Komplekse egenskaper

nylig, med raske økninger i tilgjengelige genetiske data, har forskere begynt å bedre karakterisere den genetiske arkitekturen av komplekse egenskaper. En overraskelse har vært observasjonen at de fleste loci identifisert I GWASs finnes i ikke-kodende regioner av genomet; derfor, i stedet for direkte å endre proteinsekvenser, påvirker slike varianter sannsynligvis genregulering. FOR å forstå de nøyaktige effektene av disse variantene, HAR qtl kartlegging vært ansatt for å undersøke data fra hvert trinn av genregulering; for eksempel kan kartlegging AV RNA-sekvenseringsdata bidra til å bestemme effekten av varianter på mRNA-uttrykksnivåer, som da antagelig påvirker antall proteiner som oversettes. En omfattende analyse av Qtler involvert i ulike regulatoriske trinn-promotor aktivitet—transkripsjonsrater, mRNA—uttrykksnivåer, oversettelsesnivåer og proteinuttrykksnivåer-viste at høye andeler Av Qtler deles, noe som indikerer at regulering oppfører seg som en “sekvensiell ordnet kaskade” med varianter som påvirker alle nivåer av regulering. Mange av disse variantene virker ved å påvirke transkripsjonsfaktorbinding og andre prosesser som endrer kromatinfunksjon-trinn som oppstår før OG under rna-transkripsjon.

for å bestemme de funksjonelle konsekvensene av disse variantene har forskere i stor grad fokusert på å identifisere nøkkelgener, veier og prosesser som driver kompleks egenskapsadferd; en iboende antagelse har vært at de mest statistisk signifikante varianter har størst innvirkning på egenskaper fordi de handler ved å påvirke disse nøkkeldriverne. For eksempel hypoteser en studie at det finnes hastighetsbegrensende gener som er avgjørende for funksjonen av genregulatoriske nettverk. Andre studier har identifisert funksjonelle virkninger av nøkkelgener og mutasjoner på lidelser, inkludert autisme og Skizofreni. Men en 2017 analyse Av Boyle et al. hevder at mens gener som direkte påvirker komplekse egenskaper, eksisterer, er regulatoriske nettverk så sammenkoblet at ethvert uttrykt gen påvirker funksjonene til disse” kjerne “gener; denne ideen er laget av” omnigenic ” hypotesen. Selv om disse” perifere ” genene hver har små effekter, overstiger deres kombinerte innvirkning langt bidragene fra kjernegenene selv. For å støtte hypotesen om at kjernegener spiller en mindre rolle enn forventet, beskriver forfatterne tre hovedobservasjoner: arvbarheten for komplekse egenskaper er spredt bredt, ofte jevnt, over genomet; genetiske effekter ser ikke ut til å være mediert av celletypespesifikk funksjon; og gener i de relevante funksjonelle kategoriene bidrar bare beskjedent mer til arvbarhet enn andre gener. Et alternativ til den omnigeniske hypotesen er ideen om at perifere gener ikke virker ved å endre kjernegener, men ved å endre cellulære tilstander, for eksempel hastigheten på celledeling eller hormonrespons.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.