Roche Cobas 4800 HPV-testin teho | Jiotower

teksti

ihmisen papilloomavirus (HPV) on yksi yleisimmistä sukupuoliteitse tarttuvista viruksista maailmanlaajuisesti ja merkittävä syövän aiheuttaja, joka aiheuttaa lähes 60 000 uutta syöpätapausta vuodessa Euroopassa (1) ja johtaa kohdunkaulan syövän kehittymiseen naisilla. HPV16 ja HPV18 ovat eniten syöpää aiheuttavia (2, 3), sillä noin 70 prosentissa kaikista kohdunkaulan syövistä esiintyy HPV16-tai HPV18-infektioita (4). Lähes 30 prosenttia kohdunkaulan syövistä jää näkemättä kohdunkaulan sytologisessa seulonnassa (5), joten tarkat ja objektiiviset HPV: hen liittyvän kohdunkaulan syövän testit, joissa käytetään herkempiä molekyylitekniikoita, ovat tarpeen, jotta voidaan tehokkaasti ehkäistä ja hoitaa kohdunkaulan syövän tulevia riskejä ja ilmaantuvuutta.

Roche Cobas 4800 HPV-testi (Cobas) on uusi molekyylimenetelmä, joka perustuu reaaliaikaiseen PCR: ään (RT-PCR) (6, 7) ja jossa on täysin automatisoitu järjestelmä, joka mahdollistaa nopean ja tehokkaan näytteen käsittelyn. Cobas voi havaita HPV16, HPV18, 12 muuta korkean riskin Hpvv (hrHPVs) (HPV31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, ja -68, yhdistettynä tuloksena), ja β-globiiniohjaus itsenäisesti samassa PCR: ssä. Tutkimuksemme ensisijainen tarkoitus oli arvioida Cobasin teknisiä ja kliinisiä suorituskykyominaisuuksia. Kohdunkaulan näytteet 6,056 naista tarkoitettu patologian laitokselle Icahn School of Medicine Mount Sinai rutiinitutkimusta kohdunkaulan leesiot marraskuun 2011 ja helmikuun 2012 välisenä aikana kerättiin nestepohjainen sytologia väliaine (PreservCyt; Hologic, Marlborough, MA) ja säilytetään 4°C: ssa käyttöön asti.

satakahdeksankymmentä näytettä testattiin hrHPV: n genotyyppien toteamiseksi sekä Roche Cobas 4800 HPV-testillä että Digene Hybrid Capture 2 (HC2) hrHPV-DNA-testillä (Taulukko 1), ja mahdolliset poikkeamat selvitettiin Linear Array (LA) HPV-genotyypitystestillä (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) (8). Pearsonin chi-square-testin mukaan kahdella HPV-testillä tunnistettujen positiivisten ja negatiivisten näytteiden määrässä oli merkittävä ero (P < 0,001). Näiden kahden testin välinen vastaavuus oli kuitenkin tilastollisesti vahva, sopimustaso oli 88 , 33% (P = 0, 0218) ja Cohenin kappa-kerroin 0, 767 (95% luottamusväli, 0, 674-0, 860; p < 0, 001), jossa Kappa-arvojen 95% luottamusväli johdettiin binomijakaumasta.

epäsopivista näytteistä la HPV-testi osoitti matalan riskin HPV (lrhpv)-genotyyppejä 50%: ssa (2/4) näytteistä, jotka olivat HC2-positiivisia ja Cobas negatiivinen ja 13,33% (2/15) näytteistä, jotka olivat HC2 negatiivinen ja Cobas positiivinen. HPV53 löytyi kahdesta näytteestä, jotka olivat HC2-positiivisia ja Cobas-negatiivisia, mikä viittaa siihen, että Digene-sarjan koettimet reagoivat ristiin tämän HPV-genotyypin kanssa. Tämä havainto ei ole yllättävä, koska HC2-testin ristireaktiivisuus lrHPV: n genotyyppien, erityisesti HPV53: n kanssa havaittiin aiemmin (9). LRHPV: n genotyypin ristireaktiivisuuden seurauksena HPV-testissä on lisääntynyt väärien positiivisten tulosten määrä. Tämä voi johtaa ylitutkimuksiin ja ylihoitoon seurantatesteillä naisilla, joilla on vain lrHPV-genotyyppi ja joilla on itse asiassa pieni riski sairastua kohdunkaulan syöpään. Kahdessa HC2-negatiivisessa / Cobas-positiivisessa näytteessä todettiin HPV62 ja HPV89 (CP6108) kummassakin näytteessä ja HPV42, HPV54, HPV55, HPV61, HPV70 ja HPV84 yhdessä näytteessä, mikä viittaa siihen, että sekoitettu HPV-infektio johtaa vääriin positiivisiin tuloksiin Cobasin HPV-testissä.

LA HPV-testissä todettiin hrHPV-genotyyppejä yhdessäkään näytteessä, jotka olivat HC2-positiivisia ja Cobas-negatiivisia (0/4), ja 80 prosentissa (12/15) näytteistä, jotka olivat HC2-ja Cobas-positiivisia. HC2-testi ei havainnut hrHPV: tä näissä näytteissä, mikä osoittaa, että HC2-testissä ei havaittu enemmän hrHPV: n genotyyppejä kuin Cobas-testissä, mikä viittaa siihen, että Cobas-testi on mahdollisesti tehokkaampi seulontakoe paremman herkkyyden ja tarkkuuden vuoksi. Sen sijaan HPV: tä ei todettu LA HPV-testillä 6, 67%: ssa (1/15) HC2-negatiivisista / Cobas-positiivisista näytteistä. Kaiken kaikkiaan ero hrHPV: n havaitsemisessa HC2-ja Cobas-testien välillä oli kuitenkin tilastollisesti merkityksetön (χ2 = 2, 901, P = 0, 0885).

kuusikymmentäkahdeksan näytettä käytettiin tämän jälkeen cobasin HPV-testin uusittavuuden määrittämiseen. Toistettavuus alku-ja toistotestien välillä, standardilla 2-by-2-valmiustaulukolla laskettuna, oli 93, 55%; Cobas-testauksen ensimmäisen ja toisen kierroksen tulosten välinen kappa-kerroin Oli 0, 869 (95%: n luottamusväli 0, 744-0, 993; p < 0, 001). Tämän sopimuksen vahvuutta pidetään erittäin hyvänä, mikä viittaa siihen, että määritys on erittäin luotettava.

sata kahdeksankymmentäseitsemää näytettä testattiin Cobasin HPV-testillä, jotta voitiin määrittää HPV-toteamisen ero esi-ja postnoteerattujen näytteiden välillä. Vain 7 näytettä verrattiin väärin 3, 74%: lla (95%: n luottamusväli, 1, 02% – 6, 46%). Tilastollinen analyysi paljasti, että esi-ja postnoteerattujen näytteiden välinen ero ei ollut merkittävä (χ2 = 0, 233, P = 0, 36290). Koska HPV-positiivisuuden lisääntymistä ei havaittu ennen sytologiaprosessia eikä sen jälkeen (prealiquot vs. postaliquot), näytteiden ristikontaminaatio sytologiaprosessin aikana on erittäin harvinaista. HPV-testaus sytologian jälkeen voi merkittävästi parantaa työnkulkua ja vähentää tarpeetonta aliquointia, kun poikkeavaa sytologiaa varten on tarkoitus tehdä refleksi-HPV-testi.

lopulta 5 621 näytettä testattiin COBASIN HPV-testillä, jotta voitiin määrittää pyörteen ja pyörteen vaikutus (ennen Cobasin testiä) epäonnistumisen määrään. Vortexingin käsittelemistä 1 380 näytteestä epäonnistumisprosentti oli 4.57% (95%: n luottamusväli, 3, 65% – 5, 91%). Sitä vastoin 4 241: stä pyörittelemällä käsitellystä näytteestä epäonnistumisprosentti oli 1, 16% (95%: n luottamusväli, 0, 84% – 1, 48%). Pearsonin chi-square-testi osoitti, että pyörteisten ja kevyesti pyörivien näytteiden epäonnistumisprosenttien erot olivat erittäin merkittäviä (χ2 = 59.983, p < 0.0001), ja varovaista pyörittelyä suositeltiin cobasin epäonnistumisprosentin pienentämiseksi.

yhteenvetona voidaan todeta, että Cobas 4800 HPV-testi osoitti suurempaa herkkyyttä ja spesifisyyttä hrHPV-genotyyppien havaitsemisessa kuin Digeeni HC2 hrHPV-testi. Cobas-testissä ristireaktiivisuus lrHPV: n genotyyppien kanssa oli myös pienempi kuin HC2-testissä, mistä osoituksena oli vähemmän vääriä positiivisia tapauksia. Näiden kahden testin välinen ero kokonaissuorituksessa ei kuitenkaan ole tilastollisesti merkitsevä.