Transposons: Typer Transposons | Genetikk (Norwegian

Transposoner er av to typer, sammensatt transposon og komplekse transposon.

1. Kompositttransposonene:

kompositttransposonene er de som består Av en sentral region som bærer antibiotikaresistente gener flankert i begge ender av identiske kopier AV ET IS-element. 8.32 A). Det er en klasse av større transposoner. Tre ofte studerte kompositttransposoner er Tn5, Tn9 og Tn10.

tn5 element viser kanamycin motstand (kanr) og består av 5400 basepar segment med 1450 bp invertert gjentar i begge ender av segmentet. Det kan bli transponert fra fag λ til kromosomet Av E .coli og fra et locus Av k coli kromosom til et annet locus. Hvis det settes inn i gener, forårsaker det mutasjoner.

Tn9 transposon består av et r-faktor avledet gen for kloramfemkolresistens (camr). Enzymet som gir medikamentresistens består av 2638 sekvenser i Midten Av Tn flankert av 768 bp lang IS1 element på hver side. Tn9 IS1 er til stede i direkte rekkefølge med liten invertert gjenta i endene.

camr-segmentet blir translokert fra En R-faktor Til F-episom samt fag λ gjennom fag P1. T9 skiller seg fra de andre transposonene i ustabilitet, og et høyfrekvent tap av antibiotikaresistens kan oppstå.

Tn10 består av tetracyklinresitansgener (tetr-gener). Det er 9300 bp lang bestående av inverterte repetisjoner, på hver side av 1400 basepar. Is-elementene er IS10. Tn10 kan translokeres Fra R222 (et legemiddelresitans plasmid) til fag P22.

Struktur av kompositttransposoner:

i kompositttransposonene kan is-elementene være i en omvendt eller direkte repetisjonskonfigurasjon (Fig. 8.31 B). DE to ender AV is-elementer er selv inverterte gjentakelser. Den relative orientering (direkte eller invertert) av flankeringen er elementer av en sammensatt transposon endrer ikke dens terminal sekvenser. Således har en sammensatt transposon med armer av direkte gjentakelser strukturen: arm L-sentral region-arm R.

strukturen blir: arm l-sentral region – arm R, hvis armene er inverterte gjentakelser. Pilene viser retningen av armene i henhold til retningen av genetisk kart av transposon fra venstre (L) til høyre (R) (Fig. 8.31 B, i-ii). Funksjonene i kompositttransposoner er gitt i Tabell 8.4.

Videre Er det noen tilfeller der moduler av et kompositt transposon er identiske, for eksempel Tn9 (har direkte gjentakelse AV IS1) eller Tn903 (inverterte gjentakelser AV IS 903 til stede), mens i visse tilfeller modulene er nært beslektet. Derfor kan modulene I Tn10 eller Tn5 skille seg ut. Men når modulene er identiske, kan begge sponse bevegelsen av transposon som funnet I Tn9 Av Tn903.

når modulene er forskjellige, kan de også variere i funksjonell evne. Derfor er transponering helt avhengig av en av modulene for Eksempel Tn10 eller Tn5. Dermed en ER modul når funksjonell, transponerer enten seg selv eller hele transposon.

evnen til en enkelt modul til å transponere hele kompositttransposonet forklarer mangelen på selektivt trykk for at begge modulene skal forbli aktive. Den is elementer kode for transposase aktivitet som er ansvarlig både for å skape et målområde og for å gjenkjenne endene av transposon. Bare endene er nødvendig for en transposon å tjene som substrat for transponering.

2. De Komplekse Transposons (TnA transposon familie):

TnA familien av transposons inkluderer Tn1, Tn2, Og Tn3. TnA består av ganske store elementer(ca 500 bp). Disse inneholder uavhengige enheter som bærer gener for transponering så vel som for stoffresistens. Disse er ikke sammensatt videresending PÅ IS-type transponeringsmoduler. TnA-familien inneholder flere relaterte transposoner, hvorav Tn3 og Tn10 er de best studerte.

TnA-familien er også kjent med navnet tn3-familien fordi Tn3 transposon først ble oppdaget i bakterielle plasmider i 1974 av Hedges og Jacob. Tn3 er et eksempel på en kompleks transposon. Det tar en modulær struktur som finnes I Tn10 og er ikke basert PÅ IS-elementer. Det har heller ikke evolusjonære koblinger TIL IS-elementer. Den grunnleggende strukturen Til Tn3 er beskrevet For tna-familien.

En av de unike egenskapene Til tna-familien er at den begrenser flere innsettinger av samme transposon i et plasmid. Mest overraskende funn er at transponeringsfrekvensen til andre plasmider i samme celle er upåvirket. Heffron (1979) har gitt analyse AV DNA-sekvens av transposon Tn3.

Struktur Av Transposoner Av TnA-familien:

Transposoner Av TnA-familien består av inverterte terminalrepetisjoner (av 38 bp lang, men ingen er flankert AV IS-lignende elementer), et internt res-område og tre kjente gener, f.eks. tnpA, tnpR og ampr.

genet tnpA koder for transposase og tnpR koder for resolvase. Ampr-genet (5 bp langt) genereres på målstedet som direkte gjentakelse og koder for β-laktamase som gir resistens mot ampicillin. Res-området består av tre underenheter: I, II OG III (Fig. 8.33)