Analiza molekularna linii plazmidów podobnych do ColV IncF, które przenoszą złożone Locus oporności z możliwą do śledzenia sygnaturą genetyczną

plazmidy Incf ColV są ważną grupą niezgodności plazmidowych, które są obecnie ograniczone do Enterobacteriaceae. Plazmidy te posiadają ważny repertuar genów związanych z zjadliwością (VAG), które przyczyniają się do zdolności ptasiej patogennej Escherichia coli do wywoływania choroby u drobiu. Vag znalezione na plazmidach ColV były również związane z uroseptyką i zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych u ludzi, ale mechanizmy wywołujące te choroby nie są dobrze poznane. Niedawno opisaliśmy sekwencję plazmidu ColV pSDJ2009 – 52F, który posiadał typowy repertuar VAG i złożone locus genu oporności otoczone przez IS26, element wstawiający, który odgrywa ważną rolę w mobilizowaniu genów oporności na antybiotyki na plazmidach i wyspach genomowych. Odzyskaliśmy kompletne sekwencje plazmidowe podobne do ColV z publicznych baz danych, które dzieliły >80% tożsamości sekwencji z pSDJ2009 – 52F w geograficznie różnych regionach świata w ciągu 20 lat. Wcześniej zauważyliśmy, że pSDJ2009 – 52F posiada unikalny podpis genetyczny w integronie klasy 1 w złożonym locus oporności, który został przypuszczalnie stworzony przez działanie IS26. Tutaj pokazujemy, że większość plazmidów podobnych do ColV, które są blisko spokrewnione z pSDJ2009-52F, również ma tę samą sygnaturę. Nasze badania zapewniają wgląd w to, w jaki sposób te plazmidy opatrzone podpisem i mobilne elementy genetyczne przenoszą ruch między typami sekwencji E. coli na dużych odległościach geograficznych.