Identificación, prevalencia y patogenicidad de especies de Colletotrichum que causan antracnosis de Capsicum annuum en Asia

Las observaciones morfológicas y los datos filogenéticos de las especies de conidios rectos identificaron claramente tres especies nuevas, dos de Indonesia y una de Taiwán. A continuación se proporcionan descripciones morfológicas detalladas de todas las especies de Colletotrichum asociadas con la antracnosis de chile (Tabla 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB826936.

Figura 6 Etimología: Lleva el nombre de Java, la isla en Indonesia donde se recolectó la especie.

Diagnóstico: Colletotrichum javanense difiere de C. brisbanense en la formación de clamidosporas y conidiomas acervulares distintos en todos los medios probados. En contraste, C. brisbanense solo produjo Conidiomas en el tallo del Antrisco, pero no se observaron células basales. Además, C. javanense crece más rápido que C. brisbanense (C. javanense en OA, MEA y SNA de 60, 55 y 66 mm de diámetro en 7d, respectivamente, C. brisbanense en OA y SNA de 18,5, 20 mm de diámetro en 7d, respectivamente). Colletotrichum javanense es filogenéticamente distinto a C. brisbanense con ambas especies siendo diferentes en las secuencias de chs-1, y más efectivamente con gapdh (diferencia de 7 pa) e his3 (diferencia de 4 pa).

Tipo: Indonesia: Java Occidental, regencia de Purwakata, sobre fruta de Capsicum annuum, diciembre. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963-holotipo; CBS 144963 = UOM 1115 = cultivos de tipo EWINDO 3 – ex).

Descripción: Transformación sexual no observada. Transformación asexual en PDA. Micelio vegetativo de 1-5 µm de diámetro, hialino, de paredes lisas, septado, hifas ramificadas. Clamidosporas globosas o alargadas, de color marrón pálido, de paredes lisas, de 5-25 × 3-8 µm. Conidioma acervular, setos no observados. Conidióforos hialinos, septados, ramificados. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas o ampolliformes, de 7-17, 5 µm, ápice de 1-3 µm de diámetro. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, en su mayoría fusiformes, un extremo redondeado, el otro extremo agudo o ambos extremos agudos (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Conidios en masa de color amarillo a naranja. Appressoria individual o en grupos sueltos, marrón medio, de paredes lisas, subglobosas o elípticas, con margen entero u ondulado, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

Transformación asexual en SNA. Micelio vegetativo de 1-7 µm de diámetro, hialino, de paredes lisas, septado, hifas ramificadas. Clamidosporas globosas o alargadas, de color marrón pálido, de paredes lisas, de 4,5-28 × 4-8 µm. Conidioma acervular, setos no observados. Conidióforos hialinos, septados, ramificados, de 20-35 µm de largo. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas o ampolliformes, 5-20 µm, ápice, 1-3 µm de diámetro. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, cilíndricos con ambos extremos agudos o un extremo redondo y un extremo agudo, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Conidios en masa de color amarillo a naranja.

Características del cultivo: Colonias en PDA de 48-54 mm de diámetro en 7 d (6,5–7,5 mm/d), planas con margen entero; superficie cubierta de micelio aéreo corto de color gris a verde oliva, margen blanco a gris claro, reverso mayormente blanquecino crema, gris oliváceo a negro en el centro. Conidiomas acervulares de color amarillo a naranja. Las colonias en SNA eran de 60-66 mm de diámetro en 7 d (8-9, 5 mm/d), planas con margen entero, hialinas a marrón pálido, superficie cubierta con micelio aéreo gris corto, inverso de los mismos colores. Conidioma acervular anaranjado en el centro de la cultura. Las colonias en AA eran de 55-60 mm de diámetro en 7 d (7,8–8,5 mm/d), planas con margen entero; superficie cubierta con micelio aéreo corto de color crema a gris, margen blanco, reverso mayormente naranja claro, con pigmentos marrones. Conidioma acervular anaranjado. Colonias en la superficie del MEA micelio aéreo corto gris pálido, naranja claro inverso.

Notas: La coincidencia más cercana en una búsqueda de blastn con la secuencia gapdh fue GenBank JQ948617, C. cepa sloanei IMI 364297 con 98% de identidad (4 diferencias de presión arterial), mientras que las coincidencias más cercanas con la secuencia his3 con 99% de identidad (2 diferencias de presión arterial) fueron GenBank JQ949279 C. cepa indonesiense CBS 127551 y GenBank KJ947248 C. aislado de guajavae OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827691.

Figura 7 Etimología: Nombrada en honor a Makassar, la ciudad en el sur de Sulawesi, Indonesia, donde se recolectó la especie.

Diagnóstico: Colletotrichum makassarense está filogenéticamente estrechamente relacionado con C. tropicale. Los datos de secuencia de ITS no pudieron separar las dos especies, pero se pueden distinguir por todos los otros genes probados y de manera más efectiva utilizando datos de secuencia ApMat (22 diferencias de presión arterial) y gs (18 diferencias de presión arterial).

Tipo: Indonesia: Makassar, de lesión frutal de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H – 143664-holotipo; CBS 143664 = cultivos de tipo CCP 28612-ex).

Descripción: Transformación sexual no observada. Transformación asexual en OA. Micelio vegetativo compuesto de hifas ramificadas, septadas, hialinas, de paredes lisas, de 2-3 µm de diámetro. No se observan clamidosporas. Setas presentes, marrón medio, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-septadas, disminuyendo a ápices agudos. Conidioma acervular, de 100-200 µm de diámetro, con masas conidiales anaranjadas. Conidióforos subcilindricos, flexuosos, 1-4-septados, hialinos, lisos, ramificados, 15-45 × 3-4 µm. Células conidiógenas subcilindricas, hialinas, lisas, fialídicas con engrosamiento periclinal, 7-25 × 3-4 µm. Conidios hialinos, lisos, aseptados, subcilindricos, rectos, ápice obtuso, cónicos en la base a hilio truncado protuberante, de 1 µm de diámetro, prominentemente gutulados, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Apresorios solitario, marrón medio, de paredes lisas, subglobose, elipsoidales a obovadas, de margen entero, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

Características de cultivo: Colonias en PDA de 45 mm de diámetro después de 7 d (6,5 mm / d), colonias planas, con micelio aéreo moderado, en superficie de AA gris humo. En la superficie de PDA gris humo, gris oliváceo inverso. En la superficie del MEA, blanco sucio, ocre inverso.

Notas: La coincidencia más cercana en una búsqueda de blastn con la secuencia ApMat fue GenBank KU923732, C. queenslandicum cepa AUS22 con una identidad del 98% (16 diferencias de presión arterial), mientras que la coincidencia más cercana con la secuencia gs con una identidad del 99% (7 diferencias de presión arterial) fue GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24. Las mejores coincidencias con la secuencia gapdh fueron GenBank KX578784 C. siamense (99% de identidad, 3 diferencias de presión arterial) y GenBank KU221347 C. queenslandicum (99% de identidad, 3 diferencias de presión arterial).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827692.

Figura 8 Etimología: Lleva el nombre de Tainan, la ciudad de Taiwán donde se recolectó la especie.

Diagnóstico: Colletotrichum tainanense difiere de su vecino filogenético más cercano C. salsolas en las características de cultivo en PDA, micelio aéreo escaso y micelio de superficie gris pálido de ratón, mientras que C. salsolae produce una capa de estructuras similares a acervulos con masas conidiales de color marrón anaranjado profundo y numerosos setos. Las dos especies son separables utilizando todos los genes probados, excepto SU y más eficazmente con secuencias gapdh (diferencia de 7 pa), tub2 (diferencia de 6 pa) y act (diferencia de 5 pa). Solo hay una diferencia de pa en la secuencia chs-1 entre las dos especies.

Tipo: Taiwán: Tainan: en fruta de Capsicum annuum, Agosto. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666-holotipo; CBS 143666 = CCP 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – cultivos de tipo ex).

Descripción: Transformación sexual no observada. Transformación asexual en PDA. Micelio vegetativo ramificado, hialino, de paredes lisas, septadas, hifas de 2-3 µm de diámetro, melanizadas con el tiempo. Un solo conidioma encontrado en una placa de PDA, estéril en SNA, MEA y OA. No se observan clamidosporas ni setos. Conidióforos subcilindricos, flexuosos, 1-2 septados, hialinos, de color marrón claro a liso, ramificados. Células conidiógenas subcilindricas, hialinas, lisas, periídicas con engrosamiento periclinal. Conidios hialinos, lisos, aseptados, subcilindricos a subclavados, rectos o ligeramente curvados, ápice obtuso, cónico en la base a hilio truncado saliente, 1,5-2 µm de diámetro, prominentemente gutulados, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Apresorios sola o suelto grupos, a menudo estrecho-cilíndrica, de medio a marrón oscuro, a menudo, adelgazándose hacia el ápice, con el borde entero o ondulan a veces irregularmente lobulado (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

Características de cultivo: Colonias en PDA de 45 mm de diámetro después de 7 d (6,5 mm / d), colonias planas, con micelio aéreo moderado. En la superficie de AA, gris ratón pálido. En la superficie de PDA gris ratón pálido, gris ratón inverso. En la superficie del MEA, gris pálido ratón, gris oliváceo inverso.

Notas: La coincidencia más cercana en una búsqueda de blastn con la secuencia gapdh con 99% de identidad (diferencia de 2 pb) fue GenBank KC790761 Colletotrichum sp. cepa MTCC 9664, mientras que la coincidencia más cercana con la secuencia act con 99% de identidad (diferencia de 2 pb) fue GenBank KY995522 C. siamense cepa LJDY1–2. La coincidencia más cercana con la secuencia tub2 con una identidad del 99% (diferencia de 7 pa) fue GenBank MF143931 C. cepa siamense 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Diversidad 61: 112 (2013); como ‘endofítica’.

Descripción: Colonias en PDA de 42 mm de diámetro después de 7 d (5,5 mm / d), micelio aéreo de color naranja pálido a blanco; blanco pálido inverso a naranja y negro en el centro y numerosos conidiomas anaranjados dispersos por la superficie. No se observan clamidosporas. Conidiomas presentes, conidióforos formados directamente sobre hifas. Setas presentes, moderadamente brown, 47-95 × 3-6 µm, 3-4-septadas, disminuyendo ápices agudos. Conidióforos hialinos, de paredes lisas y sin ramificaciones. Células conidiógenas hialinas, de paredes lisas, aseptadas, subcilindricas, de 12-21 × 3-4 µm. Conidios hialinos, de paredes lisas, aseptados, recto, cilíndrico, con dos extremos obtusos, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Apresorios sola o suelto grupos, marrón, ligeramente lobulado, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

Notas: Colletotrichum endophyticum fue descrito por primera vez como un endófito de hierba de Pennisetum purpureum del norte de Tailandia (Manamgoda et al. 2013). Más tarde, se informó de varias otras especies hospederas, incluido el pimiento en China (Diao et al. 2017). La longitud de los conidios del aislado de Tailandia (UOM 1137) fue ligeramente más corta que la del tipo ex (LC0324) de C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

Material examinado: Tailandia: Kanchanaburi: de lesión frutal de Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultivo UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al., Fung. Diversity 39: 158 (2009).

Descripción: Colonias en PDA de 65 mm de diámetro después de 7 d (8,5-11 mm/d), planas con todo el borde, micelio aéreo denso, algodonoso, micelio aéreo de gris pálido a blanco y numerosos estromas negros dispersos sobre la superficie, gris en el centro, blanco en el margen; verde grisáceo inverso. No se observan clamidosporas. Se observaron conidiomas acervulares, Setos marrones, de paredes lisas, 1-2 septados, de 60 µm de largo, ápices agudos afilados. Conidióforos hialinos, septados, ramificados. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas o ampolliformes, de 7-17, 5 µm. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, cilíndricos, ambos extremos obtusos, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Apresorios no se observó.

Notas: La transformación sexual de estos aislados no se observó en cultivo. Conidios longitud de aislar CPC 28644 fue ligeramente mayor que la de la ex-tipo de ICMP (18581 = BPD-I16) de C. fructicola (conidios 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

Material examinado: Tailandia: Chiang Mai: de lesión de fruta de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culturas CCP 28644 y CCP 28645). Taiwán: Cyonglin, Hsinchu, de lesión de fruto de fruto rojo maduro de Capsicum sp. (pimienta dulce), 22 de abril. 2015, Z. M. Sheu (cultivo UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, de lesión de fruta verde de Capsicum sp. (pimienta dulce), 4 de septiembre. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (culture UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241( 2011); como ‘karstii’.

Descripción: Colonias en PDA de 65 mm de diámetro después de 7 d (6,5–10.5 mm / d), plano con todo el borde, micelio aéreo de color naranja a blanco y numerosas masas conidiales anaranjadas dispersas por la superficie, blancas en el margen; reverso amarillo a naranja. No se observan clamidosporas. Se observaron conidiomas acervulares, setos marrones, de paredes lisas, 2-4 septados, de 60 µm de largo, base sumergida, cónica hacia el ápice, punta mayormente aguda. Conidióforos hialinas, septadas, ramificadas, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas o ampolliformes, de 7-15, 5 µm. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, cortos, cilíndricos, ambos extremos obtusos o un extremo ligeramente agudo o truncado en la base, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria simple o en grupos sueltos, marrón, subgloboso, contorno circular, 6-12, 5 × 3,5-8 µm.

Notas: Los cuatro aislados identificados de Indonesia en el complejo boninense produjeron conidios cortos distintos en comparación con el cultivo ex epitípico de C. karsti (14,5-17 × 5-6, 5 µm; Yang et al. 2011). Sin embargo, la alta variabilidad del tamaño de los conidios entre las diferentes cepas de C. los karsti fueron reportados por Damm et al. (2012a, 2012b) donde las mediciones de conidios de CBS 129833 fueron (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, media ± DE = 13,1 ± 0,7 × 5,8 ± 0,4 µm; y CBS 111998 tenía una longitud de conidio de hasta 18,5 µm, relación L/W = 2,8. Estos aislamientos no formaron una transformación sexual en la cultura. Aunque estos cuatro aislados formaron una subclada totalmente soportada (100% BS/1 PP) dentro de C. karsti, todos los árboles genéticos individuales (datos no mostrados) no proporcionaron un soporte significativo para justificar la introducción de una especie críptica para estos aislados.

Material examinado: Indonesia: Jeneponto, de lesiones de frutos de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin( cultivos CPC 28553, CPC 28554); a partir de lesión de fruto de frutos rojos maduros y lesiones del pedúnculo de Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultivos CCP 28601, CCP 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Perno. Mycol. 92: 31 (2019).

Descripción: Colonias en PDA de 63 mm de diámetro después de 7 d (8 mm/d), micelio aéreo gris a marrón oscuro; inverso de color gris a marrón claro con amarillo anaranjado en el centro con abundantes conidiomas acervulares que rezuman masas conidiales de color naranja pálido en el centro, no se observan clamidosporas. Conidiomas presentes (cerca del punto de inoculación), conidióforos formados directamente sobre hifas. Esclerocios presentes. Setas presentes, marrón medio, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-septadas, adelgazándose hacia los ápices agudos, a menudo con una constricción en el ápice. Conidióforos hialinos a marrón pálido, de paredes lisas, septados y ramificados. Células conidiógenas hialinas, de paredes lisas, aseptadas, subcilíndricas, rectas a suavemente curvadas, 26-48 × 3-4 µm, perialídicas, con engrosamiento periclinal visible. Conidios hialinos, de paredes lisas, aseptados, rectos, cilíndricos con dos extremos obtusos o un extremo ligeramente agudo, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Apresorios sola o suelto grupos, marrón medio, de forma irregular, crenadas o contorno lobulado, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Transformación sexual en PDA. Así peritecios, formado después de 2 semanas. solitaria, semi-sumergida o sumergida en el medio de agar, no cromática, subesférica a ovoide, ostiolada, glabra, marrón medio, 96-130 × 160-200 µm. Peridio de 10-12, 5 µm de espesor, compuesto de células angulares aplanadas de color marrón pálido a medio, de 3,5–10 µm de diámetro. Hifas ascógenas hialinas, de paredes lisas, delicadas, raramente visibles. Tejido interascal no observado. Unidad Asci unitaria, de 8 esporas, cilíndrica, cónica al ápice y a la base, de paredes lisas, 51-65 × 9,5-13 µm, la base truncada. Ascosporas dispuestas biseriamente, aseptadas, hialinas, de paredes lisas, fusiformes, ligeramente curvadas, con la base redondeada, ápice agudo o redondeado, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

Notas: La longitud conidial de los aislados examinados (CCP 28638, CCP 28639) fue variable y estuvo dentro del rango del aislado de tipo ex (CBS 125474) de C. plurivorum (15-17 × 5,5 µm; Damm et al. 2019).

Material examinado: Tailandia: Chiang Rai, de lesiones foliares de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor (culturas CCP 28638 y CCP 28639); Bangkok, restaurante en el área de Phaya Thai, tejido infectado de Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (culture UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Perno. Mycol. 73: 100 (2012).

Descripción: Colonias en PDA de 20-38 mm de diámetro después de 7 d (5-6, 2 mm/d), planas con margen entero; superficie cubierta de micelio aéreo corto de color rosa claro a naranja, que se vuelve gris con el tiempo, margen de color blanquecino a rosa pálido, reverso de color rosa pálido, gris oliváceo a gris pardo en el centro; reverso de color naranja a salmón, oscuro en el centro. No se observan clamidosporas. Conidiomas acervulares, setos no observados, Conidióforos hialinos, septados, ramificados. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas o ampolliformes, de 7-17, 5 µm, ápice de 1-3 µm de diámetro. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, muy fusiformes, un extremo redondeado, un extremo agudo, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidios en masa de color salmón a naranja. Apresorios sola o suelto grupos, marrón medio, ovoides, entero a crenado margen, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

Notas: La mayoría de los aislados identificados como C. scovillei tenía forma de esporas y tamaños de esporas similares, en comparación con el espécimen tipo(10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, descrito por Damm et al. (2012a, 2012b). Sin embargo, algunos aislados tenían diferentes colores de colonia, diferentes tasas de crecimiento de colonias y pequeñas diferencias en las mediciones de esporas.

Material examinado: Indonesia: Gowa, de lesiones de frutos de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin( cultivos CCP 28577 y CCP 28579); Java Occidental: de lesión de fruta de Capsicum annuum, Dic. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Tailandia: Chiang Mai: de lesiones de frutos de Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (cultures UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al., Fung. Diversidad 39: 98 (2009)

Descripción: Colonias en PDA de 79 mm de diámetro en 7 d (5,5–6 mm/d). Micelio aéreo de color amarillo-blanco pálido, gris, denso algodonoso con conidiomas acervulares anaranjados en el centro; reverso amarillento pálido. No se observan clamidosporas. Conidiomas acervulares, conidióforos formados sobre un cojín de células redondeadas y de color marrón medio. Setae no observado. Conidióforos hialinos, ramificados. Células conidiógenas hialinas, cilíndricas a ampolliformes, de 6,5-16 µm. Conidios hialinos, aseptados, de paredes lisas, fusiformes a cilíndricos, ambos extremos redondeados sin rodeos, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Apresorios de color marrón oscuro, solitario, circular, todo al margen crenado, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

Notas: Aislados de Colletotrichum siamense de diferentes países mostraron variación de caracteres morfológicos, en tasas de crecimiento y morfología de cultivo en PDA. Mediciones conidiales representativas para aislados que representan diferentes subclados en los árboles filogenéticos (Figs. 2, 3) son: CPC 30233 (Gowa, Indonesia), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Tailandia) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Tailandia) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3,5–5.5. Estos caracteres morfológicos dentro de un subclade fueron muy coherentes dentro de cada país. La especie fue descrita por Prihastuti et al. (2009); los conidios del espécimen ex holotipo (ICMP 18578/ BDP-I2) fueron reportados como 7-18.3 × 3-4.3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), que abarca el rango observado en nuestros aislamientos. Se informó que esta especie es biológica y geográficamente diversa, y se encuentra en muchos huéspedes en varias regiones tropicales y subtropicales(Weir et al. 2012).

Material examinado: Indonesia: Gowa, de lesión frutal de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin( cultivo CPC 30233); Jeneponto, de lesión frutal de Capsicum sp. 7 de junio 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CCP de cultura 30209). Tailandia: Ratchaburi, de la lesión del fruto de Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultivo UOM 1132); Kanchanaburi, de lesión frutal de Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultivo UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, de lesión de fruta de Capsicum sp. Sep. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (culture UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Micología 102: 1331 (2010)

Descripción: Colonias en PDA de 45 mm de diámetro en 7 d (6,5 mm/d). Colonias planas, dispersas, con micelio aéreo moderado, Sobre superficie de OA gris humo. En la superficie de PDA, gris oliváceo a gris humo, gris oliváceo inverso, numerosos conidiomas anaranjados dispersos por la superficie. En la superficie del MEA, blanco sucio, ocre inverso. Transformación asexual en OA. Micelio vegetativo compuesto de hifas de 2-2, 5 µm de diámetro, de hialino a marrón claro, de paredes lisas, septadas, ramificadas. No se observan clamidosporas. Setos raros (solo dos vistos), rectos, de color marrón medio, finamente verrucosos, de 2-3 septados, de hasta 120 µm de largo, con el ápice redondeado subobtusivamente. Conidioma acervular, de 150-250 µm de diámetro, con masa conidial naranja. Conidióforos subcilindricos, flexuosos, 1-3-septados, hialinos, lisos, ramificados, 15-25 × 3,5-4,5 µm. Células conidiógenas subcilindricas, hialinas, lisas, fialídicas con engrosamiento periclinal, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Conidios hialinos, lisos, aseptados, subcilindricos, rectos, ápice obtuso, cónicos en la base al hilio truncado saliente, de 1,5 a 2 µm de diámetro, prominentemente gutulados, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Apresorios no se observó. Transformación sexual no observada.

Material examinado: Indonesia, Makassar, de lesión frutal de Capsicum annuum, 7 de junio. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (CCP de cultura 28607).

Prevalencia de especies de Colletotrichum muestreadas

En general, C. truncatum fue la especie más prevalente (44%) aislada de chiles infectados (Fig. 9) y fue fácilmente identificado por sus esporas falcadas y abundantes setos en las lesiones necróticas. De las especies con conidios rectos, C. scovillei (complejo acutatum), fue la especie más común en todos los países estudiados (35%), excepto en Sri Lanka, donde esta especie no estaba aislada. Colletotrichum siamense (complejo gloeosporioides) fue la siguiente especie más común en Tailandia, Sri Lanka e Indonesia (11%). Las especies restantes estaban representadas por menos del 10% del número total de aislados.

En Indonesia, C. scovillei fue aislado de fruta de chile infectada en todas las regencias encuestadas del sur de Sulawesi, excepto en Makassar, y en el sitio de ensayo de campo en Java Occidental. Colletotrichum siamense también fue aislado de toda la región, de Gowa, Jeneponto y Makassar. Las dos nuevas especies, C. makassarense y C. javanense fueron aisladas de Makassar y Java Occidental, respectivamente.

En Tailandia, C. scovillei se aisló principalmente de las provincias septentrionales de Chiang Mai y Chiang Rai, pero también se obtuvo de fruta de chile infectada en un sitio de prueba de la Universidad Kasetsart en Nakhon Pathom. Las provincias occidentales tuvieron una alta incidencia de C. siamense y se recolectó un aislado de C. endophyticum de Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum se aisló de hojas de chile con lesiones necróticas en Chiang Rai y de lesiones necróticas de frutas de chile encontradas en un restaurante en el área de Phaya Thai de Bangkok. Además, se identificó C. fructicola a partir de fruta recolectada en Chiang Mai.

En Taiwán, se identificó un aislado como una nueva especie, C. tainanense, recolectada de fruta de chile infectada en la provincia de Tainan, y C. la fructicola se identificó a partir de frutas en Hsinchu y Nantou, Taiwán. Colletotrichum plurivorum también se identificó a partir de una fruta recolectada en Johor, Malasia.

Patogenicidad

Todas las especies de Colletotrichum causaron síntomas de antracnosis en frutas heridas, pero hubo diferencias significativas en la gravedad de los síntomas. En el fruto herido, los aislados de C. scovillei y C. javanense mostraron la mayor gravedad de la enfermedad, produciendo lesiones necróticas grandes con tamaños medios de lesión de 15,6 a 20,3 mm (Tabla 5). En frutos no heridos, todas las especies fueron menos patógenas, con tamaños medios de lesión inferiores a 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale y C. plurivorum, produjeron solo lesiones muy pequeñas o ningún síntoma visible (tamaño medio de lesión < 1 mm) 10 d después de la inoculación de frutos no heridos. Los aislados de Colletotrichum javanense y C. scovillei fueron los más patógenos en frutos no heridos y produjeron lesiones con tamaños medios de 9,4 y 9,1 mm, respectivamente. Las lesiones causadas por C. scovillei fueron significativamente mayores que las causadas por todas las demás especies, excepto C. javanense en frutos heridos y C. endophyticum en frutos no arrollados. La importancia de las pruebas t en parejas depende en gran medida del número de aislados de cada especie muestreada, por lo que los grupos que se muestran en el cuadro 5 no cambian simplemente con la magnitud de la diferencia de medias; una gran diferencia puede no ser significativa si hay tamaños de muestra pequeños para ambas especies, mientras que una diferencia más pequeña puede ser significativa. En particular, las comparaciones con C. javanense y C. endophyticum son muy imprecisas, ya que solo se probó un aislado de cada especie.