Konformációs változás

a makromolekuláris konformációs változások tanulmányozásához számos biofizikai technikát, például kristályosítást, NMR-t, elektron paramágneses rezonanciát (EPR) használnak spin label technikák alkalmazásával, körkörös dikroizmust (CD), hidrogéncserét és FRET-et. A kettős polarizációs interferometria egy asztali technika, amely képes valós időben, nagyon nagy felbontásban mérni a biomolekulák konformációs változásait.

egy specifikus Nemlineáris Optikai technikát, az úgynevezett második harmonikus generációt (SHG) nemrégiben alkalmazták a fehérjék konformációs változásának tanulmányozására. Ebben a módszerben egy második harmonikus aktív szondát helyezünk egy olyan helyre, amely mutagenezissel vagy nem helyspecifikus kötődéssel mozog a fehérjében, és a fehérjét adszorbeálják vagy specifikusan rögzítik egy felületre. A fehérje konformációjának változása megváltoztatja a festék nettó orientációját a felületi síkhoz képest, ezért a második harmonikus sugár intenzitását. Egy jól meghatározott tájolású fehérjemintában a szonda dőlésszöge mennyiségileg meghatározható, valós térben és valós időben. A második-harmonikus-aktív természetellenes aminosavak próbaként is használhatók.

egy másik módszer elektro-kapcsolható bioszűrőket alkalmaz, ahol a fehérjéket rövid DNS-molekulák tetejére helyezik, amelyeket váltakozó elektromos potenciálok alkalmazásával pufferoldaton húznak át. Sebességük mérésével, amely végső soron a hidrodinamikai súrlódástól függ, megjeleníthetők a konformációs változások.