Identifizierung, Prävalenz und Pathogenität von Colletotrichum-Arten, die Anthracnose von Capsicum annuum in Asien verursachen

Morphologische Beobachtungen und phylogenetische Daten der geraden Konidienarten identifizierten eindeutig drei neue Arten, zwei aus Indonesien und eine aus Taiwan. Detaillierte morphologische Beschreibungen sind nachstehend für alle Colletotrichum-Arten angegeben, die mit Chili Anthracnose assoziiert sind (Tabelle 4).

Colletotrichum javanense D.D. De Silva, P.W. Crous & P.W.J. Taylor, sp. Nov. MycoBank MB826936.

Abbildung 6 Etymologie: Benannt nach Java, der Insel in Indonesien, auf der die Art gesammelt wurde.

Diagnose: Colletotrichum javanense unterscheidet sich von C. brisbanense durch die Bildung ausgeprägter Chlamydosporen und acervulärer Konidiomata auf allen getesteten Medien. Im Gegensatz dazu produzierte C. brisbanense nur Konidiome am Anthriscus-Stamm, aber keine Basalzellen. Darüber hinaus wächst C. javanense schneller als C. brisbanense (C. javanense auf OA, MEA und SNA 60, 55 und 66 mm Durchmesser in 7 d bzw. C. brisbanense auf OA und SNA 18,5, 20 mm Durchmesser in 7 d). Colletotrichum javanense unterscheidet sich phylogenetisch von C. brisbanense mit beiden Arten, die sich in den Sequenzen von chs-1 unterscheiden, und am effektivsten mit gapdh (7 bp Unterschied) und his3 (4 bp Unterschied).

Typ: Indonesien: West Java, Purwakata Regency, auf Frucht von Capsicum annuum, Dez. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – Holotyp; CBS 144963 = UOM 1115 = EWINDO 3 – Ex-Typ Kulturen).

Beschreibung: Sexualmorph nicht beobachtet. Asexuelle Morph auf PDA. Vegetatives Myzel 1-5 µm Durchmesser, hyalin, glattwandig, septiert, verzweigte Hyphen. Chlamydosporen kugelig oder länglich, hellbraun, glattwandig, 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervular, setae nicht beobachtet. Konidiophoren hyalin, septiert, verzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch oder ampulliform, 7-17,5 µm, Apex 1-3 µm diam. Konidien hyalin, aseptiert, glattwandig, meist fusiform, ein Ende abgerundet, das andere Ende spitz oder beide Enden spitz (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Konidien in der Masse gelb bis orange Farbe. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, mittelbraun, glattwandig, subglobose oder elliptisch, mit ganzem oder wellenförmigem Rand, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

Asexueller Morph auf SNA. Vegetatives Myzel 1-7 µm Durchmesser, hyalin, glattwandig, septiert, verzweigte Hyphen. Chlamydosporen kugelig oder länglich, hellbraun, glattwandig, 4,5-28 × 4-8 µm. Conidiomata acervular, setae nicht beobachtet. Konidiophore hyalin, septiert, verzweigt, 20-35 µm lang. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch oder ampulliform, 5-20 µm, Spitze, 1-3 µm Durchmesser. Konidien hyalin, aseptiert, glattwandig, zylindrisch mit beiden Enden spitz oder ein Ende rund und ein Ende spitz, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Konidien in Masse mit gelber bis orangefarbener Farbe.

Kulturmerkmale: Kolonien auf PDA 48-54 mm Durchmesser in 7 d (6,5–7,5 mm/ d), flach mit ganzem Rand; Oberfläche bedeckt mit grauem bis olivgrünem kurzen Luftmyzel, Rand weiß bis hellgrau, Rückseite meist cremeweißlich, olivgrau bis schwarz in der Mitte. Gelb bis orange acervular conidiomata. Kolonien auf SNA waren 60-66 mm Durchmesser in 7 d (8-9,5 mm / d), flach mit gesamtem Rand, hyalin bis hellbraun, Oberfläche bedeckt mit kurzem grauem Luftmyzel, umgekehrt gleiche Farben. Orange acervular conidiomata im Zentrum der Kultur. Kolonien auf OA waren 55-60 mm Durchmesser in 7 d (7,8–8,5 mm / d), flach mit ganzem Rand; Oberfläche bedeckt mit cremefarbenem bis grauem kurzen Luftmyzel, Rand weiß, Rückseite meist hellorange, mit braunen Pigmenten. Orange acervular conidiomata. Kolonien auf MEA-Oberfläche hellgrau kurzes Luftmyzel, Rückseite hellorange.

Anmerkungen: Die nächste Übereinstimmung in einer blastn-Suche mit der gapdh-Sequenz war GenBank JQ948617, C. sloanei Stamm IMI 364297 mit 98% Identität (4 bp Unterschiede), während die nächsten Übereinstimmungen mit der his3-Sequenz mit 99% Identität (2 bp Unterschiede) waren GenBank JQ949279 C. indonesiense Stamm CBS 127551 und GenBank KJ947248 C. guajavae isolieren OBP19.

Colletotrichum makassarense D.D. De Silva, P.W. Crous & P.W.J. Taylor, sp. Nov. MycoBank MB827691.

Abbildung 7 Etymologie: Benannt nach Makassar, der Stadt in Süd-Sulawesi, Indonesien, in der die Art gesammelt wurde.

Diagnose: Colletotrichum makassarense ist phylogenetisch eng mit C. tropicale verwandt. Sequenzdaten von ITS konnten die beiden Spezies nicht trennen, aber sie können von allen anderen getesteten Genen unterschieden werden und am effektivsten unter Verwendung von ApMat- (22 bp-Unterschiede) und gs- (18 bp-Unterschiede) Sequenzdaten.

Typ: Indonesien: Makassar, aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – Holotyp; CBS 143664 = CPC 28612 – Ex-Typ Kulturen).

Beschreibung: Sexual Morph nicht beobachtet. Asexuelle Morph auf OA. Vegetatives Myzel bestehend aus hyalinen, glattwandigen, septierten, verzweigten Hyphen, 2-3 µm Durchmesser. Chlamydosporen nicht beobachtet. Setae vorhanden, mittelbraun, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-septiert, spitz zulaufend. Conidiomata acervular, 100-200 µm Durchmesser, mit orangefarbenen Konidienmassen. Konidiophore subzylindrisch, biegsam, 1-4-septiert, hyalin, glatt, verzweigt, 15-45 × 3-4 µm. Konidiogene Zellen subzylindrisch, hyalin, glatt, phialidisch mit periklinaler Verdickung, 7-25 × 3-4 µm. Konidien hyaline, glatt, aseptate, subcylindrical, gerade, apex stumpf, Verjüngung an der Basis zu vorstehenden Kegelstumpf hilum, 1 µm diam, prominent guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria solitär, mittelbraun, glattwandig, subglobose, ellipsoid bis obovat, ganzer Rand, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

Kulturmerkmale: Kolonien auf PDA 45 mm Durchmesser nach 7 d (6,5 mm/d), Kolonien flach, mit mäßigem Luftmyzel, auf OA-Oberfläche rauchgrau. Auf PDA-Oberfläche rauchgrau, Rückseite olivgrau. Auf MEA Oberfläche schmutzig weiß, Rückseite ockerfarben.

Anmerkungen: Die nächste Übereinstimmung in einer blastn-Suche mit der ApMat-Sequenz war GenBank KU923732, C. queenslandicum Stamm AUS22 mit einer 98% Identität (16 bp Unterschiede), während die nächste Übereinstimmung mit der gs-Sequenz mit 99% Identität (7 bp Unterschiede) war GenBank KJ947286 C. siamense isolieren OBP24. Die besten Übereinstimmungen mit der gapdh-Sequenz waren GenBank KX578784 C. siamense (99% Identität, 3 bp Unterschiede) und GenBank KU221347 C. queenslandicum (99% Identität, 3 bp Unterschiede).

Colletotrichum tainanense D.D. De Silva, P.W. Crous & P.W.J. Taylor, sp. Nov. MycoBank MB827692.

Abbildung 8 Etymologie: Benannt nach Tainan, der Stadt in Taiwan, in der die Art gesammelt wurde.

Diagnose: Colletotrichum tainanense unterscheidet sich von seinem nächsten phylogenetischen Nachbarn C. salsolae in der Kultur konzentriert sich auf PDA, spärliches Luftmyzel und blasses mausgraues Oberflächenmyzel, während C. salsolae eine Schicht von acervuli-ähnlichen Strukturen mit tief orangebraunen Konidienmassen und zahlreichen Setae produziert. Die beiden Arten sind unter Verwendung aller getesteten Gene mit Ausnahme von ITS trennbar und am effektivsten mit gapdh- (7 BP-Unterschied), tub2- (6 bp-Unterschied) und act- (5 bp-Unterschied) Sequenzen. Es gibt nur einen signifikanten Unterschied in der chs-1-Sequenz zwischen den beiden Spezies.

Typ: Taiwan: Tainan: auf Frucht von Capsicum annuum, Aug. 2014, Z.M. Sheu (CBS H-143666 – Holotyp; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298 – Ex-Typ Kulturen).

Beschreibung: Sexualmorph nicht beobachtet. Asexuelle Morph auf PDA. Vegetatives Myzel verzweigt, hyalin, glattwandig, septiert, Hyphen 2-3 µm Durchmesser, mit der Zeit melanisiert. Ein einzelnes Konidiom auf einer PDA-Platte, steril auf SNA, MEA und OA. Chlamydosporen und Setae nicht beobachtet. Konidiophore subzylindrisch, biegsam, 1-2-septiert, hyalin, glatt bis hellbraun, verzweigt. Konidiogene Zellen subzylindrisch, hyalin, glatt, phialidisch mit periklinaler Verdickung. Konidien hyaline, glatt, aseptate, subcylindrical zu subclavate, gerade oder leicht gebogen, apex stumpf, verjüngung an der basis zu vorstehenden kegelstumpf hilum, 1,5-2 µm diam, prominent guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, oft schmal-zylindrisch, mittel bis dunkelbraun, oft zur Spitze hin verjüngend, der Rand ganz oder wellenförmig, manchmal unregelmäßig gelappt (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

Kulturmerkmale: Kolonien auf PDA 45 mm Durchmesser nach 7 d (6,5 mm / d), Kolonien flach, mit mäßigem Luftmyzel. Auf OA Oberfläche blass mausgrau. Auf PDA Oberfläche blass Maus-grau, reverse Maus-grau. Auf MEA Oberfläche blass mausgrau, Rückseite olivgrau.

Anmerkungen: Die nächste Übereinstimmung in einer blastn-Suche mit der gapdh-Sequenz mit 99% Identität (2 bp Unterschied) war GenBank KC790761 Colletotrichum sp. stamm MTCC 9664, während die engste Übereinstimmung mit der Act–Sequenz mit 99% Identität (2 bp Unterschied) GenBank KY995522 C. siamense Stamm LJDY1-2 war. Die engste Übereinstimmung mit der tub2-Sequenz mit 99% Identität (7 bp Unterschied) war GenBank MF143931 C. siamense Stamm 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Vielfalt 61: 112 (2013); als ‘endophytica’.

Beschreibung: Kolonien auf PDA 42 mm Durchmesser nach 7 d (5,5 mm / d), blassorange bis weißes Luftmyzel; Rückseite blassweiß bis orange und schwarz in der Mitte und zahlreiche orangefarbene Konidiomata über die Oberfläche verstreut. Chlamydosporen nicht beobachtet. Konidiome vorhanden, Konidiophoren direkt auf Hyphen gebildet. Setae vorhanden, mäßig braun, 47-95 × 3-6 µm, 3-4-septiert, spitz zulaufende Spitzen. Konidiophore hyalin, glattwandig und unverzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, glattwandig, aseptiert, subzylindrisch, 12-21 × 3-4 µm. Konidien hyaline, glattwandig, aseptate, gerade, zylindrisch mit zwei Enden stumpf, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, braun, leicht gelappt, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

Anmerkungen: Colletotrichum endophyticum wurde zuerst als Grasendophyt von Pennisetum purpureum aus Nordthailand beschrieben (Manamgoda et al. 2013). Später wurde es von mehreren anderen Wirtsarten einschließlich Capsicum in China berichtet (Diao et al. 2017). Die Länge der Konidien des Isolats aus Thailand (UOM 1137) war etwas kürzer als die des Ex-Typs (LC0324) von C. endophyticum (Konidien 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

Untersuchtes Material: Thailand: Kanchanaburi: aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, 2010, P.W.J. Taylor & O. Mongkolporn (Kultur UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. in: et al., Fung. Vielfalt 39: 158 (2009).

Beschreibung: Kolonien auf PDA 65 mm Durchmesser nach 7 d (8,5–11 mm/d), flach mit ganzer Kante, Luftmyzel dicht, baumwollig, hellgrau bis weiß Luftmyzel und zahlreiche schwarze Stroma über die Oberfläche verstreut, grau in der Mitte, weiß am Rand; Rückseite graugrün. Chlamydosporen nicht beobachtet. Es wurden Conidiomata acervular, Setae beobachtet, braun, glattwandig, 1-2-septiert, 60 µm lang, spitz zulaufende Spitzen. Konidiophoren hyalin, septiert, verzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch oder ampulliform, 7-17,5 µm. Konidien hyalin, aseptiert, glattwandig, zylindrisch, beidseitig stumpf, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria nicht beobachtet.

Anmerkungen: Der sexuelle Morph dieser Isolate wurde in Kultur nicht beobachtet. Die Konidienlänge des Isolats CPC 28644 war geringfügig länger als die des Ex-Typs (ICMP 18581 = BPD-I16) von C. fructicola (Konidien 9,7–14 × 3-4,3 µm, x = 11,53 ± 1,03 × 3,55 ± 0,32 µm; Prihastuti et al. 2009).

Untersuchtes Material: Thailand: Chiang Mai: aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & O. Mongkolov (Kulturen CPC 28644 und CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, aus Fruchtläsion reifer roter Früchte von Capsicum sp. (paprika), 22 Apr. 2015, Z.M. Sheu (Kultur UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, aus Fruchtläsion der grünen Frucht von Capsicum sp. (paprika), 4 Sep. 2008, Z.M. Sheu & C. Wang (Kultur UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti Sie L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); als ‘karstii’.

Beschreibung: Kolonien auf PDA 65 mm Durchmesser nach 7 d (6,5–10.5 mm/d), flach mit ganzem Rand, orangefarbenes bis weißes Luftmyzel und zahlreiche orangefarbene Konidienmassen über die Oberfläche verstreut, am Rand weiß; umgekehrt gelb bis orange. Chlamydosporen nicht beobachtet. Conidiomata acervular, setae wurden beobachtet, braun, glattwandig, 2-4-septiert, 60 µm lang, Basis untergetaucht, verjüngt sich zur Spitze hin, Spitze meist spitz. Konidiophoren hyalin, septiert, verzweigt, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch oder ampulliform, 7-15,5 µm. Konidien hyalin, aseptiert, glattwandig, kurz, zylindrisch, beide Enden stumpf oder ein Ende leicht spitz oder an der Basis abgeschnitten, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, braun, subglobose, kreisförmige Kontur, 6-12,5 × 3,5-8 µm.

Anmerkungen: Die vier Isolate, die aus Indonesien im Boninense-Komplex identifiziert wurden, produzierten im Vergleich zur Ex-Epityp–Kultur von C. karsti (14,5-17 × 5-6,5 µm; Yang et al. 2011). Jedoch hohe Variabilität der Konidiengröße zwischen verschiedenen Stämmen von C. karsti wurden von Damm et al. (2012a, 2012b) wo die Konidienmessungen von CBS 129833 waren (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) SD = 13,1 ± 0,7 × 5,8 ± 0,4 µm; und CBS 111998 hatte eine Konidiumlänge von bis zu 18,5 µm, L / W-Verhältnis = 2,8. Diese Isolate bildeten keinen sexuellen Morph in der Kultur. Obwohl diese vier Isolate eine vollständig unterstützte (100% BS / 1 PP) Unterklasse innerhalb von C. karsti bildeten, lieferten alle einzelnen Genbäume (Daten nicht gezeigt) keine signifikante Unterstützung, um die Einführung einer kryptischen Spezies für diese Isolate zu rechtfertigen.

Untersuchtes Material: Indonesien: Jeneponto, aus Fruchtläsionen von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (Kulturen CPC 28553, CPC 28554); aus Fruchtläsionen reifer roter Früchte und Stielläsionen von Capsicum sp. Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (siehe CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Gestüt. Mycol. 92: 31 (2019).

Beschreibung: Kolonien auf PDA 63 mm Durchmesser nach 7 d (8 mm/d), graues bis dunkelbraunes Luftmyzel; reverse grau bis hellbraun mit gelb-orange in der Mitte mit reichlich acervular Konidiome, die blass orange Konidienmassen in der Mitte sickern, Chlamydosporen nicht beobachtet. Konidiome vorhanden (in der Nähe des Impfpunktes), Konidiophoren direkt auf Hyphen gebildet. Sklerotien vorhanden. Setae vorhanden, mittelbraun, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-septiert, sich zu den Spitzen verjüngend, oft mit einer Verengung an der Spitze. Konidiophore hyalin bis hellbraun, glattwandig, septiert und verzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, glattwandig, aseptiert, subzylindrisch, gerade bis leicht gebogen, 26-48 × 3-4 µm, phialidisch, periklinale Verdickung auffällig. Konidien hyalin, glattwandig, aseptiert, gerade, zylindrisch mit zwei Enden stumpf oder einem Ende leicht spitz, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, mittelbraun, unregelmäßige Form, Zinnen- oder gelappter Umriss, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Sexual morph auf PDA. Ascomata perithecia, gebildet nach 2 wk., solitär, halb eingetaucht oder eingetaucht in das Agarmedium, nicht-chromatisch, subsphärisch bis eiförmig, ostiolat, kahl, mittelbraun, 96-130 × 160-200 µm. Peridium 10-12,5 µm dick, bestehend aus blass bis mittelbraun abgeflachten eckigen Zellen 3,5–10 µm Durchmesser. Aszites Hyphen hyalin, glattwandig, zart, selten sichtbar. Interascal Gewebe nicht beobachtet. Asci unitunicate, 8-sporig, zylindrisch, sich zu Spitze und Basis verjüngend, glattwandig, 51-65 × 9,5-13 µm, die Basis abgeschnitten. Ascosporen zweireihig angeordnet, aseptiert, hyalin, glattwandig, fusiform, leicht gebogen, Basis abgerundet, Spitze spitz oder abgerundet, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

Hinweise: Die Konidiallänge der untersuchten Isolate (CPC 28638, CPC 28639) war variabel und lag im Bereich des Ex-Typ-Isolats (CBS 125474) von C. plurivorum (15-17 × 5,5 µm; Damm et al. 2019).

Untersuchtes Material: Thailand: Chiang Rai, aus Blattläsionen von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor (siehe CPC 28638 und CPC 28639); Bangkok, Restaurant in Phaya Thai Bereich, infiziertes Gewebe von Capsicum sp. Jun. 2015, P.W.J. Taylor (Kultur UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Gestüt. Mycol. 73: 100 (2012).

Beschreibung: Kolonien auf PDA 20-38 mm Durchmesser nach 7 d (5-6,2 mm / d), flach mit gesamtem Rand; Oberfläche bedeckt mit kurzem hellrosa bis orangefarbenem Luftmyzel, mit der Zeit grau, Rand weißlich bis blassrosa, umgekehrter rosiger Buff, olivgrau bis braungrau in der Mitte; umgekehrtes Orange bis Lachs, dunkel in der Mitte. Chlamydosporen nicht beobachtet. Conidiomata acervular, Setae nicht beobachtet, Konidiophoren hyalin, septiert, verzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch oder ampulliform, 7-17,5 µm, Apex 1-3 µm diam. Konidien hyaline, aseptate, glattwandig, meist fusiform, ein Ende abgerundet, ein Ende spitz, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Konidien in Masse mit Lachs bis orange Farbe. Appressoria einzeln oder in losen Gruppen, mittelbraun, eiförmig, ganz bis Zinnenrand, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

Anmerkungen: Die Mehrheit der Isolate identifiziert als C. scovillei hatte ähnliche Sporenform und Sporengrößen, im Vergleich zur Typenprobe (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, beschrieben von Damm et al. (2012a, 2012b). Einige Isolate wiesen jedoch eine unterschiedliche Koloniefarbe, unterschiedliche Koloniewachstumsraten und geringe Unterschiede in den Sporenmessungen auf.

Untersuchtes Material: Indonesien: Gowa, aus Fruchtläsionen von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (Kulturen CPC 28577 und CPC 28579); West Java: aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, Dez. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146/ EWINDO 10. Thailand: Chiang Mai: von Fruchtläsionen von Capsicum sp. 2008, O. Mongkolov (Kulturen UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. in: et al., Fung. Vielfalt 39: 98 (2009)

Beschreibung: Kolonien auf PDA 79 mm Durchmesser in 7 d (5,5–6 mm/d). Hellgelb-weißes, graues, dichtes baumwolliges Luftmyzel mit orangefarbenen acervulären Konidiomata in der Mitte; Rückseite blass gelblich. Chlamydosporen nicht beobachtet. Conidiomata acervular, Konidiophoren auf einem Kissen aus rundlichen und mittelbraunen Zellen gebildet. Setae nicht beobachtet. Konidiophoren hyalin, verzweigt. Konidiogene Zellen hyalin, zylindrisch bis ampulliform, 6,5-16 µm. Konidien hyalin, aseptiert, glattwandig, fusiform bis zylindrisch, beidseitig stumpf gerundet, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria dunkelbraun, solitär, kreisförmig, ganz bis Zinnenrand, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

Anmerkungen: Colletotrichum siamense-Isolate aus verschiedenen Ländern zeigten Variationen der morphologischen Merkmale, der Wachstumsraten und der Kulturmorphologie auf PDA. Repräsentative Konidialmessungen für Isolate, die verschiedene Subklassen in den phylogenetischen Bäumen repräsentieren (Abb. 2, 3) sind: CPC 30233 (Gowa, Indonesien), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Thailand) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOM 1126 / F4-1C (Kanchana Buri, Thailand) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3,5– 5.5. Diese morphologischen Merkmale innerhalb einer Unterklasse waren in jedem Land sehr konsistent. Die Art wurde von Prihastuti et al. (2009); Konidien der Ex-Holotyp-Probe (ICMP 18578 / BDP-I2) wurden als 7-18 gemeldet.3 × 3-4,3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), dies umfasst den Bereich, der in unseren Isolaten beobachtet wird. Es wurde berichtet, dass diese Art biologisch und geografisch vielfältig ist und auf vielen Wirten in mehreren tropischen und subtropischen Regionen vorkommt (Weir et al. 2012).

Untersuchtes Material: Indonesien: Gowa, aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (Kultur CPC 30233); Jeneponto, aus Fruchtläsion von Capsicum sp. 7 Juni. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (Kultur CPC 30209). Thailand: Ratchaburi, aus Fruchtläsion von Capsicum sp., Jan. 2010, P.W.J. Taylor & O. Mongkolporn (Kultur UOM 1132); Kanchanaburi, aus Fruchtläsion von Capsicum sp. Jan. 2010, P.W.J. Taylor & O. Mongkolporn (Kultur UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, aus Fruchtläsion von Capsicum sp. Sep. 2013, D.D. De Silva & N. Ranathunge (Kultur UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E.I. Rojas et al., Mycologia 102: 1331 (2010)

Beschreibung: Kolonien auf PDA 45 mm Durchmesser in 7 d (6,5 mm/ d). Kolonien flach, sich ausbreitend, mit mäßigem Luftmyzel, Auf OA-Oberfläche rauchgrau. Auf PDA-Oberfläche olivgrau bis rauchgrau, Rückseite olivgrau, zahlreiche orangefarbene Konidiome über die Oberfläche verstreut. Auf MEA Oberfläche schmutzig weiß, Rückseite ockerfarben. Asexuelle Morph auf OA. Vegetatives Myzel bestehend aus hyalinen bis hellbraunen, glattwandigen, septierten, verzweigten, 2-2,5 µm durchmessenden Hyphen. Chlamydosporen nicht beobachtet. Setae selten (nur zwei gesehen), gerade, mittelbraun, fein verruculos, 2-3-septiert, bis 120 µm lang, Apex subobtus gerundet. Conidiomata acervular, 150-250 µm Durchmesser, mit orangefarbener Konidienmasse. Konidiophore subzylindrisch, biegsam, 1-3–septiert, hyalin, glatt, verzweigt, 15-25 × 3,5-4,5 µm. Konidiogene Zellen subzylindrisch, hyalin, glatt, phialidisch mit periklinaler Verdickung, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Konidien hyaline, glatt, aseptate, subcylindrical, gerade, apex stumpf, Verjüngung an der Basis zu vorstehenden Kegelstumpf hilum, 1,5-2 µm diam, prominent guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria nicht beobachtet. Sexual Morph nicht beobachtet.

Untersuchtes Material: Indonesien, Makassar, aus Fruchtläsion von Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P.W.J. Taylor & A. Nasruddin (Kultur CPC 28607).

Prävalenz der untersuchten Colletotrichum-Arten

Insgesamt war C. truncatum die am weitesten verbreitete Art (44%), die aus infizierten Chilifrüchten isoliert wurde (Abb. 9) und wurde leicht durch seine Falkaten Sporen und reichlich setae in den nekrotischen Läsionen identifiziert. Von den Arten mit geraden Konidien war C. scovillei (acutatum-Komplex) die häufigste Art in den untersuchten Ländern (35%), mit Ausnahme von Sri Lanka, wo diese Art nicht isoliert wurde. Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) war die zweithäufigste Art, die in Thailand, Sri Lanka und Indonesien vorkam (11%). Die übrigen Arten waren mit weniger als 10% der Gesamtzahl der Isolate vertreten.

In Indonesien, C. scovillei wurde in allen untersuchten Regionen Südsulawesis, außer in Makassar, und auf dem Feldversuchsgelände in West-Java aus infizierten Chilifrüchten isoliert. Colletotrichum siamense wurde auch aus der gesamten Region isoliert, von Gowa, Jeneponto und Makassar. Die beiden neuen Arten C. makassarense und C. javanense wurden aus Makassar bzw.

In Thailand wurde C. scovillei hauptsächlich aus den nördlichen Provinzen Chiang Mai und Chiang Rai isoliert, aber auch aus infizierten Chilifrüchten in einem Versuchsgelände der Kasetsart University in Nakhon Pathom gewonnen. Die westlichen Provinzen hatten eine hohe Inzidenz von C. siamense und ein Isolat von C. endophyticum wurde aus Kanchana Buri gesammelt. Colletotrichum plurivorum wurde aus Chiliblättern mit nekrotischen Läsionen in Chiang Rai und aus nekrotischen Läsionen von Chilifrüchten isoliert, die in einem Restaurant in Phaya Thai in Bangkok gefunden wurden. Darüber hinaus wurde C. fructicola aus Früchten aus Chiang Mai identifiziert.

In Taiwan wurde ein Isolat als eine neue Art, C. tainanense, identifiziert, die aus infizierten Chilifrüchten in der Provinz Tainan gewonnen wurde, und C. Fructicola wurde aus Früchten in Hsinchu und Nantou, Taiwan, identifiziert. Colletotrichum plurivorum wurde auch aus einer in Johor, Malaysia, gesammelten Frucht identifiziert.

Pathogenität

Alle Colletotrichum-Arten verursachten Anthracnosesymptome an verwundeten Früchten, aber es gab signifikante Unterschiede in der Schwere der Symptome. An verwundeten Früchten zeigten Isolate von C. scovillei und C. javanense den höchsten Krankheitsschweregrad und produzierten große, nekrotische Läsionen mit mittleren Läsionsgrößen von 15,6–20,3 mm (Tabelle 5). An nicht verwundeten Früchten waren alle Arten weniger pathogen, mit mittleren Läsionsgrößen von weniger als 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale und C. plurivorum produzierten nur sehr kleine Läsionen oder keine sichtbaren Symptome (mittlere Läsionsgröße < 1 mm) 10 d nach Inokulation von nicht verwundeten Früchten. Colletotrichum javanense- und C. scovillei-Isolate waren in nicht verwundeten Früchten am pathogensten und verursachten Läsionen mit mittleren Größen von 9,4 bzw. 9,1 mm. Die durch C. scovillei verursachten Läsionen waren signifikant größer als die durch alle anderen Arten mit Ausnahme von C verursachten. javanense in verwundeten Früchten und C. endophyticum in ungewickelten Früchten. Die Signifikanz der paarweisen t-Tests hängt stark von der Anzahl der Isolate jeder untersuchten Spezies ab, so dass sich die in Tabelle 5 gezeigten Gruppierungen nicht einfach mit der Größe der Differenz der Mittelwerte ändern; Ein großer Unterschied kann nicht signifikant sein, wenn es für beide Spezies kleine Probengrößen gibt, während ein kleinerer Unterschied signifikant sein kann. Insbesondere Vergleiche mit C. javanense und C. endophyticum sind sehr ungenau, da von jeder Spezies nur ein Isolat getestet wurde.