Formato de salida
En la página de resultados, para cada secuencia de consulta se presentará el nombre, la longitud y la puntuación de salida de la red en la que se basa la asignación cTP/no cTP. Cuanto mayor sea la puntuación, más segura es la red de que esta secuencia contiene un péptido de tránsito de cloroplastos N-terminal (cTP).También se presentará una longitud potencial de cTP, junto con la puntuación correspondiente del sitio de división. Tenga en cuenta que la predicción de la longitud del transitpéptido se lleva a cabo incluso si no se predice su presencia.El propósito es proporcionar la máxima información en casos límite.
Si se elige “Salida detallada”, también se presentará la puntuación de la red neuronal para cada residencia. Cuanto mayor sea esta puntuación, más segura será la red de que este residuo forma parte de un cTP. También se presenta un derivado del networkscore. Esta puntuación se utiliza para encontrar el área en la que se busca el sitio de extracción, es decir, entre los 40 residuos que rodean el residuo con la puntuación derivada más alta. Finalmente, se presenta la puntuación del sitio de escisión(score-score) para cada residuo. Esta puntuación se calcula a partir de una matriz de ascensión derivada de un algoritmo automático de búsqueda de motivos llamado MEME. La puntuación de la escisión se define de modo que el sitio de escisión predicho sea directamente terminal del residuo de mayor puntuación dentro de los 40 residuos. Por lo tanto, es posible que exista uno o varios score(s) CS que resulten ser mayores que el score de la longitud de cTP propuesta, pero dado que se encuentran fuera de los 40residuos alrededor de la puntuación de derivados más alta, la longitud de cTP presentada sigue siendo lo que ChloroP considera como la longitud de presecuencia más probable(es decir, la longitud de cTP presentada). correspondiendo al sitio de escisión más probable).
