出力形式

結果ページでは、各クエリシーケンスに対して、cTP/非cTP割り当てが基づいている名前、長さ、およびeuralネットワーク出力スコアが提示されます。 スコアが高いほど、この配列にはN末端葉緑体トランジットペプチド（cTP）が含まれているネットワークがより確実である。潜在的なＣＴＰ長も、対応するｃｌｅａｖａｇｅ部位スコアと共に提示される。 Transitpeptideの長さの予測は存在が予測されなくても遂行されることに注意して下さい。目的は、境界線の場合に最大限の情報を提供することです。

“詳細出力”を選択すると、各residueのニューラルネットワークスコアも表示されます。 このスコアが高いほど、この残基がcTPの一部であるというネットワーク。 また，ｎｅｔｗｏｒｋｓｃｏｒｅの導関数も示した。 このスコアは、cleavageサイトが検索される領域を見つけるために使用されます-すなわち、最高の派生スコアを持つtheresidueを囲む40残基の中で。 最後に、切断部位スコア（ＣＳ−スコア）を各残基について提示する。 このスコアは，ＭＥＭＥと呼ばれる自動モチーフ発見アルゴリズムから導出された行列のascoringから計算される。 切断部位スコアは、予測された切断部位が40残基の中で最も高い得点残基の直接末端であるように定義される。 したがって、提案されたCTPの長さよりも大きいCSスコアが一つまたは複数存在するが、それらは最も高い派生スコアの周りの40residuesの外側に位置しているため、提示されたcTPの長さは依然として最も可能性の高いpresequenceの長さ（すなわち）とみなされる。 最も可能性の高い切断部位に対応する）。

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