Roche Cobas4800HPV検査の臨床成績 | Jiotower
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ヒトパピローマウイルス(HPV)は、世界的に最も一般的な性感染ウイルスの1つであり、がんの主要な原因であり、欧州では年に約60,000件の新規がん症例を引き起こし(1)、女性の子宮頸がんの発症につながる。 HPV16およびHPV18は、HPV16またはHPV18感染症に存在するすべての子宮頸がんの約70%として、最も発癌性があります(2、3)(4)。 子宮頸がんのほぼ30%は、最初の子宮頸部細胞診スクリーニング(5)によって見逃されているので、より敏感な分子技術を使用してHPV関連子宮頸がんの正確かつ客観的な検査は、将来のリスクと子宮頸がんの発生率を減らすために効果的な予防と治療を提供するために必要である。
Roche Cobas4800HPVテスト(Cobas)は、リアルタイムPCR(RT-PCR)(6、7)に基づく新しい分子法で、完全に自動化されたシステムにより、迅速かつ効率的なサンプル処理が可能です。 CobasはHPV16、HPV18、12の他の危険度が高いHpv(hrhpv)(HPV31)を検出できます, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, および-68、プールされた結果として)、およびβ-グロビンは同じPCRで独立して制御する。 私たちの研究の主な目的は、Cobasの技術的および臨床的性能特性を評価することでした。 6,056人の女性からの子宮頸部サンプルは、2011年から2012年の間に子宮頸部病変の定期的な検査のためにシナイ山のIcahn School of Medicineの病理学部門に呼ばれ、液体ベースの細胞学培地(PreservCyt)に収集された。; Hologic、Marlborough、MA)を使用するまで4℃で保存した。
百八十の標本は、Roche Cobas4800HPVテストとDigene Hybrid Capture2(HC2)hrHPV DNAテスト(表1)の両方によってhrHPV遺伝子型について試験され、線形アレイ(LA)HPV遺伝子型テスト(Roche Molecular Systems,Pleasanton,CA)(8)を使用して不一致が解決された。 ピアソンのカイ二乗検定によると、2つのHPV検定によって同定された陽性サンプルと陰性サンプルの数に有意差があった(P<0.001)。 しかし、2つの検定間の一致は統計的に強く、一致レベルは88.33%(P=0.0218)、コーエンのκ係数は0.767(95%信頼区間、0.674~0.860;P<0.001)で、κ値の95%信頼区間は二項分布か
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HC2とCobas HPVテストの比較
Cobas HPVテスト結果 | いいえ。 HC2HPVテストの結果が付いているサンプルの | |||
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HPV+ | HPV− | 不定 | 合計 | |
HPV+ | 72 | 15 | 7 | 94 |
HPV− | 4 | 80 | 2 | 86 |
合計 | 76 | 95 | 9 | 180 |
不和なサンプルでは、LA HPVテストはHC2陽性だったサンプルの50%(2/4)の低危険HPV(lrHPV)の遺伝子型を検出しました Cobas陰性であり、HC2陰性およびCobas陽性であったサンプルの13.33%(2/15)である。 HPV53はHc2陽性およびCobas陰性であった二つのサンプルで発見され、Digene kitのプローブがこのHPV遺伝子型と交差反応したことを示唆している。 LrHPV遺伝子型、具体的にはHPV53とのHC2試験の交差反応性が以前に観察されたので、この観察は驚くべきことではない(9)。 HPV試験におけるlrHPV遺伝子型交差反応性の結果は、偽陽性結果の数の増加である。 これはlrHPVの遺伝子型だけ所有し、子宮頸癌を開発する危険度が低いに実際にある女性のフォローアップのテストによってoverinvestigationおよびovertreatmentの原因となるこ 二つのHC2陰性/Cobas陽性サンプルでは、HPV62およびHPV89(CP6108)は、両方のサンプルで検出され、hpv42、HPV54、HPV55、HPV61、HPV70、およびHPV84は、混合HPV感染がCobas HPVテストによっ
LA HPV試験は、HC2陽性およびCobas陰性であったサンプルのいずれも(0/4)およびHC2陰性およびCobas陽性であったサンプルの80%(12/15)でhrHPV遺伝子型を検出した。 HC2テストはHc2テストがCobasテストよりより多くのhrHPVの遺伝子型を逃したことを示すこれらのサンプルのHrhpvを検出しなかった、Cobasがよりよい感受性お 対照的に、HPVは、HC2陰性/Cobas陽性サンプルの6.67%(1/15)でLA HPV試験によって検出されなかった。 しかし、全体として、HC2試験とCobas試験との間のhrHPVの検出における差は、依然として統計的に有意ではなかった(σ2=2.901、P=0.0885)。次に、Cobas HPV試験の再現性を決定するために、68個のサンプルを使用しました。 標準的な2行2列の分割表で計算した初期試験と反復試験の間の再現性は93.55%であり、Cobas試験の1回目と2回目の結果の間のカッパ係数は0.869(95%CI、0.744~0.993;P<0.001)であった。 この一致の強さは非常に良いと考えられ,アッセイが信頼性が高いことを示唆した。
Cobas HPVテストによって百八十から七のサンプルをテストし、事前に液体化されたサンプルと後に液体化されたサンプルのHPV検出の違いを決定しました。 不一致は7サンプルのみで、割合は3.74%(95%CI、1.02%~6.46%)でした。 統計的分析は、事前に引用されたサンプルと後に引用されたサンプルの差が有意ではなかったことを明らかにした(λ2=0.233、P=0.36290)。 HPV陽性率の増加は細胞診プロセスの前後に観察されなかったので(prealiquot対postaliquot)、細胞診プロセス中の標本の交差汚染は非常にまれである。 細胞診後のHPV検査は、異常な細胞診のための反射HPV検査が意図されている場合、ワークフローを大幅に改善し、不要なaliquotingを減らすことができます。
最後に、5,621個のサンプルをCobas HPVテストを使用してテストし、vortexingとswirling(Cobasテスト前)が故障率に及ぼす影響を決定しました。 Vortexingによって処理された1,380サンプルのうち、故障率は4でした。57%(95%CI、3.65%~5.91%)。 対照的に、旋回によって処理された4,241サンプルのうち、故障率は1.16%(95%CI、0.84%〜1.48%)であった。 ピアソンのカイ二乗検定では、渦動サンプルと穏やかに旋回したサンプルの故障率の差が非常に有意であり(σ2=59.983、P<0.0001)、穏やかな旋回はCobasの故障率を減少させることが推奨されていることが明らかになった。結論として、Cobas4800HPV試験は、Digene HC2hrHPV試験よりもhrHPV遺伝子型の検出における感度および特異性の程度が高いことを示した。 Cobas試験はまた、より少ない偽陽性例によって証明されるように、HC2試験よりもlrHPV遺伝子型との交差反応性のレベルが低かった。 ただし、これらの2つのテストの全体的なパフォーマンスの差は統計的に有意ではありません。