Klinisk Ytelse Av Roche Cobas 4800 HPV Test | Jiotower

TEKST

Humant papillomavirus (HPV) er et av de vanligste seksuelt overførbare virusene over hele verden og en stor bidragsyter til kreft, forårsaker nesten 60 000 nye krefttilfeller per År I Europa (1) og fører til utvikling av livmorhalskreft hos kvinner. HPV16 og HPV18 er de mest kreftfremkallende (2, 3), da omtrent 70% av alle livmorhalskreft er TILSTEDE med hpv16-eller hpv18-infeksjoner (4). Nesten 30% av livmorhalskreftene blir savnet av innledende cervikal cytologi screening (5), så nøyaktige og objektive tester for HPV-assosiert livmorhalskreft som bruker mer sensitive molekylære teknikker er nødvendige for å gi effektiv forebygging og behandling for å redusere fremtidig risiko og forekomst av livmorhalskreft.

Roche Cobas 4800 HPV test (Cobas) er en ny molekylær metode basert på sanntids PCR (RT-PCR) (6, 7), med et helautomatisk system som gir rask og effektiv prøvebehandling. Cobas kan detektere HPV16, HPV18, 12 andre Høyrisiko HPVs (hrHPVs) (HPV31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, og -68, som et samlet resultat), og β-globin kontrollerer uavhengig i samme PCR. Hovedformålet med studien var å evaluere De tekniske og kliniske ytelsesegenskapene Til Cobas. Cervical prøver fra 6,056 kvinner henvist Til Institutt For Patologi Ved Icahn School Of Medicine Ved Mount Sinai for rutinemessig undersøkelse av livmorhalskreft lesjoner mellom November 2011 og februar 2012 ble samlet i et væskebasert cytologi medium (PreservCyt; Hologic, Marlborough, MA) og lagres hos 4°C til bruk.

Ett hundre og åtti prøver ble testet for hrHPV-genotyper av Både Roche Cobas 4800 HPV-testen og Digene Hybrid Capture 2 (HC2) HRHPV DNA-testen (Tabell 1), der eventuelle avvik ble løst ved Hjelp Av Linear Array (LA) HPV-GENOTYPINGSTESTEN (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) (8). Ifølge Pearsons chi-square-test var det en signifikant forskjell i antall positive og negative prøver identifisert av DE TO HPV-testene (P < 0,001). Konkordansen mellom de to testene var imidlertid statistisk sterk, med et avtalenivå på 88,33% (P = 0,0218) og Cohens kappa-koeffisient på 0,767 (95% konfidensintervall, 0,674 til 0,860; P < 0,001), hvor 95% konfidensintervall av kappa-verdiene ble utledet fra en binomialfordeling.

I de uharmoniske prøvene oppdaget LA HPV-testen lavrisiko HPV (lrHPV) genotyper i 50% (2/4) av prøvene SOM VAR HC2 positive og Cobas negative og i 13,33% (2/15) av prøver SOM VAR HC2 negative og Cobas positive. HPV53 ble funnet i to prøver SOM VAR HC2 positive Og Cobas negative, noe som tyder på at probene I Digene kit kryssreagerte med DENNE HPV-GENOTYPEN. Denne observasjonen er ikke overraskende, siden KRYSSREAKTIVITETEN TIL HC2-testen med lrHPV-genotyper, spesielt HPV53, ble observert tidligere (9). Konsekvensen av lrHPV genotype kryssreaktivitet i EN HPV-test er et økt antall falske positive resultater. Dette kan føre til overundersøkelse og overbehandling gjennom oppfølgingstesting av kvinner som bare har lrHPV-genotyper og faktisk har lav risiko for å utvikle livmorhalskreft. I TO HC2-negative/Cobas-positive prøver ble HPV62 og HPV89 (CP6108) påvist i begge prøvene, OG HPV42, HPV54, HPV55, HPV61, HPV70 og HPV84 ble påvist i en av prøvene, noe som tyder på at blandet HPV-infeksjon fører til falske positive resultater ved Cobas HPV-testen.

LA HPV-testen påviste hrHPV-genotyper i ingen av prøvene SOM VAR HC2-positive og Cobas-negative (0/4) og i 80% (12/15) av prøvene SOM VAR HC2-negative og Cobas-positive. HC2-testen klarte ikke å oppdage hrHPV i disse prøvene, noe som indikerer AT HC2-testen savnet flere hrHPV-genotyper enn Cobas-testen, noe som innebærer At Cobas er en potensielt mer effektiv screeninganalyse på grunn av bedre følsomhet og nøyaktighet. HPV ble derimot ikke påvist VED LA HPV-testen i 6,67% (1/15) AV DE HC2-negative/Cobas-positive prøvene. Samlet sett var forskjellen i detektering av hrHPV mellom HC2-og Cobas-tester fortsatt statistisk ubetydelig (χ2 = 2,901, P = 0,0885).

Sekstiåtte prøver ble deretter brukt til å bestemme reproduserbarheten Av Cobas HPV-testen. Reproduserbarheten mellom innledende og gjentatte tester, beregnet med en standard 2-til-2-beredskapstabell, var 93,55%; kappa-koeffisienten mellom resultatene fra Første og andre Runder Av Cobas-testing var 0,869 (95% KI, 0,744 til 0,993; P < 0,001). Styrken i denne avtalen anses å være veldig god, noe som tyder på at analysen er svært pålitelig.

Ett hundre og åttisju prøver ble testet Av Cobas HPV-testen for å bestemme forskjellen I HPV-deteksjon mellom prealiquoted og postaliquoted prøver. Bare 7 prøver var feilaktige, med en hastighet på 3,74% (95% KI, 1,02% til 6,46%). Statistisk analyse viste at forskjellen mellom prealiquoted og postaliquoted prøver ikke var signifikant (χ 2 = 0,233, P = 0,36290). SIDEN ingen ØKNING I HPV-positiv frekvens ble observert før og etter cytologiprosessen (prealiquot versus postaliquot), er krysskontaminering av prøver under cytologibehandling ekstremt sjelden. HPV-testing etter cytologi kan forbedre arbeidsflyten betydelig og redusere unødvendig aliquoting når en REFLEKS HPV-test for unormal cytologi er ment.

til slutt ble 5621 prøver testet ved Hjelp Av Cobas HPV-testen for å bestemme effekten av hvirvel og virvling (før Cobas testing) på feilfrekvenser. Blant 1.380 prøver behandlet ved vortexing var feilfrekvensen 4.57% (95% KI, 3,65% til 5,91%). I kontrast, blant 4,241-prøver behandlet ved virvling, var feilfrekvensen 1.16% (95% KI, 0.84% til 1.48%). Pearsons chi-square-test viste at forskjellene i feilratene mellom virvelformede og forsiktig virvlede prøver var ekstremt signifikante (χ2 = 59.983, P < 0.0001), med mild virvling som anbefales for å redusere Cobas feilfrekvens.

Avslutningsvis viste Cobas 4800 HPV-testen en større grad av sensitivitet og spesifisitet ved påvisning av hrHPV-genotyper enn Digene HC2 HRHPV-testen. Cobas-testen hadde også et lavere nivå av kryssreaktivitet med lrhpv-genotyper enn HC2-testen, noe som fremgår av de færre falske positive tilfellene. Forskjellen i total ytelse mellom disse to testene er imidlertid statistisk ikke signifikant.