トランスポゾン:トランスポゾンの種類|遺伝学

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トランスポゾンは複合トランスポゾンと複合トランスポゾンの二つのタイプがある。

1. 複合トランスポゾン:

複合トランスポゾンは、is要素の同一のコピーによって両端に隣接する抗生物質耐性遺伝子を運ぶ中央領域からなるものであるため、複合トランスポゾンは、転位に加えて薬剤耐性または他のマーカーを運ぶ(図。 8.32A)。 これは、より大きなトランスポゾンのクラスです。 よく研究されている複合トランスポゾンはTn5、Tn9、Tn10である。

トランスポゾンの図

Tn5元素はカナマイシン抵抗性(kanr)を示し、5,400塩基対のセグメントで構成され、セグメントの両端に1,450bpの逆リピートがある。 これは、ファージγからeの染色体に転置することができます。大腸菌およびK大腸菌染色体の遺伝子座から別の遺伝子座への。 遺伝子に挿入された場合、それは突然変異を引き起こす。

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Tn9トランスポゾンは、クロランフェムコール耐性(camr)のためのR因子由来遺伝子からなる。 薬剤耐性を付与する酵素は、Tnの中央に2,638個の配列からなり、両側に768bpの長さのIS1要素が隣接している。 Tn9IS1は端に小さい逆にされた繰り返しが付いている直接順序であります。

camrセグメントは、ファージp1を介してファージγと同様に、R因子からFエピソームに移動する。 T9は他のトランスポゾンとは不安定性が異なり、抗生物質耐性の高周波損失が発生する可能性があります。

Tn10はテトラサイクリン耐性遺伝子(tetr遺伝子)で構成されている。 それは1,400塩基対の両側に、反転繰り返しからなる9,300bpの長さです。 IS要素はIS10です。 Tn1 0は、R2 2 2(薬剤耐性プラスミド)からファージP2 2に移動させることができる。

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コンポジットトランスポゾンの構造:

コンポジットトランスポゾンでは、IS要素は反転または直接繰り返し構成にすることができます(図。 年8月31日)。 IS要素の両端は、それ自体が反転繰り返しです。 フランキングの相対的な向き(直接または反転)は、複合トランスポゾンの要素であり、その末端配列は変更されません。 したがって、直接繰り返しの腕を持つ複合トランスポゾンは、構造を持っています:腕L-中央領域–腕R.

構造は、腕が反転繰り返しである場合、腕L-中央領域–腕Rになります。 矢印は、左(L)から右(R)へのトランスポゾンの遺伝的マップの向きに応じた腕の向きを示しています(図2)。 8.31B,i-ii)。 複合トランスポゾンの特徴を表8.4に示します。

複合トランスポゾンと複合トランスポゾンの特性

さらに、複合トランスポゾンのモジュールが同一である場合もあります。 したがって、Tn10またはTn5のモジュールを区別することができます。 しかし、モジュールが同一である場合、Tn9のTn903に見られるように、両方ともトランスポゾンの動きを後援することができる。

モジュールが異なる場合、機能的能力も異なる可能性があります。 したがって、転置は、例えばTn10またはTn5のようなモジュールのいずれかに完全に依存します。 したがって、ISモジュールは、機能的な場合、それ自体または全体のトランスポゾンのいずれかを転置します。

複合トランスポゾン全体を転置する単一のモジュールの能力は、両方のモジュールがアクティブなままにするための選択的圧力の欠如を説明します。 ターゲットサイトの作成とトランスポゾンの端を認識するための両方を担当するトランスポザーゼアクティビティの要素コードです。 トランスポゾンが転置のための基質として機能するためには、端部のみが必要である。

2. 複雑なトランスポゾン(TnAトランスポゾンファミリー):

トランスポゾンのTnAファミリーには、Tn1、Tn2、およびTn3が含まれます。 TnAは非常に大きな要素(約500bp)で構成されています。 これらには、転位のためだけでなく、薬剤耐性のための遺伝子を運ぶ独立した単位が含まれています。 これらはIS型移調モジュールでの複合中継ではありません。 TnAファミリーには、Tn3とTn10が最もよく研究されているいくつかの関連するトランスポゾンが含まれています。

TnAファミリーは、Tn3トランスポゾンが1974年にHedgesとJacobによって細菌プラスミドから初めて発見されたことから、Tn3ファミリーという名前でも知られている。 Tn3は複素トランスポゾンの一例である。 これは、Tn10に見られるようにモジュール構造を取り、IS要素に基づいていません。 また、IS要素への進化的なリンクはありません。 TnaファミリーのTn3の基本的な構造について説明します。

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TnAファミリーのユニークな特徴の一つは、プラスミドへの同じトランスポゾンの複数の挿入を制限することです。 最も驚くべき発見は、同じ細胞内の他のプラスミドへの転置頻度は影響を受けないということです。 Heffron(1979)はトランスポゾンTn3のDNA配列の解析を行った。

TnAファミリーのトランスポゾンの構造:

TnAファミリーのトランスポゾンは、逆末端反復(38bpの長さが、IS様要素によって隣接していない)、内部res部位、およびtnpa、tnpR、amprなどの三つの既知の遺伝子で構成されている。

遺伝子tnpAはトランスポザーゼをコードし、tnpRはリゾルバーゼをコードする。 Ampr遺伝子(5bpの長さ)は、アンピシリンに対する耐性を付与するβ-ラクタマーゼの直接リピートおよびコードとして標的部位で生成される。 Res部位は、i、II、IIIの3つのサブユニットからなる(図1)。 8.33)

Rプラスミドとトランスポゾンの構造

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