Identifikasjon, prevalens Og patogenitet Av Colletotrichum-arter som forårsaker anthracnose Av Capsicum annuum I Asia

Morfologiske observasjoner Og fylogenetiske data av de rette conidia-artene identifiserte tydelig tre nye arter, to Fra Indonesia og En Fra Taiwan. Detaljerte morfologiske beskrivelser er gitt nedenfor for Alle Colletotrichum arter assosiert med chili antracnose (Tabell 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB826936.

Figur 6 Etymologi: Oppkalt Etter Java, øya I Indonesia hvor arten ble samlet.

Diagnose: Colletotrichum javanense skiller Seg fra c. brisbanense i å danne forskjellige chlamydospores og acervular conidiomata på alle testede medier. C. brisbanense produserte Kun Conidiomata på Anthriscus-stammen, men ingen basale celler ble observert. I tillegg vokser c. javanense raskere enn c. brisbanense (C. javanense PÅ OA, MEA og SNA 60, 55 og 66 mm diam i henholdsvis 7 d, C. brisbanense på OA og SNA 18,5, 20 mm diam i henholdsvis 7 d). Colletotrichum javanense er fylogenetisk forskjellig Fra C. brisbanense med begge arter som er forskjellige i sekvensene av chs-1, og mest effektivt med gapdh (7 bp forskjell) og his3(4 bp forskjell).

Type: Indonesia: Vest-Java, Purwakata regency, på frukt Av Capsicum annuum, Desember. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963-holotype; CBS 144963 = UOM 1115 = ewindo 3-ex-type kulturer).

Beskrivelse: Seksuell morph ikke observert. Aseksuell morph på PDA. Vegetativt mycelium 1-5 µ diam, hyalin, glattvegget, septat, forgrenet hyphae. Chlamydosporer globose eller langstrakte, lysebrune, glatte vegger, 5-25 × 3-8 µ. Conidiomata acervular, setae ikke observert. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 µ, apex 1-3 µ diam. Conidia hyalin, aseptat, glattvegget, for det meste fusiform, den ene enden avrundet, den andre enden akutt, eller begge ender akutt (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µ. Conidia i masse gul til oransje farge. Appressoria enkelt eller i løse grupper, middels brun, glattvegget, subglobose eller elliptisk, med hele eller undulate margin, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µ.

Aseksuell morph på SNA. Vegetativt mycelium 1-7 µ diam, hyalin, glattvegget, septat, forgrenet hyphae. Chlamydospores globose eller langstrakt, lysebrun, glattvegget, 4.5-28 × 4-8@m. Conidiomata acervular, setae ikke observert. Conidiophores hyaline, septate, forgrenet, 20-35 µ lang. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk eller ampulliform, 5-20 µ, apex, 1-3 µ diam. Conidia hyaline, aseptat, glattvegget, sylindrisk med begge ender akutt eller en ende rund og en ende akutt, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µ. Conidia i masse med gul til oransje farge.

kulturkarakteristikker: Kolonier på PDA 48-54 mm diam i 7 d (6,5-7,5 mm / d), flate med hele margen; overflate dekket med grått til olivengrønt kort antennemycel, marg hvit til lysegrå, omvendt hovedsakelig kremhvit, olivaceous grå til svart i midten. Gul til oransje acervular conidiomata. Kolonier på SNA var 60-66 mm diam i 7 d (8-9, 5 mm/d), flate med hele margen, hyalin til lysebrun, overflate dekket med kort grå luftmycel, omvendt samme farger. Oransje acervular conidiomata i sentrum av kulturen. Kolonier på OA var 55-60 mm diam i 7 d (7,8-8,5 mm / d), flat med hele margen; overflate dekket med krem til grå kort antenne mycelium, margin hvit, omvendt hovedsakelig lys oransje, med brune pigmenter. Oransje acervular conidiomata. Kolonier på MEA overflate lysegrå kort antennemycel, omvendt lys oransje.

Merknader: den nærmeste kampen i et blastn-søk med gapdh-sekvensen var GenBank JQ948617, C. sloanei strain IMI 364297 MED 98% identitet (4 bp-forskjeller), mens de nærmeste kampene med his3-sekvensen med 99% identitet (2 bp-forskjeller) Var GenBank JQ949279 C. indonesiense stamme CBS 127551 Og GenBank KJ947248 C. guajavae isolere OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827691.

Figur 7 Etymologi: Oppkalt Etter Makassar, byen I Sør-Sulawesi, Indonesia, hvor arten ble samlet.

Diagnose: Colletotrichum makassarense er fylogenetisk nært beslektet Med c. tropicale. Sekvensdata fra ITS kunne ikke skille de to artene, men de kan skille seg fra alle andre gener som er testet og mest effektivt ved Hjelp Av ApMat (22 bp-forskjeller) og gs (18 bp-forskjeller) sekvensdata.

Type: Indonesia: Makassar, fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664-holotype; CBS 143664 = CPC 28612-ex-type kulturer).

Beskrivelse: Seksuell morph ikke observert. Aseksuell morph på OA. Vegetativt mycelium bestående av hyalin, glattvegget, septat, forgrenet hyphae, 2-3 µ diam. Klamydosporer ikke observert. Setae til stede, medium brun, 40-55 × 3-5 µ, 2-3-septat, avsmalnende til akutte apices. Conidiomata acervular, 100-200 µ diam, med oransje konidiale masser. Konidioforer subsylindrisk, fleksuøs, 1-4-septat, hyalin, glatt, forgrenet, 15-45 × 3-4 µ. Konidiogene celler subcylindrisk, hyaline, glatt, phialidic med periclinal fortykkelse, 7-25 × 3-4 µ. Conidia hyaline, glatt, aseptat, subsylindrisk, rett, apex stump, avsmalnende på basen til utstående avkortet hilum, 1 µ diam, tydelig guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µ. Appressoria ensom, medium brun, glattvegget, subglobose, ellipsoidal til obovate, hele margen, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µ.

kulturkarakteristikker: Kolonier på PDA 45 mm diam etter 7 d (6,5 mm / d), kolonier flate, med moderat luftmycel, på oa-overflaten røykgrå. På PDA overflaten røykgrå, omvendt olivaceous grå. På MEA overflate skitten hvit, omvendt oker.

Merknader: den nærmeste kampen i et blastn-søk med ApMat-sekvensen var GenBank KU923732, c. queenslandicum-stamme AUS22 med en 98% identitet (16 bp-forskjeller), mens den nærmeste kampen med gs-sekvensen med 99% identitet (7 bp-forskjeller) Var GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24. De beste kampene med gapdh-sekvensen var GenBank KX578784 C. siamense (99% identitet, 3 bp-forskjeller) Og GenBank KU221347 c. queenslandicum (99%, identitet, 3 bp-forskjeller).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827692.

Figur 8 Etymologi: Oppkalt Etter Tainan, Byen I Taiwan hvor arten ble samlet.

Diagnose: Colletotrichum tainanense skiller seg fra sin nærmeste fylogenetiske nabo C. salsolae i kulturen kjennetegn PÅ PDA, sparsom antenne mycelium og blek mus-grå overflate mycelium, Mens C. salsolae produserer et lag av acervuli-lignende strukturer med dype oransje brun conidial masser og mange setae. De to artene er separerbare ved hjelp av alle de testede genene unntatt DENS og mest effektivt med gapdh (7 bp forskjell), tub2 (6 bp forskjell) og act (5 bp forskjell) sekvenser. Det er bare en bp-forskjell i chs-1-sekvensen mellom de to artene.

Type: Taiwan: Tainan: på frukt Av Capsicum annuum, August. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666-holotype; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298-ex-type kulturer).

Beskrivelse: Seksuell morph ikke observert. Aseksuell morph på PDA. Vegetativt mycelium forgrenet, hyalin, glattvegget, septat, hyphae 2-3 µ diam, melanisert med tiden. En enkelt conidioma funnet på EN PDA plate, steril PÅ SNA, MEA, OG OA. Chlamydospores og setae ikke observert. Conidiophores subcylindrical, flexuous, 1-2-septat, hyalin, glatt til lysebrun, forgrenet. Konidiogene celler subcylindrisk, hyalin, glatt, phialidic med periclinal fortykning. Conidia hyaline, glatt, aseptat, subsylindrisk til subklavat, rett eller svakt buet, apex stump, avsmalnende ved basen til utstående avkortet hilum, 1.5-2 µ diam, tydelig guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µ. Appressoria enkelt eller i løse grupper, ofte smal-sylindriske, medium til mørk brun, ofte avsmalnende mot apex, kanten hele eller undulate noen ganger uregelmessig flikete (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µ.

kulturkarakteristikker: Kolonier på PDA 45 mm diam etter 7 d (6,5 mm / d), kolonier flate, med moderat luftmycel. På oa overflaten blek mus-grå. På PDA overflaten blek mus-grå, omvendt mus-grå. På mea overflaten blek mus-grå, omvendt olivaceous grå.

Merknader: det nærmeste treffet i et blastn-søk med gapdh-sekvensen med 99% identitet (2 bp-forskjell) var GenBank KC790761 Colletotrichum sp. stamme MTCC 9664 mens nærmeste kamp med act sekvens med 99% identitet (2 bp forskjell) Var GenBank KY995522 C. siamense stamme LJDY1-2. Den nærmeste match med tub2 sekvens med 99% identitet (7 bp forskjell) Var GenBank MF143931 C. siamense stamme 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Mangfold 61: 112 (2013); som ‘endophytica’.

Beskrivelse: Kolonier på PDA 42 mm diam etter 7 d (5,5 mm / d), blek oransje til hvitt luftmycel; omvendt blek hvit til oransje og svart i midten og mange oransje conidiomata spredt over overflaten. Klamydosporer ikke observert. Conidiomata tilstede, conidiophorer dannet direkte på hyphae. Setae til stede, moderat brun, 47-95 × 3-6 µ, 3-4-septat, avsmalnende akutte apices. Conidiophores hyaline, glattvegget og uforgrenet. Konidiogene celler hyalin, glattvegget, aseptat, subcylindrisk, 12-21 × 3-4 µ. Conidia hyaline, glattvegget, aseptat, rett, sylindrisk med to ender stumpe, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µ. Appressoria singel eller i løse grupper, brun, litt flikete, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µ.

Merknader: Colletotrichum endophyticum ble først beskrevet som en gressendofyte Av Pennisetum purpureum fra nord-Thailand (Manamgoda et al. 2013). Senere ble det rapportert fra flere andre vertsarter, inkludert Capsicum I Kina (Diao et al. 2017). Lengden på conidia av isolatet Fra Thailand (UOM 1137) var litt kortere enn ex-typen (LC0324) Av C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µ).

materiale undersøkt: Thailand: Kanchanaburi: fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1137 = F5-2d).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al., Fung. Mangfold 39: 158 (2009).

Beskrivelse: Kolonier på PDA 65 mm diam etter 7 d (8,5-11 mm/d), flate med hele kanten, antennemycel tett, bomullsaktig, blekgrå til hvit antennemycel og tallrike svarte stroma spredt over overflaten, grå i midten, hvit i margen; omvendt grågrønn. Klamydosporer ikke observert. Conidiomata acervular, Setae ble observert, brune, glatte vegger, 1-2-septat, 60 µ lange, avsmalnende akutte apices. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5@m. Conidia hyaline, aseptate, glattvegget, sylindrisk, begge ender stumpe, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria ikke observert.

Merknader: seksuell morph av disse isolatene ble ikke observert i kultur. Conidial lengde av isolere CPC 28644 var litt lenger enn ex-typen (ICMP 18581 = BPD-I16) av C. fructicola (conidia 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

Materiale undersøkt: Thailand: Chiang Mai: fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulturer CPC 28644 og CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, fra frukt lesjon av moden rød frukt Av Capsicum sp. (søt pepper), 22 Apr. 2015, Z. M. Sheu (kultur UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, fra fruktlesjon av grønn frukt Av Capsicum sp. (søt pepper), 4 Sep. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (kultur UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti Du L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); som ‘karstii’.

Beskrivelse: Kolonier på PDA 65 mm diam etter 7 d (6,5–10.5 mm/d), flatt med hele kanten, oransje til hvitt luftmycel og mange oransje konidiale masser spredt over overflaten, hvit i margen; omvendt gul til oransje. Klamydosporer ikke observert. Conidiomata acervular, setae ble observert, brun, glattvegget, 2-4-septat, 60 µ lang, bunn neddykket, konisk mot apex, spiss hovedsakelig akutt. Conidiophores hyalin, septat, forgrenet, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µ. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk eller ampulliform, 7-15, 5@m. Conidia hyaline, aseptat, glattvegget, kort, sylindrisk, begge ender stumpe eller den ene enden litt akutt eller avkortet ved basen, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µ. Appressoria enkelt eller i løse grupper, brun, subglobose, sirkulær omriss, 6-12. 5 × 3.5-8 µ.

Merknader: de fire isolatene identifisert fra Indonesia i boninense-komplekset produserte distinkte korte conidia sammenlignet Med ex-epitypekulturen Til C. karsti (14.5–17 × 5-6, 5 µ; Yang et al. 2011). Men høy variasjon av conidia størrelse mellom forskjellige stammer Av C. karsti ble rapportert Av Damm et al. (2012a, 2012b) hvor conidia målinger av CBS var 129833(11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, gjennomsnitt ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm; og CBS 111998 hadde en conidium lengde opp til 18.5 µm, L/B-forhold = 2.8. Disse isolater ikke danner en seksuell morph i kultur. Selv om disse fire isolatene dannet en fullt støttet (100% BS/1 PP) underklasse innen c. karsti, ga ikke alle de enkelte gentrær (data ikke vist) betydelig støtte for å rettferdiggjøre innføring av en kryptisk art for disse isolatene.

materiale undersøkt: Indonesia: Jeneponto, fra frukt lesjoner Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28553, CPC 28554); fra frukt lesjon av modne røde frukt og peduncle lesjoner Av Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum Plurivorum Damm et al. Hingst. Mycol. 92: 31 (2019).

Beskrivelse: Kolonier på PDA 63 mm diam etter 7 d (8 mm / d), grå til mørk brun luftmycel; omvendt grå til lys brun med gul-oransje i midten med rikelig acervular conidiomata som oser blek oransje conidial massene i sentrum, Chlamydospores ikke observert. Conidiomata tilstede (nær inokuleringspunktet), conidiophorer dannet direkte på hyphae. Sclerotia tilstede. Setae tilstede, medium brun, 94-125 × 4-6 µ, 1-4-septat, avsmalnende mot akutte apices, ofte med en innsnevring ved apices. Conidiophores hyaline til lysebrun, glattvegget, septat og forgrenet. Konidiogene celler hyalin, glattvegget, aseptat, subcylindrisk, rett til forsiktig buet, 26-48 × 3-4 µ, phialidic, periclinal fortykning iøynefallende. Conidia hyaline, glattvegget, aseptat, rett, sylindrisk med to ender stumpe eller en ende litt akutt, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µ. Appressoria enkelt eller i løse grupper, middels brun, uregelmessig i form, crenate eller flikete omriss, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µ. Seksuell morph på PDA. Ascomata perithecia, dannet etter 2 uker., ensom, semi-nedsenket eller nedsenket i agarmediet, ikke-stromatisk, subsfærisk til ovoid, ostiolat, glabrous, medium brun, 96-130 × 160-200 µ. Peridium 10-12, 5 µ tykk, sammensatt av bleke til middels brune flatete vinkelceller 3.5-10 µ diam. Ascogenous hyphae hyaline, glattvegget, delikat, sjelden synlig. Interascal vev ikke observert. Asci-enhet, 8-sporet, sylindrisk, avsmalnende til topp og base, glattvegget, 51-65 × 9.5-13 µ, basen avkortet. Ascosporer biseriately arrangert, aseptat, hyalin, glattvegget, fusiform, svakt buet, base avrundet, apex akutt eller avrundet, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µ,

Merknader: den konidiale lengden på de undersøkte isolatene (CPC 28638, CPC 28639) var variabel og falt innenfor området ex-type isolat (CBS 125474) Av C. plurivorum (15-17 × 5.5 µ; Damm et al. 2019).

Materiale undersøkt: Thailand: Chiang Rai, fra blad lesjoner Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor (cultures CPC 28638 og CPC 28639); Bangkok, restaurant I Phaya Thai-området, infisert vev Av Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (kultur UOM 1004).

Colletotrichum Scovillei Damm et al. Hingst. Mycol. 73: 100 (2012).

Decription: Kolonier PÅ PDA 20-38 mm diam etter 7 d (5-6.2 mm/d), flatt med hele margen; overflate dekket med kort lys rosa til oransje luftmycel, blir grå med tiden, margen hvitaktig til blek rosa, omvendt rosenrød buff, olivaceous grå til brungrå i midten; omvendt oransje til laks, mørk i midten. Klamydosporer ikke observert. Conidiomata acervular, setae ikke observert, Conidiophores hyalin, septat, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 µ, apex 1-3 µ diam. Conidia hyaline, aseptate, glattvegget, mest fusiform, den ene enden avrundet, den ene enden akutt, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia i masse med laks til oransje farge. Appressoria enkelt eller i løse grupper, medium brun, ovoid, hele til crenate margin, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µ.

Merknader: flertallet av isolater identifisert Som C. scovillei hadde lignende sporeform og sporestørrelser, sammenlignet med typeprøven (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µ, beskrevet av Damm et al. (2012a, 2012b). Noen isolater hadde imidlertid varierende kolonifarge, forskjellige kolonivekstnivåer og små forskjeller i sporemålinger.

Materiale undersøkt: Indonesia: Gowa, fra frukt lesjoner Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28577 OG CPC 28579); Vest-Java :fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, Desember. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thailand: Chiang Mai: fra frukt lesjoner Av Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (kulturer UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum Siamense Prihast. et al., Fung. Mangfold 39: 98 (2009)

Beskrivelse: Kolonier på PDA 79 mm diam i 7 d (5,5–6 mm/d). Lysegul-hvit, grå, tett bomullsaktig luftmycel med oransje acervular conidiomata i midten; omvendt lysegul. Klamydosporer ikke observert. Conidiomata acervular, conidiophores dannet på en pute av runde og middels brune celler. Setae ikke observert. Conidiophores hyaline, forgrenet. Konidiogene celler hyalin, sylindrisk til ampulliform, 6.5–16 µ Conidia hyaline, aseptat, glattvegget, fusiform til sylindrisk, begge ender helt avrundet, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µ. Appressoria mørk brun, ensom, sirkulær, hele til crenate margin, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µ.

Merknader: Colletotrichum siamense isolater fra forskjellige land viste variasjon av morfologiske tegn, i vekstrater og kulturmorfologi på PDA. Representative konidiale målinger for isolater som representerer forskjellige subclades i fylogenetiske trær (Fig. 2, 3) er: CPC 30233 (Gowa, Indonesia), 12.5–17 x 2,5–5.5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thailand), 9.5–14.5 × 3.5–5 µm; UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thailand) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10.5–16.5 × 3.5–5.5. Disse morfologiske tegnene i en underklasse var svært konsistente i hvert land. Arten ble beskrevet Av Prihastuti et al. (2009); conidia av ex-holotype prøven (ICMP 18578 / BDP-I2) ble rapportert som 7-18.3 × 3-4, 3 µ (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), som omfatter området observert i våre isolater. Denne arten ble rapportert å være biologisk og geografisk mangfoldig, og finnes på mange verter over flere tropiske og subtropiske regioner (Weir et al. 2012).

materiale undersøkt: Indonesia: Gowa, fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30233); Jeneponto ,fra fruktlesjon Av Capsicum sp. 7 Juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30209). Thailand: Ratchaburi, fra frukt lesjon Av Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1132); Kanchanaburi ,fra frukt lesjon Av Paprika sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1126 = F4-1c). Sri Lanka: Kandy, fra frukt lesjon Av Capsicum sp. Sep. 2013 ,D. D. De Silva & N. Ranathunge (kultur UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

Beskrivelse: Kolonier på PDA 45 mm diam i 7 d (6.5 mm / d). Kolonier flat, sprer seg, med moderat antenne mycelium, på OA overflaten røyk grå. På PDA overflaten olivaceous grå å røyke grå, omvendt olivaceous grå, mange oransje conidiomata spredt over overflaten. På MEA overflate skitten hvit, omvendt oker. Aseksuell morph på OA. Vegetativt mycelium bestående av hyalin til lysebrunt, glattvegget, septat, forgrenet, 2-2, 5 µ diam hyphae. Klamydosporer ikke observert. Setae sjeldne (bare to sett), rett, middels brun, fin verruculose, 2-3-septat, til 120 µ lang, apex subobtusely avrundet. Conidiomata acervular, 150-250 µ diam, med oransje konidial masse. Konidioforer subsylindrisk, fleksuøs, 1-3-septat, hyalin, glatt, forgrenet, 15-25 × 3.5-4.5 µ. Konidiogene celler subsylindrisk, hyalin, glatt, phialidisk med periclinal fortykkelse, 7-15 × 3.5-4.5 µ. Conidia hyaline, glatt, aseptat, subsylindrisk, rett, apex stump, avsmalnende ved basen til utstående avkortet hilum, 1.5-2 µ diam, tydelig guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µ. Appressoria ikke observert. Seksuell morph ikke observert.

Materiale undersøkt: Indonesia, Makassar, fra frukt lesjon Av Capsicum annuum, 7 Juni. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 28607).

Prevalens av Samplede Colletotrichumarter

Totalt Var C. truncatum den mest utbredte arten (44%) isolert fra infisert chilifrukt (Fig. 9) og ble lett identifisert av sine falcate sporer og rikelig setae i nekrotiske lesjoner. Av artene med rett conidia var C. scovillei (acutatum complex) den vanligste arten i de undersøkte landene (35%), bortsett Fra Sri Lanka hvor denne arten ikke var isolert. Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) var den nest vanligste arten som oppstod I Thailand, Sri Lanka og Indonesia (11%). De resterende artene var representert av færre enn 10% av det totale antall isolater.

I Indonesia, C. scovillei ble isolert fra infisert chili frukt i alle undersøkte regencies Av Sør-Sulawesi, unntatt I Makassar, og i feltforsøk i Vest-Java. Colletotrichum siamense ble også isolert fra hele regionen, Fra Gowa, Jeneponto Og Makassar. De to nye artene, c. makassarense og c. javanense, ble isolert fra Henholdsvis Makassar og Vest-Java.

I Thailand ble C. scovillei isolert hovedsakelig fra De nordlige provinsene Chiang Mai og Chiang Rai, men ble også hentet fra infisert chilifrukt i Et prøvested Ved Kasetsart University I Nakhon Pathom. De Vestlige provinsene hadde en høy forekomst Av c. siamense og en isolat Av c. endophyticum ble samlet inn Fra Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum ble isolert fra chiliblader med nekrotiske lesjoner I Chiang Rai og fra nekrotiske lesjoner av chilifrukt funnet i en restaurant I Phaya Thai-området I Bangkok. I tillegg ble c. fructicola identifisert fra frukt samlet fra Chiang Mai.

I Taiwan ble et isolat identifisert som en ny art, C. tainanense, samlet fra infisert chilifrukt I tainan-provinsen, Og C. fructicola ble identifisert fra frukt I Hsinchu og Nantou, Taiwan. Colletotrichum plurivorum ble også identifisert fra en frukt samlet i Johor, Malaysia.

Patogenitet

Alle Colletotrichumartene forårsaket antracnose symptomer på såret frukt, men det var signifikante forskjeller i alvorlighetsgraden av symptomene. På sårede frukter viste isolatene C. scovillei og c. javanense den høyeste alvorlighetsgraden av sykdommen, og produserte store, nekrotiske lesjoner med gjennomsnittlig lesjonsstørrelse 15,6–20,3 mm(Tabell 5). På ikke-sårede frukter var alle arter mindre patogene, med gjennomsnittlig lesjonsstørrelse mindre enn 10 mm. Colletotrichum makassarense, c. tropicale og C. plurivorum, produserte kun svært små lesjoner eller ingen synlige symptomer (gjennomsnittlig lesjonsstørrelse < 1 mm) 10 d etter inokulering av ikke-sårede frukter. Kolletotrichum javanense og c. scovillei isolater var de mest patogene i ikke-såret frukt og produserte lesjoner med gjennomsnittsstørrelser på henholdsvis 9,4 og 9,1 mm. Lesjoner forårsaket Av C. scovillei var signifikant større enn de som ble forårsaket av alle andre arter unntatt C. javanense i såret frukt og c. endophyticum i ubundet frukt. Betydningen av de parvise t-testene er sterkt avhengig av antall isolater av hver art som er samplet, slik at grupperingene vist i Tabell 5 ikke bare endres med størrelsen på forskjellen på midlene; en stor forskjell kan ikke være signifikant hvis det er små utvalgsstørrelser for begge arter, mens en mindre forskjell kan være signifikant. Spesielt sammenligninger med c. javanense og c. endophyticum er svært upresise da bare ett isolat av hver art ble testet.