Esitysmuoto

tulossivulla esitetään kunkin kyselysekvenssin nimi, pituus ja maaseudun verkkoulospistemäärä, johon cTP/ei-cTP-määritys perustuu. Mitä korkeampi pistemäärä, sitä varmempi on verkko, että tämä sekvenssi Sisältää n-terminaalisen kloroplastikuljetuspeptidin (cTP).Lisäksi esitetään mahdollinen cTP-pituus sekä vastaavat Cleavage – sivuston pisteet. Huomaa, että transitpeptidin pituuden ennustaminen suoritetaan, vaikka sen esiintymistä ei ennustettaisikaan.Tarkoituksena on antaa rajatapauksissa maksimaalista tietoa.

jos “Detailed output” valitaan, esitetään myös kunkin residuen neuroverkkoarvosana. Mitä korkeampi tämä pistemäärä on, sitä varmempi on verkko, että tämä jäännös on osa KTP: tä. Lisäksi esitetään networkscoren johdannainen. Tätä pistemäärää käytetään etsittäessä aluetta, jolta thebleavage-sivustoa etsitään-nimittäin niiden 40 jäännöksen joukosta, jotka ympäröivät sitä aluetta, jolla on korkein derivoituva pistemäärä. Lopuksi esitetään katkaisukohdan pisteet(CS-score) kullekin jäämälle. Tämä pistemäärä lasketaan ascoring-matriisista, joka on johdettu meemiksi kutsutusta automaattisesta motiivin löytämisalgoritmista. Cleavagesiitin pistemäärä määritellään siten, että ennustettu pilkkoutumiskohta on 40 jäämän sisällä olevan korkeimman pisteytysjäämän directlyN-terminaalinen. Näin ollen on olemassa yksi tai useita CS-pisteitä, jotka sattuvat olemaan suurempia kuin ehdotetun cTP-pituuden osuus, mutta koska ne sijaitsevat 40residentin ulkopuolella suurimman derivaattapisteen ympärillä, esitetty cTP-pituus on edelleen se, mitä ChloroP pitää todennäköisimpänä presekvenssipituutena (ts. vastaa todennäköisintä katkaisukohtaa).

avun saaminen

tieteelliset ongelmat: tekniset ongelmat:

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.