I ceppi congenici

sono generati in laboratorio accoppiando due ceppi inbred (di solito ratti o topi) e incrociando i discendenti 5-10 generazioni con uno dei ceppi originali, noto come ceppo ricevente. In genere la selezione per fenotipo o genotipo viene eseguita prima di ogni generazione di back-cross. In questo modo un fenotipo interessante, o una regione cromosomica definita assaggiata dal genotipo, viene passato dal ceppo donatore su uno sfondo ricevente altrimenti uniforme. Topi o ratti congenici possono quindi essere confrontati con il ceppo ricevente puro per determinare se sono fenotipicamente diversi se la selezione è stata per una regione genotipica, o per identificare il locus genetico critico, se la selezione è stata per un fenotipo.

I congeniti di velocità possono essere prodotti in appena cinque generazioni di back-cross, attraverso la selezione ad ogni generazione di prole che non solo mantengono il frammento cromosomico desiderato, ma anche “perdono” la quantità massima di informazioni genetiche di fondo dal ceppo donatore. Ciò inoltre è conosciuta come congenics marker-assisted, dovuto l’uso dei marcatori genetici, marcatori tipicamente microsatelliti, ma ora, più comunemente, marcatori del polimorfismo del singolo nucleotide (SNPs). Il processo può essere ulteriormente aiutato dalla superovulazione delle femmine, per produrre molte più uova.