전산 게놈

전산 게놈의 뿌리는 생물 정보학의 것과 공유됩니다. 1960 년대에 마가렛 데이 호프와 국립 생물 의학 연구 재단의 다른 사람들은 진화 연구를 위해 상동 단백질 서열의 데이터베이스를 수집했습니다. 그들의 연구는 특정 단백질이 기본 아미노산 서열에 따라 다른 단백질로 변하는 데 필요한 진화 적 변화를 결정하는 계통 발생 나무를 개발했습니다. 이것은 그(것)들을 또 다른 한개와 관련있는 1 개의 단백질의 가능성을 사정하는 득점 모체를 창조하는 지도했습니다.

1980 년대부터 게놈 서열 데이터베이스가 기록되기 시작했지만,이는 유전자 정보의 데이터베이스를 검색하고 비교하는 형태로 새로운 도전을 제시했다. 구글이나 위키피디아와 같은 웹 사이트에서 사용되는 텍스트 검색 알고리즘과는 달리 유전적 유사성 섹션을 검색하려면 단순히 동일하지는 않지만 유사한 문자열을 찾아야 합니다. 이는 데이호프의 초기 연구에서 파생된 채점 행렬을 사용하여 아미노산 서열 세트를 서로 비교하는 동적 프로그래밍 알고리즘이다. 나중에 폭발 알고리즘은 유전자 서열 데이터베이스의 빠르고 최적화 된 검색을 수행하기 위해 개발되었습니다. 폭발과 그 파생물은 아마도이 목적을 위해 가장 널리 사용되는 알고리즘 일 것입니다.

“전산 유전체학”이라는 문구의 출현은 1990 년대 중반에서 후반에 완전한 서열화 된 게놈의 가용성과 일치한다. 전산 유전체학에 대한 연례 회의의 첫 번째 회의는 게놈 연구소의 과학자들에 의해 조직되었다(티그르)에서 1998,이 전문 분야에 대한 포럼을 제공하고 효과적으로 게놈 또는 전산 생물학의 일반적인 분야와 과학의이 영역을 구별. 메드 라인 초록에 따르면 과학 문헌에서이 용어의 첫 번째 사용은 핵산 연구에서 불과 1 년 전이었습니다. 최종 전산 유전체학 회의는 노벨상 수상자 배리 마샬,헬리코박터 파일로리와 위궤양 사이의 링크의 공동 발견 자에 의해 기조 연설을 특징으로,2006 년에 개최되었다. 2014 년 현재,현장에서 선도적 인 회의는 전산 분자 생물학(재조합)에서 분자 생물학(이엠비)및 연구를위한 지능형 시스템을 포함한다.

컴퓨터 지원 수학(매스매티카나 매트랩과 같은 제품 사용)의 개발은 엔지니어,수학자,컴퓨터 과학자가 이 영역에서 작업을 시작할 수 있도록 도왔으며,전체 게놈 비교에서 유전자 발현 분석에 이르기까지 공개적인 사례 연구 및 시연 모음이 증가하고 있습니다. 이것은 시스템 및 제어,정보 이론,문자열 분석 및 데이터 마이닝의 개념을 포함하여 다양한 아이디어의 도입을 증가 시켰습니다. 전산 접근법이 연구 및 교육을위한 표준 주제가되어 남아있을 것으로 예상되며,두 주제에 능통 한 학생들은 지난 몇 년 동안 만들어진 여러 과목에서 형성되기 시작합니다.

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