Identificación y caracterización de amarillo cítrico vena de compensación de virus, un supuesto nuevo miembro del género Mandarivirus
características Moleculares y genómicas de la organización se determinaron para el amarillo Cítrico vena de compensación de virus (CYVCV), la supuesta viral agente causal de amarillo vena de compensación de la enfermedad de limoneros, informó en Pakistán, la India, y más recientemente en Turquía y China. El aislado Y1 de CYVCV de Adana, Turquía, se utilizó para el análisis de secuenciación profunda de pequeñas fracciones de ARN inducidas por el virus y para la inoculación mecánica y de injertos de plantas indicadoras herbáceas y cítricas. Se desarrolló un antisuero policlonal a partir de CYVCV-Y1 purificado de Phaseolus vulgaris y se utilizó en ensayos de western blot para caracterizar la proteína de la capa de CYVCV-Y1 y determinar su relación serológica con virus relacionados. Los contiguos ensamblados a partir de las lecturas cortas secuenciadas de Illumina se utilizaron para construir el genoma completo del virus de limpieza de venas amarillas de Cítricos (CYVCV), que consiste en un ARN de sentido positivo de 7.529 nucleótidos y que contiene seis marcos de lectura abiertos previstos. La organización y el tamaño del genoma del CYVCV se asemejaban a los de los flexivirus, y la búsqueda de homologías de secuencia reveló que el virus indio de manchas anulares de cítricos (ICRSV) (Mandarivirus, Alphaflexiviridae) es el virus más estrechamente relacionado. Sin embargo, el CYVCV tenía una identidad de secuencia de nucleótidos global de ≈74% con el ICRSV. Aunque los dos virus eran similares con respecto a la organización del genoma, las partículas virales y el rango del huésped herbáceo, el CYVCV causó síntomas diferentes en los cítricos y fue serológicamente distinto del ICRSV. Se diseñaron y utilizaron pares de cebadores para detectar el virus mediante reacción en cadena de polimerasa con transcripción inversa convencional y cuantitativa en árboles de campo sintomáticos de limpieza de venas amarillas, así como plantas huésped inoculadas mecánicamente y con injerto. Colectivamente, estos datos sugieren que el CYVCV es el agente causal de la enfermedad de limpieza de venas amarillas y representa una nueva especie en el género Mandarivirus.
