Short communicationA comparison of methods for forensic DNA extraction: Chelex-100® and the QIAGEN DNA Investigator Kit (manual and automated)

tehokas DNA-eristäminen näytteestä on onnistuneen oikeuslääketieteellisen DNA-profiloinnin perusta. Saatavilla on monia DNA: n uuttamismenetelmiä, ja niiden kyky erottaa DNA tehokkaasti vaihtelee; sekä käsittelyajassa, käyttäjän toimenpiteissä, saastumisriskissä ja helppokäyttöisyydessä. Viime vuosina saataville on tullut automatisoituja robotteja, jotka nopeuttavat käsittelyaikaa ja vähentävät käyttäjän syötteen määrää. Hankkeessa tutkittiin kolmen DNA: n uuttamismenetelmän tehokkuutta, kahden manuaalisen (Chelex®-100 ja QIAGEN DNA Investigator Kit) ja yhden automatisoidun (QIAcube) menetelmän tehokkuutta käyttäen DNA: n lähteenä sekä suuontelon soluja että veritahroja. Uutetun DNA: n määrä määritettiin reaaliaikaisen PCR: n avulla kussakin näytteessä olevan DNA: n määrän arvioimiseksi. Valitut näytteet monistettiin AmpFlSTR SGM Plus amplification kit. Tulokset viittasivat siihen, että eri tutkituilla menetelmillä saatujen tulosten välillä ei ollut tilastollista eroa, mutta automatisoitu QIAcube-robotti teki näytteiden käsittelystä paljon yksinkertaisempaa ja nopeampaa ilman DNA-kontaminaatiota.