formato de saída
na página de resultado, para cada sequência de consulta será apresentado o nome, o comprimento e a pontuação de saída da rede em que se baseia a atribuição cTP/não-cTP. Quanto maior a pontuação, mais certa é a rede que esta sequência contém um peptídeo de trânsito Cloroplástico N-terminal (cTP).Também será apresentado um potencial comprimento cTP, juntamente com a correspondente pontuação do site de decivagem. Por favor, note que a previsão do comprimento do transitpeptídeo é realizada mesmo que a sua presença não seja prevista.O objectivo é fornecer informações máximas em casos limítrofes.
se for escolhida a “saída detalhada”, será também apresentada a Pontuação da rede neural para cada resíduo. Quanto maior esta pontuação, mais certa é a rede de que este resíduo faz parte de um cTP. Um derivado do networkscore também é apresentado. Esta pontuação é utilizada para encontrar a área em que o sítio de dissociação é procurado – nomeadamente entre os 40 resíduos que rodeiam a margem com a pontuação mais elevada de derivados. Finalmente, a pontuação do local de clivagem(pontuação CS) é apresentada para cada resíduo. This score is calculated from ascoring matrix derived from an automatic motif finding algorithm called MEME. A Pontuação da clivagesite é definida de modo que o local de clivagem previsto é directlyN-terminal do maior resíduo de pontuação dentro dos 40 resíduos. Assim, pode existir uma ou várias pontuação(S) CS que acontece(s) ser maior (es) do que o escore do comprimento cTP proposto, mas uma vez que eles estão localizados fora dos 40 dólares em torno da pontuação derivada mais elevada, o comprimento cTP apresentado é ainda o que ChloroP considera como o comprimento de presequência mais provável (ou seja. correspondentesao local de clivagem mais provável).Problemas científicos: problemas técnicos:
