identificatie, prevalentie en pathogeniteit van Colletotrichum-soorten die anthracnose van Capsicum annuum veroorzaken in Azië

morfologische waarnemingen en fylogenetische gegevens van de rechte conidia-soorten hebben duidelijk drie nieuwe soorten geïdentificeerd, twee uit Indonesië en één uit Taiwan. Hieronder worden gedetailleerde morfologische beschrijvingen gegeven van alle Colletotrichum-soorten die geassocieerd zijn met chili anthracnose (Tabel 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB826936.

Figuur 6 etymologie: vernoemd naar Java, Het eiland in Indonesië waar de soort werd verzameld.

diagnose: Colletotrichum javanense verschilt van C. brisbanense in het vormen van verschillende chlamydosporen en acervulaire conidiomata op alle geteste media. C. brisbanense daarentegen produceerde alleen Conidiomata op anthriscusstam, maar geen basale cellen waargenomen. Daarnaast groeit C. javanense sneller dan C. brisbanense (C. javanense op OA, MEA en SNA 60, 55 en 66 mm diam in 7 d, respectievelijk, C. brisbanense op OA en SNA 18.5, 20 mm diam in 7 d, respectievelijk). Colletotrichum javanense is fylogenetisch te onderscheiden van C. brisbanense met beide soorten verschillend in de opeenvolgingen van chs-1, en het meest effectief met gapdh (7 BP verschil) en his3 (4 bp verschil).

soort: Indonesië: West-Java, purwakata regency, op vruchten van Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotype; CBS 144963 = uom 1115 = EWINDO 3-ex-type cultures).

omschrijving: Sexual morph not observed. Aseksuele morph op PDA. Vegetatief mycelium 1-5 µm diam, hyalien, gladwandig, gesepteerd, vertakte Hyphen. Chlamydosporen bol of langwerpig, lichtbruin, gladwandig, 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervulair, setae niet waargenomen. Conidioforen hyalien, gesepteerd, vertakt. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch of ampulvormig, 7-17, 5 µm, apex 1-3 µm diam. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, meestal spoelvormig, één uiteinde afgerond, het andere uiteinde acuut, of beide uiteinden acuut (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Conidia in massa geel tot oranje kleur. Appressoria enkel of in losse groepen, Middelbruin, gladwandig, subglobose of elliptisch, met gehele of golvende rand, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

aseksuele morph op SNA. Vegetatief mycelium 1-7 µm diam, hyalien, gladwandig, gesepteerd, vertakte Hyphen. Chlamydosporen bol of langwerpig, lichtbruin, gladwandig, 4,5-28 × 4-8 µm. Conidiomata acervulair, setae niet waargenomen. Conidioforen hyalien, gesepteerd, vertakt, 20-35 µm lang. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch of ampulvormig, 5-20 µm, apex, 1-3 µm diam. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, cilindrisch met beide uiteinden acuut of één uiteinde rond en één uiteinde acuut, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Conidia in massa met geel tot oranje kleur.

Kweekkenmerken: kolonies op PDA 48-54 mm diam in 7 d (6,5-7,5 mm / dag), plat met volledige rand; oppervlak bedekt met grijs tot olijfgroen kort antenne mycelium, rand wit tot lichtgrijs, omgekeerd meestal crème Wittig, olijfgrijs tot zwart in het midden. Geel tot oranje acervul conidiomata. Kolonies op SNA waren 60-66 mm diam in 7 d (8-9, 5 mm/d), plat met volledige rand, hyalien tot lichtbruin, oppervlak bedekt met kort grijs antenne mycelium, omgekeerde dezelfde kleuren. Oranje acervular conidiomata in het centrum van de cultuur. Kolonies op OA waren 55-60 mm diam in 7 d (7,8–8,5 mm/d), plat met volledige rand; oppervlak bedekt met crème tot grijs kort antenne mycelium, rand wit, omgekeerd meestal lichtoranje, met bruine pigmenten. Oranje acervular conidiomata. Kolonies op MEA-oppervlak lichtgrijze korte antenne mycelium, omgekeerd lichtoranje.

Opmerkingen: De dichtstbijzijnde overeenkomst in een blastn-zoekopdracht met de GAPDH-sequentie was GenBank JQ948617, C. sloanei stam IMI 364297 met 98% identiteit (4 verschillen in bp), terwijl de dichtstbijzijnde overeenkomsten met de his3-sequentie met 99% identiteit (2 verschillen in bp) GenBank JQ949279 C waren. indonesiense stam CBS 127551 en GenBank KJ947248 C. guajavae isoleren OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827691.Figuur 7 etymologie: genoemd naar Makassar, de stad in Zuid-Sulawesi, Indonesië, waar de soort werd verzameld.

Colletotrichum makassarense (CBS 143664). een kolonie op PDA. B achterzijde van de kolonie op PDA. c Conidiomata. d-e Appressoria. F Setae, G, h, j conidioforen en conidia. I Conidia. Staven = 10 µm

diagnose: Colletotrichum makassarense is fylogenetisch nauw verwant aan C. tropicale. De sequentiegegevens van ITS konden de twee species niet scheiden, maar zij kunnen door alle andere geteste genen worden onderscheiden en het meest effectief gebruikend apmat (22 BP verschillen) en gs (18 BP verschillen) sequentiegegevens.

Type: Indonesia: Makassar, from fruit laesion of Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotype; CBS 143664 = CPC 28612 – EX-Type cultures).

beschrijving: Seksuele morph niet waargenomen. Aseksuele morph op OA. Vegetatief mycelium bestaande uit hyaliene, gladwandige, gesepteerde, vertakte Hyphen, 2-3 µm diam. Chlamydosporen niet waargenomen. Setae aanwezig, Middelbruin, 40-55 × 3-5 µm, 2-3 septen, taps toelopend tot scherpe toppen. Conidiomata acervulair, 100-200 µm diam, met oranje conidiale massa ‘ s. Conidioforen subcylindrisch, buigzaam, 1-4 septen, hyalien, glad, vertakt, 15-45 × 3-4 µm. Conidiogene cellen subcylindrisch, hyalien, glad, fialidisch met verdikking periclinaal, 7-25 × 3-4 µm. Conidia hyalien, glad, aseptaat, subcylindrisch, recht, apex stomp, aan de basis toelopend tot uitpuilend toelopend hilum, 1 µm diam, prominent guttulaat, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria solitair, Middelbruin, gladwandig, subglobose, ellipsoïdaal tot obovaat, hele marge, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

Kweekkenmerken: kolonies op PDA 45 mm diam na 7 d (6,5 mm/d), kolonies plat, met matig mycelium uit de lucht, op oa-oppervlak Rookgrijs. Op PDA oppervlak Rookgrijs, omgekeerd olijfgrijs. Op MEA oppervlak vuilwit, omgekeerd oker.

Opmerkingen: De dichtstbijzijnde overeenkomst in een blastn-zoekopdracht met de apmat-sequentie was GenBank KU923732, C. queenslandicum stam AUS22 met een 98% – identiteit (16 BP-verschillen), terwijl de dichtstbijzijnde overeenkomst met de gs-sequentie met 99% – identiteit (7 BP-verschillen) GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24 was. De beste overeenkomsten met de GAPDH reeks waren GenBank KX578784 C. siamense (99% identiteit, 3 bp verschillen) en GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identiteit, 3 bp verschillen).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827692.Figuur 8 etymologie: genoemd naar Tainan, de stad in Taiwan waar de soort werd verzameld.

Colletotrichum tainanense (CBS 143666). een kolonie op PDA. B achterzijde van de kolonie op PDA. c Conidia. d-e conidioforen en Conidia. f Melanised hypae g-j Appressoria. Staven = 10 µm

diagnose: Colletotrichum tainanense verschilt van zijn naaste fylogenetische buur C. salsolae in de kweekkenmerken op PDA, schaars luchtmycelium en licht muisgrijs oppervlak mycelium, terwijl C. salsolae een laag acervuli-achtige structuren produceert met diep oranjebruine conidiale massa ‘ s en talrijke setae. De twee species zijn scheidbaar gebruikend alle geteste genen behalve voor zijn en het meest effectief met GAPDH (7 bp verschil), tub2 (6 bp verschil) en act (5 BP verschil) opeenvolgingen. Er is slechts één bp verschil in de Chs-1 sequentie tussen de twee soorten.

Type: Taiwan: Tainan: op vruchten van Capsicum annuum, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666 – holotype; CBS 143666 = CPC 30245 = uom 1120 = Coll 1298 – EX-Type culturen).

omschrijving: Sexual morph not observed. Aseksuele morph op PDA. Vegetatief mycelium vertakt, hyalien, gladwandig, gesepteerd, Hyphen 2-3 µm diam, met de tijd melaniseerd. Een enkel conidioom gevonden op een PDA plaat, steriel op SNA, MEA en OA. Chlamydosporen en setae niet waargenomen. Conidioforen subcylindrisch, buigzaam, 1-2 septen, hyalien, glad tot lichtbruin, vertakt. Conidiogene cellen subcylindrisch, hyalien, glad, fialidisch met verdikking periclinaal. Conidia hyalien, glad, aseptaat, subcylindrisch tot subclavaat, recht of licht gebogen, apex stomp, aan de basis taps toelopend tot uitpuilend toelopend hilum, 1,5-2 µm diam, prominent guttulaat, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria enkel of in losse groepen, vaak smal-cilindrisch, medium tot donkerbruin, vaak taps toelopend naar de top, de rand geheel of golvend soms onregelmatig gelobd (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

Kweekkenmerken: kolonies op PDA 45 mm diam na 7 d (6,5 mm / d), kolonies plat, met matig mycelium uit de lucht. Op OA oppervlak bleek muizengrijs. Op PDA-oppervlak bleek mouse-grey, reverse mouse-grey. Op MEA oppervlak bleek muizengrijs, omgekeerd olijfgrijs.

Opmerkingen: De dichtstbijzijnde overeenkomst in een blastn zoekopdracht met de GAPDH sequentie met 99% identiteit (2 BP verschil) was GenBank KC790761 Colletotrichum sp. stam MTCC 9664 terwijl de dichtstbijzijnde match met de act sequentie met 99% identiteit (2 BP verschil) was GenBank KY995522 C. siamense stam LJDY1–2. De dichtstbijzijnde match met de tub2 sequentie met 99% identiteit (7 BP verschil) was GenBank MF143931 C. siamense stam 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al. Fung. Diversiteit 61: 112 (2013); als ‘endophytica’.

omschrijving: kolonies op PDA 42 mm diam na 7 d (5,5 mm / d), lichtoranje tot wit bovenmycelium; omgekeerd bleekwit tot oranje en zwart in het Midden en talrijke over het oppervlak verspreide oranje conidiomata. Chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata aanwezig, conidioforen gevormd direct op Hyphen. Setae aanwezig, matig bruin, 47-95 × 3-6 µm, 3-4 septen, scherpe toppen taps toelopend. Conidioforen hyalien, gladwandig en onvertakt. Conidiogene cellen hyalien, gladwandig, aseptaat, subcylindrisch, 12-21 × 3-4 µm. Conidia hyalien, gladwandig, aseptaat, recht, cilindrisch met twee uiteinden stomp, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria enkel of in losse groepen, bruin, licht gelobd, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

opmerkingen: Colletotrichum endophyticum werd voor het eerst beschreven als een gras endofyt van Pennisetum purpureum uit Noord-Thailand (Manamgoda et al. 2013). Later werd het gemeld van verschillende andere gastheersoorten waaronder Capsicum in China (Diao et al. 2017). De lengte van conidia van het isolaat uit Thailand (uom 1137) was iets korter dan die van het ex-type (LC0324) van C. endophyticum (conidia) 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

onderzocht materiaal: Thailand: Kanchanaburi: from fruit laesion of Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum Fructicola Prihast. et al. Fung. Diversiteit 39: 158 (2009).

beschrijving: Kolonies op PDA 65 mm diam na 7 d (8,5–11 mm / d), plat met hele rand, luchtmycelium dicht, katoenachtig, lichtgrijs tot wit luchtmycelium en tal van zwarte stroma verspreid over het oppervlak, grijs in het midden, wit aan de rand; omgekeerd grijsgroen. Chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata acervular, Setae waargenomen, bruin, gladwandig, 1-2 septen, 60 µm lang, scherpe toppen taps toelopend. Conidioforen hyalien, gesepteerd, vertakt. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch of ampulvormig, 7-17, 5 µm. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, cilindrisch, beide uiteinden stomp, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria niet waargenomen.

opmerkingen: de seksuele vorm van deze isolaten werd niet waargenomen in de cultuur. Conidiale lengte van isolaat CPC 28644 was iets langer dan die van het ex-type (ICMP 18581 = BPD-I16) van C. fructicola (conidia 9,7–14 × 3-4, 3 µm, x = 11,53 ± 1,03 × 3,55 ± 0,32 µm; Prihastuti et al. 2009).

onderzocht materiaal: Thailand: Chiang Mai: afkomstig van vruchtenlaesie van Capsicum annuum, 7 Jun. (CPC 28644 en CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, uit vruchtlaesie van rijpe rode vruchten van Capsicum sp. (paprika), 22 Apr. 2015, Z. M. Sheu (culture UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, uit vruchtlaesie van groene vruchten van Capsicum sp. (paprika), 4 Sep. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (culture UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); als ‘karstii’.

omschrijving: kolonies op PDA 65 mm diam na 7 d (6.5-10.5 mm / dag), plat met volledige rand, oranje tot wit bovenmycelium en talrijke over het oppervlak verspreide oranje conidiale massa ‘ s, wit aan de rand; omgekeerd geel tot oranje. Chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata acervulaire, setae waargenomen, bruin, gladwandig, 2-4 septen, 60 µm lang, basis ondergedompeld, taps toelopend naar de top, top meestal acuut. Conidioforen hyalien, gesepteerd, vertakt, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch of ampulvormig, 7-15, 5 µm. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, kort, cilindrisch, aan beide uiteinden stomp of aan één uiteinde iets scherp of afgekapt aan de basis, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria enkel of in losse groepen, bruin, subglobose, cirkelvormige omtrek, 6-12. 5 × 3.5-8 µm.

Opmerkingen: De vier isolaten geïdentificeerd uit Indonesië in het boninense complex produceerden duidelijke korte conidia vergeleken met de ex-epitype cultuur van C. karsti (14,5-17 × 5-6, 5 µm; Yang et al. 2011). Er is echter een grote variabiliteit in conidia-grootte tussen verschillende stammen van C. karsti werden gemeld door Damm et al. (2012a, 2012b) waar de conidia metingen van CBS 129833 waren (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, gemiddelde ± SD = 13,1 ± 0,7 × 5,8 ± 0,4 µm; en CBS 111998 had een conidium lengte tot 18,5 µm, L / W verhouding = 2,8. Deze isolaten vormden geen seksuele morph in de cultuur. Hoewel deze vier isolaten een volledig ondersteunde (100% BS/1 PP) subclade vormden binnen C. karsti, boden alle individuele genbomen (gegevens niet getoond) geen significante ondersteuning om de introductie van een cryptische soort voor deze isolaten te rechtvaardigen.

onderzocht materiaal: Indonesië: Jeneponto, afkomstig van Vruchtlaesies van Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culturen CPC 28553, CPC 28554); uit vruchtlaesie van rijpe rode vruchten en steeltjes van Capsicum sp. Jun. (CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Stud. Mycol. 92: 31 (2019).

omschrijving: kolonies op PDA 63 mm diam na 7 d (8 mm/d), grijs tot donkerbruin luchtmycelium; omgekeerde grijsbruin tot lichtbruin met geeloranje in het centrum met overvloedige acervulaire conidiomata die in het centrum lichtoranje conidiummassa ‘ s sijpelen, chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata aanwezig (nabij het inoculatiepunt), conidioforen gevormd direct op Hyphen. Sclerotia aanwezig. Setae aanwezig, Middelbruin, 94-125 × 4-6 µm, 1-4 septen, taps toelopend naar de scherpe toppen, vaak met een vernauwing aan de top. Conidioforen hyalien tot lichtbruin, gladwandig, gesepteerd en vertakt. Conidiogene cellen hyalien, gladwandig, aseptaat, subcylindrisch, recht tot licht gebogen, 26-48 × 3-4 µm, fialidisch, periclinale verdikking opvallend. Conidia hyalien, gladwandig, aseptaat, recht, cilindrisch met twee uiteinden stomp of één uiteinde licht acuut, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria enkel of in losse groepen, Middelbruin, onregelmatig van vorm, gekruld of gelobd contour, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Seksuele morph op PDA. Ascomata perithecia, gevormd na 2 wk., solitair, semi-ondergedompeld of ondergedompeld in het agarmedium, niet-symptomatisch, subsferisch tot eivormig, ostiolaat, kaal, Middelbruin, 96-130 × 160-200 µm. Peridium 10-12. 5 µm dik, samengesteld uit bleke tot middelbruine afgeplatte hoekcellen 3,5–10 µm diam. Ascogene hyphae hyalien, gladwandig, delicaat, zelden zichtbaar. Interascaal weefsel niet waargenomen. Asci unitunicate, 8-sporen, cilindrisch, taps toelopend tot apex en base, gladwandig, 51-65 × 9.5-13 µm, de basis afkapt. Ascosporen biserieel gerangschikt, aseptaat, hyalien, gladwandig, spoelvormig, licht gebogen, basis afgerond, Top acuut of afgerond, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

opmerkingen: de conidiale lengte van de onderzochte isolaten (CPC 28638, CPC 28639) was variabel en viel binnen het bereik van het EX-Type isolaat (CBS 125474) van C. plurivorum (15-17 × 5,5 µm; Damm et al. 2019).

onderzocht materiaal: Thailand: Chiang Rai, afkomstig van bladlaesies van Capsicum annuum, 7 Jun. (CPC 28638 en CPC 28639); Bangkok, restaurant in Phaya Thai gebied, besmet weefsel van Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (culture uom 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Stud. Mycol. 73: 100 (2012).

omschrijving: kolonies op PDA 20-38 mm diam na 7 d (5-6, 2 mm / d), plat met volledige rand; oppervlak bedekt met kort lichtroze tot oranje antenne mycelium, met de tijd grijs, marge witachtig tot lichtroze, omgekeerde rooskleurige buff, olijfgrijs tot bruingrijs in het centrum; omgekeerde oranje tot zalm, donker in het centrum. Chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata acervulair, setae niet waargenomen, conidioforen hyalien, gesepteerd, vertakt. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch of ampulvormig, 7-17, 5 µm, apex 1-3 µm diam. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, meest spoelvormig, één uiteinde afgerond, één uiteinde acuut, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia in massa met zalm tot oranje kleur. Appressoria enkel of in losse groepen, Middelbruin, eivormig, gehele tot gekristalliseerde rand, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

opmerkingen: de meerderheid van de isolaten geïdentificeerd als C. scovillei had vergelijkbare sporenvorm en sporengroottes, vergeleken met het type specimen (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, beschreven door Damm et al. (2012a, 2012b). Sommige isolaten hadden echter een verschillende kleur van de kolonie, verschillende groeisnelheden en kleine verschillen in sporenmetingen.

onderzocht materiaal: Indonesië: Gowa, afkomstig van vruchtlaesies van Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culturen CPC 28577 en CPC 28579); West-Java: from fruit laesion of Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146/ EWINDO 10. Thailand: Chiang Mai: van vruchtletsels van Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (cultures uom 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al. Fung. Diversiteit 39: 98 (2009)

omschrijving: kolonies op PDA 79 mm diam in 7 d (5.5–6 mm/d). Lichtgeelwit, grijs, dicht katoenachtig bovenmycelium met in het midden oranje acervul conidiomata; omgekeerd bleekgeel. Chlamydosporen niet waargenomen. Conidiomata acervulaire, conidioforen gevormd op een kussen van ronde en middelbruine cellen. Setae niet waargenomen. Conidioforen hyalien, vertakt. Conidiogene cellen hyalien, cilindrisch tot ampulvormig, 6,5-16 µm. Conidia hyalien, aseptaat, gladwandig, spoelvormig tot cilindrisch, beide uiteinden botafrond, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria donkerbruin, solitair, rond, gehele tot gekrende rand, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

nota’ s: isolaten van Colletotrichum siamense uit verschillende landen toonden variatie van morfologische karakters, in groeisnelheden en cultuurmorfologie op PDA. Representatieve conidiale metingen voor isolaten die verschillende subkladen in de fylogenetische bomen vertegenwoordigen (Fig. 2, 3) zijn: CPC 30233 (Gowa, Indonesië), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thailand) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOM 1126/ F4-1c (Kanchana Buri, Thailand) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3,5–5,5. Deze morfologische karakters binnen een subclade waren zeer consistent binnen elk land. De soort werd beschreven door Prihastuti et al. (2009); conidia van het ex-holotype (ICMP 18578/ BDP-I2) werden gerapporteerd als 7-18.3 × 3-4, 3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), die het bereik omvat dat in onze isolaten wordt waargenomen. Deze soort is biologisch en geografisch divers, en wordt gevonden op vele gastheren in verschillende tropische en subtropische regio ‘ s (Weir et al. 2012).

onderzocht materiaal: Indonesië: Gowa, afkomstig van vruchtlaesie van Capsicum annuum, 7 Jun. (CPC 30233); Jeneponto, from fruit laesion of Capsicum sp. 7 Jun. (CPC 30209), P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultuur, CPC 30209). Thailand: Ratchaburi, van fruitlaesie van Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture UOM 1132); Kanchanaburi, from fruit laesion of Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, van fruitlaesie van Capsicum sp. Sep. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (culture UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

omschrijving: kolonies op PDA 45 mm diam in 7 d (6.5 mm/d). Kolonies plat, verspreidend, met matig luchtmycelium, op oa-oppervlak Rookgrijs. Op PDA-oppervlak olijfgrijs tot Rookgrijs, omgekeerd olijfgrijs, talrijke oranje conidiomata verspreid over het oppervlak. Op MEA oppervlak vuilwit, omgekeerd oker. Aseksuele morph op OA. Vegetatief mycelium bestaande uit hyalien tot lichtbruin, gladwandig, gesepteerd, vertakt, 2-2, 5 µm Diam Hyphen. Chlamydosporen niet waargenomen. Setae zeldzaam (slechts twee gezien), recht, Middelbruin, fijn-wrattig, 2-3 septen, tot 120 µm lang, Top subobtusig afgerond. Conidiomata acervulair, 150-250 µm diam, met oranje conidiale massa. Conidioforen subcylindrisch, buigzaam, 1-3 septen, hyalien, glad, vertakt, 15-25 × 3.5-4.5 µm. Conidiogene cellen subcylindrisch, hyalien, glad, fialidisch met periclinale verdikking, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Conidia hyalien, glad, aseptaat, subcylindrisch, recht, apex stomp, aan de basis toelopend tot uitpuilend toelopend hilum, 1.5-2 µm diam, prominent guttulaat, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria niet waargenomen. Seksuele morph niet waargenomen.

onderzocht materiaal: Indonesia, Makassar, from fruit laesion of Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (cultuur CPC 28607).

prevalentie van bemonsterde Colletotrichum-soorten

algemeen was C. truncatum de meest voorkomende soort (44%) geïsoleerd uit geïnfecteerd chilivrucht (Fig. 9) en werd gemakkelijk geïdentificeerd door zijn valkensporen en overvloedige setae in de necrotische laesies. Van de soort met rechte conidia was C. scovillei (acutatum complex) de meest voorkomende soort in de onderzochte landen (35%), met uitzondering van Sri Lanka waar deze soort Niet geïsoleerd was. Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) was de volgende meest voorkomende soort die voorkwam in Thailand, Sri Lanka en Indonesië (11%). De overige soorten waren vertegenwoordigd door minder dan 10% van het totale aantal isolaten.

in Indonesië, C. scovillei werd geïsoleerd van besmet chilivrucht in alle onderzochte regenten van Zuid-Sulawesi, behalve in Makassar, en in de veld proef site in West-Java. Colletotrichum siamense werd ook geïsoleerd uit de hele regio, van Gowa, Jeneponto en Makassar. De twee nieuwe soorten, C. makassarense en C. javanense, werden geïsoleerd uit Makassar en West-Java.In Thailand werd C. scovillei voornamelijk geïsoleerd uit de noordelijke provincies Chiang Mai en Chiang Rai, maar werd ook verkregen van besmet chilivrucht in een proeflocatie van de Kasetsart Universiteit in Nakhon Pathom. De westelijke provincies hadden een hoge incidentie van C. siamense en een isolaat van C. endophyticum werd verzameld uit Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum werd geïsoleerd uit chili bladeren met necrotische laesies in Chiang Rai en van necrotische laesies van chili fruit gevonden in een restaurant in Phaya Thai gebied van Bangkok. Bovendien werd C. fructicola geïdentificeerd uit fruit dat werd verzameld in Chiang Mai.

in Taiwan werd een isolaat geïdentificeerd als een nieuwe soort, C. tainanense, verzameld van besmet chilivrucht in de provincie Tainan, en C. fructicola werd geïdentificeerd uit fruit in Hsinchu en Nantou, Taiwan. Colletotrichum plurivorum werd ook geïdentificeerd uit een vrucht die werd verzameld in Johor, Maleisië.

pathogeniteit

alle Colletotrichum-soorten veroorzaakten antracnose-symptomen op gewonde vruchten, maar er waren significante verschillen in ernst van de symptomen. Op gewond fruit vertoonden isolaten van C. scovillei en C. javanense de hoogste ernst van de ziekte en produceerden grote necrotische laesies met een gemiddelde laesiegrootte van 15,6–20,3 mm (Tabel 5). Op niet-gewonde vruchten waren alle soorten minder pathogeen, met een gemiddelde laesiegrootte van minder dan 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale en C. plurivorum produceerden slechts zeer kleine laesies of geen zichtbare symptomen (gemiddelde laesiegrootte < 1 mm) 10 d na inoculatie van niet-gewonde vruchten. Colletotrichum javanense en C. scovillei isolaten waren het meest pathogeen in niet-gewonde vruchten en produceerden laesies met gemiddelde grootte van respectievelijk 9,4 en 9,1 mm. Laesies veroorzaakt door C. scovillei waren significant groter dan die veroorzaakt door alle andere soorten behalve C. javanense in wounded fruit en C. endophyticum in unwunded fruit. De significantie van de paarsgewijze t-tests is sterk afhankelijk van het aantal isolaten van elke bemonsterde soort, zodat de in Tabel 5 weergegeven groepen niet alleen veranderen met de grootte van het verschil in gemiddelden; een groot verschil kan niet significant zijn als er voor beide soorten kleine steekproefgrootten zijn, terwijl een kleiner verschil significant kan zijn. In het bijzonder zijn vergelijkingen met C. javanense en C. endophyticum zeer onnauwkeurig, aangezien slechts één isolaat van elke soort werd getest.