identificarea și caracterizarea virusului de curățare a venelor galbene citrice, un nou membru presupus al genului Mandarivirus
caracteristicile moleculare și organizarea genomică au fost determinate pentru virusul de curățare a venelor galbene citrice (CYVCV), presupusul agent cauzal viral al bolii de curățare a venelor galbene a lămâilor, raportat în Pakistan, India și, mai recent, în Turcia și China. Izolatul Y1 CYVCV din Adana, Turcia, a fost utilizat pentru analiza secvențială profundă a fracțiilor ARN mici induse de virus și pentru inocularea mecanică și grefă a plantelor erbacee și citrice indicatoare. Un antiser policlonal a fost dezvoltat din CYVCV-Y1 purificat din Phaseolus vulgaris și utilizat în testele western blot pentru a caracteriza proteina de acoperire a CYVCV-Y1 și pentru a determina relația sa serologică cu virușii înrudiți. Contig-urile asamblate din citirile scurte secvențiate Illumina au fost folosite pentru a construi întregul genom al virusului de compensare a venei galbene citrice (Cyvcv), constând într-un ARN cu sens pozitiv de 7.529 nucleotide și conținând șase cadre de citire deschise prezise. Organizarea și dimensiunea genomului CYVCV seamănă cu cea a flexivirusurilor, iar căutarea omologilor de secvență a arătat că virusul Indian citrus ringspot (ICRSV) (Mandarivirus, Alphaflexiviridae) este cel mai strâns legat de virus. Cu toate acestea, CYVCV a avut o identitate globală a secvenței nucleotidice de 74% cu icrsv. Deși cei doi viruși au fost similari în ceea ce privește organizarea genomului, particulele virale și gama de gazde erbacee, CYVCV a provocat simptome diferite în citrice și a fost serologic distinct de ICRSV. Perechile de primeri au fost proiectate și utilizate pentru a detecta virusul prin transcriere inversă convențională și cantitativă-reacția în lanț a polimerazei pe arborii de câmp simptomatici de compensare a venei galbene, precum și pe plantele gazdă grefate și inoculate mecanic. În mod colectiv, aceste date sugerează că CYVCV este agentul cauzal al bolii de curățare a venelor galbene și reprezintă o nouă specie din genul Mandarivirus.
