Concatemer

Un concatemer è una lunga molecola di DNA continua che contiene più copie della stessa sequenza di DNA collegate in serie. Queste molecole polimeriche sono solitamente copie di un intero genoma collegato end to end e separati da siti cos (una sequenza nucleotidica di legame proteico che si verifica una volta in ogni copia del genoma). I concatemeri sono spesso il risultato della replicazione del cerchio di rotolamento e possono essere osservati nella fase avanzata dell’infezione batterica da parte dei fagi. Ad esempio, se i geni nel DNA dei fagi sono disposti ABC, allora in un concatemer i geni sarebbero ABCABCABCABC e così via (supponendo che la sintesi sia stata avviata tra i geni C e A). Sono ulteriormente rotti dai ribozimi.

Durante l’infezione attiva, alcune specie di virus hanno dimostrato di replicare il loro materiale genetico attraverso la formazione di concatemeri. Nel caso di herpesvirus umano-6, il suo intero genoma è fatto più e più volte su un singolo filamento. Questi concatemeri lunghi vengono successivamente scissi tra le regioni pac-1 e pac-2 dai ribozimi quando il genoma viene confezionato in virioni individuali.

Il DNA replicante del batteriofago T4 è stato etichettato con timidina tritiata ed esaminato mediante autoradiografia. Gli intermedi di replicazione del DNA osservati includevano strutture concatemeriche circolari e ramificate circolari che probabilmente sorsero dalla replicazione del cerchio rotolante.