Transposonit: Transposonit / genetiikka

Transposoneja on kahta tyyppiä, komposiittitransposonia ja kompleksitransposonia.

1. Yhdistetyt Transposonit:

yhdistetyt transposonit ovat niitä, jotka koostuvat keskusalueesta, jossa on antibioottiresistenttejä geenejä, joita reunustavat molemmista päistä identtiset IS-alkuaineen kopiot, joten yhdistetyissä transposoneissa on transposaation lisäksi lääkeresistenssiä tai muita markkereita (Kuva. 8, 32 A). Se on suurempien transposonien Luokka. Kolme usein tutkittua komposiittitransposonia ovat Tn5, Tn9 ja Tn10.

Tn5-alkuaineessa näkyy kanamysiiniresistenssi (kanr) ja se koostuu 5 400 emäsparin segmentistä, joissa on 1 450 bp: n käänteinen toistuma janan molemmissa päissä. Se voidaan transponoida faagista λ E: n kromosomiin .coli-bakteeria ja K. coli-kromosomin lokuksesta toiseen lokukseen. Jos se lisätään geeneihin, se aiheuttaa mutaatioita.

Tn9 transposoni koostuu kloramfemkoliresistenssiä aiheuttavasta R-tekijästä johdetusta geenistä (camr). Lääkeaineresistenssin aikaansaava entsyymi koostuu 2 638 sekvenssistä TN: n keskellä, jota reunustaa 768 bp pitkä IS1-alkuaine molemmin puolin. Tn9 IS1 esiintyy suorassa järjestyksessä, jonka päissä on pieni Käänteinen toisinto.

camr-segmentti translokoituu R-tekijästä F-episomiksi sekä faagista λ faagi P1: n kautta. T9 eroaa muista transposoneista epävakaisuudessaan ja sen antibioottiresistenssi voi hävitä suurtaajuuksisesti.

Tn10 koostuu tetrasykliiniresitanssigeeneistä (tetr-geeneistä). Se on 9 300 bp pitkä ja koostuu käänteisistä toistoista 1 400 emäsparin molemmin puolin. Is-elementit on IS10. Tn10 voidaan translokoida r222: sta (lääkeresitanssiplasmidi) phage P22: een.

komposiittitransposonien rakenne:

komposiittitransposoneissa IS-elementit voivat olla käänteisessä tai suorassa toistokokonaisuudessa (Kuva. 8, 31 B). Molemmat päät on elementtejä ovat itse Käänteinen toistoja. Suhteellinen orientaatio (suora tai käänteinen) on komposiittitransposoni ei muuta sen päätejaksoja. Näin komposiittitransposonilla suorien toistojen varsien kanssa on rakenne: arm L – central region-arm R.

rakenteesta tulee: arm L – central region-arm R, jos käsivarret ovat ylösalaisin toistoja. Nuolet osoittavat aseiden suuntautumisen transposonin geneettisen kartan suuntauksen mukaan vasemmalta (L) oikealle (R) (Kuva. 8, 31 B, i-ii). Komposiittitransposonien ominaisuudet on esitetty taulukossa 8.4.

lisäksi on olemassa tapauksia, joissa komposiittitransposonin moduulit ovat identtisiä, esimerkiksi Tn9 (on suora toisto IS1: stä) tai Tn903 (Käänteinen toisinto on 903: sta), kun taas joissakin tapauksissa moduulit ovat läheistä sukua keskenään. Näin ollen voidaan erottaa TN10: n tai Tn5: n moduulit. Kuitenkin, kun moduulit ovat identtisiä molemmat voivat sponsoroida liikkeen transposonin kuten löytyy TN9 of tn903.

kun moduulit eroavat toisistaan, voivat ne erota myös toimintakyvyltään. Sen vuoksi saattaminen osaksi kansallista lainsäädäntöä riippuu täysin yhdestä moduulista, esimerkiksi TN10: stä tai Tn5: stä. Näin ollen on moduuli kun toiminnallinen, transposoi joko itse tai koko transposoni.

yksittäisen moduulin kyky transposoida koko komposiittitransposoni selittää sen, että molemmat moduulit eivät pysy aktiivisina. Is elementit koodi transposase toimintaa, joka on vastuussa sekä luoda kohdesivuston ja tunnistaa päättyy transposon. Transposonia varten tarvitaan vain päät, jotka toimivat alustana transposonille.

2. Kompleksitransposonit (TNA transposoniperhe):

transposonien TNA-perheeseen kuuluvat Tn1, Tn2 ja Tn3. TnA koostuu melko suurista elementeistä (noin 500 bp). Niissä on itsenäisiä yksiköitä, jotka kuljettavat geenejä niin transpositiota kuin lääkeresistenssiäkin varten. Nämä eivät ole yhdistettyjä uudelleensijoituksia IS-tyyppisiin transpositiomoduuleihin. TNA-perheeseen kuuluu useita toisiinsa liittyviä transposoneja, joista TN3 ja Tn10 ovat parhaiten tutkittuja.

TnA-suku tunnetaan myös nimellä Tn3-suku, sillä Hedges ja Jacob löysivät TN3-transposonin bakteeriplasmideista ensimmäisen kerran vuonna 1974. Tn3 on esimerkki monimutkaisesta transposonista. Se kestää modulaarinen rakenne kuten löytyy TN10 ja ei perustu on elementtejä. Sillä ei myöskään ole evolutiivisia yhteyksiä IS: n alkuaineisiin. TN3: n perusrakenne on kuvattu TnA-perheelle.

yksi TNA-perheen ainutlaatuisista piirteistä on se, että se rajoittaa saman transposonin useita lisäyksiä plasmidiin. Yllättävin havainto on, että transpositiotaajuus muihin saman solun plasmideihin ei vaikuta. Heffron (1979) ovat antaneet analyysin DNA sekvenssin transposoni Tn3.

TNA-perheen transposonien rakenne:

TnA-perheen Transposonit koostuvat käänteisistä terminaalikertymistä (joiden pituus on 38 bp, mutta yksikään niistä ei ole IS: n kaltaisten elementtien ympäröimä), sisäisestä res-paikasta ja kolmesta tunnetusta geenistä, kuten tnpA, tnpR ja ampr.

geeni tnpA koodaa transposaasia ja tnpr resolvasia. Ampr-geeni (5 bp pitkä) syntyy kohdekohdassa suorana toistona ja koodina β-laktamaasille, joka aiheuttaa resistenssin ampisilliinille. Res-sivusto koostuu kolmesta alayksiköstä: I, II ja III (Kuva. 8.33)