Molekyylianalyysi IncF ColV-tyyppisestä Plasmidilinjasta, joka kantaa Kompleksiresistenssilokusta, jonka geneettinen jälki on jäljitettävissä
IncF ColV-plasmidit ovat tärkeitä plasmidisoveltuvuusryhmiä, jotka tällä hetkellä rajoittuvat enterobakteereihin. Näissä plasmideissa on tärkeä repertuaari virulenssiin liittyviä geenejä (VAG), jotka edistävät lintupatogeenisen Escherichia coli-bakteerin kykyä aiheuttaa tauteja siipikarjassa. ColV-plasmideista löydetyt VAG: t on yhdistetty myös ihmisten urosepsiaan ja aivokalvontulehdukseen, mutta näitä tautitiloja aiheuttavia mekanismeja ei tunneta hyvin. Äskettäin kuvasimme sekvenssi ColV plasmid pSDJ2009 – 52F, joka kantoi tyypillinen repertuaari VAGs ja monimutkainen resistenssi geeni lokus rinnalla IS26, insertioelementti, joka on tärkeä rooli mobilisoida antibioottiresistenssigeenit plasmidit ja genomisaaret. Löysimme täydelliset ColV-tyyppiset plasmidijaksot julkisista tietokannoista, jotka jakoivat >80% sekvenssidentiteetin pSDJ2009-52F: n kanssa maantieteellisesti eri puolilla maailmaa 20 vuoden ajanjaksolla. Aiemmin huomasimme, että pSDJ2009-52F kantaa ainutlaatuista geneettistä allekirjoitusta luokan 1 integronissa monimutkaisessa resistenssilokuksessa, joka oletettavasti luotiin is26: n vaikutuksesta. Tässä osoitamme, että useimmat ColV-tyyppiset plasmidit, jotka ovat läheistä sukua pSDJ2009-52F: lle, kantavat myös samaa allekirjoitusta. Tutkimuksemme antavat tietoa siitä, miten nämä allekirjoitusta kantavat plasmidit ja liikkuvat geneettiset elementit kuljettavat E. coli-sekvenssityyppien välistä liikennettä suurilla maantieteellisillä etäisyyksillä.
