Les souches congénitales
sont générées en laboratoire en accouplant deux souches consanguines (généralement des rats ou des souris) et en croisant les descendants de 5 à 10 générations avec l’une des souches originales, connue sous le nom de souche réceptrice. Généralement, la sélection pour le phénotype ou le génotype est effectuée avant chaque génération croisée. De cette manière, soit un phénotype intéressant, soit une région chromosomique définie dosée par génotype, est transmise de la souche donneuse à un fond de receveur par ailleurs uniforme. Des souris ou des rats congéniques peuvent ensuite être comparés à la souche réceptrice pure pour déterminer s’ils sont phénotypiquement différents si la sélection concerne une région génotypique, ou pour identifier le locus génétique critique, si la sélection concerne un phénotype.
Les congénères de vitesse peuvent être produits en aussi peu que cinq générations croisées, grâce à la sélection à chaque génération de progénitures qui non seulement conservent le fragment chromosomique souhaité, mais “perdent” également la quantité maximale d’informations génétiques de fond provenant de la souche donneuse. Ceci est également connu sous le nom de congénères assistés par des marqueurs, en raison de l’utilisation de marqueurs génétiques, généralement des marqueurs microsatellites, mais maintenant, plus généralement, des marqueurs de polymorphisme nucléotidique unique (SNP). Le processus peut être encore facilité par la superovulation des femelles, pour produire beaucoup plus d’œufs.
