Identificazione, prevalenza e patogenicità delle specie di Colletotrichum che causano l’antracnosi di Capsicum annuum in Asia

Osservazioni morfologiche e dati filogenetici delle specie di conidi rettilinei hanno chiaramente identificato tre nuove specie, due provenienti dall’Indonesia e una da Taiwan. Descrizioni morfologiche dettagliate sono fornite di seguito per tutte le specie di Colletotrichum associate al peperoncino antracnosi (Tabella 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. ov. MycoBank MB826936.

Figura 6 Etimologia: Prende il nome da Giava, l’isola in Indonesia dove è stata raccolta la specie.

Diagnosi: Colletotrichum javanense differisce da C. brisbanense nella formazione di chlamydospores distinte e conidiomata acervular su tutti i media testati. Al contrario, C. brisbanense ha prodotto solo Conidiomati sullo stelo dell’Antrisco, ma non sono state osservate cellule basali. Inoltre, C. javanense cresce più velocemente di C. brisbanense (C. javanense su OA, MEA e SNA 60, 55 e 66 mm di diametro in 7 d, rispettivamente, C. brisbanense su OA e SNA 18.5, 20 mm di diametro in 7 d, rispettivamente). Colletotrichum javanense è filogeneticamente distinto da C. brisbanense con entrambe le specie essendo diverse nelle sequenze di chs-1, e più efficacemente con gapdh (7 bp differenza) e his3 (4 bp differenza).

Tipo: Indonesia: Giava occidentale, reggenza di Purwakata, su frutto di Capsicum annuum, dicembre. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – olotipo; CBS 144963 = UOMO 1115 = EWINDO 3-colture ex-tipo).

Descrizione: Morph sessuale non osservato. Morph asessuata su PDA. Micelio vegetativo 1-5 µm di diametro, ialino, a parete liscia, settato ,ph ramificate. Chlamydospores globose o allungate, marrone chiaro, a parete liscia, 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervulare, setole non osservate. Conidiofori ialini, settati, ramificati. Cellule conidiogene ialine, cilindriche o ampulliformi, 7-17, 5 µm, apice 1-3 µm diam. Conidi ialini, aseptati, pareti lisce, per lo più fusiformi, un’estremità arrotondata, l’altra estremità acuta o entrambe le estremità acute (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Conidi in massa di colore giallo-arancio. Appressoria singola o in gruppi sciolti, marrone medio, a parete liscia, subglobosa o ellittica, con margine intero o ondulato, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

Morph asessuale su SNA. Micelio vegetativo 1-7 µm di diametro, ialino, a parete liscia, settato ,ph ramificate. Chlamydospores globose o allungate, marrone chiaro, a parete liscia, 4,5-28 × 4-8 µm. Conidiomata acervulare, setole non osservate. Conidiofori ialini, settati, ramificati, lunghi 20-35 µm. Cellule conidiogene ialine, cilindriche o ampulliformi, 5-20 µm, apice, 1-3 µm diam. Conidia ialina, aseptata, a parete liscia, cilindrica con entrambe le estremità acuta o un’estremità rotonda e un’estremità acuta, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Conidi in massa di colore da giallo ad arancio.

Caratteristiche della coltura: Colonie su PDA 48-54 mm di diametro in 7 d (6,5–7,5 mm/d), piatte con margine intero; superficie ricoperta da micelio aereo corto da grigio a verde oliva, margine da bianco a grigio chiaro, rovescio per lo più biancastro crema, grigio olivaceo al nero al centro. Acervular conidiomata giallo-arancio. Le colonie su SNA erano di 60-66 mm di diametro in 7 d (8-9, 5 mm/d), piatte con margine intero, da ialine a marrone chiaro, superficie ricoperta da micelio aereo grigio corto, stesso colore inverso. Conidiomi acervulari arancioni al centro della coltura. Le colonie su OA erano 55-60 mm di diametro in 7 d (7,8–8,5 mm/d), piatte con margine intero; superficie ricoperta da micelio aereo corto da crema a grigio, margine bianco, inverso per lo più arancione chiaro, con pigmenti marroni. Conidiomi acervulari arancioni. Colonie sulla superficie MEA micelio aereo corto grigio chiaro, arancione chiaro inverso.

Note: La corrispondenza più vicina in una ricerca blastn con la sequenza gapdh era GenBank JQ948617, ceppo C. sloanei IMI 364297 con identità al 98% (4 differenze bp), mentre le corrispondenze più vicine con la sequenza his3 con identità al 99% (2 differenze bp) erano GenBank JQ949279 C. ceppo indonesiense CBS 127551 e GenBank KJ947248 C. guajavae isolano OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. ov. MycoBank MB827691.

Figura 7 Etimologia: Prende il nome da Makassar, la città nel sud Sulawesi, in Indonesia, dove la specie è stata raccolta.

Diagnosi: Colletotrichum makassarense è filogeneticamente strettamente correlato a C. tropicale. I dati di sequenza da ITS non hanno potuto separare le due specie, ma possono essere distinti da tutti gli altri geni testati e più efficacemente utilizzando i dati di sequenza ApMat (22 differenze bp) e gs (18 differenze bp).

Tipo: Indonesia: Makassar, dalla lesione della frutta di Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – olotipo; CBS 143664 = CPC 28612-colture ex-tipo).

Descrizione: Morph sessuale non osservato. Morph asessuata su OA. Micelio vegetativo costituito daph ialine, a parete liscia, settate, ramificate, diam 2-3 µm. Clamidospore non osservate. Setole presenti, marrone medio, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-settate, affusolate ad apici acuti. Conidiomata acervulare, 100-200 µm di diametro, con masse conidiali arancioni. Conidiofori subcilindrici, flessuosi, 1-4-settati, ialini, lisci, ramificati, 15-45 × 3-4 µm. Cellule conidiogene subcilindriche, ialine, lisce, fialidiche con ispessimento periclinale, 7-25 × 3-4 µm. Conidia ialina, liscia, asettica, subcilindrica, diritta, apice ottuso, affusolata alla base fino a sporgere l’hil troncato, 1 µm di diametro, prominente guttulata, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria solitario, marrone medio, a parete liscia, subgloboso, da ellissoidale a obovato, margine intero, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

Caratteristiche della coltura: Colonie su PDA 45 mm diam dopo 7 d (6,5 mm/d), colonie piatte, con micelio aereo moderato, su superficie OA grigio fumo. Su superficie PDA grigio fumo, grigio olivaceo inverso. Sulla superficie MEA bianco sporco, ocra inversa.

Note: La corrispondenza più vicina in una ricerca blastn con la sequenza ApMat era GenBank KU923732, ceppo C. queenslandicum AUS22 con un’identità del 98% (16 differenze bp), mentre la corrispondenza più vicina con la sequenza gs con identità del 99% (7 differenze bp) era GenBank KJ947286 C. siamense isolate OBP24. Le migliori corrispondenze con la sequenza gapdh erano GenBank KX578784 C. siamense (99% identità, 3 differenze bp) e GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identità, 3 differenze bp).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. ov. MycoBank MB827692.

Figura 8 Etimologia: prende il nome da Tainan, la città di Taiwan in cui è stata raccolta la specie.

Diagnosi: Colletotrichum tainanense differisce dal suo vicino filogenetico più vicino C. salsolae nelle caratteristiche della coltura su PDA, micelio aereo sparso e micelio superficiale grigio-topo pallido, mentre C. salsolae produce uno strato di strutture simili a acervuli con masse conidiali marrone arancio intenso e numerose setole. Le due specie sono separabili utilizzando tutti i geni testati ad eccezione di ITS e più efficacemente con gapdh (differenza di 7 bp), tub2 (differenza di 6 bp) e act (differenza di 5 bp) sequenze. C’è solo una differenza bp nella sequenza chs-1 tra le due specie.

Tipo: Taiwan: Tainan: su frutta di Capsicum annuum, agosto. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666 – olotipo; CBS 143666 = CPC 30245 = UOMO 1120 = Coll 1298 – colture ex tipo).

Descrizione: Morph sessuale non osservato. Morph asessuata su PDA. Micelio vegetativo ramificato, ialino, a parete liscia, settato, di 2-3 µm di diametro, melanizzato nel tempo. Un singolo conidioma trovato su una piastra PDA, sterile su SNA, MEA e OA. Clamidospore e setole non osservate. Conidiofori subcilindrici, flessuosi, 1-2-settati, ialini, da lisci a marrone chiaro, ramificati. Cellule conidiogene subcilindriche, ialine, lisce, fialidiche con ispessimento periclinale. Conidi ialini, lisci, asettici, da subcilindrici a succlavi, diritti o leggermente ricurvi, apice ottuso, affusolati alla base a protruding troncato sporgente, 1,5-2 µm di diametro, prominentemente guttulati, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria singola o in gruppi sciolti, spesso stretto-cilindrico, da medio a marrone scuro, spesso affusolato verso l’apice, il bordo intero o ondulato a volte irregolarmente lobato (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

Caratteristiche della coltura: Colonie su PDA 45 mm diam dopo 7 d (6,5 mm / d), colonie piatte, con micelio aereo moderato. Sulla superficie OA pallido grigio topo. Sulla superficie PDA grigio topo pallido, grigio topo inverso. Sulla superficie MEA grigio topo pallido, grigio olivaceo inverso.

Note: La corrispondenza più vicina in una ricerca blastn con la sequenza gapdh con identità del 99% (differenza di 2 bp) è stata GenBank KC790761 Colletotrichum sp. ceppo MTCC 9664 mentre la partita più vicina con la sequenza atto con 99% identità (2 differenza bp) era GenBank KY995522 C. siamense ceppo LJDY1–2. La corrispondenza più vicina con la sequenza tub2 con identità 99% (differenza 7 bp) era GenBank MF143931 C. ceppo siamense 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Diversità 61: 112 (2013); come ‘endophytica’.

Descrizione: Colonie su PDA 42 mm di diametro dopo 7 d (5,5 mm/d), micelio aereo da arancione a bianco pallido; bianco pallido inverso ad arancione e nero al centro e numerosi conidiomi arancioni sparsi sulla superficie. Clamidospore non osservate. Conidiomata presente, conidiofori formati direttamente sulleph. Setole presenti, moderatamente marroni, 47-95 × 3-6 µm, apici acuti 3-4-settati, affusolati. Conidiofori ialini, a pareti lisce e non ramificati. Cellule conidiogene ialine, a parete liscia, aseptate, subcilindriche, 12-21 × 3-4 µm. Conidia ialina, a parete liscia, asettica, diritta, cilindrica con due estremità ottuse, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria singolo o in gruppi sciolti, marrone, leggermente lobato, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

Note: Colletotrichum endophyticum è stato descritto per la prima volta come un endofito erboso di Pennisetum purpureum dal nord della Thailandia (Manamgoda et al. 2013). Successivamente, è stato segnalato da diverse altre specie ospiti tra cui Capsicum in Cina (Diao et al. 2017). La lunghezza dei conidi dell’isolato dalla Thailandia (UOM 1137) era leggermente più corta di quella del tipo ex (LC0324) di C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

Materiale esaminato: Thailandia: Kanchanaburi: dalla lesione del frutto di Capsicum annuum, 2010, PWJ Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al., Fung. Diversità 39: 158 (2009).

Descrizione: Colonie su PDA 65 mm di diametro dopo 7 d (8,5-11 mm / d), piatte con bordo intero, micelio aereo denso, cotonoso, micelio aereo da grigio chiaro a bianco e numerosi stromi neri sparsi sulla superficie, grigio al centro, bianco al margine; verde grigiastro inverso. Clamidospore non osservate. Conidiomata acervulare, Setae è stato osservato, marrone, a parete liscia, 1-2-settato, 60 µm lungo, affusolato apici acuti. Conidiofori ialini, settati, ramificati. Cellule conidiogene ialine, cilindriche o ampulliformi, 7-17, 5 µm. Conidia ialina, aseptata, a parete liscia, cilindrica, entrambe le estremità ottuse, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria non osservata.

Note: Il morph sessuale di questi isolati non è stato osservato in coltura. La lunghezza conidiale dell’isolato CPC 28644 era leggermente più lunga di quella del tipo ex (ICMP 18581 = BPD-I16) di C. fructicola (conidia 9,7–14 × 3-4, 3 µm, x = 11,53 ± 1,03 × 3,55 ± 0,32 µm; Prihastuti et al. 2009).

Materiale esaminato: Thailandia: Chiang Mai: dalla lesione del frutto di Capsicum annuum, 7 Jun. Nel 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture CPC 28644 e CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, dalla lesione del frutto del frutto rosso maturo di Capsicum sp. (peperone dolce), 22 apr. 2015, Z. M. Sheu (cultura UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, dalla lesione del frutto del frutto verde di Capsicum sp. (peperone dolce), 4 set. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (cultura UOMO 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); come ‘karstii’.

Descrizione: Colonie su PDA 65 mm diam dopo 7 d (6.5–10.5 mm/d), piatto con bordo intero, micelio aereo da arancione a bianco e numerose masse conidiali arancioni sparse sulla superficie, bianche al margine; giallo inverso ad arancione. Clamidospore non osservate. Sono stati osservati Conidiomata acervulari, setole, marroni, a parete liscia, 2-4-settate, lunghe 60 µm, base sommersa, affusolata verso l’apice, punta per lo più acuta. Conidiofori ialini, settati, ramificati, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Cellule conidiogene ialine, cilindriche o ampulliformi, 7-15, 5 µm. Conidia ialina, asettica, a parete liscia, corta, cilindrica, entrambe le estremità ottuse o un’estremità leggermente acuta o troncata alla base, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Appressoria singolo o in gruppi sciolti, marrone, subgloboso, contorno circolare, 6-12, 5 × 3,5–8 µm.

Note: I quattro isolati identificati dall’Indonesia nel complesso boninense hanno prodotto conidi corti distinti rispetto alla cultura ex-epitype di C. karsti (14,5-17 × 5-6, 5 µm; Yang et al. 2011). Tuttavia, elevata variabilità delle dimensioni dei conidi tra diversi ceppi di C. karsti sono stati segnalati da Damm et al. (2012a, 2012b) dove le misurazioni dei conidi di CBS 129833 erano (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, media ± SD = 13,1 ± 0,7 × 5,8 ± 0,4 µm; e CBS 111998 aveva una lunghezza del conidio fino a 18,5 µm, rapporto L/W = 2,8. Questi isolati non hanno formato un morph sessuale nella cultura. Sebbene questi quattro isolati formassero una sottoclade completamente supportata (100% BS/1 PP) all’interno di C. karsti, tutti i singoli alberi genetici (dati non mostrati) non fornivano un supporto significativo per giustificare l’introduzione di una specie criptica per questi isolati.

Materiale esaminato: Indonesia: Jeneponto, da lesioni da frutto di Capsicum annuum, 7 giugno. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 28553, CPC 28554) ; dalla lesione della frutta di frutta rossa matura e lesioni del peduncolo di Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Perno. Micol. 92: 31 (2019).

Descrizione: Colonie su PDA 63 mm diam dopo 7 d (8 mm/d), micelio aereo da grigio a marrone scuro; grigio inverso a marrone chiaro con giallo-arancio al centro con abbondanti conidiomi acervulari che trasudano masse conidiali arancione chiaro al centro, Clamidospore non osservate. Conidiomata presente (vicino al punto di inoculazione), conidiofori formati direttamente sulleph. Sclerotia presente. Setole presenti, marrone medio, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-settate, affusolate verso gli apici acuti, spesso con una costrizione all’apice. Conidiofori da ialini a marrone chiaro, a parete liscia, settati e ramificati. Cellule conidiogene ialine, a parete liscia, aseptate, subcylindrical, dritte a delicatamente curve, 26-48 × 3-4 µm, phialidic, ispessimento periclinale cospicuo. Conidia ialina, a parete liscia, asettica, diritta, cilindrica con due estremità ottuse o un’estremità leggermente acuta, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria singola o in gruppi sciolti, marrone medio, di forma irregolare, profilo crenato o lobato, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Morph sessuale su PDA. Peritecia ascomata, formata dopo 2 settimane., solitario, semi-immerso o immerso nel mezzo di agar, non stromatico, subsferico a ovoide, ostiolato, glabro, marrone medio, 96-130 × 160-200 µm. Peridio 10-12, 5 µm di spessore, composto da pallido a marrone medio appiattito cellule angolari 3,5-10 µm diam. Asc ascogene ialine, a pareti lisce, delicate, raramente visibili. Tessuto interascale non osservato. Asci unitunicato, 8-spored, cilindrico, affusolato all’apice e alla base, a parete liscia, 51-65 × 9,5-13 µm, la base troncata. Conidiospore biseriately organizzato, aseptate, ialine, a parete liscia, fusiforme, leggermente curvo, base arrotondata, con apice acuto o arrotondati, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

Note: Il conidial lunghezza del isolati esaminati (CPC 28638, CPC 28639) è variabile ed è caduto all’interno della gamma di ex-tipo di isolare (CBS 125474) di C. plurivorum (15-17 × 5.5 µm; Damm et al. 2019).

Materiale esaminato: Thailandia: Chiang Rai, da lesioni fogliari di Capsicum annuum, 7 giugno. 2015, P. W. J. Taylor (culture CPC 28638 e CPC 28639); Bangkok, ristorante nella zona di Phaya Thai, tessuto infetto di Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (cultura UOMO 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Perno. Micol. 73: 100 (2012).

Decription: Colonie su PDA 20-38 mm di diametro dopo 7 d (5-6, 2 mm/d), piatte con margine intero; superficie ricoperta da corto micelio aereo da rosa chiaro ad arancio, grigio virato con il tempo, margine da biancastro a rosa pallido, rosato inverso, grigio olivaceo a grigio bruno al centro; arancio inverso a salmone, scuro al centro. Clamidospore non osservate. Conidiomata acervulare, setole non osservate, Conidiofori ialini, settati, ramificati. Cellule conidiogene ialine, cilindriche o ampulliformi, 7-17, 5 µm, apice 1-3 µm diam. Conidi ialini, aseptati, a parete liscia, prevalentemente fusiformi, un’estremità arrotondata, un’estremità acuta, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidi in massa dal salmone all’arancio. Appressoria singola o in gruppi sciolti, marrone medio, ovoidale, margine intero a crenato, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

Note: La maggior parte degli isolati identificati come C. scovillei aveva simili spore forma e spore dimensioni, rispetto al tipo di campione (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, descritto da Damm et al. (2012a, 2012b). Tuttavia, alcuni isolati avevano un colore diverso della colonia, diversi tassi di crescita delle colonie e piccole differenze nelle misurazioni delle spore.

Materiale esaminato: Indonesia: Gowa, da lesioni da frutto di Capsicum annuum, 7 giugno. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 28577 e CPC 28579); West Java: dalla lesione della frutta di Capsicum annuum, dicembre. 2014, F. Fitriyah, UOMO 1146 / EWINDO 10. Thailandia: Chiang Mai: da lesioni da frutto di Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (culture UOMO 1101/313, UOMO 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al., Fung. Diversità 39: 98 (2009)

Descrizione: Colonie su PDA 79 mm diam in 7 d (5,5–6 mm/d). Giallo pallido-bianco, grigio, denso micelio aereo cotonoso con conidiomi acervulari arancioni al centro; giallo pallido inverso. Clamidospore non osservate. Conidiomata acervulare, conidiofori formati su un cuscino di cellule tondeggianti e marrone medio. Setole non osservate. Conidiofori ialini, ramificati. Cellule conidiogene ialine, da cilindriche a ampulliformi, 6,5-16 µm. Conidi ialini, asettici, a parete liscia, da fusiformi a cilindrici, entrambe le estremità arrotondate senza mezzi termini, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria marrone scuro, solitario, circolare, intero a margine crenate, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

Note: Gli isolati di Colletotrichum siamense di diversi paesi hanno mostrato variazioni dei caratteri morfologici, dei tassi di crescita e della morfologia della cultura su PDA. Misure conidiali rappresentative per isolati che rappresentano diverse sottocladi negli alberi filogenetici (Figs. 2, 3) sono: CPC 30233 (Gowa, Indonesia), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOMO 1132 (Ratchaburi, Thailandia) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOMO 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thailandia) 12-15 × 5-7 µm; UOMO 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3,5–5,5. Questi caratteri morfologici all’interno di una sottoclade erano altamente coerenti all’interno di ciascun paese. La specie è stata descritta da Prihastuti et al. (2009); i conidi dell’ex esemplare olotipo (ICMP 18578/ BDP-I2) sono stati riportati come 7-18.3 × 3-4, 3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), che comprende la gamma osservata nei nostri isolati. Questa specie è stata segnalata per essere biologicamente e geograficamente diversificata, e si trova su molti ospiti in diverse regioni tropicali e subtropicali (Weir et al. 2012).

Materiale esaminato: Indonesia: Gowa, dalla lesione del frutto di Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 30233); Jeneponto, dalla lesione del frutto di Capsicum sp. 7 Giugno. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 30209). Thailandia: Ratchaburi, da lesione da frutto di Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1132); Kanchanaburi, dalla lesione del frutto di Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (cultura UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, dalla lesione del frutto di Capsicum sp. Settembre. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (cultura UOMO 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Micologia 102: 1331 (2010)

Descrizione: Colonie su PDA 45 mm diam in 7 d (6,5 mm / d). Colonie piatte, a diffusione, con moderato micelio aereo, Su superficie OA grigio fumo. Sulla superficie PDA grigio olivaceo a grigio fumo, grigio olivaceo inverso, numerosi conidiomati arancioni sparsi sulla superficie. Sulla superficie MEA bianco sporco, ocra inversa. Morph asessuata su OA. Micelio vegetativo costituito da ialino a marrone chiaro, a parete liscia, settato, ramificato, di diam 2-2, 5 µm. Clamidospore non osservate. Setole rare (solo due osservate), dritte, marrone medio, finemente verruculose, da 2-3-settate, lunghe fino a 120 µm, apice subottusamente arrotondato. Conidiomata acervulare, diametro 150-250 µm, con massa conidiale arancione. Conidiofori subcilindrici, flessuosi, 1-3–settati, ialini, lisci, ramificati, 15-25 × 3,5-4,5 µm. Cellule conidiogene subcilindriche, ialine, lisce, fialidiche con ispessimento periclinale, 7-15 × 3,5-4,5 µm. Conidia ialina, liscia, asettica, subcilindrica, diritta, apice ottuso, affusolata alla base fino a sporgere l’hil troncato, 1,5-2 µm di diametro, prominente guttulata, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria non osservata. Morph sessuale non osservato.

Materiale esaminato: Indonesia, Makassar, dalla lesione del frutto di Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (cultura CPC 28607).

Prevalenza delle specie di Colletotrichum campionate

Nel complesso, C. truncatum era la specie più diffusa (44%) isolata dal frutto di peperoncino infetto (Fig. 9) ed è stato facilmente identificato dalle sue spore falcate e setole abbondanti nelle lesioni necrotiche. Delle specie con conidi dritti, C. scovillei (complesso acutatum), era la specie più comune in tutti i paesi intervistati (35%), ad eccezione dello Sri Lanka dove questa specie non era isolata. Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) è stata la prossima specie più comune che si è verificato in Thailandia, Sri Lanka e Indonesia (11%). Le altre specie erano rappresentate da meno del 10% del numero totale di isolati.

In Indonesia, C. scovillei è stato isolato dal peperoncino infetto in tutte le reggenze censite del sud Sulawesi, ad eccezione di Makassar e nel sito di prova sul campo a West Java. Colletotrichum siamense è stato anche isolato da tutta la regione, da Gowa, Jeneponto e Makassar. Le due nuove specie, C. makassarense e C. javanense sono state isolate rispettivamente da Makassar e West Java.

In Thailandia, C. scovillei è stato isolato principalmente dalle province settentrionali di Chiang Mai e Chiang Rai, ma è stato anche ottenuto da peperoncino infetto in un sito di prova della Kasetsart University di Nakhon Pathom. Le province occidentali avevano un’alta incidenza di C. siamense e un isolato di C. endophyticum è stato raccolto da Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum è stato isolato da foglie di peperoncino con lesioni necrotiche a Chiang Rai e da lesioni necrotiche di frutti di peperoncino trovati in un ristorante nella zona di Phaya Thai di Bangkok. Inoltre, C. fructicola è stato identificato da frutta raccolta da Chiang Mai.

A Taiwan, un isolato è stato identificato come una nuova specie, C. tainanense, raccolta da peperoncino infetto nella provincia di Tainan, e C. fructicola è stato identificato da frutta in Hsinchu e Nantou, Taiwan. Colletotrichum plurivorum è stato anche identificato da un frutto raccolto a Johor, in Malesia.

Patogenicità

Tutte le specie di Colletotrichum hanno causato sintomi di antracnosi sul frutto ferito, ma c’erano differenze significative nella gravità dei sintomi. Sul frutto ferito, gli isolati di C. scovillei e C. javanense hanno mostrato la più alta gravità della malattia, producendo lesioni necrotiche di grandi dimensioni con dimensioni medie delle lesioni 15,6-20,3 mm (Tabella 5). Sui frutti non feriti, tutte le specie erano meno patogene, con dimensioni medie della lesione inferiori a 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale e C. plurivorum, producevano solo lesioni molto piccole o nessun sintomo visibile (dimensione media della lesione < 1 mm) 10 d dopo l’inoculazione di frutti non feriti. Gli isolati di Colletotrichum javanense e C. scovillei sono stati i più patogeni nei frutti non feriti e hanno prodotto lesioni con dimensioni medie rispettivamente di 9,4 e 9,1 mm. Le lesioni causate da C. scovillei erano significativamente più grandi di quelle causate da tutte le altre specie ad eccezione di C. javanense nel frutto ferito e C. endophyticum nel frutto non avvolto. Il significato dei test t a coppie dipende fortemente dal numero di isolati di ciascuna specie campionata, pertanto i raggruppamenti indicati nella Tabella 5 non cambiano semplicemente con l’entità della differenza dei mezzi; una grande differenza può non essere significativa se ci sono campioni di piccole dimensioni per entrambe le specie, mentre una differenza minore può essere significativa. In particolare, i confronti che coinvolgono C. javanense e C. endophyticum sono molto imprecisi in quanto è stato testato solo un isolato di ogni specie.