az Ázsiában a Capsicum annuum antracnózisát okozó Colletotrichum fajok azonosítása, prevalenciája és patogenitása

a straight conidia Fajok morfológiai megfigyelései és filogenetikai adatai egyértelműen azonosítottak három új fajt, kettőt Indonéziából és egyet Tajvanról. Az alábbiakban részletes morfológiai leírást adunk a chili antracnózishoz kapcsolódó összes Colletotrichum fajról (4.táblázat).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. November. MycoBank MB826936.

6. ábra etimológia: elnevezett Java, A sziget Indonéziában, ahol a faj gyűjtötték.

diagnózis: a Colletotrichum javanense abban különbözik a C. brisbanense-től, hogy különböző chlamydosporákat és acervularis conidiomatákat képez az összes vizsgált táptalajon. Ezzel szemben a C. brisbanense csak az Anthriscus száron termelt Conidiomatát, de bazális sejteket nem figyeltek meg. Ezenkívül a C. javanense gyorsabban növekszik, mint a C. brisbanense (C. javanense OA-n, MEA-n és SNA 60, 55 és 66 mm diam 7 d-ben, illetve C. brisbanense OA-n és SNA 18,5, 20 mm diam 7 d-ben). A Colletotrichum javanense filogenetikailag különbözik a C-től. brisbanense, mindkét faj különbözik a CHS-1 szekvenciáiban, és a leghatékonyabban gapdh (7 bp különbség) és his3 (4 bp különbség).

Típus: Indonézia: Nyugat-Jáva, Purwakata regency, A Capsicum annuum gyümölcsén, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H – 144963-holotípus; CBS 144963 = UOM 1115 = EWINDO 3-ex-típusú kultúrák).

leírás: Szexuális morph nem figyelhető meg. Szexuális morph a PDA-n. Vegetatív micélium 1-5 km diam, hialin, sima falú, septate, elágazó hifák. Klamidoszporák gömbölyű vagy hosszúkás, halványbarna, sima falú, 5-25 6-8 m. Conidiomata acervularis, setae nem figyelhető meg. Conidiophores hyaline, septate, elágazó. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 7-17, 5 6m, apex 1-3 mm diam. Conidia hyaline, aszeptát, sima falú, többnyire fusiform, egyik vége lekerekített, a másik vége akut, vagy mindkét vége akut (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) 6m. Konídiumok tömege sárga vagy narancssárga színű. Appressoria egy vagy laza csoportokban, Közepesen barna, sima falú, szubglobóz vagy elliptikus, egész vagy hullámos szélű, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) 6m.

aszexuális morph az SNA-n. Vegetatív micélium 1-7 km diam, hialin, sima falú, septate, elágazó hifák. Klamidoszporák gömbölyű vagy hosszúkás, halványbarna, sima falú, 4,5-28 ~ 4-8 ~ m. Conidiomata acervularis, setae nem figyelhető meg. Conidiophores hyaline, septate, elágazó, 20-35 MHz hosszú. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 5-20 km, csúcs, 1-3 km diam. Konídium-hialin, aszeptát, sima falú, hengeres, mindkét vége akut vagy egyik vége kerek, egyik vége akut, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) 6m. Konídiumok tömege sárga-narancssárga színű.

tenyésztési jellemzők: kolóniák 48-54 mm átmérőjű PDA-n 7 d-ben (6,5–7,5 mm/nap), lapos, teljes margóval; a felületet szürke vagy olívazöld rövid légi micélium borítja, margó fehér vagy világosszürke, fordított többnyire krémfehéres, olivaceous szürke-fekete a közepén. Sárga vagy narancssárga acervularis conidiomata. Az SNA kolóniái 60-66 mm átmérőjűek voltak 7 d-ben (8-9, 5 mm/nap), laposak, teljes margóval, hialintól halványbarnáig, felületüket rövid szürke légi micélium borította, fordított azonos színű. Narancssárga acervular conidiomata a kultúra középpontjában. Az OA kolóniái 55-60 mm átmérőjűek voltak 7 d-ben (7,8–8,5 mm/d), laposak, teljes margóval; krémmel vagy szürke rövid légi micéliummal borított felület, margó fehér, fordított többnyire világos narancssárga, barna pigmentekkel. Narancssárga acervularis conidiomata. Kolóniák MEA felület halványszürke rövid légi micélium, fordított világos narancssárga.

Megjegyzések: a gapdh szekvenciával végzett blastn-keresés során a legközelebbi egyezés a GenBank JQ948617, a C. sloanei IMI 364297 törzs 98% – os identitással (4 bp különbség), míg a legközelebbi egyezés a his3 szekvenciával 99% – os identitással (2 bp különbség) a GenBank JQ949279 C volt. az indonesiense CBS 127551 törzs és a GenBank KJ947248 C. guajavae izolátum OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. November. MycoBank MB827691.

7.ábra etimológia: Makassarról nevezték el, az indonéziai Dél-Sulawesi városáról, ahol a fajt gyűjtötték.

diagnózis: a Colletotrichum makassarense filogenetikailag szorosan kapcsolódik a C. tropicale-hez. Az ITS szekvencia adatai nem tudták elválasztani a két fajt, de az összes többi vizsgált gén alapján megkülönböztethetők, és a leghatékonyabban ApMat (22 bp különbség) és gs (18 bp különbség) szekvencia adatok felhasználásával.

Típus: Indonézia: Makassar, A Capsicum annuum gyümölcsléziójából, június 7. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotípus; CBS 143664 = CPC 28612 – ex-típusú kultúrák).

leírás: Szexuális morph nem figyelhető meg. Szexuális morph az OA-n. Vegetatív micélium, amely hialinból, sima falú, septátból, elágazó hifákból áll, 2-3 km diam. Chlamydospores nem figyelhető meg. Setae jelen van, Közepesen barna, 40-55 6-5 kb, 2-3-septate, akut csúcsokra szűkítve. Conidiomata acervularis, 100-200 CA diam, narancssárga konidiális tömegekkel. Konidiofórok subcylindrical, Hajlékony, 1-4-septate, hialin, sima, elágazó, 15-45 6-4 Ft. Konidiogén sejtek subcylindrical, hyaline, sima, fialidic periclinalis megvastagodással, 7-25 6-4 KB. Conidia hyaline, sima, aszeptát, subcylindrical, egyenes, csúcs tompa, elvékonyodó tövénél kiálló csonka hilum, 1 db diam, jól láthatóan guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 6m. Appressoria magányos, közepes barna, sima falú, subglobose, ellipszoidális obovate, teljes margó, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) 6m.

tenyésztési jellemzők: telepek PDA 45 mm diam után 7 d (6,5 mm / d), telepek lapos, mérsékelt légi micélium, az OA felületén füstszürke. A PDA felületén füstszürke, fordított olivaceous szürke. MEA felület piszkos fehér, fordított okker.

megjegyzések: az apmat szekvenciával végzett blastn-keresés során a legközelebbi egyezés a GenBank KU923732, a C. queenslandicum aus22 törzs 98% – os identitással (16 bp különbség), míg a legközelebbi egyezés a 99% – os identitású gs-szekvenciával (7 bp különbség) a GenBank KJ947286 C. siamense izolátum OBP24 volt. A gapdh-szekvenciával a GenBank KX578784 C. siamense (99% identitás, 3 bp különbség) és a GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identitás, 3 bp különbség) volt a legjobb egyezés.

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. November. MycoBank MB827692.

8. ábra etimológia: névadója Tainan, a város Tajvanon, ahol a faj gyűjtötték.

diagnózis: a Colletotrichum tainanense különbözik legközelebbi filogenetikai szomszédjától, C-től. salsolae a tenyészet jellemzői A PDA, ritka légi micélium és halvány egérszürke felszíni micélium, míg a C. salsolae termel egy réteg acervuli-szerű struktúrák mély narancsbarna konidiális tömegek és számos sörét. A két faj elválasztható az összes vizsgált gén felhasználásával, kivéve a gapdh (7 bp különbség), a tub2 (6 bp különbség) és az act (5 bp különbség) szekvenciákat. A chs-1 szekvenciában csak egy bp különbség van a két faj között.

Típus: Tajvan: Tainan: a Capsicum annuum gyümölcsén, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666-holotípus; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – ex-típusú kultúrák).

leírás: Szexuális morph nem figyelhető meg. Szexuális morph a PDA-n. Vegetatív micélium elágazó, hyaline, sima falú, septate, hifák 2-3 km diam, melanizált idővel. Egyetlen konidioma található egy PDA lemezen, steril az SNA – n, MEA-n és OA-n. Chlamydospores és setae nem figyelhető meg. Konidioforok subcylindrical, Hajlékony, 1-2-septate, hialin, sima vagy halványbarna, elágazó. Konidiogén sejtek subcylindrical, hyaline, sima, fialidic periclinal megvastagodása. Conidia hyaline, sima, aszeptát, subcylindrical to subclavate, egyenes vagy enyhén ívelt, csúcs tompa, tövénél kúpos a kiálló csonka hilumig, 1,5-2 km diam, jól láthatóan guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 6m. Appressoria egy vagy laza csoportokban, gyakran keskeny hengeres, közepes vagy sötétbarna, gyakran a csúcs felé kúpos, az él egész vagy hullámos, néha szabálytalanul karéjos (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) 6m.

tenyésztési jellemzők: kolóniák 45 mm átmérőjű PDA-n 7 d (6,5 mm/d) után, kolóniák laposak, mérsékelt légi micéliummal. Az OA felületén halvány egérszürke. A PDA felületén halvány egérszürke, fordított egérszürke. MEA felület halvány egér-szürke, fordított olivaceous szürke.

Megjegyzések: a 99% – os identitású (2 bp különbség) gapdh szekvenciával végzett blastn-keresés során a legközelebbi egyezés a GenBank KC790761 Colletotrichum sp volt. törzs MTCC 9664 míg a legközelebb egyezik a törvény szekvencia 99% identitás (2 bp különbség) volt GenBank KY995522 C. siamense törzs LJDY1–2. A legközelebbi egyezés a tub2 szekvenciával 99% – os identitással (7 bp különbség) GenBank MF143931 C. siamense törzs 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al. Fung. Sokszínűség 61: 112 (2013); mint ‘endophytica’.

leírás: telepek a 42 mm átmérőjű PDA-n 7 d (5,5 mm/nap) után, halvány narancssárga-fehér légi micélium; középen fordított halványfehér-narancssárga és fekete, valamint számos narancssárga konidiomata szétszórva a felszínen. Chlamydospores nem figyelhető meg. Conidiomata jelen, conidiophores képződött közvetlenül hifák. Setae jelen van, Közepesen barna, 47-95 kb 3-6 kb, 3-4-septate, kúpos akut csúcsok. Conidiophores hyaline, sima falú és nem elágazó. Konidiogén sejtek hialin, sima falú, aszeptát, subcylindricalis, 12-21 6-4 KB. Conidia hyaline, sima falú, aszeptát, egyenes, hengeres, két végű tompa, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) 6m. Appressoria egy vagy laza csoportokban, barna, enyhén karéjos, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) 6m.

megjegyzések: A Colletotrichum endophyticumot először a Pennisetum purpureum fű endofitájaként írták le Észak-Thaiföldről (Manamgoda et al. 2013). Később számos más gazdafajról számoltak be, beleértve a Capsicumot Kínában (Diao et al. 2017). A Thaiföldről származó izolátum konídiumainak hossza (UOM 1137) valamivel rövidebb volt, mint a C. endophyticum (conidia) ex-típusa (LC0324) 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 6m).

vizsgált anyag: Thaiföld: Kanchanaburi: a Capsicum annuum gyümölcselváltozásából, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultúra UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al. Fung. Sokszínűség 39: 158 (2009).

leírás: Kolóniák 65 mm átmérőjű PDA–n 7 d (8,5-11 mm/nap) után, lapos, teljes élű, légi micélium sűrű, pamut, halványszürke-fehér légi micélium és számos fekete sztróma szétszórva a felszínen, középen szürke, szélén fehér; fordított szürkészöld. Chlamydospores nem figyelhető meg. Conidiomata acervularis, Setae-t figyeltek meg, barna, sima falú, 1-2-septate, 60 MHz hosszú, kúpos akut csúcsok. Conidiophores hyaline, septate, elágazó. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 7-17, 5 KB. Conidia hialin, aszeptát, sima falú, hengeres, mindkét vége tompa, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria nem figyelhető meg.

Megjegyzések: ezeknek az izolátumoknak a Szexuális morfáját nem figyelték meg a kultúrában. Conidial hossza különíteni CPC 28644 volt valamivel hosszabb, mint az ex-típusú (ICMP 18581 = BPD-I16) C. fructicola (konídium 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 x 3.55 ± 0.32 µm; Prihastuti et al. 2009).

vizsgált anyag: Thaiföld: Chiang Mai: A Capsicum annuum gyümölcselváltozásából, június 7. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (CPC 28644 és CPC 28645 kultúrák). Tajvan: Cyonglin, Hsinchu, a Capsicum SP Érett Vörös gyümölcsének gyümölcskárosodásából. (édes paprika), ápr 22. 2015, Z. M. Sheu (kultúra UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, a Capsicum SP. (édes paprika), 4 Szeptember. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (kultúra UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); mint ‘karstii’.

leírás: telepek PDA 65 mm diam után 7 d (6,5-10.5 mm/nap), lapos, teljes élű, narancssárga-fehér légi micélium és számos narancssárga konidiális tömeg szétszórva a felszínen, szélén fehér; fordított sárgától narancssárgáig. Chlamydospores nem figyelhető meg. Conidiomata acervularis, setae-t figyeltek meg, barna, sima falú, 2-4-septate, 60 MHz hosszú, alja elmerült, csúcsa felé kúpos, csúcsa többnyire akut. Conidiophores hialin, septate, elágazó, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) 6m. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 7-15, 5 KB. Conidia hialin, aszeptát, sima falú, rövid, hengeres, mindkét vége tompa vagy egyik vége kissé éles vagy csonka az alján, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) 6m. Appressoria egy-vagy laza csoportokban, barna, subglobose, körvonal, 6-12, 5 6,5-8 6m.

megjegyzések: az Indonéziából a boninense komplexben azonosított négy izolátum különálló rövid konídiumokat hozott létre A C. karsti ex-epitípus kultúrájához képest (14,5–17 6-6, 5 KB; Yang et al. 2011). A konídiumok méretének nagy variabilitása azonban a C különböző törzsei között. karsti jelentették Damm et al. (2012a, 2012b), ahol a konídium mérések a CBS 129833 volt (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, átlag ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm; a CBS 111998 volt conidium hossza 18.5 µm-es, L/W arány = 2.8. Ezek az izolátumok nem képeztek szexuális morphot a kultúrában. Bár ez a négy izolátum teljes mértékben támogatott (100% BS/1 PP) alosztályt alkotott a C. karsti-n belül, az összes egyedi génfa (az adatok nem szerepelnek) nem nyújtott jelentős támogatást ahhoz, hogy igazolja ezen izolátumok rejtélyes fajának bevezetését.

vizsgált anyag: Indonézia: Jeneponto, a Capsicum annuum gyümölcselváltozásaiból, június 7. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultúrák CPC 28553, CPC 28554); érett vörös gyümölcs és a Capsicum SP. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultúrák CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al. Csődör. Mycol. 92: 31 (2019).

leírás: telepek PDA 63 mm diam után 7 d (8 mm / d), szürke vagy sötétbarna légi micélium; fordított szürkétől világosbarnáig, közepén sárga-narancssárgával, bőséges acervularis conidiomatával, amely közepén halvány narancssárga konidiális tömegeket szivárog, Chlamydospórák nem figyelhetők meg. Conidiomata jelen van (az oltási pont közelében), a konidioforok közvetlenül a hifákon képződnek. Sclerotia jelen van. Setae jelen van, Közepesen barna, 94-125 kb 4-6 KB, 1-4-septate, az akut csúcsok felé kúpos, gyakran a szűkület a csúcson. Conidiophores hialin halvány barna, sima falú, septate és elágazó. Konidiogén sejtek hialin, sima falú, aszeptát, subcylindricalis, egyenes vagy enyhén ívelt, 26-48 6-4 KB, fialidikus, periklinális megvastagodás szembetűnő. Conidia hyaline, sima falú, aszeptát, egyenes, hengeres, két vége tompa vagy egyik vége kissé éles, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) 6m. Appressoria egy vagy laza csoportokban, Közepesen barna, szabálytalan alakú, krenát vagy karéjos körvonal, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) 6m. Szexuális morph a PDA-n. Ascomata perithecia, után alakult 2 hét., magányos, félig merített vagy az agar közegbe merítve, nem-szomatikus, szubgömb alakú vagy tojásdad, ostiolate, glabrous, közepes barna, 96-130 660-200 XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX XNUMX. Peridium 10-12, 5 KB vastag, halvány vagy közepesen barna lapított szögsejtekből áll, 3,5-10 km diam. Ascogén hifák hialin, sima falú, finom, ritkán látható. Interascal szövet nem figyelhető meg. Asci unitunicate, 8-orrú, hengeres, kúpos, hogy csúcs és az alap, sima falú, 51-65 6,5-13 6m, az alap csonka. Aszkospórák kétsorosan elrendezve, aszeptát, hialin, sima falú, fusiform, enyhén ívelt, alap lekerekített, csúcs akut vagy lekerekített, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) 6580>

Megjegyzések: a vizsgált izolátumok konidiálishossza (CPC 28638, CPC 28639) változó volt, és a C. plurivorum ex-típusú izolátumának (CBS 125474) tartományába esett (15-17 ~ 5,5 ~ m; Damm et al. 2019).

vizsgált anyag: Thaiföld: Chiang Rai, A Capsicum annuum levélsérüléseiből, június 7. 2015, P. W. J. Taylor (CPC 28638 és CPC 28639 kultúrák); Bangkok, étterem Phaya Thai területen, fertőzött szövet Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (kultúra UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al. Csődör. Mycol. 73: 100 (2012).

Leírás: A 20-38 mm átmérőjű PDA-n lévő telepek 7 d (5-6, 2 mm/nap) után laposak, teljes szélességgel; a felület rövid, világos rózsaszín-narancssárga légi micéliummal borított, idővel szürkévé válik, a margó fehéres-halvány rózsaszínűvé válik, fordított rózsás buff, közepén olivaceous szürke-barna-szürke; fordított narancs-lazac, középen sötét. Chlamydospores nem figyelhető meg. Conidiomata acervularis, setae nem figyelhető meg, conidiophores hyaline, septate, elágazó. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 7-17, 5 6m, apex 1-3 mm diam. Conidia hialin, aszeptát, sima falú, leginkább fusiform, egyik vége lekerekített, egyik vége akut, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Konídiumok tömege lazac-narancssárga színű. Appressoria egy vagy laza csoportokban, Közepesen barna, tojásdad, egész a crenate margóig, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) 6m.

megjegyzések: A C-ként azonosított izolátumok többsége. a scovillei hasonló spóra alakú és spóra méretű volt, mint a típuspéldány (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) (D. O. D.), leírta Damm et al. (2012a, 2012b). Néhány izolátumnak azonban eltérő volt a kolónia színe, eltérő volt a kolónia növekedési üteme és kis különbségek voltak a spórák mérésében.

vizsgált anyag: Indonézia: Gowa, a Capsicum annuum gyümölcselváltozásaiból, június 7. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 28577 és CPC 28579 kultúrák); Nyugat-Jáva: a Capsicum annuum gyümölcsléziójából, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thaiföld: Chiang Mai: a Capsicum SP. 2008, O. Mongkolporn (kultúrák UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al. Fung. Sokszínűség 39: 98 (2009)

leírás: telepek 79 mm átmérőjű PDA–n 7 d-ben (5,5-6 mm/nap). Halványsárga-fehér, szürke, sűrű pamut légi micélium narancssárga acervular conidiomata a közepén; fordított halvány sárgás. Chlamydospores nem figyelhető meg. Conidiomata acervularis, conidiophores alakult egy párna kerek és közepes barna sejtek. Setae nem figyelhető meg. Conidiophores hyaline, elágazó. Konidiogén sejtek hialin, hengeres vagy ampulliform, 6,5-16 MHz. Conidia hialin, aszeptát, sima falú, fusiform vagy hengeres, mindkét vége nyersen lekerekített, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) 6m. Appressoria sötétbarna, magányos, kör alakú, egész crenate margin, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) 6m.

Megjegyzések: a különböző országokból származó Colletotrichum siamense izolátumok eltérő morfológiai jellemzőket mutattak a PDA növekedési ütemében és tenyészmorfológiájában. Reprezentatív konidiális mérések a filogenetikai fák különböző alosztályait képviselő izolátumokra (füge. 2, 3): CPC 30233 (Gowa, Indonézia), 12.5–17 × 2.5–5.5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thaiföld) 9.5–14.5 × 3.5–5 µm; UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thaiföld) 12-15 x 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Srí Lanka) 10.5–16.5 x 3.5–5.5. Ezek a morfológiai karakterek egy alosztályon belül nagyon konzisztensek voltak az egyes országokon belül. A fajt Prihastuti et al. (2009); az ex-holotípus minta (ICMP 18578/ BDP-I2) konídiumait 7-18-ként jelentették.3 6-4, 3 fő (x)= 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), amely magában foglalja az izolátumainkban megfigyelt tartományt. Ez a faj biológiailag és földrajzilag is változatos, és számos trópusi és szubtrópusi régióban megtalálható (Weir et al. 2012).

vizsgált anyag: Indonézia: Gowa, a Capsicum annuum gyümölcselváltozásából, június 7. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultúra CPC 30233); Jeneponto, a Capsicum SP. Június 7. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultúra CPC 30209). Thaiföld: Ratchaburi, a Capsicum SP., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultúra UOM 1132); Kanchanaburi, a Capsicum SP. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultúra UOM 1126 = F4-1C). Srí Lanka: Kandy, a Capsicum SP. Szept. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (kultúra UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

leírás: telepek 45 mm átmérőjű PDA-n 7 d-ben (6,5 mm/nap). A kolóniák laposak, elterjedtek, mérsékelt légi micéliummal, az OA felületén füstszürke. A PDA felületén olivaceous szürke füst szürke, fordított olivaceous szürke, számos narancssárga conidiomata szétszórva a felszínen. MEA felület piszkos fehér, fordított okker. Szexuális morph az OA-n. Vegetatív micélium álló hialin halványbarna, sima falú, septate, elágazó, 2-2, 5 km diam hifák. Chlamydospores nem figyelhető meg. Setae ritka (csak kettő látható), egyenes, Közepesen barna, finoman verrukulóz, 2-3-septate, 120 6m hosszú, csúcs subobtusely lekerekített. Conidiomata acervularis, 150-250 CA diam, narancssárga konidiális tömeggel. Konidioforok subcylindrical, Hajlékony, 1-3-septate, hyaline, sima, elágazó, 15-25 6,5-4,5 Ft. Konidiogén sejtek subcylindrical, hyaline, sima, fialidic periclinalis megvastagodással, 7-15 6,5-4,5 Ft. Conidia hyaline, sima, aszeptát, subcylindrical, egyenes, csúcs tompa, kúpos tövénél a kiálló csonka hilum, 1,5-2 km diam, jól láthatóan guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) 6m. Appressoria nem figyelhető meg. Szexuális morph nem figyelhető meg.

vizsgált anyag: Indonézia, Makassar, A Capsicum annuum gyümölcsléziójából, június 7. 2015, P. V.J. Taylor & A. Nasruddin (kultúra CPC 28607).

a mintában szereplő Colletotrichum Fajok prevalenciája

összességében a C. truncatum volt a legelterjedtebb faj (44%), amelyet fertőzött chili gyümölcsből izoláltak (ábra. 9), és könnyen azonosítható a falcate spórák és bőséges sörték a nekrotikus elváltozások. Az egyenes konídiumú fajok közül a C. scovillei (acutatum complex) volt a leggyakoribb faj a vizsgált országokban (35%), kivéve Srí Lankát, ahol ezt a fajt nem izolálták. A Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) volt a következő leggyakoribb faj, amely Thaiföldön, Srí Lankán és Indonéziában fordult elő (11%). A fennmaradó fajokat az összes izolátum kevesebb mint 10% – a képviselte.

Indonéziában, C. a scovillei – t izolálták a fertőzött chili gyümölcsből Dél-Sulawesi összes vizsgált régiójában, kivéve Makassart, valamint a Nyugat-jávai terepi kísérleti helyszínen. A Colletotrichum siamense szintén elszigetelt volt a régió egész területéről, Gowától, Jenepontótól és Makassartól. A két új fajt, a C. makassarense-t és a C. javanense-t makassarból, illetve Nyugat-Jávából izolálták.

Thaiföldön a C. scovillei-t leginkább az északi Chiang Mai és Chiang Rai tartományokból izolálták, de fertőzött chili gyümölcsből is nyerték a Nakhon Pathomban található Kasetsart Egyetem kísérleti helyszínén. A nyugati tartományokban magas volt a C. siamense előfordulási gyakorisága, és egy C. endophyticum izolátumot Kanchana Buriból gyűjtöttek. A Colletotrichum plurivorumot Chiang Rai-Ban nekrotikus elváltozásokkal rendelkező chili levelekből, valamint Bangkok Phaya Thai területén található étteremben talált chili gyümölcs nekrotikus elváltozásaiból izolálták. Ezenkívül a C. fructicola-t a Chiang Mai-ból gyűjtött gyümölcsökből azonosították.

Tajvanon egy izolátumot azonosítottak egy új fajként, a C. tainanense-t, amelyet a Tainan tartomány fertőzött chili gyümölcséből gyűjtöttek be, és a C. a Fructicolát Hsinchu és Nantou (Tajvan) gyümölcseiből azonosították. A Colletotrichum plurivorumot A Malajziai Johorban gyűjtött gyümölcsből is azonosították.

patogenitás

az összes Colletotrichum faj antracnózis tüneteket okozott a sebesült gyümölcsökön, de a tünetek súlyossága szignifikáns különbségeket mutatott. A sebesült gyümölcsökön a C. scovillei és a C. javanense izolátumai mutatták a legmagasabb betegség súlyosságot, nagy, nekrotikus léziókat eredményezve, átlagos lézióméretekkel 15,6-20,3 mm (5.táblázat). A nem sérült gyümölcsökön az összes faj kevésbé volt patogén, az átlagos lézióméret kevesebb volt, mint 10 mm. A Colletotrichum makassarense, a C. tropicale és a C. plurivorum csak nagyon kis elváltozásokat okozott, vagy nem mutatott látható tüneteket (átlagos lézióméret < 1 mm) 10 nappal a nem sérült gyümölcsök beoltása után. A Colletotrichum javanense és a C. scovillei izolátumok voltak a legpatogénebbek a nem sebzett gyümölcsökben és az okozott léziókban, amelyek átlagos mérete sorrendben 9,4, illetve 9,1 mm volt. A C. scovillei által okozott elváltozások szignifikánsan nagyobbak voltak, mint a C kivételével az összes többi faj által okozott elváltozások. javanense a sebesült gyümölcsben és a C. endophyticum a nem sebzett gyümölcsben. A páros T-tesztek jelentősége erősen függ az egyes mintavételezett Fajok izolátumainak számától, így az 5.táblázatban bemutatott csoportosítások nem egyszerűen változnak az eszközök különbségének nagyságával; nagy különbség nem lehet szignifikáns, ha mindkét faj esetében kis mintaméretek vannak, míg kisebb különbség jelentős lehet. Különösen a C. javanense és a C. endophyticum összehasonlítása nagyon pontatlan, mivel minden fajból csak egy izolátumot vizsgáltak.