A Roche COBAS 4800 HPV teszt klinikai teljesítménye | Jiotower

TEXT

a humán papillomavírus (HPV) az egyik leggyakoribb nemi úton terjedő vírus világszerte, és jelentős mértékben hozzájárul a rák kialakulásához, évente közel 60 000 új rákos megbetegedést okoz Európában (1), és a méhnyakrák kialakulásához vezet a nőknél. A HPV16 és a HPV18 a leginkább karcinogén (2, 3), mivel az összes méhnyakrák körülbelül 70% – a jelen van a HPV16 vagy HPV18 fertőzésekkel (4). A méhnyakrákok közel 30%-át elmulasztják a kezdeti méhnyakrák-szűrés (5), így a HPV-vel összefüggő méhnyakrák pontos és objektív tesztjei, amelyek érzékenyebb molekuláris technikákat alkalmaznak, szükségesek a hatékony megelőzéshez és kezeléshez a méhnyakrák jövőbeli kockázatainak és előfordulásának csökkentése érdekében.

a Roche COBAS 4800 HPV teszt (COBAS) egy új molekuláris módszer, amely valós idejű PCR-en (RT-PCR) (6, 7) alapul, egy teljesen automatizált rendszerrel, amely gyors és hatékony mintafeldolgozást tesz lehetővé. A Cobas képes észlelni a HPV16, HPV18, 12 egyéb magas kockázatú HPV-ket (hrhpv) (HPV31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, és -68, összevont eredményként), valamint az ONS-globin kontroll egymástól függetlenül ugyanabban a PCR-ben. Vizsgálatunk elsődleges célja a Cobas technikai és klinikai teljesítményjellemzőinek értékelése volt. 6056 nő nyaki mintáit a Sínai-hegy Icahn Orvostudományi Karának patológiai osztályára utalták a nyaki elváltozások rutinszerű vizsgálatára 2011 novembere és 2012 februárja között folyékony alapú citológiai közegben (PreservCyt; Hologic, Marlborough, MA) és tárolva 4CC használatig.

száznyolcvan mintát vizsgáltak hrHPV genotípusok szempontjából mind a Roche cobas 4800 HPV teszttel, mind a Digene Hybrid Capture 2 (HC2) hrHPV DNS teszttel (1.táblázat), az esetleges eltéréseket a lineáris tömb (LA) HPV genotipizáló teszt (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) (8). Pearson khi-négyzet tesztje szerint szignifikáns különbség volt a két HPV teszt által azonosított pozitív és negatív minták számában (P < 0,001). A két teszt közötti konkordancia azonban statisztikailag erős volt, az egyetértési szint 88,33% (P = 0,0218) és a Cohen kappa-együtthatója 0,767 volt (95% – os konfidencia intervallum , 0,674-0,860; P < 0,001), ahol a kappa-értékek 95% – os konfidencia-intervallumát binomiális eloszlásból vonták le.

az eltérő mintákban az LA HPV teszt alacsony kockázatú HPV (lrHPV) genotípusokat mutatott ki a minták 50%-ában (2/4), amelyek HC2 pozitívak voltak és Cobas negatív és a minták 13,33% – ában (2/15) volt HC2 negatív és COBAS pozitív. A HPV53-at két mintában találták, amelyek HC2 pozitívak és Cobas negatívak voltak, ami arra utal, hogy a Digene kit próbái keresztreakciót mutattak ezzel a HPV genotípussal. Ez a megfigyelés nem meglepő, mivel a HC2 teszt keresztreaktivitását az lrHPV genotípusokkal, különösen a HPV53-mal korábban megfigyelték (9). Az lrHPV genotípus keresztreaktivitásának következménye a HPV tesztben a hamis pozitív eredmények számának növekedése. Ez túlvizsgálathoz és túlkezeléshez vezethet a csak lrHPV genotípusokkal rendelkező és a méhnyakrák kialakulásának alacsony kockázatával rendelkező nők nyomon követésével. Két HC2-negatív / Cobas-pozitív mintában mindkét mintában HPV62 és HPV89 (CP6108) volt kimutatható, az egyik mintában pedig HPV42, HPV54, HPV55, HPV61, HPV70 és HPV84 volt kimutatható, ami arra utal, hogy a vegyes HPV-fertőzés a COBAS HPV-teszt álpozitív eredményeihez vezet.

az LA HPV-teszt egyik mintában sem mutatott ki HC2-pozitív és Cobas-negatív (0/4), illetve a minták 80% – ában (12/15) HC2-negatív és COBAS-pozitív. A HC2 teszt nem mutatta ki a hrHPV-t ezekben a mintákban, ami azt jelzi, hogy a HC2 teszt több hrHPV genotípust hagyott ki, mint a Cobas teszt, ami arra utal, hogy a Cobas potenciálisan hatékonyabb szűrővizsgálat a jobb érzékenység és pontosság miatt. Ezzel szemben a HPV-t az LA HPV-teszt nem mutatta ki a HC2-negatív/Cobas-pozitív minták 6,67% – ában (1/15). Összességében azonban a HC2 és a COBAS tesztek közötti különbség a hrHPV kimutatásában statisztikailag még mindig jelentéktelen volt (ons = 2,901, P = 0,0885).

ezután hatvannyolc mintát használtunk a COBAS HPV teszt reprodukálhatóságának meghatározására. A standard 2-by-2 kontingenciatáblázattal kiszámított, a kezdeti és az ismételt vizsgálatok közötti reprodukálhatóság 93,55% volt; a Cobas-vizsgálat első és második fordulójának eredményei közötti kappa-együttható 0,869 volt (95% CI, 0,744-0,993; P < 0,001). E megállapodás erősségét nagyon jónak tekintik, ami arra utal, hogy a vizsgálat rendkívül megbízható.

száznyolcvanhét mintát vizsgáltunk a COBAS HPV-teszttel, hogy meghatározzuk a HPV-kimutatás különbségét a prealiquoted és postaliquoted minták között. Csak 7 minta nem volt megfelelő, 3,74% – os sebességgel (95% CI, 1,02% – 6,46%). A statisztikai elemzés azt mutatta, hogy a prealiquoted és postaliquoted minták közötti különbség nem volt szignifikáns (62 = 0,233, P = 0,36290). Mivel a HPV-pozitív arány növekedését nem figyelték meg a citológiai folyamat előtt és után (prealiquot versus postaliquot), a minták keresztszennyeződése a citológiai feldolgozás során rendkívül ritka. A citológia utáni HPV-vizsgálat jelentősen javíthatja a munkafolyamatot és csökkentheti a felesleges aliquoting-ot, ha reflex HPV-tesztet terveznek abnormális citológiára.

végül 5621 mintát vizsgáltunk a COBAS HPV teszttel, hogy meghatározzuk az Örvénylés és az Örvénylés hatását (a Cobas tesztelés előtt) a meghibásodási arányokra. Az örvényléssel feldolgozott 1380 minta közül a hibaarány 4 volt.57% (95% CI, 3, 65% – 5, 91%). Ezzel szemben a kavargással feldolgozott 4241 minta közül a hibaarány 1,16% volt (95% CI, 0,84% – 1,48%). Pearson khi-négyzet tesztje kimutatta, hogy az örvénylő és a finoman örvénylő minták közötti meghibásodási arányok közötti különbségek rendkívül jelentősek voltak (62 = 59,983, P < 0,0001), a Cobas meghibásodási arányának csökkentése érdekében a kíméletes kavargást javasolták.

összefoglalva, a COBAS 4800 HPV teszt nagyobb fokú érzékenységet és specificitást mutatott a hrHPV genotípusok kimutatásában, mint a Digene HC2 hrHPV teszt. A Cobas teszt alacsonyabb keresztreaktivitást mutatott az lrHPV genotípusokkal, mint a HC2 teszt, amit a kevesebb hamis pozitív eset is bizonyít. A két teszt közötti általános teljesítménybeli különbség azonban statisztikailag nem szignifikáns.