identyfikacja i charakterystyka wirusa Citrus yellow vein clearing, domniemanego nowego członka rodzaju Mandarivirus
cechy molekularne i organizacja genomowa zostały określone dla Citrus yellow vein clearing virus (CYVCV), domniemanego wirusowego czynnika przyczynowego choroby Yellow vein clearing drzew cytrynowych, opisanego w Pakistanie, Indiach, a ostatnio w Turcji i Chinach. CYVCV izolat Y1 Z adany w Turcji został użyty do głębokiej analizy sekwencyjnej indukowanych przez wirusa małych frakcji RNA oraz do mechanicznej i przeszczepowej inokulacji roślin wskaźnikowych Zielnych i cytrusowych. Poliklonalna surowica została opracowana z CYVCV-Y1 oczyszczonego z Phaseolus vulgaris i użyta w testach Western blot do scharakteryzowania białka płaszcza CYVCV-Y1 i określenia jego serologicznego związku z pokrewnymi wirusami. Contigs zmontowane z sekwencjonowanych krótkich odczytów Illumina zostały użyte do skonstruowania całego genomu wirusa Citrus yellow vein clearing (CYVCV), składającego się z dodatnio-zmysłowego RNA 7529 nukleotydów i zawierającego sześć przewidywanych otwartych ramek odczytu. Organizacja i rozmiar genomu CYVCV przypominały flekswirusy, a poszukiwanie homologii sekwencji ujawniło, że indyjski wirus cytrusowy (ICRSV) (Mandarivirus, Alphaflexiviridae) jest najbardziej spokrewnionym wirusem. Jednak CYVCV miał całkowitą identyczność sekwencji nukleotydów wynoszącą ≈74% Z ICRSV. Chociaż oba wirusy były podobne w odniesieniu do organizacji genomu, cząstek wirusa i zakresu gospodarza zielnego, CYVCV powodował różne objawy u cytrusów i był serologicznie odmienny od ICRSV. Pary starterów zostały zaprojektowane i wykorzystane do wykrywania wirusa za pomocą konwencjonalnej i ilościowej odwrotnej transkrypcji-reakcji łańcuchowej polimerazy na żółtych żyłach oczyszczających objawowe drzewa polowe, a także przeszczepionych i mechanicznie zaszczepionych roślin żywicielskich. Łącznie dane te sugerują, że CYVCV jest czynnikiem przyczynowym choroby usuwania żółtych żył i reprezentuje nowy gatunek w rodzaju Mandarivirus.
