染色体立体配座キャプチャ

はじめに

染色体立体配座キャプチャ（3C）は、固定細胞内の染色体DNAの空間組織を検出するために使用される技術です。 核内で空間的に近接しているか、または物理的相互作用（遺伝子と調節要素との間のものなど）に関与しているＤＮＡ配列を定量的に評価して、それらの会合の頻度および／またはそれらの近接性を潜在的に反映する尺度を提供することができる。 3Cは、同じ染色体上のDNA配列間（染色体内）または異なる染色体間（染色体間）の長距離相互作用を研究するために使用することができる。 簡単に言えば、近接しているクロマチン断片はホルムアルデヒドで固定され、続いて制限酵素による消化、核溶解、架橋複合体の希釈、および分子内結 その後、架橋は除去され、ＤＮＡは精製される。 ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）は、調査中のDNA配列のペアに特異的なプライマーを使用して、新規ライゲーション接合を含むDNA断片を増幅するために使用されます。 ここでは、詳細な3Cプロトコルとcisまたはtransで、任意の二つのゲノム領域の核並置を調査するために適用することができる実験的なコントロール