Wiskunde voor Real-World Systems Centrum voor Doctoraatsopleidingen

2020 – 2021 Serie
woensdag 1100-1200 via MS Teams Computational Techniques Team

deelname aan deze klassen is verplicht voor MSc-studenten.

Eerste term week 2 – 14 oktober 2020

Inleiding tot de Wetenschappelijke Computing Research Technology Platform deel 1 – Professor David Quigley

Dia

Eerste term week 3 – 21 oktober 2020

Inleiding tot de Wetenschappelijke Computing Research Technology Platform deel 2 – Professor David Quigley

Dia

Eerste term week 4 – 28 oktober 2020

Inleiding tot de ontwikkeling van software – Dr. Chris Brady en Dr Heather Ratcliffe

link

Dit praten op basis van een overzicht van deze dia ‘ s

Eerste term week 5 – 4 November 2020

Versie besturing en software duurzaamheid – Dr. Chris Brady en Dr Heather Ratcliffe

link

Eerste term week 6 – 11 November 2020

Inleiding bash-scripting-Dr. Paul Brown

Dia

Eerste term week 7 – 18 November 2020

Het maken van webpagina ‘s met interactieve content – Dr. Paul Brown

Dia

Eerste term week 8 – 25 November 2020

Geen seminar

Eerste term week 9 – 2 December 2020

met Behulp van de Gpu’ s in Warwick – Professor David Quigley

De notebook gebruikt voor het aanbieden van dit gesprek, en zo veel meer gedetailleerde notebooks op Python GPU programmeren op github.com/WarwickRSE/gpuschool2018

Eerste term week 10 – 9 December 2020

Machine learning met Julia – Dr. Sebastian Vollmer

2019-2020 serie
woensdag van 11 – 12 uur in D1.07

Deelname aan deze lessen is verplicht voor de MSc-studenten.

Eerste term week 2 – 9 oktober 2019

Inleiding tot de Wetenschappelijke Computing Research Technology Platform deel 1 – Professor David Quigley

Dia

Eerste term week 3 – 16 oktober 2019

Inleiding tot de Wetenschappelijke Computing Research Technology Platform deel 2 – Professor David Quigley

Dia

Eerste term week 4 – 23 oktober 2019

Inleiding tot de ontwikkeling van software – Dr. Chris Brady en Dr Heather Ratcliffe

Dit praten op basis van een overzicht van deze dia ‘ s

Eerste term week 5 – 30 oktober 2019

Versie besturing en software duurzaamheid – Dr. Chris Brady en Dr Heather Ratcliffe

Eerste term week 6 – 6 November 2019

Inleiding bash-scripting-Dr. Paul Brown

Dia

Eerste term week 7 – 13 November 2019

het Maken van webpagina ‘ s met interactieve content – Dr. Paul Brown

Dia

Eerste term week 8 – 20 November 2019

Geen seminar

Eerste term week 9 – 27 November 2019

met Behulp van de Gpu ‘ s in Warwick – Professor David Quigley

De notebook gebruikt voor het aanbieden van dit gesprek, en zo veel meer gedetailleerde notebooks op Python GPU programmeren op github.com/WarwickRSE/gpuschool2018

2018-2019 serie

Eerste term week 2 – 10 oktober 2018

Inleiding tot de Wetenschappelijke Computing Research Technology Platform

Dr. David Quigley

De Universiteit van Warwick loopt acht Research Technology Platforms (RTPs) het universitair onderzoek en de gemeenschap door middel van grootschalige gedeelde faciliteiten in meerdere academische afdelingen. Ik zal de beschikbare faciliteiten introduceren via het Scientific Computing RTP, waaronder onze managed Linux desktop environment en high-performance computing (HPC) systemen. Dit omvat mechanismen voor het verkrijgen van toegang, effectief werken binnen een beheerde multi-user Linux omgeving en hoe toegang te krijgen tot ondersteuning en training.

eerste termijn week 3-17 oktober 2018

statistische gevolgtrekking uit genomische gegevens

Dr. Jere Koskela

een technologische revolutie in de genetica is aan de gang. Het rangschikken van het genoom wordt steeds goedkoper en goedkoper, en zal uiteindelijk een routinematig deel van gezondheidszorg worden. Er is voorspeld dat binnen 15 jaar een miljard menselijke genomen zal zijn gesequenced. Deze gegevens zijn opwindend omdat patronen van variatie in DNA-sequenties tussen individuen informatie bevatten over een aantal biologische en demografische processen, zoals mutatie, natuurlijke selectie, populatiegrootte en migratiegebeurtenissen. Dergelijke enorme hoeveelheden gegevens brengen echter een aantal statistische en computationele uitdagingen met zich mee. Ik zal een aantal van de statistische technieken die zijn toegepast om deze problemen aan te pakken bespreken, met een focus op Monte Carlo methoden zoals belang bemonstering, en Markov keten Monte Carlo (MCMC). Ik zal ook enkele populatiegenetica modellen introduceren die gebruikt worden om de evolutie van grote, willekeurige paringspopulaties te bestuderen, waarbij speciaal gebruik wordt gemaakt van een gebied dat bekend staat als coalescentietheorie.

eerste termijn week 4 – 24 oktober 2018

Data driven modelling-a model of chromosome oscillations from data to bifurcations

Professor Nigel Burroughs

Celbiologie wordt vaak genoemd als de nieuwe ‘fysica’, een rijk veld waar natuurkundige theorieën kunnen worden ontwikkeld om biologische processen te verklaren/voorspellen, analoog aan de kwantumfysica en relativiteitssuccessen begin vorige eeuw. Het realiseren van dit ambitieuze doel blijkt echter moeilijk, vooral omdat biologische processen uit evenwicht zijn, vaak zeer stochastisch zijn met kleine aantallen moleculen en zeer complex zijn, met een scala aan fenomenale zelforganiserende dynamiek. In deze talk zal ik onderzoeken wat het betekent om biologische processen te ‘verklaren’, en hoe een scala aan fysische technieken van stochastische simulaties, dynamische systeemanalyse en computationele statistieken aan elkaar gekoppeld kunnen worden om deze complexe vragen aan te pakken. Voorbeelden zullen worden getrokken uit cytoskeletal mechanica en celdeling.

eerste termijn week 6-7 November 2018

inzicht in menselijk gedrag met data science

Professor Tobias Preis

in deze lezing schetsen we enkele recente hoogtepunten van ons onderzoek, waarbij we twee vragen behandelen. Ten eerste, kunnen big data-bronnen inzicht geven in crises in de financiële markten? Door het analyseren van Google query volumes voor zoektermen met betrekking tot financiën en standpunten van Wikipedia-artikelen, vinden we patronen die kunnen worden geïnterpreteerd als vroege waarschuwingssignalen van de aandelenmarkt beweegt. Ten tweede, kunnen we inzicht geven in internationale verschillen in economisch welzijn door patronen van interactie met het Internet te vergelijken? Om deze vraag te beantwoorden, introduceren we een future-orientation index om te kwantificeren in welke mate internetgebruikers meer informatie zoeken over jaren in de toekomst dan jaren in het verleden. We analyseren Google-logs en vinden een opvallende correlatie tussen het BBP van het land en de neiging van de inwoners om vooruit te kijken. Onze resultaten illustreren het potentieel dat het combineren van uitgebreide gedragsdatasets biedt voor een beter begrip van grootschalig menselijk economisch gedrag.

eerste termijn week 7-14 November 2018

Statistical inference using Markov chain Monte Carlo

Dr Jake Carson

in deze lezing zal ik enkele technieken introduceren voor modelmontage binnen een Bayesiaans kader en deze illustreren met enkele eenvoudige voorbeelden. In het bijzonder zal ik me richten op Markov keten Monte Carlo en aanverwante methoden. Ik zal proberen uit te leggen hoe het werkt, waarom het zo vaak wordt gebruikt en een aantal praktische richtsnoeren geven over de uitvoering ervan.

eerste termijn week 8-21 November 2018

beeldgebaseerde modellering van celdynamica

Dr Sharon Collier

Moderne live-cell fluorescentiemicroscopie stelt ons in staat dynamische cellulaire processen in ongekende details te visualiseren. Ik zal lopende onderzoeksprojecten presenteren die betrekking hebben op het samenbrengen van I) beeldanalysemethoden om cellen en hun bewegingen te volgen, en het kwantificeren van spatio-temporele patronen van fluorescent gelabelde cellulaire bestanddelen, en ii) wiskundige modellen om regulerende mechanismen van cellulaire biochemie en mechanica te onderzoeken.

eerste termijn week 9-28 November 2018

softwareontwikkeling voor academici

Dr Heather Ratcliffe

softwareontwikkeling is veel meer dan het schrijven van code – het gaat om het produceren van professionele, onderhoudbare, begrijpelijke software. Planning en stijl, documentatie, versiebeheer, verpakking, licenties en meer. Deze talk is bedoeld om een aantal van de vitale tools die je moet weten over als onderzoekers-die-schrijven-code te introduceren, zodat je goed uitgerust bent om te lezen en verder te leren en ze te gebruiken. We zullen versiebeheer in de vorm van Git bespreken, een beetje over softwarelicenties, een paar mooie pakketten voor het documenteren van code, en kort een paar andere dingen noemen die iedereen zou moeten weten, maar niemand denkt erover te praten.

2017-2018 serie

eerste termijn week 2-11 oktober 2017

aanpak van complexiteit en zelforganisatie in biologische systemen

Professor Nigel Burroughs

Celbiologie wordt vaak genoemd als de nieuwe ‘fysica’, een rijk veld waar natuurkundige theorieën kunnen worden ontwikkeld om biologische processen te verklaren/voorspellen, analoog aan de kwantumfysica en relativiteitssuccessen begin vorige eeuw. Het realiseren van dit ambitieuze doel blijkt echter moeilijk, vooral omdat biologische processen uit evenwicht zijn, vaak zeer stochastisch zijn met kleine aantallen moleculen en zeer complex zijn, met een scala aan fenomenale zelforganiserende dynamiek. In deze talk zal ik onderzoeken wat het betekent om biologische processen te ‘verklaren’, en hoe een scala aan fysische technieken van stochastische simulaties, dynamische systeemanalyse en computationele statistieken aan elkaar gekoppeld kunnen worden om deze complexe vragen aan te pakken. Voorbeelden zullen worden getrokken uit cytoskeletal mechanica en celdeling.

eerste termijn week 3-18 oktober 2017

Statistical inference using Markov chain Monte Carlo

Dr Simon Spencer
in deze lezing zal ik enkele technieken introduceren voor modelmontage binnen een Bayesiaans kader en deze illustreren met enkele eenvoudige voorbeelden. In het bijzonder zal ik me richten op Markov keten Monte Carlo en aanverwante methoden. Ik zal proberen uit te leggen hoe het werkt, waarom het zo vaak wordt gebruikt en een aantal praktische richtsnoeren geven over de uitvoering ervan.

eerste termijn week 4-25 oktober 2017

inzicht in menselijk gedrag met data science
Professor Tobias Preis
in deze lezing zullen we enkele recente hoogtepunten van ons onderzoek schetsen, waarbij we twee vragen behandelen. Ten eerste, kunnen big data-bronnen inzicht geven in crises in de financiële markten? Door het analyseren van Google query volumes voor zoektermen met betrekking tot financiën en standpunten van Wikipedia-artikelen, vinden we patronen die kunnen worden geïnterpreteerd als vroege waarschuwingssignalen van de aandelenmarkt beweegt. Ten tweede, kunnen we inzicht geven in internationale verschillen in economisch welzijn door patronen van interactie met het Internet te vergelijken? Om deze vraag te beantwoorden, introduceren we een future-orientation index om te kwantificeren in welke mate internetgebruikers meer informatie zoeken over jaren in de toekomst dan jaren in het verleden. We analyseren Google-logs en vinden een opvallende correlatie tussen het BBP van het land en de neiging van de inwoners om vooruit te kijken. Onze resultaten illustreren het potentieel dat het combineren van uitgebreide gedragsdatasets biedt voor een beter begrip van grootschalig menselijk economisch gedrag.

eerste termijn week 6-8 November 2017

Scientific Computing with Julia
Professor Christoph Ortner
deel 1: Inleiding tot Julia. Ik zal kort de taal Julia en enkele van zijn tools introduceren, en laten zien hoe het Matlab, Python en Lisp interpoleert in een programmeeromgeving die perfect geschikt is voor numeriek intensieve computing, zowel rapid prototyping als HPC.
deel 2: Ik zal enkele voorbeelden laten zien uit mijn eigen onderzoek naar multi-scale materials modelling.

eerste termijn week 7-15 November 2017
stochastische simulaties
Professor Matthew Keeling
in deze lezing zullen we in eerste instantie het belang van stochasticiteit bespreken bij het begrijpen van problemen in de echte wereld. Stochasticiteit kan op vele manieren worden opgenomen, maar we zullen ons richten op individuele, event-drive stochasticiteit en zullen methoden bespreken om dergelijke dynamiek te simuleren. Schaamteloos met voorbeelden uitsluitend uit ecologie en epidemiologie, zullen we zowel Gillespie ‘ s methoden als Ensemble/Master vergelijkingen bekijken. We zullen bespreken wat er gebeurt als de populatie groot wordt – en benaderingen die het probleem computationeel tracteerbaar maken. Tot slot zullen we kijken naar volledig individuele ruimtelijke simulaties en bespreken methoden die een enorme computationele besparing kunnen bieden.

eerste termijn week 8-22 November 2017

Image-based modelling of celdynamics
Professor Till Bretschneider

Moderne live-cell fluorescentiemicroscopie stelt ons in staat om dynamische cellulaire processen in ongekend detail te visualiseren. Ik zal lopende onderzoeksprojecten presenteren die betrekking hebben op het samenbrengen van I) beeldanalysemethoden om cellen en hun bewegingen te volgen, en het kwantificeren van spatio-temporele patronen van fluorescent gelabelde cellulaire bestanddelen, en ii) wiskundige modellen om regulerende mechanismen van cellulaire biochemie en mechanica te onderzoeken.

eerste termijn week 9-29 November 2017

statistische gevolgtrekking uit genomische gegevens

Dr. Paul Jenkins

een technologische revolutie in de genetica is aan de gang. Het rangschikken van het genoom wordt steeds goedkoper en goedkoper, en zal uiteindelijk een routinematig deel van gezondheidszorg worden. Er is voorspeld dat binnen 15 jaar een miljard menselijke genomen zal zijn gesequenced. Deze gegevens zijn opwindend omdat patronen van variatie in DNA-sequenties tussen individuen informatie bevatten over een aantal biologische en demografische processen, zoals mutatie, natuurlijke selectie, populatiegrootte en migratiegebeurtenissen. Dergelijke enorme hoeveelheden gegevens brengen echter een aantal statistische en computationele uitdagingen met zich mee. Ik zal enkele van de statistische technieken die zijn toegepast om deze problemen aan te pakken bespreken, met een focus op Monte Carlo methoden zoals belang bemonstering, Markov keten Monte Carlo (MCMC), en Geschatte Bayesiaanse berekening (ABC). Ik zal ook enkele populatiegenetica modellen introduceren die gebruikt worden om de evolutie van grote, willekeurige paringspopulaties te bestuderen, waarbij speciaal gebruik wordt gemaakt van een gebied dat bekend staat als coalescentietheorie.

2016-2017 Serie
Deze cursus vindt plaats op Woensdag 11.00-12.00 uur in de D1.07-zaal.

eerste termijn week 2-12 oktober 2016

inzicht in menselijk gedrag met data science
Dr Tobias Preis
in deze lezing zullen we enkele recente hoogtepunten van ons onderzoek schetsen, waarbij we twee vragen behandelen. Ten eerste, kunnen big data-bronnen inzicht geven in crises in de financiële markten? Door het analyseren van Google query volumes voor zoektermen met betrekking tot financiën en standpunten van Wikipedia-artikelen, vinden we patronen die kunnen worden geïnterpreteerd als vroege waarschuwingssignalen van de aandelenmarkt beweegt. Ten tweede, kunnen we inzicht geven in internationale verschillen in economisch welzijn door patronen van interactie met het Internet te vergelijken? Om deze vraag te beantwoorden, introduceren we een future-orientation index om te kwantificeren in welke mate internetgebruikers meer informatie zoeken over jaren in de toekomst dan jaren in het verleden. We analyseren Google-logs en vinden een opvallende correlatie tussen het BBP van het land en de neiging van de inwoners om vooruit te kijken. Onze resultaten illustreren het potentieel dat het combineren van uitgebreide gedragsdatasets biedt voor een beter begrip van grootschalig menselijk economisch gedrag.

eerste termijn week 3-19 oktober 2016

stochastische simulaties
Professor Matthew Keeling
in deze lezing zullen we in eerste instantie het belang van stochasticiteit bespreken bij het begrijpen van problemen in de echte wereld. Stochasticiteit kan op vele manieren worden opgenomen, maar we zullen ons richten op individuele, event-drive stochasticiteit en zullen methoden bespreken om dergelijke dynamiek te simuleren. Schaamteloos met voorbeelden uitsluitend uit ecologie en epidemiologie, zullen we zowel Gillespie ‘ s methoden als Ensemble/Master vergelijkingen bekijken. We zullen bespreken wat er gebeurt als de populatie groot wordt – en benaderingen die het probleem computationeel tracteerbaar maken. Tot slot zullen we kijken naar volledig individuele ruimtelijke simulaties en bespreken methoden die een enorme computationele besparing kunnen bieden.

eerste termijn week 4-26 oktober 2016

Big data en Bioinformatica
Dr Richard Savage
geneeskunde en biologie ondergaan een datarevolutie. Van het sequencen van het gehele genoom tot digitale beeldvorming en elektronische medische dossiers, nieuwe bronnen van gegevens beloven een revolutie in de manier waarop we ziekten behandelen en ons biomedisch onderzoek uitvoeren. Met deze kansen komen echter aanzienlijke uitdagingen. De gegevens zijn vaak hoogdimensionaal, lawaaierig, met een complexe onderliggende structuur. En we willen misschien meerdere gegevenstypen combineren uit zeer verschillende bronnen. Ik zal een rondleiding geven over een aantal van deze kwesties, met de nadruk op een aantal real-world projecten die het potentieel hebben om de manier waarop we onderzoek doen op deze gebieden te veranderen. Ik zal ook praten over hoe dit zich verhoudt tot Warwick ‘ s betrokkenheid bij grootschalige projecten zoals het 100.000 genomen Project en het Alan Turing Institute.

Eerste term week 5 – 2 November 2016

Computationele technieken in de wiskundige biologie
Dr. Nabil-Fareed Alikhan, Dr Tot Bretschneider en Dr Giorgos Minas

Eerste term week 6 – 9 November 2016

Geen seminarie deze week

Eerste term week 7 en 16 November 2016

Statistische inferentie met behulp van Markov chain Monte Carlo
Dr. Simon Spencer
In deze lezing zal ik voeren een aantal technieken om het model passend binnen een Bayesiaanse raamwerk en illustreren ze met een aantal eenvoudige voorbeelden. In het bijzonder zal ik me richten op Markov keten Monte Carlo en aanverwante methoden. Ik zal proberen uit te leggen hoe het werkt, waarom het zo vaak wordt gebruikt en een aantal praktische richtsnoeren geven over de uitvoering ervan.

eerste termijn week 8-23 November 2016

Scientific Computing with Julia
Professor Christoph Ortner
deel 1: Inleiding tot Julia. Ik zal kort de taal Julia en enkele van zijn tools introduceren, en laten zien hoe het Matlab, Python en Lisp interpoleert in een programmeeromgeving die perfect geschikt is voor numeriek intensieve computing, zowel rapid prototyping als HPC.
deel 2: Ik zal enkele voorbeelden tonen uit mijn eigen onderzoek naar multi-scale materials modelling.

eerste termijn week 9-30 November 2016

gevolgtrekking en montage van spatial dynamic systems in cell biology. Professor Nigel Burroughs wordt vaak genoemd als de nieuwe ‘fysica’, een rijk veld waar natuurkundige theorieën kunnen worden ontwikkeld om biologische processen te verklaren/voorspellen, analoog aan de kwantumfysica en relativiteitssuccessen begin vorige eeuw. Het realiseren van dit ambitieuze doel blijkt echter moeilijk, vooral omdat biologische processen uit evenwicht zijn, vaak zeer stochastisch zijn met kleine aantallen moleculen en zeer complex zijn, met een scala aan fenomenale zelforganiserende dynamiek. In deze talk zal ik onderzoeken wat het betekent om biologische processen te ‘verklaren’, inclusief discussie over de soorten modellen/modellering en wanneer ze nuttig zijn, het vergelijken van die modellen met data (reverse engineering) en verificatie van die modellen. Voorbeelden zullen worden getrokken uit cytoskeletal processen en celdeling.

2015-2016 Serie
Deze cursus vindt plaats op Woensdag 11.00-12.00 uur in de Complexity lecture room.

eerste termijn week 2-14 oktober 2015

stochastische simulaties
Professor Matthew Keeling
in deze lezing zullen we in eerste instantie het belang van stochasticiteit bespreken bij het begrijpen van problemen in de echte wereld. Stochasticiteit kan op vele manieren worden opgenomen, maar we zullen ons richten op individuele, event-drive stochasticiteit en zullen methoden bespreken om dergelijke dynamiek te simuleren. Schaamteloos met voorbeelden uitsluitend uit ecologie en epidemiologie, zullen we zowel Gillespie ‘ s methoden als Ensemble/Master vergelijkingen bekijken. We zullen bespreken wat er gebeurt als de populatie groot wordt – en benaderingen die het probleem computationeel tracteerbaar maken. Tot slot zullen we kijken naar volledig individuele ruimtelijke simulaties en bespreken methoden die een enorme computationele besparing kunnen bieden.

eerste termijn week 3-21st October 2015

Scientific Computing at Warwick: a double perspective from a Chemist / Director
Professor Mark Rodger
deze lezing zal een blik werpen op Scientific Computing at Warwick vanuit zowel een algemeen als een persoonlijk perspectief. Vanuit het algemene perspectief zal ik proberen een overzicht te geven van het scala van activiteiten die binnen Warwick plaatsvinden, van de rol van het Centre for Scientific Computing bij het bevorderen van deze activiteiten, en van een aantal van de hardware en software die gemakkelijk beschikbaar is om onderzoek op het algemene gebied van Scientific Computing te ondersteunen. Om een meer persoonlijk perspectief te bieden, zal ik verder gaan met het beschrijven van een aantal van het onderzoek dat ik doe op het gebied van klassieke statistische mechanica en moleculaire modellering, in het bijzonder het beschrijven van een aantal van de adaptieve moleculaire dynamica methoden die zijn ontwikkeld in de afgelopen jaren om fase ruimteverkenning te verbeteren, karakterisering van vrije energie landschappen, en de simulatie van zeldzame gebeurtenissen voor toepassingen in de materiaalwetenschap.

eerste termijn week 4-28 oktober 2015

gevolgtrekking en montage van spatial dynamic systems in cell biology. Professor Nigel Burroughs wordt vaak genoemd als de nieuwe ‘fysica’, een rijk veld waar natuurkundige theorieën kunnen worden ontwikkeld om biologische processen te verklaren/voorspellen, analoog aan de kwantumfysica en relativiteitssuccessen begin vorige eeuw. Het realiseren van dit ambitieuze doel blijkt echter moeilijk, vooral omdat biologische processen uit evenwicht zijn, vaak zeer stochastisch zijn met kleine aantallen moleculen en zeer complex zijn, met een scala aan fenomenale zelforganiserende dynamiek. In deze talk zal ik onderzoeken wat het betekent om biologische processen te ‘verklaren’, inclusief discussie over de soorten modellen/modellering en wanneer ze nuttig zijn, het vergelijken van die modellen met data (reverse engineering) en verificatie van die modellen. Voorbeelden zullen worden getrokken uit cytoskeletal processen en celdeling.

eerste termijn week 5-4 November 2015

Mass Univariate and Multivariate Approaches to Understanding Genetic Variation in the Brain
Professor Thomas Nichols
er was grote interesse in het ontdekken en begrijpen van de rol van genetische variatie in beeldvormingsgegevens van de hersenen. Typische “imaging genetics” studies gebruiken een klein aantal kandidaat-genen, een klein aantal hersengebieden, of beide. In deze talk zal ik methoden overwegen voor het zoeken naar gen-hersenassociaties over het gehele genoom en alle hersengebieden. Een dergelijke aanpak stelt enorme computationele en statistische uitdagingen. Ik zal twee benaderingen bespreken, een massa-univariate aanpak en een multivariate aanpak. Een mass-univariate model is de standaard tool in neuroimaging analyse, maar het opschalen van het voor 100.000 SNPs vereist een reeks van computationele en statistische innovaties. Met onze methode toegepast op Tensor-gebaseerde Morfometriegegevens van het ADNI-project, rapporteren we de eerste gen-hersenassociatie die het hele genoom, het hele brein familywise foutcorrectie overleeft. Onze multivariate benadering maakt gebruik van een Sparse Reduced Rank regressie (sRRR) om gen-hersenassociaties gezamenlijk en parsimoniously te verklaren. Gedetailleerde gedetailleerde machtsanalyses tonen aan dat de multivariate benadering nog meer macht zou moeten hebben dan de univariate benadering.

eerste termijn week 6-11 November 2015

Statistical inference using Markov chain Monte Carlo
Dr Simon Spencer
in deze lezing zal ik enkele technieken introduceren voor modelmontage binnen een Bayesiaans kader en deze illustreren met enkele eenvoudige voorbeelden. In het bijzonder zal ik me richten op Markov keten Monte Carlo en aanverwante methoden. Ik zal proberen uit te leggen hoe het werkt, waarom het zo vaak wordt gebruikt en een aantal praktische richtsnoeren geven over de uitvoering ervan.

eerste termijn week 7-18 November 2015

Big data en Bioinformatica
Dr Richard Savage
geneeskunde en biologie ondergaan een datarevolutie. Van het sequencen van het gehele genoom tot digitale beeldvorming en elektronische medische dossiers, nieuwe bronnen van gegevens beloven een revolutie in de manier waarop we ziekten behandelen en ons biomedisch onderzoek uitvoeren. Met deze kansen komen echter aanzienlijke uitdagingen. De gegevens zijn vaak hoogdimensionaal, lawaaierig, met een complexe onderliggende structuur. En we willen misschien meerdere gegevenstypen combineren uit zeer verschillende bronnen. Ik zal een rondleiding geven over een aantal van deze kwesties, met de nadruk op een aantal real-world projecten die het potentieel hebben om de manier waarop we onderzoek doen op deze gebieden te veranderen. Ik zal ook praten over hoe dit zich verhoudt tot Warwick ‘ s betrokkenheid bij grootschalige projecten zoals het 100.000 genomen Project en het Alan Turing Institute.

eerste termijn week 8-25 December 2015

No talk this week

eerste termijn week 9-2 December 2015

inzicht in menselijk gedrag met data science
Dr Tobias Preis
in deze lezing zullen we enkele recente hoogtepunten van ons onderzoek schetsen, waarbij we twee vragen behandelen. Ten eerste, kunnen big data-bronnen inzicht geven in crises in de financiële markten? Door het analyseren van Google query volumes voor zoektermen met betrekking tot financiën en standpunten van Wikipedia-artikelen, vinden we patronen die kunnen worden geïnterpreteerd als vroege waarschuwingssignalen van de aandelenmarkt beweegt. Ten tweede, kunnen we inzicht geven in internationale verschillen in economisch welzijn door patronen van interactie met het Internet te vergelijken? Om deze vraag te beantwoorden, introduceren we een future-orientation index om te kwantificeren in welke mate internetgebruikers meer informatie zoeken over jaren in de toekomst dan jaren in het verleden. We analyseren Google-logs en vinden een opvallende correlatie tussen het BBP van het land en de neiging van de inwoners om vooruit te kijken. Onze resultaten illustreren het potentieel dat het combineren van uitgebreide gedragsdatasets biedt voor een beter begrip van grootschalig menselijk economisch gedrag.

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.