Identyfikacja, występowanie i patogenność gatunków Colletotrichum powodujących antraknozę Capsicum annuum w Azji

obserwacje morfologiczne i dane filogenetyczne gatunków konidia prostego wyraźnie zidentyfikowały trzy nowe gatunki, dwa z Indonezji i jeden z Tajwanu. Szczegółowe opisy morfologiczne przedstawiono poniżej dla wszystkich gatunków Colletotrichum związanych z antraknozą chili (Tabela 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, Sp. listopad MycoBank MB826936

Rysunek 6 etymologia: nazwa pochodzi od jawy, wyspy w Indonezji, na której zebrano gatunek.

rozpoznanie: Colletotrichum javanense różni się od C. brisbanense tworzeniem odrębnych chlamydospor i acervular conidiomata na wszystkich badanych nośnikach. Natomiast C. brisbanense wytwarzało Konidiomata tylko na łodydze Anthriscus, ale nie zaobserwowano komórek podstawnych. Ponadto C. javanense rośnie szybciej niż C. brisbanense (C. javanense na OA, MEA i SNA 60, 55 i 66 mm średnicy w 7 d, odpowiednio, C. brisbanense na OA i SNA 18,5, 20 mm średnicy w 7 d, odpowiednio). Colletotrichum javanense jest filogenetycznie odrębny od C. brisbanense z obu gatunków różni się w sekwencji chs-1, A najskuteczniej z gapdh (różnica 7 bp) i his3 (różnica 4 bp).

Rodzaj: Indonezja: Jawa Zachodnia, Purwakata regency, na owocach Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotyp; CBS 144963 = UOM 1115 = EWINDO 3-Typ ex).

opis: nie obserwuje się morfologii seksualnej. Aseksualny morph na PDA. Grzybnia wegetatywna o średnicy 1-5 µm, hialinowa, gładkościenna, septowana, rozgałęziona. Chlamydospory kuliste lub wydłużone, jasnobrązowe, gładkościenne, o rozmiarach 5-25 × 3-8 µm. Conidiomata acervular, setae nie obserwowane. Konidiofory hialinowe, przegrodowe, rozgałęzione. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne lub ampulliform, 7-17, 5 µm, wierzchołkowe 1-3 µm średnicy. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, głównie wrzecionowate, jeden koniec zaokrąglony, drugi koniec ostry lub oba końce ostre (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) µm. Konidia masowo żółte do pomarańczowych. Appressoria pojedyncze lub w luźnych grupach, średnio brązowe, gładkościenne, subglobalne lub eliptyczne, z całym lub pofałdowanym marginesem, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) µm.

aseksualny morph na SNA. Grzybnia wegetatywna o średnicy 1-7 µm, hialinowa, gładkościenna, septowana, rozgałęziona. Chlamydospory kuliste lub wydłużone, jasnobrązowe, gładkościenne, o rozmiarach 4,5–28 × 4-8 µm. Conidiomata acervular, setae nie obserwowane. Konidiofory hialinowe, septowane, rozgałęzione, o długości 20-35 µm. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne lub ampulliform, 5-20 µm, wierzchołkowe, 1-3 µm średnicy. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, cylindryczne z obydwoma końcami ostrymi lub jednym końcem okrągłym i jednym końcem ostrym, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) µm. Konidia w masie o barwie od żółtej do pomarańczowej.

charakterystyka hodowli: kolonie na PDA 48-54 mm średnicy w 7 d (6,5-7,5 mm / d), płaskie z całym marginesem; powierzchnia pokryta szarą do oliwkowozielonej krótką grzybnią powietrzną, Brzeg biały do jasnoszarego, odwrócony głównie kremowy białawy, oliwkowoszary do Czarnego w centrum. Żółta do pomarańczowej acervular conidiomata. Kolonie na SNA miały średnicę 60-66 mm w 7 d (8-9, 5 mm / d), płaskie z całym marginesem, hialinowe do bladobrązowych, powierzchnia pokryta krótką szarą grzybnią powietrzną, odwrócona ta sama barwa. Pomarańczowa acervular conidiomata w Centrum Kultury. Kolonie na OA miały 55-60 mm średnicy w 7 d (7,8–8,5 mm/d), płaskie z całym marginesem; powierzchnia pokryta kremową do szarej krótką grzybnią powietrzną, Brzeg biały, odwrócony przeważnie Jasnopomarańczowy, z brązowymi pigmentami. Acervular conidiomata. Kolonie na powierzchni mea bladoszare krótkie Grzybnie powietrzne, odwrócone jasnopomarańczowe.

uwagi: najbliżej dopasowania w wyszukiwaniu blastn z sekwencją gapdh był GenBank jq948617, szczep C. sloanei IMI 364297 z 98% tożsamością (różnice 4 bp), podczas gdy najbliżej dopasowania z sekwencją his3 z 99% tożsamością (różnice 2 bp) był GenBank Jq949279 C. indonesiense szczep CBS 127551 i GenBank kj947248 C. guajavae izolat OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, Sp. listopad MycoBank MB827691

Rysunek 7 etymologia: nazwa pochodzi od Makassar, miasta w południowym Sulawesi w Indonezji, gdzie gatunek został zebrany.

diagnoza: Colletotrichum makassarense jest filogenetycznie blisko spokrewniony z C. tropicale. Dane sekwencyjne z ITS nie mogły oddzielić tych dwóch gatunków, ale można je odróżnić przez wszystkie inne badane geny i najskuteczniej wykorzystując dane sekwencyjne ApMat (różnice 22 bp) i GS (różnice 18 bp).

Typ: Indonezja: Makassar, z owoców Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotyp; CBS 143664 = CPC 28612-Ex-type).

opis: Nie zaobserwowano morfologii seksualnej. Aseksualny morph na OA. Grzybnia wegetatywna składająca się z hialinowych, gładkościennych, przegrodowych, rozgałęzionych strzępek o średnicy 2-3 µm. Nie obserwowano chlamydospor. Setae obecne, średnio brązowe, 40-55 × 3-5 µm, 2-3-septowe, zwężające się do ostrych wierzchołków. Conidiomata acervular, o średnicy 100-200 µm, z pomarańczowymi masami stożkowymi. Konidiofory subcylindrowe, elastyczne, 1-4-przegubowe, hialinowe, gładkie, rozgałęzione, 15-45 × 3-4 µm. Komórki konidiogenne subcylindrowe, hialinowe, gładkie, fialidialne z peryklinalnym zgrubieniem, 7-25 × 3-4 µm. Konidia hialinowe, gładkie, aseptyczne, subcylindrowe, proste, wierzchołkowe rozwarte, zwężające się u podstawy do wystającego ściętego hilum, średnica 1 µm, wyraźnie guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 µm. Appressoria samotna, średnio brązowa, gładkościenna, subglobalna, elipsoidalna do obowata, cały Brzeg, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) µm.

charakterystyka hodowli: kolonie na PDA 45 mm średnicy po 7 d (6,5 mm / d), kolonie płaskie, z umiarkowaną grzybnią powietrzną, na powierzchni OA dymorfizm szary. Na powierzchni PDA dymno-szary, odwrócony oliwkowoszary. Na powierzchni mej brudnobiały, odwrócony ochrowy.

uwagi: najbliżej dopasowania w poszukiwaniu blastn z sekwencją ApMat był GenBank KU923732, C. queenslandicum szczep AUS22 z 98% tożsamością (różnice 16 bp), podczas gdy najbliżej dopasowania z sekwencją gs z 99% tożsamością (różnice 7 bp) był GenBank kj947286 C. siamense izolat OBP24. Najlepiej pasowały do sekwencji gapdh GenBank KX578784 C. siamense (99% tożsamości, 3 różnice bp) i GenBank KU221347 C. Queensland (99%, tożsamości, 3 różnice bp).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, Sp. z o. o. listopad MycoBank MB827692

Rysunek 8 etymologia: nazwa pochodzi od Tainan, miasta na Tajwanie, w którym gatunek został zebrany.

diagnoza: Colletotrichum tainanense różni się od najbliższego filogenetycznego sąsiada C. salsolae w kulturze cechują się PDA, rzadką grzybnią powietrzną i jasnoszarą grzybnią powierzchniową, podczas gdy C. salsolae wytwarza warstwę struktur przypominających acervuli z głębokimi pomarańczowo-brązowymi masami stożkowymi i licznymi setae. Oba gatunki można rozdzielić przy użyciu wszystkich badanych genów z wyjątkiem jego i najskuteczniej z sekwencjami gapdh (różnica 7 bp), tub2 (różnica 6 bp) i act (różnica 5 bp). Istnieje tylko jedna różnica bp w sekwencji chs – 1 między tymi dwoma gatunkami.

Typ: Tajwan: Tainan: na owocach Capsicum annuum, sierpień. 2014, Z. M. Sheu (CBS H-143666 – holotyp; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298-hodowle typu ex).

opis: nie obserwuje się morfologii seksualnej. Aseksualny morph na PDA. Grzybnia wegetatywna rozgałęziona, hialinowa, gładkościenna, septowana, o średnicy 2-3 µm, z czasem melanalizowana. Pojedynczy konidioma znaleziony na płytce PDA, sterylny na SNA, MEA i OA. Chlamydospory i setae nie obserwowano. Konidiofory subcylindrowe, giętkie, 1-2-przegrodowe, hialinowe, gładkie do bladobrązowych, rozgałęzione. Komórki konidiogenne subcylindrowe, hialinowe, gładkie, fialidowe z pogrubieniem peryklinalnym. Konidia hialinowe, gładkie, aseptyczne, subcylindrowe do subclavate, proste lub lekko zakrzywione, wierzchołek rozwarty, zwężający się u podstawy do wystającego ściętego hilum, średnica 1,5-2 µm, wyraźnie guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 µm. Appressoria pojedyncze lub w luźnych grupach, często wąsko walcowate, średnie do ciemnobrązowych, często zwężające się ku wierzchołkowi, Brzeg cały lub pofałdowany, czasami nieregularnie płatkowany (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) µm.

charakterystyka Kultury: kolonie na PDA 45 mm średnicy po 7 d (6,5 mm / d), kolonie płaskie, z umiarkowaną grzybnią powietrzną. Na powierzchni OA blada mysz-szara. Na powierzchni PDA mysz blada-szara, odwrócona mysz-szara. Na powierzchni mea jasnoszary, odwrócony oliwkowoszary.

uwagi: najbliższe dopasowanie w wyszukiwaniu blastn z sekwencją gapdh z 99% tożsamością (różnica 2 bp) to GenBank KC790761 Colletotrichum sp. szczep MTCC 9664, natomiast najbliżej pasujący do sekwencji act o 99% identyczności (różnica 2 bp) był GenBank KY995522 C. siamense szczep LJDY1-2. Najbliżej spokrewniony z sekwencją tub2 o 99% identyczności (różnica 7 bp) był GenBank mf143931 C. siamense szczep 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Diversity 61: 112 (2013); jako “endophytica”.

opis: kolonie na PDA o średnicy 42 mm po 7 d (5,5 mm / d), bladopomarańczowa do białej grzybni powietrznej; odwrócona bladobiała do pomarańczowo-czarnej w centrum i liczne pomarańczowe konidiomata rozrzucone po powierzchni. Nie obserwowano chlamydospor. Obecne konidiomata, konidiofory utworzone bezpośrednio na strzępkach. Setae obecne, umiarkowanie brązowe, 47-95 × 3-6 µm, 3-4-septowe, zwężające się ostre wierzchołki. Konidiofory hialinowe, gładkościenne i nierozgałęzione. Komórki konidiogenne hialinowe, gładkościenne, aseptyczne, subcylindrowe, o rozmiarach 12-21 × 3-4 µm. Konidia hialinowe, gładkościenne, aseptyczne, proste, cylindryczne z dwoma końcami rozwartymi, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) µm. Appressoria pojedyncze lub w luźnych grupach, brązowe, lekko płatkowane, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) µm.

uwagi: Colletotrichum endophyticum został po raz pierwszy opisany jako endofit trawny z Pennisetum purpureum z północnej Tajlandii (Manamgoda et al. 2013). Później odnotowano go od kilku innych gatunków żywicieli, w tym Capsicum w Chinach (Diao et al. 2017). Długość conidia izolatu z Tajlandii (UOM 1137) była nieco krótsza niż u rodzaju ex (LC0324) C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 µm).

materiał badany: Tajlandia: Kanchanaburi: z uszkodzenia owoców Capsicum annuum, 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultura UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. i in., Fung. Diversity 39: 158 (2009).

opis: Kolonie na PDA o średnicy 65 mm po 7 d (8,5-11 mm/d), płaskie z całą krawędzią, grzybnia powietrzna gęsta, bawełniana, bladoszara do białej grzybni powietrznej i liczne czarne stromy rozproszone po powierzchni, szare w centrum, białe na marginesie; odwrócony szarawozielony. Nie obserwowano chlamydospor. Conidiomata acervular, Setae, brown, gładkościenne, 1-2-septate, 60 µm długie, zwężające się ostre wierzchołki. Konidiofory hialinowe, przegrodowe, rozgałęzione. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne lub ampulliform, 7-17, 5 µm. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, cylindryczne, na obu końcach rozwarte, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria nie zaobserwowano.

uwagi: Morf seksualny tych izolatów nie był obserwowany w kulturze. Stożkowa długość izolatu CPC 28644 była nieco dłuższa niż w przypadku typu ex (ICMP 18581 = BPD-I16) C. fructicola (conidia 9,7-14 × 3-4, 3 µm, x = 11,53 ± 1,03 × 3,55 ± 0,32 µm; Prihastuti i in. 2009).

badany materiał: Tajlandia: Chiang Mai: z Owocowej zmiany Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultura CPC 28644 i CPC 28645). Tajwan: Cyonglin, Hsinchu, z owoców dojrzałych czerwonych owoców Capsicum Sp. (papryka słodka), 22.04.2010 2015, Z. M. Sheu (culture UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, from fruit lesion of green fruit of Capsicum Sp. (papryka słodka), 4 września 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (culture UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti You L. Yang et al. Cryptogamia, Mycologie 32: 241 (2011); jako “karstii”.

opis: kolonie na PDA o średnicy 65 mm po 7 d (6,5–10.5 mm/d), płaska z całą krawędzią, pomarańczowa do białej grzybni nadziemnej i liczne pomarańczowe masy stożkowe rozrzucone po powierzchni, białe na marginesie; odwrócona żółta do pomarańczowej. Nie obserwowano chlamydospor. Conidiomata acervular, setae, brązowe, gładkościenne, 2-4-septate, 60 µm długie, podstawa zanurzona, zwężająca się ku wierzchołkowi, wierzchołek przeważnie ostry. Konidiofory hialinowe, przegrodowe, rozgałęzione, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) µm. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne lub ampulliform, 7-15, 5 µm. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, krótkie, cylindryczne, oba końce rozwarte lub jeden koniec lekko ostry lub ścięty u podstawy, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) µm. Apresoria pojedyncze lub w luźnych grupach, brązowe, subglobalne, o okrągłym zarysie, 6-12, 5 × 3,5–8 µm.

uwagi: cztery Izolaty zidentyfikowane z Indonezji w kompleksie boninense wytwarzały wyraźne krótkie konidia w porównaniu z kulturą ex-epitetype C. karsti (14,5-17 × 5-6, 5 µm; Yang i in. 2011). Jednak duża zmienność wielkości konidia pomiędzy różnymi szczepami C. karsti zostały zgłoszone przez Damm et al. (2012A, 2012b), gdzie pomiary konidia CBS 129833 były (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, średnia ± SD = 13,1 ± 0,7 × 5,8 ± 0,4 µm; a CBS 111998 miał stożkowate długości do 18,5 µm, stosunek L/W = 2,8. Izolaty te nie tworzyły morfologii seksualnej w kulturze. Chociaż te cztery Izolaty tworzyły w pełni wspieraną (100% BS/1 PP) podkladę w obrębie C. karsti, wszystkie pojedyncze drzewa genowe (dane nie pokazane) nie zapewniały znaczącego wsparcia dla uzasadnienia wprowadzenia tajemniczego gatunku dla tych izolatów.

badany materiał: Indonezja: Jeneponto, z owocowych zmian Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (Kultury CPC 28553, CPC 28554); od zmian owocowych dojrzałych czerwonych owoców i zmian szypułkowych Capsicum Sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Ogier. Mycol. 92: 31 (2019).

opis: kolonie na PDA o średnicy 63 mm po 7 d (8 mm / d), szare do ciemnobrązowych; odwłok szary do jasnobrązowego z żółto-pomarańczowym w centrum z obfitymi acervular conidiomata, które wydzielają jasnopomarańczowe masy konidialne w centrum, chlamydospory nie obserwowane. Conidiomata obecne (w pobliżu miejsca zaszczepienia), konidiofory utworzone bezpośrednio na strzępkach. Sclerotia obecny. Setae obecne, średnio brązowe, 94-125 × 4-6 µm, 1-4-septowe, zwężające się ku ostrym wierzchołkom, często z zwężeniem na wierzchołku. Konidiofory szkliste do bladobrązowych, gładkościenne, septowane i rozgałęzione. Komórki konidiogenne hialinowe, gładkościenne, aseptyczne, subcylindrowe, proste do delikatnie zakrzywionych, 26-48 × 3-4 µm, fialidialne, peryklinalne pogrubione. Konidia hialinowe, gładkościenne, aseptyczne, proste, cylindryczne z dwoma końcami rozwartymi lub jednym końcem lekko ostrym, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) µm. Appressoria pojedyncze lub w luźnych grupach, średnio brązowe, nieregularny kształt, krętkowate lub płowe zarys, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) µm. Morph seksualny na PDA. Ascomata perithecia, utworzona po 2 wk., pojedyncze, półprzezroczyste lub zanurzone w podłożu agarowym, niestromatyczne, subspherialne do jajowatych, ostiolate, nagie, średnio brązowe, 96-130 × 160-200 µm. Perydium o grubości 10-12, 5 µm, złożone z jasnych do średnio brązowych spłaszczonych komórek kątowych o średnicy 3,5–10 µm. Hyphae hialinowe, gładkościenne, delikatne, rzadko widoczne. Nie obserwowano tkanki międzykomórkowej. Asci unitunicate, 8-zarodnikowe, cylindryczne, zwężające się ku wierzchołkowi i podstawie, gładkościenne, 51-65 × 9,5-13 µm, podstawa ścięta. Askospory dwudzielnie ułożone, aseptyczne, hialinowe, gładkościenne, wrzecionowate, lekko zakrzywione, podstawa zaokrąglona, wierzchołek ostry lub zaokrąglony, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) µm,

uwagi: długość stożkowa badanych izolatów (CPC 28638, CPC 28639) była zmienna i mieściła się w zakresie izolatu typu ex (CBS 125474) C. plurivorum (15-17 × 5,5 µm; Damm i in. 2019).

badany materiał: Tajlandia: Chiang Rai, ze zmian liści Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor (kultur CPC 28638 i CPC 28639); Bangkok, restauracja w Phaya Thai area, zainfekowane tkanki Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (culture UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Ogier. Mycol. 73: 100 (2012).

opis: kolonie na PDA o średnicy 20-38 mm po 7 d (5-6, 2 mm/d), płaskie z całym marginesem; powierzchnia pokryta krótką jasnoróżową do pomarańczowej grzybnią powietrzną, z czasem szarawa, margines białawy do bladoróżowego, odwrócony różowaty buff, oliwkowoszary do brązowoszarego w centrum; odwrócony pomarańczowy do łososiowego, ciemny w centrum. Nie obserwowano chlamydospor. Conidiomata acervular, setae not observed, Conidiophores hialine, septate, branched. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne lub ampulliform, 7-17, 5 µm, wierzchołkowe 1-3 µm średnicy. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, mostkowo wrzecionowate, jeden koniec zaokrąglony, jeden koniec ostry, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Konidia w masie o barwie łososiowej do pomarańczowej. Appressoria pojedyncze lub w luźnych grupach, średnio brązowe, jajowate, całe do krenatowego marginesu, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) µm.

uwagi: większość izolatów zidentyfikowanych jako C. scovillei miał podobny kształt i rozmiary zarodników, w porównaniu do okazu typu(10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) µm, opisane przez Damm et al. (2012a, 2012b). Jednak niektóre Izolaty miały różną barwę Kolonii, różne tempo wzrostu kolonii i niewielkie różnice w pomiarach zarodników.

badany materiał: Indonezja: Gowa, z owocowych zmian Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (Kultury CPC 28577 i CPC 28579); Jawa Zachodnia: od zmiany owoców Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Tajlandia: Chiang Mai: ze zmian owocowych Capsicum Sp. 2008, O. Mongkolporn (kultur UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. i in., Fung. Różnorodność 39: 98 (2009)

opis: kolonie na PDA o średnicy 79 mm w 7 d (5,5-6 mm / d). Bladożółto-białe, szare, gęste Grzybnie powietrzne z pomarańczowym acervular conidiomata w centrum; odwłok bladożółty. Nie obserwowano chlamydospor. Conidiomata acervular, konidiofory utworzone na poduszce o okrągłych i średnio brązowych komórkach. Setae nie obserwuje się. Konidiofory hialinowe, rozgałęzione. Komórki konidiogenne hialinowe, cylindryczne do ampulliformalnych, 6,5-16 µm. Konidia hialinowe, aseptyczne, gładkościenne, wrzecionowate do cylindrycznych, oba końce tępo zaokrąglone, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) µm. Appressoria ciemnobrązowy, pojedynczy, okrągły, cały do kreacji Brzeg, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) µm.

uwagi: Izolaty Colletotrichum siamense z różnych krajów wykazały zmienność cech morfologicznych, szybkości wzrostu i morfologii kultur na PDA. Reprezentatywne pomiary konidialne dla izolatów reprezentujących różne podklady w drzewach filogenetycznych (Fig. 2, 3) to: CPC 30233 (Gowa, Indonezja), 12,5–17 × 2,5–5,5 µm; UOM 1132 (Ratchaburi, Tajlandia) 9,5–14,5 × 3,5–5 µm; UOM 1126 / F4-1C (Kanchana Buri, Tajlandia) 12-15 × 5-7 µm; UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10,5–16,5 × 3,5–5 µm 5.5. Te cechy morfologiczne w obrębie podklady były bardzo spójne w każdym kraju. Gatunek został opisany przez Prihastuti et al. (2009); konidia okazu ex-holotypu (ICMP 18578/ BDP-I2) odnotowano jako 7-18.3 × 3-4, 3 µm (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), który obejmuje zakres obserwowany w naszych izolatach. Stwierdzono, że gatunek ten jest zróżnicowany biologicznie i geograficznie i występuje na wielu gospodarzach w kilku regionach tropikalnych i subtropikalnych (Weir et al. 2012).

badany materiał: Indonezja: Gowa, z owoców Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 30233); Jeneponto, from fruit lesion of Capsicum Sp. 7 cze. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 30209). Tajlandia: Ratchaburi, z owoców Capsicum Sp., Jan 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (culture UoM 1132); Kanchanaburi, from fruit lesion of Capsicum Sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultura UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, z owoców Capsicum Sp. Wrz. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (culture UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al., Mykologia 102: 1331 (2010)

opis: kolonie na PDA o średnicy 45 mm w 7 d (6,5 mm/d). Kolonie płaskie, rozłożyste, z umiarkowaną grzybnią powietrzną, na powierzchni OA dym szary. Na powierzchni PDA oliwkowoszare do szarawych, odwrócone oliwkowoszare, liczne pomarańczowe conidiomata rozrzucone po powierzchni. Na powierzchni mej brudnobiały, odwrócony ochrowy. Aseksualny morph na OA. Grzybnia wegetatywna składająca się z hialinowych do bladobrązowych, gładkościennych, septowanych, rozgałęzionych, o średnicy 2-2, 5 µm. Nie obserwowano chlamydospor. Setae rzadkie (widziane tylko dwa), proste, średnio brązowe, drobno verruculose, 2-3-septate, do 120 µm Długości, wierzchołek subobtusely zaokrąglony. Conidiomata acervular, o średnicy 150-250 µm, z pomarańczową masą stożkowatą. Konidiofory subcylindrowe, elastyczne, 1-3-przegubowe, hialinowe, gładkie, rozgałęzione, 15-25 × 3,5–4,5 µm. Komórki konidiogenne subcylindrowe, hialinowe, gładkie, fialidialne z zgrubieniem peryklinalnym, 7-15 × 3,5–4,5 µm. Konidia hialinowe, gładkie, aseptyczne, subcylindrowe, proste, wierzchołkowe rozwarte, zwężające się u podstawy do wystającego ściętego hilum, średnica 1,5-2 µm, wyraźnie guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) µm. Appressoria nie zaobserwowano. Nie zaobserwowano morfologii seksualnej.

badany materiał: Indonezja, Makassar, z owoców Capsicum annuum, 7 czerwca. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (culture CPC 28607).

częstość występowania gatunków Colletotrichum

ogólnie C. truncatum był najbardziej rozpowszechnionym gatunkiem (44%) wyizolowanym z zakażonych owoców chili (Fig. 9) i został łatwo zidentyfikowany przez jego falcate zarodniki i obfite setae w martwiczych zmian. Spośród gatunków z konidiami prostymi, C. scovillei (acutatum complex) był gatunkiem najczęściej występującym w badanych krajach (35%), Z wyjątkiem Sri Lanki, gdzie gatunek ten nie był izolowany. Colletotrichum siamense (kompleks gloeosporioides) był kolejnym najczęściej występującym gatunkiem występującym w Tajlandii, Sri Lance i Indonezji (11%). Pozostałe gatunki reprezentowane były przez mniej niż 10% ogólnej liczby izolatów.

w Indonezji C. scovillei został wyizolowany z zakażonych owoców chili we wszystkich badanych rejonach Południowego Sulawesi, z wyjątkiem Makassar, oraz w miejscu prób polowych w zachodniej Jawie. Colletotrichum siamense było również izolowane z całego regionu, z Gowa, Jeneponto i Makassar. Dwa nowe gatunki, C. makassarense i C. javanense, zostały wyizolowane odpowiednio z Makassar i jawy Zachodniej.

w Tajlandii C. scovillei został wyizolowany głównie z północnych prowincji Chiang Mai i Chiang Rai, ale został również pozyskany z zakażonych owoców chili w miejscu próbnym Uniwersytetu Kasetsart w Nakhon Pathom. W zachodnich prowincjach stwierdzono dużą częstość występowania C. siamense, a z Kanchana Buri pobrano jeden izolat C. endophyticum. Colletotrichum plurivorum został wyizolowany z liści chili z martwiczymi zmianami w Chiang Rai i z martwiczych zmian owoców chili znalezionych w restauracji w Phaya Thai w Bangkoku. Ponadto C. fructicola została zidentyfikowana z owoców zebranych w Chiang Mai.

na Tajwanie zidentyfikowano izolat jako nowy gatunek, C. tainanense, zebrany z zakażonych owoców chili w prowincji Tainan i C. fructicola została zidentyfikowana z owoców w Hsinchu i Nantou na Tajwanie. Colletotrichum plurivorum został również zidentyfikowany z owoców zebranych w Johor w Malezji.

patogenność

wszystkie gatunki Colletotrichum powodowały objawy antraknozy na uszkodzonych owocach, ale występowały znaczne różnice w nasileniu objawów. Na zranionych owocach Izolaty C. scovillei i C. javanense wykazywały najwyższy stopień nasilenia choroby, tworząc duże, martwicze zmiany o średnich rozmiarach zmian 15,6-20,3 mm(Tabela 5). Na owocach nieuszkodzonych wszystkie gatunki były mniej patogenne, przy średnich rozmiarach zmian poniżej 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale i C. plurivorum, powodowały tylko bardzo małe zmiany lub brak widocznych objawów (średnia wielkość zmian < 1 mm) 10 d po zaszczepieniu owoców nieuszkodzonych. Izolaty Colletotrichum javanense i C. scovillei były najbardziej patogenne w owocach nieuszkodzonych i powodowały zmiany o średnich rozmiarach odpowiednio 9,4 i 9,1 mm. Zmiany wywołane przez C. scovillei były znacznie większe niż te wywołane przez wszystkie inne gatunki z wyjątkiem C. jawajka w owocach poranionych i C. endophyticum w owocach nieurodzajnych. Znaczenie parowych testów t jest silnie zależne od liczby izolatów każdego gatunku, z którego pobrano próbki, więc grupy przedstawione w tabeli 5 nie zmieniają się po prostu wraz z wielkością różnicy środków; duża różnica może nie być znacząca, jeśli istnieją małe rozmiary próbek dla obu gatunków, podczas gdy mniejsza różnica może być znacząca. W szczególności porównania dotyczące C. javanense i C. endophyticum są bardzo nieprecyzyjne, ponieważ zbadano tylko jeden izolat każdego gatunku.