マンダリウイルス属の推定新メンバーであるシトラスイエロー静脈クリアウイルスの同定と特性-Pubmedマンダリウイルス属の推定新メンバーであるシトラスイエロー静脈クリアウイルス

パキスタン、インド、そして最近ではトルコ、中国で報告されているレモンの木の黄色静脈クリア病の推定ウイルス原因物質であるシトラスイエロー静脈クリアウイルス(CYVCV)について、分子的特徴とゲノム組織を決定した。 Adana、トルコからのCYVCVの隔離集団Y1は、ウイルス誘発の小さいRNAの画分の深い配列決定の分析と草本および柑橘類の表示器の植物の機械および接木の接種のために使用された。 ポリクローナル抗血清は、phaseolus vulgarisから精製されたCYVCV-Y1から開発され、CYVCV-Y1のコートタンパク質を特徴づけ、関連するウイルスとの血清学的関係を決定す イルミナ配列の短い読み取りから組み立てられたContigsは、7,529ヌクレオチドの陽性センスRNAで構成され、六つの予測されたオープン読み取りフレームを含 CYVCVのゲノム組織と大きさはフレキシウイルスのそれに類似しており,配列相同性の検索により,インドシトラスリングスポットウイルス(ICRSV)(マンダリウイルス,アルファフレキシウイルス科)が最も密接に関連するウイルスであることが明らかになった。 しかし、CYVCVは、ICRSVと7 4%以上の全体的なヌクレオチド配列同一性を有していた。 二つのウイルスはゲノム組織,ウイルス粒子,草本宿主範囲に関して類似していたが,CYVCVは柑橘類で異なる症状を引き起こし,icrsvとは血清学的に異なっていた。 プライマー対を設計し,黄色静脈クリア症候性フィールドツリーだけでなく、移植片および機械的に接種された宿主植物上の従来の定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応によってウイルスを検出するために使用した。 これらのデータは,CYVCVが黄色静脈クリア病の原因物質であり,マンダリウイルス属の新種であることを示唆している。

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