement cutanée et la peau se trouve dans de vastes plis charnus sur les côtés du corps. La tête et le corps sont aplatis. Andrias peut atteindre une longueur de 1,5 m (5 pieds); c’est la plus grande salamandre du monde. Les Hynobiidae, une famille exclusivement asiatique comprenant plus de 50 espèces, sont la deuxième famille de salamandres basales. La plupart des membres de ce groupe sont plus petits que les cryptobranchidés, ont des corps robustes et subissent une métamorphose complète (Conant et Collins, 1991; Zug, 1993; Vitt et Caldwell, 2009).
Six familles composent les salamandres dérivées : Amphiumidae, Proteidae, Ambystomatidae, Rhyacotritonidae, Plethodontidae et Salamandridae. Les Amphiumidae contiennent trois espèces d’Amphiuma, qui ressemblent superficiellement à des sirènes. Les Amphiuma, cependant, n’ont pas de branchies externes et peuvent atteindre une longueur adulte de plus de 1 m. Les Proteidae contiennent deux genres, Proteus et Necturus. Proteus est une salamandre troglodyte présente en Europe. Necturus maculosus, le necturus maculosus, a une tête large et plate et des branchies externes bien développées. Les Mudpuppies sont aquatiques et se trouvent dans l’est et le centre de l’Amérique du Nord. Il y a deux genres et plus de 37 espèces représentées chez les Ambystomatidae. Plusieurs espèces présentent un pédomorphisme, dont Ambystoma mexicanum (l’axolotl) et A. tigrinum (la salamandre tigrée). Les ambystomatides sont principalement terrestres, avec des membres forts et des poumons fonctionnels. Ce sont des animaux robustes et les adultes de nombreuses espèces peuvent dépasser 16 cm de longueur (Fig. 18.1). Les Rhyacotritonidae ont un seul genre (Rhyacotriton) avec quatre espèces. Ces salamandres ressemblent aux ambystomatides mais se trouvent dans les forêts humides de la côte Pacifique.
Plus de 400 espèces d’Amérique du Nord et du Sud, d’Europe méditerranéenne et de Corée forment la famille des Plethodontidae. Les pléthodontides se présentent dans une grande variété de tailles et de formes; cependant, tous sont sans poumons, quadrupèdes et possèdent un sillon nasolabial. Parmi les multiples genres inclus dans cette famille se trouvent Plethodon, Desmognathus, Eurycea, Gyrinophilus, Pseudotriton, Aneides et Batrachoseps.
Les membres de la famille des Salamandridae partagent certaines caractéristiques avec les Plethodontidae; cependant, les salamandridés possèdent des poumons et ont de nombreuses glandes empoisonnées dans leur peau. De plus, ils peuvent être de couleur vive, une publicité de leur toxicité. Salamandra, Taricha et Notophthalmus sont des genres représentatifs de cette famille. Les tritons (Notophthalmus) peuvent avoir un stade larvaire aquatique, une période juvénile terrestre (au cours de laquelle les animaux sont appelés ” efts “) et un stade adulte aquatique (Conant et Collins, 1991; Zug, 1993; Vitt et Caldwell, 2009).
L’ordre des Anura compte plus de 6000 espèces de grenouilles, allant du cercle arctique aux points extrêmes de l’hémisphère sud. Les anoures sont facilement reconnaissables à leur plan corporel commun, conçu pour le saut et permettant un mouvement en moyenne de deux à 10 fois la longueur du corps. De nouvelles espèces continuent d’être décrites dans ce groupe d’amphibiens répandu et diversifié. L’application de techniques moléculaires a permis aux taxonomistes d’ajouter des informations génétiques aux méthodologies de classification existantes, ce qui a entraîné la reclassification de nombreuses lignées d’anoures. Ce processus est en cours et des changements de noms scientifiques continueront de se produire (Conant et Collins, 1991; Zug, 1993; Vitt et Caldwell, 2009; amphibiaweb). Les espèces de grenouilles familières comprennent le crapaud à ventre de feu, Bombina orientalis, et le crapaud sage-femme, Alytes obstetricans. D’autres espèces d’anoures couramment rencontrées se trouvent dans les familles Pipidae, Ranidae, Bufonidae, Dendrobatidae, Hylidae, Pyxicephalidae et Ceratophryidae. Les genres Pipa, Xenopus (y compris X. laevis) et Silurana (y compris Silurana tropicalis) font partie des Pipidae. Les Bufonidae contiennent les vrais crapauds, y compris des représentants nord-américains du genre Anaxyrus (par exemple, Anaxyrus americanus, Anaxyrus terrestris). Les crapauds ont une peau épaisse et verruqueuse avec des glandes parotoïdes bien développées (un groupe surélevé de glandes granulaires situées sur la tête derrière les yeux), et les mâles ont un organe de soumission (tissu ovarien situé sur le pôle crânien du testicule). Le crapaud de canne (Rhinella marina) est un grand bufonidé envahissant. Les dendrobates et les Phyllobates sont des membres de la famille des Dendrobatidae. Ce sont de petites grenouilles actives aux motifs de couleurs vives, qui alertent les prédateurs potentiels de la présence de sécrétions cutanées alcaloïdes hautement toxiques (caractéristique appelée aposomatisme). Ces sécrétions alcaloïdes proviennent de l’alimentation sauvage des arthropodes, principalement des fourmis, des acariens et des coléoptères (Saporito et al., 2009), et les toxines sont considérablement réduites chez les grenouilles en captivité qui mangent des régimes typiques de mouches des fruits et de quenouilles. La famille Hylidae contient plus de 840 espèces du genre Hyla et de leurs parents. Les Hyla sont des grenouilles arboricoles, reconnaissables à leur corps élancé, à leurs longs membres et à l’extrémité élargie de leurs doigts. Les Ceratophrys, les grenouilles à cornes d’Amérique du Sud, sont de grands animaux avec des protubérances charnues au-dessus des yeux et une bouche incroyablement large. Ces membres de la famille des Ceratophryidae sont des prédateurs terrestres voraces (Zug, 1993). Les Ranidae (“vraies grenouilles”) comprennent des membres du genre Rana (Lithobates). Les espèces comprennent L. catesbeianus (ouaouaron), L. grylio (grenouille porcine), L. clamitans (grenouille bronze) et L. pipiens (grenouille léopard du Nord). Les ranidés sont des grenouilles de taille moyenne à grande à la peau lisse. Chez certaines espèces (ouaouaron, grenouille porcine et grenouille bronze), le tympan du mâle est plus grand que l’œil, tandis que le tympan de la femelle a le même diamètre que l’œil (Conant et Collins, 1991).