identificarea, prevalența și patogenitatea speciilor de Colletotrichum care cauzează antracnoza Capsicum annuum în Asia

observațiile morfologice și datele filogenetice ale speciilor de conidii drepte au identificat în mod clar trei specii noi, două din Indonezia și una din Taiwan. Descrierile morfologice detaliate sunt prezentate mai jos pentru toate speciile de Colletotrichum asociate cu antracnoza chili (Tabelul 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. Mycobank MB826936.

Figura 6 etimologie: numită după Java, insula din Indonezia unde a fost colectată specia.

diagnostic: Colletotrichum javanense diferă de C. brisbanense în formarea clamidosporilor distincți și a conidiomatelor acervulare pe toate mediile testate. În schimb, C. brisbanense a produs Conidiomate numai pe tulpina Antriscului, dar nu au fost observate celule bazale. În plus, C. javanense crește mai repede decât C. brisbanense (C. javanense pe OA, MEA și SNA 60, 55 și 66 mm diam în 7 D, respectiv, C. brisbanense pe OA și SNA 18,5, 20 mm diam în 7 D, respectiv). Colletotrichum javanense este filogenetic distinct de C. brisbanense cu ambele specii fiind diferite în secvențele chs-1 și cel mai eficient cu gapdh (diferența de 7 bp) și his3 (diferența de 4 bp).

Tip: Indonezia: Java de Vest, purwakata regency, pe fructe de Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotip; CBS 144963 = UOM 1115 = culturi de tip ewindo 3 – ex).

descriere: morful Sexual nu a fost observat. Morph Asexual pe PDA. Miceliu vegetativ 1-5 mm Diam, hialin, cu pereți netezi, septat, hife ramificate. Chlamydospori globosi sau alungiti, maro pal, cu pereti netedi, 5-25 int. 3-8 int. Conidiomata acervular, setae nu au fost observate. Conidiofori hialini, septați, ramificați. Celule conidiogene hialine, cilindrice sau ampuliforme, 7-17, 5 MMCT, apex 1-3 mmctm diam. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, în cea mai mare parte fusiformă, un capăt rotunjit, celălalt capăt acut sau ambele capete acute (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) ing. Conidia în masă de culoare galbenă până la portocalie. Appressoria simplă sau în grupuri libere, maro mediu, cu pereți netezi, subgloboză sau eliptică, cu margini întregi sau ondulate, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) ing.

morph Asexual pe SNA. Miceliu vegetativ de 1-7 mm Diam, hialin, cu pereți netezi, septat, hife ramificate. Chlamydospori globosi sau alungiti, maro pal, cu pereti netedi, 4.5-28 int. 4-8 int. Conidiomata acervular, setae nu au fost observate. Conidiofori hialini, septati, ramificati, cu lungimea de 20-35 mm. Celule conidiogene hialine, cilindrice sau ampuliforme, 5-20 mm, apex, 1-3 mm diametru. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, cilindrici, cu ambele capete acute sau cu un capăt rotund și cu un capăt acut, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) ing. Conidia în masă cu culoare galbenă până la portocalie.

caracteristici de Cultură: colonii pe PDA 48-54 mm diam în 7 d (6,5–7,5 mm/d), plat cu margine întreagă; suprafață acoperită cu miceliu aerian scurt de la gri la verde-măsliniu, margine albă până la gri deschis, reversă în cea mai mare parte crem albicioasă, gri olivac până la negru în centru. Conidiomata acervulară galbenă până la portocalie. Coloniile de pe SNA au fost de 60-66 mm diam în 7 d (8-9, 5 mm/d), plate cu întreaga marjă, hialine până la maro pal, suprafață acoperită cu miceliu aerian gri scurt, inversează aceleași culori. Conidiomata acervulară portocalie în centrul culturii. Coloniile de pe OA au fost de 55-60 mm diam în 7 d (7,8-8,5 mm/d), plate cu întreaga marjă; suprafață acoperită cu miceliu aerian scurt crem până la gri, margine albă, inversă în cea mai mare parte portocaliu deschis, cu pigmenți maro. Conidiomata acervulară portocalie. Colonii pe suprafața mea miceliu aerian scurt gri pal, portocaliu deschis invers.

Note: cea mai apropiată potrivire într-o căutare blastn cu secvența gapdh a fost GenBank JQ948617, C. sloanei tulpina IMI 364297 cu 98% identitate (4 diferențe bp), în timp ce cele mai apropiate potriviri cu secvența his3 cu 99% identitate (2 diferențe bp) au fost GenBank JQ949279 C. indoneziense tulpina CBS 127551 și GenBank KJ947248 C. guajavae izolat OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. Mycobank MB827691.

Figura 7 etimologie: numit după Makassar, orașul din Sulawesi de Sud, Indonezia, unde a fost colectată specia.

diagnostic: Colletotrichum makassarense este strâns legat filogenetic de C. tropicale. Datele de secvență din ITS nu au putut separa cele două specii, dar pot fi distinse prin toate celelalte gene testate și folosind cel mai eficient datele de secvență ApMat (22 diferențe bp) și GS (18 diferențe bp).

Tip: Indonezia: Makassar, din leziunea fructelor de Capsicum annuum, 7 iun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotip; CBS 143664 = CPC 28612 – culturi de tip ex).

descriere: Transformarea sexuală nu a fost observată. Morph Asexual pe OA. Miceliu vegetativ format din hife hialine, cu pereți netezi, septate, ramificate, cu diam de 2-3 mm. Chlamydospori nu au fost observate. Setae prezent, maroniu mediu, 40-55 int. 3-5 int. m, 2-3-septat, conic la varfuri acute. Conidiomata acervulara, 100-200 mm diametru, cu mase conidiale portocalii. Conidiofori subcilindrici, flexuosi, 1-4-septati, hialini, netedi, ramificati, 15-45 int. 3-4 int. Celule conidiogene subcilindrice, hialine, netede, fialidice cu ingrosare periclinala, 7-25 int. 3-4 int. Conidia hialină, netedă, aseptată, subcilindrică, dreaptă, Apex obtuză, conică la bază până la hilul trunchiat proeminent, 1 mm diametru, guttulat vizibil, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 ing. Appressoria solitar, mediu maro, cu pereți netezi, subglobose, elipsoidale la obovate, întreaga marjă, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) ing.

caracteristici de Cultură: colonii pe PDA 45 mm diam după 7 d (6,5 mm/zi), colonii plate, cu miceliu aerian moderat, pe OA suprafață gri-fum. Pe suprafața PDA fum-gri, reverse olivaceous grey. Pe suprafața mea alb murdar, invers ocru.

Note: cea mai apropiată potrivire într-o căutare blastn cu secvența ApMat a fost GenBank KU923732, tulpina C. queenslandicum aus22 cu o identitate de 98% (diferențe de 16 bp), în timp ce cea mai apropiată potrivire cu secvența gs cu identitate de 99% (diferențe de 7 bp) a fost GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24. Cele mai bune meciuri cu secvența gapdh au fost GenBank KX578784 C. siamense (99% identitate, 3 diferențe bp) și GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identitate, 3 diferențe bp).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. Mycobank MB827692.

figura 8 etimologie: numit după Tainan, orașul din Taiwan unde a fost colectată specia.

diagnostic: Colletotrichum tainanense diferă de cel mai apropiat vecin filogenetic C. salsolae în caracteristicile culturii pe PDA, miceliu aerian rar și miceliu de suprafață gri-șoarece palid, în timp ce C. salsolae produce un strat de structuri asemănătoare acervulilor cu mase conidiale maro portocaliu intens și numeroase seturi. Cele două specii sunt separabile folosind toate genele testate, cu excepția secvențelor sale și cel mai eficient cu gapdh (diferența de 7 bp), tub2 (diferența de 6 bp) și act (diferența de 5 bp). Există o singură diferență bp în secvența chs-1 între cele două specii.

Tip: Taiwan: Tainan: pe fructe de Capsicum annuum, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666-holotip; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – culturi de tip ex).

descriere: morful Sexual nu a fost observat. Morph Asexual pe PDA. Miceliu vegetativ ramificat, hialin, cu pereți netezi, septat, hife de 2-3 cm diametru, melanizate cu timpul. Un singur conidiom găsit pe o placă PDA, steril pe SNA, MEA și OA. Chlamydospores și setae nu au fost observate. Conidiofori subcilindrici, flexuosi, 1-2-septati, hialini, netezi pana la maro pal, ramificati. Celulele conidiogene subcilindrice, hialine, netede, fialidice cu îngroșare periclinală. Conidia hialină, netedă, aseptată, subcilindrică până la subclavată, dreaptă sau ușor curbată, apex obtuz, conic la bază până la hilul trunchiat proeminent, diam de 1,5-2 mm, guttulat vizibil, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 ing. Appressoria unică sau în grupuri libere, adesea cilindrice înguste, maro mediu până la închis, adesea conice spre vârf, marginea întreagă sau ondulată uneori lobată neregulat(6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) ing.

caracteristici de Cultură: colonii pe PDA 45 mm diam după 7 d (6,5 mm/zi), colonii plate, cu miceliu aerian moderat. Pe suprafața OA PAL mouse-gri. Pe suprafața PDA pale mouse-gri, mouse-ul invers-gri. Pe suprafața mea gri-șoarece palid, gri olivaceos invers.

Note: cea mai apropiată potrivire într-o căutare blastn cu secvența gapdh cu 99% identitate (diferență de 2 bp) a fost GenBank Kc790761 Colletotrichum sp. tulpina MTCC 9664 în timp ce cel mai apropiat meci cu secvența de act cu 99% identitate (2 diferență bp) a fost GenBank KY995522 C. siamense tulpina ljdy1–2. Cea mai apropiată potrivire cu secvența tub2 cu 99% identitate (diferență de 7 bp) a fost GenBank MF143931 C. tulpina siamense 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda și colab., Fung. Diversitate 61: 112 (2013); ca ‘endophytica’.

descriere: colonii pe PDA 42 mm diam după 7 d (5,5 mm/zi), miceliu aerian de culoare Portocaliu pal până la alb; inversează alb pal până la portocaliu și negru în centru și numeroase conidiomate portocalii împrăștiate pe suprafață. Chlamydospori nu au fost observate. Conidiomatele prezente, conidioforii s-au format direct pe hife. Setae prezente, moderat maronii, 47-95 oct 3-6 XCT, 3-4-septate, conice apice acute. Conidiofori hialini, cu pereți netezi și neramificați. Celule conidiogene hialine, cu pereti netedi, aseptate, subcilindrice, 12-21 int. 3-4 int. Conidia hialină, cu pereți netezi, aseptată, dreaptă, cilindrică cu două capete obtuze, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) ing. Appressoria simplă sau în grupuri libere, maro, ușor lobată, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) ing.

Note: Colletotrichum endophyticum a fost descris pentru prima dată ca un endofit de iarbă de Pennisetum purpureum din nordul Thailandei (Manamgoda și colab. 2013). Mai târziu, a fost raportat de la mai multe alte specii gazdă, inclusiv Capsicum în China (Diao și colab. 2017). Lungimea conidiilor izolatului din Thailanda (UOM 1137) a fost puțin mai scurtă decât cea a tipului ex (LC0324) de C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 ing).

Material examinat: Thailanda: Kanchanaburi: din leziunea fructelor de Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. și colab., Fung. Diversitate 39: 158 (2009).

descriere: Colonii pe PDA 65 mm diam după 7 d (8,5–11 mm/d), plat cu margine întreagă, miceliu aerian dens, bumbac, gri pal până la alb miceliu aerian și numeroase stroma neagră împrăștiate pe suprafață, gri în centru, alb la margine; verde Gri invers. Chlamydospori nu au fost observate. S-a observat Conidiomata acervulară, Setae, brună, cu pereți netezi, 1-2-septate, 60 mm lungime, vârfuri acute conice. Conidiofori hialini, septați, ramificați. Celule conidiogene hialine, cilindrice sau ampuliforme, 7-17, 5 unqq. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, cilindrici, ambele capete obtuze, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria nu a fost observată.

Note: morful sexual al acestor izolate nu a fost observat în cultură. Conidial lungime de izola CPC 28644 a fost ușor mai mare decât cea a ex-tip (ICMP 18581 = BPD-I16) din C. fructicola (conidii 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

Material examinat: Thailanda: Chiang Mai: din leziunea fructelor de Capsicum annuum, 7 iun. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culturi CPC 28644 și CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, din leziunea fructelor de fructe roșii mature de Capsicum sp. (ardei dulce), 22 Apr. 2015, Z. M. Sheu (cultura UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, din leziunea fructelor de fructe verzi de Capsicum sp. (ardei dulce), 4 Sep. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (cultura UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti tu L. Yang și colab. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); ca ‘karstii’.

descriere: colonii pe PDA 65 mm diam după 7 d (6,5–10.5 mm / d), plat cu margine întreagă, miceliu aerian portocaliu până la alb și numeroase mase conidiale portocalii împrăștiate pe suprafață, albe la margine; inversează galben spre portocaliu. Chlamydospori nu au fost observate. S-au observat conidiomate acervulare, setae, maronii, cu pereți netezi, 2-4-septate, 60 mm lungime, bază scufundată, conice spre vârf, vârf preponderent acut. Conidiofori hialini, septați, ramificați, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) ing. Celule conidiogene hialine, cilindrice sau ampuliforme, 7-15, 5 unqq. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, scurtă, cilindrică, ambele capete obtuze sau un capăt ușor acut sau trunchiat la bază, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) ing. Appressoria simplu sau în grupuri vrac, maro, subglobose, contur circular, 6-12, 5, 3.5-8, 3.5-8.

Note: cele patru izolate identificate din Indonezia în complexul boninense au produs conidii scurte distincte în comparație cu cultura ex-epitip a lui C. karsti (14,5–17, 5-6, 5, 5, 5, și colab. 2011). Cu toate acestea, variabilitatea ridicată a mărimii conidiilor între diferite tulpini de C. karsti au fost raportate de Damm și colab. (2012a, 2012b) în cazul în care conidii măsurători de CBS 129833 au fost (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, medie ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm; și CBS 111998 avut o conidium lungime de pana la 18.5 µm, L/W raport = 2.8. Aceste izolate nu au format o transformare sexuală în cultură. Deși aceste patru izolate au format o subcladă complet susținută (100% BS/1 PP) în cadrul C. karsti, toți arborii genici individuali (datele nu sunt prezentate) nu au oferit un sprijin semnificativ pentru a justifica introducerea unei specii criptice pentru aceste izolate.

Material examinat: Indonezia: Jeneponto, din leziuni de fructe de Capsicum annuum, 7 iunie. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culturi CPC 28553, CPC 28554); din leziunea fructelor de fructe roșii mature și leziunile pedunculului Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culturi CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm și colab., Armăsar. Mycol. 92: 31 (2019).

descriere: colonii pe PDA 63 mm diam după 7 d (8 mm / zi), miceliu aerian gri până la maro închis; reverse gri la maro deschis cu galben-portocaliu în centru cu conidiomate acervulare abundente care scurg mase conidiale portocalii palide în centru, Chlamydospores nu a fost observat. Conidiomatele prezente (în apropierea punctului de inoculare), conidioforii s-au format direct pe hife. Sclerotia prezentă. Setae prezent, maroniu mediu, 94-125 XTX 4-6 xtxm, 1-4-septat, conic spre varfuri acute, de multe ori cu constrictie la varf. Conidioforii hialini până la maro pal, cu pereți netezi, septați și ramificați. Celule conidiogene hialine, cu pereti netedi, aseptate, subcilindrice, drepte pana la usor curbate, 26-48 int. 3-4 int. m, ingrosare fialidica, periclinica evidenta. Conidia hialină, cu pereți netezi, aseptată, dreaptă, cilindrică cu două capete obtuze sau un capăt ușor acut, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) ing. Appressoria simplă sau în grupuri libere, maro mediu, de formă neregulată, contur crenat sau lobat, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) ing. Sexuale morph pe PDA. Ascomata perithecia, formată după 2 wk., solitar, semi-scufundat sau scufundat în mediu agar, nestromatic, subsferic spre ovoid, ostiolat, glabru, maro mediu, 96-130 int.160-200 int. Peridiu 10-12. 5 mm grosime, compus din celule unghiulare aplatizate pal până la maro mediu de 3,5-10 mm diametru. Hife ascogene hialine, cu pereți netezi, delicate, rareori vizibile. Țesutul Interascal nu a fost observat. ASCI unitunicate, 8-spored, cilindrice, conice la apex și de bază, cu pereți netezi, 51-65 de 9,5-13 de metri cubi, trunchiate de bază. Ascospori dispuși biseriat, aseptați, hialini, cu pereți netezi, fusiformi, ușor curbați, baza rotunjită, vârful acut sau rotunjit, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) note: lungimea conidială a izolatelor examinate (CPC 28638, CPC 28639) a fost variabilă și s-a încadrat în intervalul izolatului de tip ex (CBS 125474) al lui C. plurivorum (15-17, 5,5, 5, 5); Damm și colab. 2019).

Material examinat: Thailanda: Chiang Rai, din leziunile frunzelor de Capsicum annuum, 7 iun. 2015, P. W. J. Taylor (culturi CPC 28638 și CPC 28639); Bangkok, restaurant în zona Phaya Thai, țesut infectat de Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (cultura UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm și colab., Armăsar. Mycol. 73: 100 (2012).

decriptare: colonii pe PDA 20-38 mm diam după 7 d (5-6, 2 mm/d), plat cu întreaga margine; suprafață acoperită cu miceliu aerian scurt de culoare roz deschis până la portocaliu, devine gri cu timpul, margine albicioasă până la roz pal, piele de bivol roz invers, gri olivac până la maro-cenușiu în centru; portocaliu invers până la somon, întunecat în centru. Chlamydospori nu au fost observate. Conidiomata acervular, setae nu a fost observat, conidiophores hialin, septat, ramificat. Celule conidiogene hialine, cilindrice sau ampuliforme, 7-17, 5 MMCT, apex 1-3 mmctm diam. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, în cea mai mare parte fuziformă, cu un capăt rotunjit, cu un capăt acut, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia în masă cu somon la culoare portocalie. Appressoria simplă sau în grupuri libere, maro mediu, ovoid, întreagă până la margine crenată, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) ing.

Note: majoritatea izolatelor identificate ca C. scovillei avea o formă similară de spori și dimensiuni de spori, în comparație cu specimenul de tip (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) inox, descris de Damm și colab. (2012a, 2012b). Cu toate acestea, unele izolate au avut o culoare diferită a coloniei, rate diferite de creștere a coloniei și mici diferențe în măsurătorile sporilor.

Material examinat: Indonezia: Gowa, din leziuni de fructe de Capsicum annuum, 7 iunie. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culturi CPC 28577 și CPC 28579); Java de Vest: din leziunea fructelor de Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thailanda: Chiang Mai: din leziunile de fructe ale Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (culturi UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. și colab., Fung. Diversitate 39: 98 (2009)

descriere: colonii pe PDA 79 mm diam în 7 d (5,5-6 mm/zi). Galben pal-alb, gri, dens cottony miceliu aeriene cu conidiomata acervular portocaliu la centru; reverse galben pal. Chlamydospori nu au fost observate. Conidiomata acervular, conidiophores format pe o pernă de celule rotunde și maro mediu. Setae nu a fost observat. Conidiofori hialini, ramificați. Celule conidiogene hialine, cilindrice până la ampuliforme, 6,5-16 mm. Conidia hialină, aseptată, cu pereți netezi, fuziformă până la cilindrică, cu ambele capete rotunjite, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) ing. Appressoria maro închis, solitar, circular, întreg până la crenat margine, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) ing.

Note: izolatele Colletotrichum siamense din diferite țări au prezentat variații ale caracterelor morfologice, în ratele de creștere și morfologia culturii pe PDA. Măsurători conidiale reprezentative pentru izolate reprezentând diferite subclade în arborii filogenetici (Fig. 2, 3) sunt: CPC 30233 (Gowa, Indonezia), la 12,5–17 × 2.5–5.5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Tailanda) 9.5–14.5 × 3.5–5 µm; UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Tailanda) 12-15 x 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10.5–16.5 × 3.5–5.5. Aceste caractere morfologice dintr-o subcladă au fost foarte consistente în fiecare țară. Specia a fost descrisă de Prihastuti și colab. (2009); conidiile specimenului ex-holotip (ICMP 18578/ BDP-I2) au fost raportate ca 7-18.3-3-4,3-3-x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), care cuprinde intervalul observat în izolatele noastre. Această specie a fost raportată a fi diversă din punct de vedere biologic și geografic și se găsește pe multe gazde din mai multe regiuni tropicale și subtropicale (Weir și colab. 2012).

Material examinat: Indonezia: Gowa, din leziunea fructelor de Capsicum annuum, 7 iun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 30233); Jeneponto, din leziunea fructelor de Capsicum sp. 7 iun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 30209). Thailanda: Ratchaburi, din leziunea fructelor de Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1132); Kanchanaburi, din leziunea fructelor de Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, din leziunea fructelor de Capsicum sp. Sep. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (cultura UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas și colab., Mycologia 102: 1331 (2010)

descriere: colonii pe PDA 45 mm diam în 7 d (6,5 mm/zi). Colonii plate, răspândite, cu miceliu aerian moderat,pe suprafața OA gri fum. Pe suprafața PDA olivaceous grey până la fum grey, reverse olivaceous grey, numeroase conidiomate portocalii împrăștiate pe suprafață. Pe suprafața mea alb murdar, invers ocru. Morph Asexual pe OA. Miceliu vegetativ format din hialin până la maro pal, cu pereți netezi, septat, ramificat, hife diam de 2-2, 5 inqutm. Chlamydospori nu au fost observate. Setae rare (doar două văzute), drepte, maro mediu, fin verruculoză, 2-3-septate, până la 120 de centimetrii lungime, apex subobtus rotunjit. Conidiomata acervulara, 150-250 mm diametru, cu masa conidiala portocalie. Conidiofori subcilindrici, flexuosi, 1-3-septati, hialini, netedi, ramificati, 15-25 int. 3,5-4,5 int. Celule conidiogene subcilindrice, hialine, netede, fialidice cu ingrosare periclinala, 7-15 int. 3,5-4,5 int. Conidia hialină, netedă, aseptată, subcilindrică, dreaptă, Apex obtuză, conică la bază până la hilul trunchiat proeminent, 1,5-2 mm diametru, guttulat vizibil, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) ing. Appressoria nu a fost observată. Transformarea sexuală nu a fost observată.

Material examinat: Indonezia, Makassar, din leziunea fructelor de Capsicum annuum, 7 iun. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 28607).

prevalența speciilor de Colletotrichum eșantionate

în general, C. truncatum a fost cea mai răspândită specie (44%) izolată din fructul de chili infectat (Fig. 9) și a fost ușor identificat prin sporii săi falcați și setae abundente în leziunile necrotice. Dintre speciile cu conidii drepte, C. scovillei (complexul acutatum), a fost cea mai comună specie în țările chestionate (35%), cu excepția Sri Lanka, unde această specie nu a fost izolată. Colletotrichum siamense (complexul gloeosporioides) a fost următoarea specie cea mai comună care a avut loc în Thailanda, Sri Lanka și Indonezia (11%). Speciile rămase au fost reprezentate de mai puțin de 10% din numărul total de izolate.

în Indonezia, C. scovillei a fost izolat de fructele de chili infectate în toate regențele chestionate din Sulawesi de Sud, cu excepția Makassar, și în site-ul de testare pe teren din Java de vest. Colletotrichum siamense a fost, de asemenea, izolat din întreaga regiune, din Gowa, Jeneponto și Makassar. Cele două specii noi, C. makassarense și C. javanense au fost izolate din Makassar și Java de Vest, respectiv.

în Thailanda, C. scovillei a fost izolat mai ales din provinciile nordice Chiang Mai și Chiang Rai, dar a fost obținut și din fructe de chili infectate într-un loc de încercare al Universității Kasetsart din Nakhon Pathom. Provinciile occidentale au avut o incidență ridicată a C. siamense și un izolat de C. endophyticum a fost colectat de la Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum a fost izolat din frunzele de chili cu leziuni necrotice în Chiang Rai și din leziunile necrotice ale fructelor de chili găsite într-un restaurant din zona Phaya Thai din Bangkok. În plus, C. fructicola a fost identificată din fructele colectate din Chiang Mai.

în Taiwan, un izolat a fost identificat ca o nouă specie, C. tainanense, colectată din fructe de chili infectate în provincia Tainan, și C. fructicola a fost identificată din fructe în Hsinchu și Nantou, Taiwan. Colletotrichum plurivorum a fost identificat și dintr-un fruct colectat în Johor, Malaezia.

patogenitate

toate speciile de Colletotrichum au cauzat simptome de antracnoză pe fructele rănite, dar au existat diferențe semnificative în ceea ce privește severitatea simptomelor. Pe fructele rănite, izolatele de C. scovillei și C. javanense au prezentat cea mai mare severitate a bolii, producând leziuni mari, necrotice, cu dimensiuni medii ale leziunii 15,6–20,3 mm (Tabelul 5). La fructele ne-rănite, toate speciile au fost mai puțin patogene, cu dimensiuni medii ale leziunii mai mici de 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale și C. plurivorum, au produs doar leziuni foarte mici sau fără simptome vizibile (dimensiunea medie a leziunii < 1 mm) 10 d după inocularea fructelor ne-rănite. Izolatele Colletotrichum javanense și C. scovillei au fost cele mai patogene la fructele ne-rănite și au produs leziuni cu dimensiuni medii de 9,4 și, respectiv, 9,1 mm. Leziunile cauzate de C. scovillei au fost semnificativ mai mari decât cele cauzate de toate celelalte specii, cu excepția C. javanense în fructe rănite și C. endophyticum în fructe nespuse. Semnificația testelor T în perechi depinde în mare măsură de numărul de izolate din fiecare specie eșantionată, astfel încât grupările prezentate în tabelul 5 nu se modifică pur și simplu cu amploarea diferenței dintre mijloace; o diferență mare poate să nu fie semnificativă dacă există dimensiuni mici ale eșantioanelor pentru ambele specii, în timp ce o diferență mai mică poate fi semnificativă. În special, comparațiile care implică C. javanense și C. endophyticum sunt foarte imprecise, deoarece a fost testat un singur izolat din fiecare specie.