Comamonas testosteroni: Est-Ce encore un agent pathogène humain rare

Résumé

Comamonas testosteroni (formellement Pseudomonas testosteroni) est une bactérie environnementale courante qui ne fait pas partie du microbiome humain. Depuis son identification comme agent pathogène humain en 1987, de nombreux rapports ont afflué, impliquant cet organisme pour diverses infections. Bien que ces organismes soient de faible virulence, une partie de leur obscurité est peut-être due à l’incapacité des laboratoires cliniques de les identifier. La plupart des cas signalés sont des infections de la circulation sanguine. Nous rapportons un cas de gastro-entérite causée par cet organisme chez une femme de 65 ans avec colostomie in situ.

©2017 Le(s) Auteur(s) Publié(s) par S. Karger AG, Bâle

Introduction

Les Comamonas appartiennent au genre Comamonas, famille des Comamonadaceae, qui sont des bétaprotéobactéries du groupe d’homologie III de l’ARNr des pseudomonas. Les souches de Comamonas testosteroni sont capables d’utiliser la testostérone, le 4-hydroxybenzoate, l’acétate et le lactate comme seules sources de carbone, mais pas le glucose et la plupart des glucides, d’où le nom de “testosteroni”. Les espèces de Comamonas sont des bacilles aérobies, à gram négatif, mobiles, pigmentés en rose et à oxydase positive qui poussent bien sur des milieux bactériologiques de routine. Ce groupe comprend quatre espèces: C. terrigena, C. testosteroni, C. denitrificans, C. nitrativorans. Les organismes ont une faible virulence et provoquent parfois des maladies humaines. C. les testostérones peuvent être trouvées dans les cathéters intraveineux, les voies respiratoires, l’abdomen et le système urinaire et le système nerveux central. Nous présentons ici un cas de passage de sang frais associé à C. testosteroni à travers un site de colostomie.

Rapport de cas

Une femme de 65 ans avec des antécédents de colostomie de 4 ans a été admise au service des urgences de notre hôpital de soins tertiaires, avec un passage de sang frais à travers le site de colostomie. Deux jours auparavant, elle avait eu 2 épisodes de vomissements suivis d’une diarrhée aqueuse. L’examen physique a révélé un pouls de 120 battements / min et une pression artérielle de 100/60 mm Hg. Le site de colostomie n’a montré aucune inflammation ou ulcération visible.

Les analyses en laboratoire

Les analyses hématologiques de routine ont montré un taux d’hémoglobine de 9 g/DL, une leucocytose (nombre total de leucocytes de 24,2 × 103/µL) et une numération plaquettaire dans les limites normales. Les paramètres biochimiques (fonction hépatique, tests de la fonction rénale et électrolytes sériques) se situaient dans la plage de référence. La sérologie du virus de l’immunodéficience humaine, de l’antigène de surface du virus de l’hépatite B et du virus de l’hépatite C n’était pas réactive. L’échographie a incidemment révélé une lithiase biliaire. Des cultures de selles et d’hémocultures ont été envoyées au laboratoire de microbiologie du Collège médical gouvernemental de Srinagar. Le patient a reçu un remplacement de liquide et d’électrolyte et a commencé empiriquement avec de la ciprofloxacine orale à 500 mg b.i.d.

Bilan des selles

Un échantillon frais semi-formé a été reçu dans un récipient universel. L’examen microscopique a montré des globules rouges ainsi que des monocytes du sang périphérique et des leucocytes polymorphonucléaires. Les montures salines et iodées n’ont montré aucun parasite pathogène. L’échantillon a été cultivé sur plaque de gélose sanguine (Fig. 1), gélose MacConkey (Fig. 2), gélose de désoxycholate de lysine de xylose (XLD) (Fig. 3), et bouillon de sélénite F. Les cultures ont été incubées dans l’air à 35-37°C.

Fig. 1.

Culture de C. testosteroni sur gélose sanguine montrant des colonies gris-blanc, non hémolytiques.

Fig. 2.

C. culture de testostérones sur milieu différentiel et sélectif. Gélose MacConkey présentant des colonies pâles sans fermentation du lactose.

Fig. 3.

Croissance de C. testosteroni sur milieu hautement sélectif et différentiel pour les agents pathogènes intestinaux. Gélose de désoxycholate de lysine xylose montrant des colonies rouges.

Observations

Après une incubation d’une nuit, il y avait une croissance prédominante de colonies non fermentantes au lactose (incolores) sur gélose MacConkey (Fig. 2) et des colonies rouges sans centre noir sur plaque de gélose XLD (Fig. 3). Les colonies rouges sans centre noir se sont révélées mobiles et catalase et oxydase positives. Ils ont ensuite été soumis à une procédure de dépistage entérique à l’aide de VITEK 2 COMPACT (bioMérieux, Inc.) carte à gram négatif No. GNB 280. Le rapport de culture de selles était positif pour C. testosteroni avec une probabilité de 99%. L’isolat était sensible à l’amikacine, à la gentamicine, au cotrimoxazole, à la minocycline, au céfépime, à l’imipénème, au méropénème, à la ceftazidime, à la céfopérazone/salbactame, à la pipéracilline/ tazobactame, à la ceftazidime et à la tigécycline/colistine, alors qu’il était résistant à la ciprofloxacine, à la lévofloxacine et à l’aztréonam. L’hémoculture a été stérile après 24 et 48 h d’incubation aérobie. La patiente a été guérie de déshydratation; cependant, elle a continué à avoir la diarrhée, mais les selles n’étaient pas ensanglantées. Le traitement par la ciprofloxacine orale a été arrêté au bout de 3 jours et le patient a été mis sous probiotiques. Elle a continué à passer des selles molles pendant environ 6 jours, puis la consistance des selles était normale.

Discussion

Les comamonas sont omniprésentes dans la nature et ont une distribution mondiale. Les infections intra-abdominales sont les infections les plus courantes rapportées avec cet organisme. Le passage du sang avec les selles à travers un site de colostomie peut indiquer de nombreuses étiologies, y compris un traumatisme, un ulcère, une croissance ou une infection. Parmi les causes d’intoxication alimentaire accompagnée de diarrhées et de vomissements, Salmonella, Shigella, E. coli 0157, H7, Staphylococcus aureus, Campylobacter spp., Plesiomonas et Aeromonas ont été fréquemment impliqués chez des individus par ailleurs normaux. En l’absence d’agents pathogènes connus, une altération de la microflore intestinale pourrait être à l’origine d’une diarrhée continue, comme on l’observe chez les patients sous antibiotiques. La grande souplesse génétique des espèces de Comamonas, ainsi que leur capacité inhérente en tant qu’agent pathogène de l’environnement à survivre dans diverses niches écologiques, en font un candidat formidable pour provoquer des infections légères mais persistantes, en particulier chez les individus présentant des conditions prédisposantes. Arda et coll. un cas de méningite à C. testostéroni a été signalé chez un patient atteint d’un cholestéatome récurrent. Cela pourrait indiquer que la vésicule biliaire est un site de colonisation pour de tels microorganismes. Notre patient a également montré une lithiase biliaire à l’échographie, mais la vésicule biliaire n’était pas enflammée. Ma et coll. a étudié la souche prototypique de la bactérie et a constaté qu’elle avait une faible capacité à métaboliser les glucides. Cependant, ils possèdent des gènes qui utilisent des acides gras aromatiques et à chaîne courte comme source de carbone, mais ont de mauvaises voies de métabolisation du sucre. Les sécrétions biliaires sont riches en acides gras, et théoriquement C. testosteroni peut prospérer dans l’environnement riche en bile de la vésicule biliaire, une hypothèse qui pourrait être étudiée.

Il s’agit d’une incidence rare de C. testosteroni étant un organisme prédominant dans la culture de selles primaires chez une femme âgée souffrant de colostomie in situ. Opota et coll. un cas de bactériémie à C. kerstersii a été signalé chez une femme de 65 ans dans un contexte de diverticulite et d’infection gastro-intestinale. Ils ont également isolé C. testosteroni dans un échantillon de selles d’un patient de l’Hôpital universitaire de Lausanne, en Suisse. L’hémoculture chez notre patient était stérile, peut-être parce qu’il n’y avait pas de fièvre avec la diarrhée. Cela pourrait également indiquer un déplacement local de la microflore intestinale, principalement des anaérobies, chez les patients atteints de colostomies. La plupart des laboratoires sont mal équipés pour détecter de tels agents pathogènes atypiques qui peuvent causer des maladies humaines dans certains contextes cliniques et confondre le tableau clinique. Par conséquent, les systèmes d’identification automatisés peuvent aider à identifier de tels isolats. En outre, la propagation rapide de la résistance aux médicaments chez les agents pathogènes environnementaux signale une alarme pour la fraternité médicale pour les options limitées d’utilisation d’antibiotiques qui leur restent pour le traitement des infections. Le cas de l’isolement des organismes environnementaux, principalement à partir de cultures de selles de patients souffrant de diarrhée, nous oblige à penser au-delà des pathogènes intestinaux normaux dans la relation causale des diarrhées dans des contextes cliniques spéciaux tels que le côlon irritable, la colite ulcéreuse, les colostomies, etc., Comamonas étant l’un d’entre eux. La myriade de microflore intestinale découverte par l’ambitieux projet Human Microbiome nous aiderait à mieux comprendre les relations complexes entre la microflore intestinale endogène et les bactéries environnementales transitoires qui peuvent éventuellement entraîner des troubles intestinaux. Nous pensons que de telles interactions doivent faire l’objet de recherches plus approfondies. De plus, des probiotiques tels que Lactobacillus casei, Saccharomyces boulardii et les bactéries lactiques Enterococcus sont connus pour être utiles pour raccourcir la durée de la diarrhée infectieuse aiguë et diminuer la fréquence des selles. Nous recommandons que les patients sous colostomies soient soumis à une prophylaxie probiotique, car ces patients ont souvent des antécédents de troubles intestinaux.

Remerciements

Les auteurs sont reconnaissants à Mme Shugufta Akhtar, technicienne de laboratoire, pour son travail.

Déclaration d’éthique

L’article a été rédigé conformément à la Déclaration de principes éthiques d’Helsinki de l’Association médicale mondiale pour la recherche médicale impliquant des sujets humains.

Déclaration de divulgation

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.

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Contacts de l’auteur

Dr. Shaika Farooq

Département de microbiologie

Collège médical gouvernemental

Srinagar (Inde)

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