コラーゲンヘリックス

グリシン、プロリン、ヒドロキシプロリンは、正しい配置で指定された位置になければなりません。 例えば、y位置のヒドロキシプロリンは、三重らせんの熱安定性を増加させるが、x位置に位置するときは増加させない。 水酸基が間違った配置を有する場合にも、熱安定化が妨げられる。 グリシンおよびプロリンの内容の高い豊富が原因で、コラーゲンは規則的なα螺旋形およびβシートの構造を形作りません。 3つの左利きの螺旋形の繊維は右利きの三重の螺旋形を形作るためにねじる。 コラーゲンの三重の螺旋形に回転ごとの3.3残余があります。

三つの鎖のそれぞれは、プロリン残基とヒドロキシプロリン残基のピロリジン環による立体反発によって安定化される。 ピロリジン環は、ポリペプチド鎖がαヘリックスのしっかりとコイル状の形態よりもはるかに開いているこの拡張された螺旋状の形態を仮定すると、互いの邪魔にならない。三つの鎖は互いに水素結合している。 水素結合供与体はグリシン残基のペプチドNH基である。 水素結合受容体は、他の鎖上の残基のCO基である。 ヒドロキシプロリンのOH基は水素結合に関与しないが、立体電子効果によってプロリンのtrans異性体を安定化させ、したがって三重らせん全体を安定化させる。

コラーゲンヘリックス（スーパーヘリックス）の上昇は残基あたり2.9Å（0.29nm）である。 コラーゲンの三重の螺旋形の中心は非常に小さく、疎水性であり、螺旋形のあらゆる第3残余は中心が付いている接触がなければなりません。 中心の非常に小さく、堅いスペースが原因で、グリシンの側鎖の小さい水素だけ中心と相互に作用することができます。 グリシン以外にわずかに大きなアミノ酸残基が存在する場合でも、この接触は不可能である。