Output format
på resultatsiden, for hver spørringssekvens navnet, lengden, og nevralt nettverk utgang score som cTP / ikke-cTP tildelingen er basertvil bli presentert. Jo høyere poengsummen er, desto sikrere er nettverketat denne sekvensen inneholder Et n-terminalt kloroplast transittpeptid (cTP).En potensiell ctp lengde vil også bli presentert, sammen med den tilsvarendeavage nettstedet score. Vær oppmerksom på at prediksjonen av transitpeptidlengden utføres selv om dens tilstedeværelse ikke er spådd.Formålet er å gi maksimal informasjon i borderline tilfeller.
hvis “Detaljert utgang” er valgt, vil nevrale nettverkspoeng for eachresidue også bli presentert. Jo høyere denne poengsummen er, desto sikrere ernettverket at denne resten er en del av en cTP. Et derivat av nettverketcore er også presentert. Denne poengsummen brukes for å finne området der thecleavage stedet er søkt etter-nemlig blant de 40 rester rundt theresidue med høyest derivat score. Til slutt presenteres cleavage site score(CS-score) for hver rest. Denne poengsummen er beregnet fra ascoring matrix avledet fra en automatisk motiv finne algoritme kalt MEME. Cleavagesite-poengsummen er definert slik at det forventede spaltningsstedet er directlyN-terminal for den høyeste scoring-rest innen de 40 reststoffene. Dermed eksisterer det en ELLER flere CS-score (er) som skjer for å være større enn score av den foreslåtte cTP-lengden, men siden de ligger utenfor 40residues rundt den høyeste derivative poengsummen, er den presenterte ctp-lengden fortsatt hva ChloroP anser som den mest sannsynlige presequence lengden(dvs. tilsvarendetil det mest sannsynlige spaltningsstedet).
