코일 코일

프로테오피디아

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코일 코일 또는 수퍼 헬릭스는 2,3 또는 4 개의 나선을 함께 감아 형성됩니다. 나선형 가닥은 다른 펩타이드 가닥으로부터의 비극성 측쇄 사이에 형성된 소수성 힘에 의해 함께 유지된다. 1 차 구조에서 짧은 사슬 소수성 잔기의 헵 타드 반복 패턴은 일관되게 이러한 비극성 측쇄를 매 7 번째 잔기마다 함께 가져옵니다. 다른 가닥에서 이러한 비극성 잔기는 제대로 나선 약간 덜 단단히 0.51 대신 0.54 의 피치를 가지고 회전 당 3.5 잔류 물이있다되도록 정상-헬릭스보다 상처 됨으로써 왜곡되기 때문에 서로 상호 작용하는 위치 3.6. 따라서 헵타드 잔기의 측쇄는 서로 상호작용할 수 있는 위치에 있다.

• 1 코일 코일 구조:섬유 단백질 알파-케라틴 또는 트로포 미오신에서 발생하는 것과 같은 코일 코일의 리본 다이어그램.
• 2 코일 코일에서 헵 타드 반복 및 소수성 상호 작용.
• 3 추가 그림
• 4 좌표

코일 코일 구조:섬유 단백질 알파-케라틴 또는 트로포 미오신에서 발생하는 것과 같은 코일 코일의 리본 다이어그램.

(현재 지원되지 않음)섬유 성 단백질은 대부분 케라틴 및 트로포 미오신과 같은 두 개의 알파 나선의 코일 코일과 같은 매우 반복적 인 단순 서열을 특징으로합니다. 여기에 표시된 것은 코일 코일의 리본 다이어그램입니다. 세그먼트의 두 개의 동일한 체인 중 하나 인”코일 1″은 노란색이고 다른 하나는”코일 2″는 파색입니다. 각 세그먼트의 엔-및 씨-터미널 끝은 파란색과 빨간색 볼로 표시됩니다. 당신은 즉시 단백질이 평행한 코일 코일을 형성한다는 것을 볼 수 있습니다:그것의 분대 알파 나선은 오른손잡이 입니다 그러나 코일 코일은 왼손잡이 입니다. 보기 1-3 다른 각도에서 코일 코일을 볼 수 있습니다. 뷰 3 에서’클립’슬라이드를 좌우로 드래그하여 구조의 일부 또는 전부를 볼 수 있습니다. 코일 코일은 각 알파 나선이~13 회전을 만드는 거리를 1/2 회전보다 약간 더 많이 만듭니다.

마우스를 이미지를 가로로 좌우로 드래그하여 두 코일이 서로 감싸는 방식을 확인합니다. 병렬 코일 코일은 알파 케라틴을 포함한 많은 단백질에서 발생,포유 동물의 피부에서 발생하는 섬유 스트레스 베어링 단백질;트로포 미오신과 미오신,근육에 중요한 단백질; 그리고 수많은 진핵 전사 인자의 이량 체화 및 따라서 활성화를 허용하는 소위 류신 지퍼 세그먼트. 류신 지퍼는 다른 2 나선 코일 코일과 다릅니다.

코일 코일에서의 헵타드 반복 및 소수성 상호 작용.

(현재 지원되지 않음)여기에 표시된 것은 코일코일의 구조를 원자적으로 상세히 나타낸 것이지만,코일코일의 헵타드 반복과 소수성 상호작용을 볼 수 있도록 사이드체인의 콜럼븀원자만을 나타낸 것이다. 뷰 1 은 코일 1 옐로 틴트의 공유 결합,코일 2 그린 틴트의 공유 결합 및 마젠타 볼로 표시되는 콜럼븀 원자와 함께 중앙에 위치한 8 잔기 세그먼트,각 서브 유닛의”피스-4″를 보여줍니다. “-잔류물”및”디-잔류물”버튼을 클릭하여 녹색 및 금색으로 강조 표시된 ㅏ 및 디 잔류물의 콜럼븀 원자를 봅니다.

폴리펩티드의 아미노산 서열은 거친 헵타드 반복을 나타내며,(에이-비-씨-디-에프-지)엔,에이 및 디 위치에서 잔기는 작은 소수성 측쇄(알라,발,레우,및 일)를 갖는다. 이것은 코일 코일을 형성하기 위하여 또 다른 그런 나선과의 그것의 협회를 중재하는 각 알파 나선의 1 개의 얼굴에 소수성 지구를 제공합니다. 일반 알파 나선의 회전 당 3.6 잔류물과 3.5 잔류물 반복 사이의 약간의 불일치는 이 소수성 스트립이 완만 한 왼손잡이 나선에서 알파 나선을 감싸게하여 왼손잡이 코일 코일의 형성을 설명합니다.

보기 3 로 이동하여 7 개의”피스-엔”버튼을 모두 켜면 코일된 코일을 측면 뷰로 표시합니다. 여기서,상기 단백질은 상기 설명된 바와 같이 착색된 주쇄 및 콜럼븀 원자에 의해 표현된다. 보기 3~보기 8 은 코일 코일을 수퍼 헬릭스 축에 대한 다양한 방향으로 보여줍니다. 보기 1 로 이동하여’클립’슬라이드를 왼쪽 및 오른쪽으로 드래그하여 수퍼 헬릭스 축을 따라 본 코일 코일의 일부 또는 전부를 볼 수 있습니다. 어떻게 그 에이-및 디-잔류 사이드 체인이 수퍼 헬릭스 축을 따라 포장되는지 주목하십시오. 이 패킹의 근접성은 이러한 위치에서 작은 소수성 측쇄 만 존재 함을 설명합니다; 이 위치에있는 더 큰 소수성 측쇄는 두 개의 나선을 떼어 내고 코일 코일을 불안정하게 만듭니다. 마지막으로,이 잔류물이 특성에서 거의 완전히 친수성다는 것을 납득시키기 위하여 코일 코일의 주변에 있는 콜럼븀 원자의 몇몇을 클릭하십시오.

추가 삽화

베이커 효모에서 일반 제어 단백질의 두 가닥. 가닥의 약간의 코일을 관찰하십시오. ()모든 일곱 번째 잔류 물,,비극성이며,턴 당 3.5 잔기로 각 헵 타드 반복은 아래 및 위의 것과 정렬되며 두 번째 가닥에서 헵 타드 반복과 상호 작용할 위치에 있습니다. 연락처의 아래를 내려다 보면서. 그만큼 헵 타드 사이에 위치한 잔류 물은 파트너 가닥의 측쇄에서 떨어진 나선 주위에 나선형을 반복하므로 두 가닥의 이러한 측쇄 사이의 상호 작용을 허용하지 않습니다.

면역 학적으로 활성 인 바이러스 단백질 중 하나 인 3 개의 코일 가닥. 각 가닥의 헵트라 반복이 표시됩니다.

네 개의 사슬에 보여주는 일반 제어 단백질의 네 가닥.

는 이화 작용의 여러 측면의 중요한 조절 자인 구형 단백질입니다. 두 개의 코일을 주목하십시오.구조 중앙에 나선형이 있습니다. 각 코일은 다른 서브 유닛의 일부이며 코일 코일의 형성은 두 서브 유닛을 함께 유지하는 데 중추적 인 역할을합니다. 각 하위 단위에는 공간 채우기가 표시됩니다.

좌표

코일 코일(트로포 미오신)의 좌표는 브랜다이스대학교 효능 쌰와 캐롤린 코헨에서 얻었다.

에서 검색 됨.

칼 오버홀 세르,주디 보엣,이스라엘 하누 코글루,미칼 하렐