format wyjściowy
na stronie wyników dla każdej sekwencji zapytań zostanie przedstawiona nazwa, długość i wynik wyjściowy sieci, na której opiera się przypisanie cTP/non-CTP. Im wyższy wynik, tym bardziej pewna jest sieć, że sekwencja ta zawiera N-końcowy peptyd tranzytowy chloroplastu (CTP).Potencjalna długość cTP zostanie również przedstawiona, wraz z odpowiadającą jej punktacją miejsca cięcia. Należy pamiętać, że przewidywanie długości transitpeptydu jest przeprowadzane, nawet jeśli jego obecność nie jest przewidywana.Celem jest zapewnienie maksymalnej informacji w przypadkach granicznych.
jeśli wybrano “szczegółowe wyjście”, zostanie również przedstawiony wynik sieci neuronowych dla każdego z nich. Im wyższy wynik, tym większa jest pewność, że pozostałość ta jest częścią cTP. Przedstawiono również pochodną programu networkscore. Wynik ten służy do znalezienia obszaru, w którym poszukiwane jest miejsce podziału-a mianowicie wśród 40 pozostałości otaczających je z najwyższym wynikiem pochodnym. Na koniec przedstawiono punktację miejsca rozszczepiania (CS-score)dla każdej pozostałości. Wynik ten jest obliczany na podstawie macierzy ascoringu pochodzącej z automatycznego algorytmu znajdowania motywów zwanego memem. Punktacja rozszczepiania jest zdefiniowana w taki sposób, że przewidywane miejsce rozszczepiania jest bezpośrednio końcem najwyższej punktacji spośród 40 reszt. W związku z tym istnieje jeden lub kilka punktów CS, które mogą być większe niż sześćdziesiąt proponowanych długości cTP, ale ponieważ znajdują się one poza 40 opcjami wokół najwyższego wyniku pochodnego, przedstawiona długość cTP jest nadal tym, co ChloroP uważa za najbardziej prawdopodobną długość presekwencji(tj. odpowiada najbardziej prawdopodobnemu miejscu rozszczepienia).
