Identificação e caracterização de citrino amarelo veia limpeza de vírus, um suposto novo membro do gênero Mandarivirus
características Moleculares e genômica organização foram determinados para Citrino amarelo veia limpeza de vírus (CYVCV), o putativo viral agente causal do amarelo veia de compensação doença de árvores de limão, relatado no Paquistão, a Índia, e, mais recentemente, na Turquia e na China. Cyvcv Isola Y1 from Adana, Turkey, was used for deep sequencing analysis of the virus-induced small RNA fractions and for mechanical and graph inoculation of herbaceous and citrus indicator plants. Um anti-soro policlonal foi desenvolvido a partir do CYVCV-Y1 purificado de Phaseolus vulgaris e usado em ensaios de Western blot para caracterizar a proteína do revestimento do CYVCV-Y1 e determinar a sua relação serológica com vírus relacionados. Contigs monted from the Illumina sequenced short reads were used to construct the whole genome of Citrus yellow vein clearing virus( CYVCV), consisting in a positive-sense RNA of 7.529 nucleotides and containing six predicted open reading frames. A organização e o tamanho do genoma do CYVCV assemelhavam-se ao dos flexivírus, e a busca por homologias de sequência revelou que o vírus Indian citrus ringspot (ICRSV) (Mandarivirus, Alphaflexiviridae) é o vírus mais intimamente relacionado. No entanto, CYVCV tinha uma identidade de sequência nucleotídica total de ≈74% com ICRSV. Embora os dois vírus fossem semelhantes no que diz respeito à organização do genoma, partículas virais e gama de hospedeiros herbáceos, o CYVCV causou sintomas diferentes em citrus e foi serologicamente distinto do ICRSV. Os pares de iniciadores foram concebidos e utilizados para detectar o vírus por transcrição reversa convencional e quantitativa-reacção em cadeia da polimerase em árvores de campo sintomáticas de remoção de veias amarelas, bem como plantas hospedeiras inoculadas mecanicamente e em enxerto. Coletivamente, estes dados sugerem que o CYVCV é o agente causal da doença de remoção de veias amarelas e representa uma nova espécie no gênero Mandarivirus.
