Capsicum annuumin antraknoosia aiheuttavien Colletotrichum-lajien tunnistaminen, esiintyvyys ja patogeenisuus Aasiassa

suoran conidia-lajin morfologiset havainnot ja fylogeneettiset tiedot tunnistivat selvästi kolme uutta lajia, kaksi Indonesiasta ja yhden Taiwanista. Seuraavassa esitetään yksityiskohtaiset morfologiset kuvaukset kaikista chiliantrasnoosiin liittyvistä Colletotrichum-lajeista (Taulukko 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Marraskuuta. MycoBank MB826936.

kuva 6 etymologia: nimetty Indonesiassa sijaitsevan Jaavan saaren mukaan, jolta laji kerättiin.

diagnoosi: Colletotrichum javanense eroaa C. brisbanensesta siten, että se muodostaa kaikissa testatuissa medioissa erilliset chlamydospores ja acervular conidiomata. Sen sijaan C. brisbanense tuotti Conidiomataa vain Antriskuksen varteen, mutta tyvisoluja ei havaittu. Lisäksi C. javanense kasvaa nopeammin kuin C. brisbanense (C. javanense on OA, MEA ja SNA 60, 55 ja 66 mm diam in 7 d, C. brisbanense on OA ja sna 18,5, 20 mm diam in 7 d, vastaavasti). Colletotrichum javanense eroaa fylogeneettisesti C: stä. brisbanense, jossa molemmat lajit ovat erilaisia CHS-1: n sekvensseissä, ja tehokkaimmin gapdh: N (7 bp: n ero) ja his3: N (4 bp: n ero) kanssa.

Tyyppi: Indonesia: West Java, Purwakata regency, on fruit of Capsicum annuum, Joulukuu. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotyyppi; CBS 144963 = UOM 1115 = ewindo 3 – ex-tyypin kulttuurit).

kuvaus: seksuaalinen morph ei havaittu. Aseksuaalinen morph PDA: lla. Kasvullinen rihmasto 1-5 µm Diam, hyaliini, sileäseinäinen, septaatti, haarautunut hyphae. Chlamydospores pallomainen tai pitkulainen, vaaleanruskea, sileäseinäinen, 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervular, setae ei havaittu. Conidiofores hyaline, septaatti, haarautunut. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen tai ampulliformi, 7-17, 5 µm, apex 1-3 µm diam. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, enimmäkseen fusiform, toinen pää pyöristetty, toinen pää akuutti, tai molemmat päät akuutti (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Conidia massana keltainen tai oranssi väri. Appressoria yksittäin tai löyhinä ryhminä, keskiruskea, sileäseinäinen, subgloboosi tai elliptinen, kokonaisena tai aaltomaisena reunana, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

suvuton morph on SNA. Kasvullinen rihmasto 1-7 µm Diam, hyaliini, sileäseinäinen, septaatti, haarautunut hyphae. Chlamydospores pallomainen tai pitkulainen, vaaleanruskea, sileäseinäinen, 4,5-28 × 4-8 µm. Conidiomata acervular, setae ei havaittu. Conidiofores hyaline, septaatti, haarautunut, 20-35 µm pitkä. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen tai ampulliformi, 5-20 µm, apex, 1-3 µm diam. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, lieriömäinen, jonka molemmista päistä akuutti tai toinen pää pyöreä ja toinen pää akuutti, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Conidia massana, väriltään keltaisesta oranssiin.

viljelmän ominaisuudet: pesäkkeet kämmenmikrossa 48-54 mm 7 d (6, 5–7, 5 mm/d), tasaiset, koko marginaali; pinta peitetty harmaalla tai oliivinvihreällä lyhyellä antennirihmastolla, reunasta valkoinen tai vaaleanharmaa, keskeltä enimmäkseen kermanvalkea, oliivinharmaasta mustaan. Keltaisesta oranssiin acervular conidiomata. Pesäkkeitä SNA oli 60-66 mm diam 7 d (8-9, 5 mm/d), tasainen koko marginaali, hyaliini vaaleanruskea, pinta peitetty lyhyt harmaa antenni rihmasto, Käänteinen samat värit. Orange acervular conidiomata keskellä kulttuuria. Pesäkkeitä OA olivat 55-60 mm diam 7 d (7,8-8,5 mm / d), tasainen koko marginaali; pinta peitetty kerma harmaa lyhyt antenni rihmasto, marginaali valkoinen, Käänteinen enimmäkseen vaalean oranssi, ruskea pigmenttejä. Oranssi acervular conidiomata. Pesäkkeet Mean pinnalla Vaalean harmaa lyhyt antenni rihmasto, Käänteinen vaalean oranssi.

Huom. lähin vastaavuus blastn-haussa gapdh-sekvenssin kanssa oli GenBank JQ948617, C. sloanei-kanta IMI 364297 98%: n identiteetillä (4 bp: n erot), kun taas lähimmät osumat his3: n sekvenssin kanssa 99%: n identiteetillä (2 bp: n erot) olivat GenBank JQ949279 C. indonesiensen kanta CBS 127551 ja GenBank KJ947248 C. guajavae eristää OBP19: n.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Marraskuuta. MycoBank MB827691.

Kuva 7 etymologia: nimetty Etelä-Sulawesin kaupungissa Indonesiassa sijaitsevan Makassarin mukaan, josta laji kerättiin.

diagnoosi: Colletotrichum makassarense on fylogeneettisesti läheistä sukua C. tropicalelle. Sekvenssitiedot sen ei voinut erottaa kaksi lajia, mutta ne voidaan erottaa kaikki muut geenit testattu ja tehokkaimmin käyttämällä ApMat (22 bp erot) ja gs (18 bp erot) sekvenssitiedot.

Tyyppi: Indonesia: Makassar, Capsicum annuumin hedelmäleesiosta, 7.kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotyyppi; CBS 143664 = CPC 28612 – ex-tyypin kulttuurit).

kuvaus: Seksuaalinen morph ei havaittu. Aseksuaalinen morph on OA. Kasvullinen rihmasto koostuu hyaliinista, sileäseinäinen, septaatti, haarautunut hyphae, 2-3 µm diam. Chlamydospores ei havaittu. Setae läsnä, keskiruskea, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-septaatti, kapeneva akuutti apices. Conidiomata acerpular, 100-200 µm diam, oranssit kartiomassat. Conidiofores subcylindrical, flexuous, 1-4-septaatti, hyaliini, sileä, haarautunut, 15-45 × 3-4 µm. Kondidogeeniset solut subkylindrinen, hyaliininen, sileä, fialidinen ja periklinaalinen paksuuntuminen, 7-25 × 3-4 µm. Conidia hyaline, sileä, aseptaatti, subcylindrical, suora, kärki tylppä, kapeneva tyvestä ulkoneva katkaistu hilum, 1 µm diam, näkyvästi guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria yksinäinen, keskikokoinen ruskea, sileäseinäinen, subgloboosi, ellipsoidinen obovate, koko marginaali, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

viljelmän ominaisuudet: pesäkkeet kämmenmikrossa 45 mm: n diam 7 d: n jälkeen (6, 5 mm/d), pesäkkeet litteitä, joissa kohtalainen antennirihmasto, OA: n pinnalla Savunharmaa. PDA-pinnalla Savunharmaa, käänteisesti oliviiniharmaa. Pinnalla likaisen valkoinen, Käänteinen ochreous.

huomautukset: lähin vastaavuus blastn-haussa ApMat-sekvenssin kanssa oli GenBank KU923732, C. queenslandicum-kanta aus22, jonka identiteetti oli 98% (16 bp-eroa), kun taas lähin vastaavuus gs-sekvenssin kanssa, jonka identiteetti oli 99% (7 bp-eroa), oli GenBank KJ947286 C. siamense-isolaatti OBP24. Parhaiten gapdh-sekvenssin kanssa pärjäsivät GenBank KX578784 C. siamense (99% identiteetti, 3 bp ero) ja GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identiteetti, 3 bp ero).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. Marraskuuta. MycoBank MB827692.

Kuva 8 etymologia: nimetty Taiwanissa sijaitsevan Tainanin kaupungin mukaan, josta laji kerättiin.

diagnoosi: Colletotrichum tainanense eroaa lähimmästä fylogeneettisestä naapuristaan C. salsolae kulttuurin ominaisuudet PDA, harva antenni rihmasto ja vaalea hiirenharmaa pinta rihmasto, kun taas C. salsolae tuottaa kerros acervuli kaltaisia rakenteita syvä oranssinruskea conidial massat ja lukuisia setae. Nämä kaksi lajia ovat erotettavissa käyttäen kaikkia testattuja geenejä lukuun ottamatta sen ja tehokkaimmin gapdh (7 bp ero), tub2 (6 bp ero) ja act (5 bp ero) sekvenssejä. Näiden kahden lajin CHS-1-sekvenssissä on vain yksi bp-ero.

Tyyppi: Taiwan: Tainan: on fruit of Capsicum annuum, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666 – holotyyppi; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – ex-tyypin kulttuurit).

kuvaus: seksuaalinen morph ei havaittu. Aseksuaalinen morph PDA: lla. Kasvullinen rihmasto haarautunut, hyaliini, sileäseinäinen, septaatti, hyphae 2-3 µm diam, melanisoitunut ajan kanssa. Kämmenlevyltä löytyi yksi konidiooma, joka on steriili SNA: ssa, MEA: ssa ja OA: ssa. Chlamydospores ja setae ei havaittu. Conidiofores subcylindrical, flexuous, 1-2-septaatti, hyaliini, sileä vaaleanruskea, haarautunut. Conidiogeeniset solut subkylindrinen, hyaliininen, sileä, fialidinen ja periklinaalinen paksuuntuminen. Conidia hyaline, sileä, aseptaatti, subcylindrical tai subclavate, suora tai hieman kaareva, kärki tylppä, kapeneva tyvestä ulkoneva katkaistu hilum, 1,5-2 µm diam, näkyvästi guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria yhden tai löysä ryhmissä, usein kapea-lieriömäinen, keskipitkän tummanruskea, usein kapeneva kohti kärki, reuna koko tai aaltoileva joskus epäsäännöllisesti lohko (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

viljelmän ominaisuudet: pesäkkeet PDA: lla 45 mm: n diam 7 d: n jälkeen (6, 5 mm/d), pesäkkeet litteitä, keskivaikeat antennirihmastot. OA pinnalla vaalea hiiri-harmaa. PDA-pinnalla vaalea hiiri-harmaa, Käänteinen hiiri-harmaa. Mean pinnalla vaalea hiirenharmaa, käänteisesti oliviiniharmaa.

Huom. lähin vastaavuus blastn-haussa, jossa gapdh-sekvenssi oli 99% identiteetti (2 bp-ero), oli GenBank KC790761 Colletotrichum sp. kanta MTCC 9664 kun taas lähin ottelu tekojärjestys 99% identiteetti (2 bp ero) oli GenBank KY995522 C. siamense kanta LJDY1–2. Lähin vastaavuus tub2-sekvenssin kanssa 99% identiteetillä (7 bp-ero) oli GenBank MF143931 C. siamensen kanta 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al. Fung. Diversity 61: 112 (2013); nimellä “endophytica”.

kuvaus: pesäkkeitä kämmenmikrossa 42 mm diam jälkeen 7 d (5,5 mm/d), vaalean oranssista valkoiseen vaihteleva antennirihmasto; käänteisesti vaalean valkoisesta oranssiin ja mustaan keskeltä ja lukuisia oransseja conidiomatoja siroteltuna pinnalle. Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata läsnä, conidiofores muodostettu suoraan hyphae. Setae läsnä, kohtalaisen ruskea, 47-95 × 3-6 µm, 3-4-septaatti, kapeneva akuutti apices. Conidiofores hyaline, sileäseinäinen ja harjaamaton. Kartiogeeniset solut hyaliini, sileäseinäinen, aseptaatti, subkylindrinen, 12-21 × 3-4 µm. Conidia hyaline, sileäseinäinen, aseptaatti, suora, lieriömäinen, jonka kaksi päätä on tylppä, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria yksin tai löyhinä ryhminä, ruskea, hieman lohko, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

Huom.: Colletotrichum endophyticum kuvattiin ensimmäisenä Pohjois-Thaimaasta kotoisin olevana Pennisetum purpureumin ruohoendofyyttinä (Manamgoda et al. 2013). Myöhemmin se raportoitiin useista muista isäntälajeista, mukaan lukien Capsicum Kiinassa (Diao et al. 2017). Thaimaasta saadun isolaatin (UOM 1137) conidia pituus oli hieman lyhyempi kuin C. endophyticumin (conidia) ex-tyypin (lc0324) 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

tutkittu aineisto: Thaimaa: Kanchanaburi: Capsicum annuum-hedelmän leesiosta, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulttuuri UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al. Fung. Diversity 39: 158 (2009).

kuvaus: Pesäkkeitä PDA 65 mm diam jälkeen 7 d (8,5–11 mm/d), tasainen koko reuna, antenni rihmasto tiheä, puuvillainen, Vaalean harmaa valkoinen antenni rihmasto ja lukuisia musta strooma hajallaan pinnalla, harmaa keskellä, valkoinen marginaali; Käänteinen harmahtavan vihreä. Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata acervular, Setae havaittiin, ruskea, sileäseinäinen, 1-2-septaatti, 60 µm pitkä, kapeneva akuutti apices. Conidiofores hyaline, septaatti, haarautunut. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen tai ampulliformi, 7-17, 5 µm. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, lieriömäinen, molemmat päät tylppä, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria ei havaittu.

Huom.näiden isolaattien sukupuolimorphia ei havaittu kulttuurissa. Isolaatti CPC 28644: n kartiomainen pituus oli hieman pidempi kuin C. fructicolan ex-tyypin (ICMP 18581 = BPD-I16) pituus (conidia 9, 7–14 × 3-4, 3 µm, x = 11, 53 ± 1, 03 × 3, 55 ± 0, 32 µm; Prihastuti et al. 2009).

tutkittu aine: Thaimaa: Chiang Mai: from fruit leesio of Capsicum annuum, 7.kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulttuurit CPC 28644 ja CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, Capsicum sp: n kypsän punaisen hedelmän hedelmäleesio. (sweet pepper), 22 Apr. 2015, Z. M. Sheu (culture UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, from fruit leesio of green fruit of Capsicum sp. (paprika), 4.9. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (kulttuuri UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); nimellä “karstii”.

kuvaus: pesäkkeet PDA: ssa 65 mm: n diam 7 d: n jälkeen (6, 5–10.5 mm/d), tasainen koko reuna, oranssi tai valkoinen antenni rihmasto ja lukuisia oranssi kartiomassat hajallaan pinnalla, valkoinen marginaali; Käänteinen keltainen tai oranssi. Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata acervular, setae havaittiin, ruskea, sileäseinäinen, 2-4-septaatti, 60 µm pitkä, pohja upoksissa, kapeneva kohti kärkeä, kärki enimmäkseen akuutti. Conidiofores hyaline, septaatti, haaraketjuiset, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen tai ampulliformi, 7-15, 5 µm. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, lyhyt, lieriömäinen, molemmat päät tylppä tai toinen pää hieman akuutti tai katkaistu tyvestä, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria yksittäisinä tai löyhinä ryhminä, ruskea, subgloboosi, Pyöreä ääriviivat, 6-12, 5 × 3,5-8 µm.

huomautukset: boninensekompleksissa Indonesiasta tunnistetut neljä isolaattia tuottivat erillisen lyhyen conidian verrattuna C. Karstin entiseen epitype-viljelmään (14,5–17 × 5-6, 5 µm; Yang et al. 2011). Conidian koko vaihtelee kuitenkin suuresti C: n eri kantojen välillä. karsti raportoivat Damm et al. (2012a, 2012b), jossa CBS 129833: n conidia-mittaukset olivat (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, keskiarvo ± SD = 13, 1 ± 0, 7 × 5, 8 ± 0, 4 µm; ja CBS 111998: n konidiumin pituus oli jopa 18, 5 µm, l/W-suhde = 2, 8. Nämä isolaatit eivät muodostaneet seksuaalimorfia kulttuurissa. Vaikka nämä neljä isolaattia muodostivat täysin tuetun (100% BS/1 PP) alaluokan C. karsti: ssa, kaikki yksittäiset geenipuut (tietoja ei näy) eivät antaneet merkittävää tukea, jonka perusteella olisi voitu ottaa käyttöön kryptinen laji näille isolaateille.

tutkittu materiaali: Indonesia: Jeneponto, from fruit leesions of Capsicum annuum, 7. kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 28553, CPC 28554); Capsicum sp: n kypsän punaisen hedelmän ja kannan leesioista. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Nasta. Mycol. 92: 31 (2019).

kuvaus: pesäkkeet kämmenmikrossa 63 mm diam jälkeen 7 d (8 mm/d), harmaasta tummanruskeaan antennirihmasto; reverse harmaa vaaleanruskea kelta-oranssi keskellä runsaasti acervular conidiomata että tihkua vaalean oranssi conidial massat keskellä, Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata läsnä (lähellä inokulaatiopistettä), conidioforeja muodostuu suoraan hyphae. Sklerotia esiintyy. Setelit ovat keskiruskeat, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-septaatti, kapenevat kohti akuutteja apiloita, ja niiden kärki on usein kuristunut. Conidiofores hyaliin vaaleanruskea, sileäseinäinen, septaatti ja haarautunut. Kartiogeeniset solut hyaliini, sileäseinäinen, aseptaatti, subsylindrical, suora tai kevyesti kaareva, 26-48 × 3-4 µm, fialidinen, periklinaalinen paksuuntuminen silmiinpistävää. Conidia hyaline, sileäseinäinen, aseptaatti, suora, lieriömäinen, jonka kaksi päätä on tylppä tai toinen pää hieman terävä, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria yksi tai löysä ryhmissä, keskiruskea, epäsäännöllinen muoto, crenate tai lohko ääriviivat, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Seksuaalinen morph kämmenmikrolla. Ascomata perithecia, joka muodostui 2 wk: n jälkeen., yksinäinen, osittain upotettu tai upotettu agar keskipitkällä, nonstromaattinen, subspherical soikeaksi, ostiolate, karvaton, keskipitkän ruskea, 96-130 × 160-200 µm. Peridium 10-12, 5 µm paksu, joka koostuu vaalean tai keskiruskeasta litistyneestä kulmasolusta 3,5–10 µm diamia. Asogeeninen hyphae hyaline, sileäseinäinen, herkkä, harvoin näkyvä. Aurinkokudosta ei ole havaittu. Asci unitunicate, 8-spored, lieriömäinen, kapeneva kärki ja pohja, sileäseinäinen, 51-65 × 9,5-13 µm, pohja katkaistu. Ascospores biseriately järjestetty, aseptate, hyaline, sileäseinäinen, fusiform, hieman kaareva, pohja pyöristetty, kärki akuutti tai pyöristetty, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

huomautukset: tutkittujen isolaattien (CPC 28638, CPC 28639) kartiomainen pituus vaihteli ja oli C. plurivorumin (15-17 × 5, 5 µm; Damm et al. 2019).

tutkittu materiaali: Thaimaa: Chiang Rai, Capsicum annuumin lehtileesioista 7. kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor (kulttuurit CPC 28638 ja CPC 28639); Bangkok, ravintola Phaya Thai alueella, tartunnan kudosta Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (kulttuuri UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Nasta. Mycol. 73: 100 (2012).

hajoaminen: pesäkkeet kämmenmikrossa 20-38 mm diam jälkeen 7 d (5-6, 2 mm/d), tasaiset koko marginaali; pinta peitetty lyhyellä vaalean vaaleanpunaisella tai oranssilla antennirihmastolla, muuttuu ajan myötä harmaaksi, marginaali vaaleasta vaaleanpunaiseen, Käänteinen ruusuinen puskuri, keskeltä oliivinharmaa tai ruskeanharmaa; keskeltä oranssi tai lohi, keskeltä tumma. Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata acerpular, setae ei havaittu, Conidiofores hyaline, septate, haarautunut. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen tai ampulliformi, 7-17, 5 µm, apex 1-3 µm diam. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, mostely fusiform, toinen pää pyöristetty, toinen pää akuutti, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia massana lohesta oranssiin. Appressoria yksittäinen tai löysä ryhmissä, keskikokoinen ruskea, soikea, koko crenate marginaali, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

huomautukset: suurin osa isolaateista, jotka on tunnistettu C: ksi. scovilleillä oli samanlainen itiöemän muoto ja itiökoot verrattuna tyyppiyksilöön (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, kuvannut Damm et al. (2012a, 2012b). Joillakin isolaateilla oli kuitenkin vaihteleva pesäkkeiden väri, erilaiset pesäkkeiden kasvunopeudet ja pienet erot itiöemämittauksissa.

tutkittu materiaali: Indonesia: Gowa, from fruit leesions of Capsicum annuum, 7. kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 28577 ja CPC 28579); West Java: from fruit leesio of Capsicum annuum, Joulukuu. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thaimaa: Chiang Mai: Capsicum sp: n hedelmävaurioista. 2008, O. Mongkolporn (kulttuurit UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al. Fung. Monimuotoisuus 39: 98 (2009)

kuvaus: pesäkkeet PDA: ssa 79 mm diam 7 d: ssä (5,5–6 mm/d). Vaalean kellanvalkoinen, harmaa, tiheä puuvillainen antenni sienirihmasto oranssi acervular conidiomata keskellä; Käänteinen vaalean kellertävä. Chlamydospores ei havaittu. Conidiomata acerpular, conidiofores muodostettu tyyny pyöreähkö ja keskipitkän ruskeita soluja. Setiä ei havaittu. Conidiofores hyaline, haarautunut. Kartiogeeniset solut hyaliini, lieriömäinen ampulliformiin, 6,5-16 µm. Conidia hyaline, aseptaatti, sileäseinäinen, fusiform lieriömäinen, molemmat päät suoraan pyöristetty, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria tummanruskea, yksinäinen, Pyöreä, koko crenate marginaali, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

huomautukset: Colletotrichum siamense-isolaatit eri maista osoittivat morfologisten merkkien vaihtelua PDA: n kasvunopeuksissa ja viljelmämorfologiassa. Fylogeneettisten puiden eri alaluokkia edustavien isolaattien (viikunat. 2, 3) ovat: CPC 30233 (Gowa, Indonesia), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thaimaa) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOM 1126/ F4-1c (Kanchana Buri, Thaimaa) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3, 5–5, 5. Nämä alaluokan morfologiset merkit olivat hyvin yhdenmukaisia kussakin maassa. Lajin kuvasi prihastuti et al. (2009); EX-holotyypin yksilön conidiaa (ICMP 18578/ BDP-I2) ilmoitettiin 7-18.3 × 3-4, 3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), joka kattaa isolaateissamme havaitun alueen. Tämä laji on raportoitu olevan biologisesti ja maantieteellisesti monipuolinen, ja löytyy monia isäntiä useilla trooppisilla ja subtrooppisilla alueilla (Weir et al. 2012).

tutkittu aine: Indonesia: Gowa, from fruit leesions of Capsicum annuum, 7. kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 30233 culture); Jeneponto, from fruit leesion of Capsicum sp. 7.kesäkuuta. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 30209). Thaimaa: Ratchaburi, Capsicum sp: n hedelmäleesiosta., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture UOM 1132); Kanchanaburi, from fruit leesion of Capsicum sp. Tammi. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulttuuri UOM 1126 = F4-1c). Sri Lanka: Kandy, hedelmä leesiosta Capsicum sp. Syyskuuta. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (kulttuuri UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mykologia 102: 1331 (2010)

kuvaus: pesäkkeet PDA: ssa 45 mm diam 7 d: ssä (6,5 mm/d). Pesäkkeet Tasainen, leviää, kohtalainen antenni rihmasto, Oa pinnalla savu harmaa. PDA-pinnalla oliviceous harmaa Savunharmaa, Käänteinen oliviceous grey, lukuisia oranssi conidiomata hajallaan pinnalla. Pinnalla likaisen valkoinen, Käänteinen ochreous. Aseksuaalinen morph on OA. Kasvullinen rihmasto koostuu hyaliinista vaaleanruskeaan, sileäseinäiseen, septaattiin, haarautunut, 2-2, 5 µm diam hyphae. Chlamydospores ei havaittu. Setae harvinainen (vain kaksi nähty), suora, keskiruskea, hienoksi verruculose, 2-3-septate, 120 µm pitkä, kärki subobtusely pyöristetty. Conidiomata acerpular, 150-250 µm diam, oranssi kartiomassa. Conidiofores subcylindrical, flexuous, 1-3–septaatti, hyaliini, sileä, haarautunut, 15-25 × 3,5-4,5 µm. Conidioogeeniset solut subkylindrinen, hyaliininen, sileä, fialidinen ja periklinaalinen paksuuntuminen, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Conidia hyaline, sileä, aseptaatti, subcylindrical, suora, kärki tylppä, kapeneva tyvestä ulkoneva katkaistu hilum, 1,5-2 µm diam, näkyvästi guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria ei havaittu. Seksuaalinen morph ei havaittu.

tutkittu aineisto: Indonesia, Makassar, Capsicum annuumin hedelmäleesiosta, 7. kesäkuuta. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (kulttuuri CPC 28607).

tutkittavien Colletotrichum-lajien levinneisyys

kaiken kaikkiaan C. truncatum oli yleisin (44%) tartunnan saaneista chilihedelmistä eristetty laji (viikuna. 9) ja oli helposti tunnistaa sen falcate itiöt ja runsas setae nekroottisia vaurioita. Suorasukaista conidiaa sairastavista lajeista C. scovillei (acutatum complex) oli yleisin koko tutkitussa maassa (35%) lukuun ottamatta Sri lankaa, jossa lajia ei ole eristetty. Colletotrichum siamense (“gloeosporioides complex”) oli seuraavaksi yleisin laji, jota esiintyi Thaimaassa, Sri Lankassa ja Indonesiassa (11%). Jäljellä olevien lajien osuus isolaattien kokonaismäärästä oli alle 10 prosenttia.

Indonesiassa C. scovillei eristettiin tartunnan saaneista chilihedelmistä kaikissa tutkituissa Etelä-Sulawesin hallintoalueilla paitsi Makassarissa ja kenttäkoealueella Länsi-Jaavalla. Colletotrichum siamense eristettiin myös koko alueesta, Gowasta, Jenepontosta ja Makassarista. Kaksi uutta lajia, C. makassarense ja C. javanense, eristettiin Makassarista ja Länsi-Jaavalta.

Thaimaassa C. scovillei eristettiin lähinnä Chiang Main ja Chiang Rain pohjoisista provinsseista, mutta sitä saatiin myös tartunnan saaneista chilihedelmistä Kasetsartin yliopiston koealueella Nakhon Pathomissa. Läntisissä provinsseissa esiintyi paljon C. siamensea ja yksi C. endophyticumin isolaatti kerättiin Kanchana Burista. Colletotrichum plurivorum eristettiin Chiang Rain chilin lehdistä, joilla oli nekroottisia vaurioita, ja Bangkokin Phaya Thain alueella sijaitsevasta ravintolasta löydetyistä chilihedelmän nekroottisista leesioista. Lisäksi C. fructicola tunnistettiin Chiang Maista kerätyistä hedelmistä.

Taiwanissa tunnistettiin uutena lajina C. tainanense, joka on kerätty tartunnan saaneista chilihedelmistä Tainanin provinssissa, ja C. fructicola tunnistettiin hedelmistä Hsinchussa ja Nantoussa Taiwanissa. Colletotrichum plurivorum tunnistettiin myös Malesian Johorissa kerätystä hedelmästä.

patogeenisuus

kaikki Colletotrichum-lajit aiheuttivat antrasnoosioireita haavoittuneissa hedelmissä, mutta oireiden vakavuudessa oli merkittäviä eroja. Haavoittuneissa hedelmissä C. scovillein ja C. javanensen isolaatit olivat taudin vakavimpia, ja ne aiheuttivat suuria nekroottisia leesioita, joiden keskimääräinen leesio oli kooltaan 15,6-20,3 mm (Taulukko 5). Haavoittumattomilla hedelmillä kaikki lajit olivat vähemmän patogeenisiä, ja keskimääräinen leesiokoko oli alle 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale ja C. plurivorum aiheuttivat vain hyvin pieniä leesioita tai ei näkyviä oireita (leesioiden keskiarvo < 1 mm) 10 d sen jälkeen, kun haavoittumattomille hedelmille oli annettu rokotus. Colletotrichum javanense-ja C. scovillei-isolaatit olivat kaikkein patogeenisimpiä vahingoittumattomissa hedelmissä ja aiheuttivat leesioita, joiden keskikoot olivat 9,4 ja 9,1 mm. C. scovillein aiheuttamat leesiot olivat huomattavasti suurempia kuin kaikkien muiden lajien aiheuttamat leesiot C: tä lukuun ottamatta. javanense wounded fruitissa ja C. endophyticum unwounded fruitissa. Pairwise-t-testien merkitys riippuu voimakkaasti kunkin tutkittavan lajin isolaattien määrästä, joten taulukossa 5 esitetyt ryhmittelyt eivät muutu pelkästään keskiarvojen eron suuruuden mukaan; suuri ero ei välttämättä ole merkittävä, jos molempien lajien otoskoot ovat pienet, kun taas pienempi ero voi olla merkittävä. Erityisesti vertailut C. javanensen ja C. endophyticumin välillä ovat hyvin epätarkkoja, sillä kustakin lajista testattiin vain yksi isolaatti.