identifiering, prevalens och patogenicitet hos Colletotrichum-arter som orsakar antracnos av Capsicum annuum i Asien

morfologiska observationer och fylogenetiska data för de raka conidia-arterna identifierade tydligt tre nya arter, två från Indonesien och en från Taiwan. Detaljerade morfologiska beskrivningar ges nedan för alla Colletotrichum-arter som är associerade med chiliantracnos (Tabell 4).

Colletotrichum javanense D. D. De Silva ,P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB826936.

Figur 6 etymologi: uppkallad efter Java, ön i Indonesien där arten samlades.

diagnos: Colletotrichum javanense skiljer sig från C. brisbanense genom att bilda distinkta chlamydosporer och acervular conidiomata på alla testade medier. Däremot producerade C. brisbanense endast Conidiomata på Anthriscus-stammen, men inga basala celler observerades. Dessutom växer C. javanense snabbare än C. brisbanense(C. javanense på OA, MEA och SNA 60, 55 respektive 66 mm diam i 7 d, C. brisbanense på OA respektive SNA 18,5, 20 mm diam i 7 d). Colletotrichum javanense är fylogenetiskt distinkt till C. brisbanense med båda arterna är olika i sekvenserna av chs-1, och mest effektivt med gapdh (7 bp skillnad) och his3 (4 bp skillnad).

Typ: Indonesien: västra Java, Purwakata regency, på frukt av Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah (CBS H-144963 – holotyp; CBS 144963 = UOM 1115 = ewindo 3 – ex-typ kulturer).

beskrivning: sexuell morf observeras inte. Asexuell morph på PDA. Vegetativt mycelium 1-5 occurm diam, hyalin, slätväggig, septat, Grenad hyphae. Chlamydospores globose eller långsträckt, ljusbrun, slät vägg, 5-25 3-8 3kgm. Conidiomata acervular, setae inte observerats. Conidiophores hyalin, septat, Grenad. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 miclm, apex 1-3 miclm diam. Conidia hyaline, aseptat, slät vägg, mestadels fusiform, ena änden rundad, den andra änden akut eller båda ändarna akut (11.5–)13.5–14(− 16) × (2.5–) 4(− 4.5) – ja. Conidia i massa gul till orange färg. Appressoria, enkel eller i lösa grupper, mellanbrun, slätväggig, subglobos eller elliptisk, med hel eller vågig marginal, (6–)8(− 11.5) × (4–)6(− 7.5) – ja.

asexuell morph på SNA. Vegetativt mycelium 1-7 oc. m. diam, hyalin, slätväggig, septat, Grenad hyphae. Chlamydospores globose eller långsträckt, ljusbrun, slät vägg, 4,5-28 2-8 4-8 oc.m. Conidiomata acervular, setae inte observerats. Conidiophores hyaline, septate, Grenad, 20-35 kcal lång. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 5-20 micrm, apex, 1-3 micrm diam. Conidia hyalin, aseptat, slätväggig, cylindrisk med båda ändarna akuta eller ena änden runda och ena änden akut, (13.5–)16.5(− 24) × (2.5–) 3(− 4.5) – ja. Conidia i massa med gul till orange färg.

Kulturegenskaper: kolonier på PDA 48-54 mm diam i 7 d (6,5–7,5 mm/d), Platt med hela marginalen; yta täckt med grått till olivgrönt kort luftmycel, marginal vit till ljusgrå, omvänd mestadels grädde vitaktig, olivgrå till svart i mitten. Gul till orange acervular conidiomata. Kolonier på SNA var 60-66 mm diam i 7 d (8-9, 5 mm/d), Platt med hela marginalen, hyalin till ljusbrun, yta täckt med kort grått luftmycelium, omvänd samma färger. Orange acervular conidiomata i centrum av kulturen. Kolonier på OA var 55-60 mm diam i 7 d (7,8–8,5 mm/d), Platt med hela marginalen; yta täckt med grädde till grått kort luftmycel, marginalvit, omvänd mestadels ljusorange, med bruna pigment. Orange acervular conidiomata. Kolonier på MEA yta ljusgrå kort antenn mycel, omvänd ljusorange.

anmärkningar: Den närmaste matchen i en blastn-sökning med gapdh-sekvensen var GenBank JQ948617, C. sloanei stam IMI 364297 med 98% identitet (4 bp-skillnader), medan de närmaste matcherna med his3-sekvensen med 99% identitet (2 bp-skillnader) var GenBank JQ949279 C. indonesiense stam CBS 127551 och GenBank KJ947248 C. guajavae isolera OBP19.

Colletotrichum makassarense D. D. De Silva ,P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827691.

Figur 7 etymologi: uppkallad efter Makassar, staden i södra Sulawesi, Indonesien, där arten samlades in.

diagnos: Colletotrichum makassarense är fylogenetiskt nära besläktad med C. tropicale. Sekvensdata från ITS kunde inte separera de två arterna, men de kan särskiljas av alla andra testade gener och mest effektivt med ApMat (22 bp-skillnader) och gs (18 bp-skillnader) sekvensdata.

Typ: Indonesien: Makassar, från fruktskada av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (CBS H-143664 – holotyp; CBS 143664 = CPC 28612 – ex-typ kulturer).

beskrivning: Sexuell morph inte observerats. Asexuell morph på OA. Vegetativt mycelium bestående av hyalin, slätväggig, septat, Grenad hyphae, 2-3 kcal diam. Chlamydospores inte observerats. Setae närvarande, medium brun,40-55 2-5 3-5 oc, 2-3-septat, avsmalnande till akuta apices. Conidiomata acervular, 100-200 oc-m diam, med orange konidiala massor. Conidiophores subcylindrisk, flexuous, 1-4-septat, hyalin, slät, Grenad, 15-45 2-4 3-4 MGM. Konidiogena celler subcylindriska, hyalina, släta, fialidiska med periklinal förtjockning, 7-25 3-4 oc.m. Conidia hyalin, slät, aseptat, subcylindrisk, rak, apex trubbig, avsmalnande vid basen för att utskjutande trunkera hilum, 1 occylm diam, framträdande guttulate, (11–)13-15(− 17) × (4–)4.5–5 -Ja. Appressoria ensam, medelbrun, slätväggig, subglobos, ellipsoidal till obovat, hela marginalen, (6–)8.0(− 10.5) × (4–)3.5(− 8.5) – ja.

odlingsegenskaper: kolonier på PDA 45 mm diam efter 7 d (6,5 mm/d), kolonier platta, med måttligt luftmycelium, på OA-ytan rökgrå. På PDA-ytan rökgrå, omvänd olivgrå. På MEA yta smutsig vit, omvänd ockra.

anmärkningar: Den närmaste match i en blastn sökning med ApMat sekvensen var GenBank KU923732, C. queenslandicum stam AUS22 med en 98% identitet (16 bp skillnader), medan den närmaste match med gs sekvensen med 99% identitet (7 bp skillnader) var GenBank KJ947286 C. siamense isolera OBP24. De bästa matcherna med gapdh-sekvensen var GenBank KX578784 C. siamense (99% identitet, 3 bp-skillnader) och GenBank KU221347 C. queenslandicum (99%, identitet, 3 bp-skillnader).

Colletotrichum tainanense D. D. De Silva, P. W. Crous & P. W. J. Taylor, sp. nov. MycoBank MB827692.

figur 8 etymologi: uppkallad efter Tainan, staden i Taiwan där arten samlades in.

diagnos: Colletotrichum tainanense skiljer sig från sin närmaste fylogenetiska granne C. salsolae i odlingsegenskaperna på PDA, gles luftmycelium och blekt musgrå ytmycelium, medan C. salsolae producerar ett lager av acervuli-liknande strukturer med djupa orange bruna konidiala massor och många setae. De två arterna är separerbara med alla testade gener förutom dess och mest effektivt med gapdh (7 bp skillnad), tub2 (6 bp skillnad) och act (5 bp skillnad) sekvenser. Det finns bara en bp-skillnad i CHS-1-sekvensen mellan de två arterna.

Typ: Taiwan: Tainan: på frukt av Capsicum annuum, Aug. 2014, Z. M. Sheu (CBS H – 143666 – holotyp; CBS 143666 = CPC 30245 = UOM 1120 = Coll 1298-ex-typ kulturer).

beskrivning: sexuell morf observeras inte. Asexuell morph på PDA. Vegetativt mycelium grenat, hyalint, slätväggigt, septat, hyphae 2-3 kcal diam, melaniserat med tiden. En enda conidioma finns på en PDA platta, steril på SNA, MEA, och OA. Chlamydosporer och setae inte observerats. Conidiophores subcylindrisk, flexuous, 1-2-septat, hyalin, slät till ljusbrun, Grenad. Konidiogena celler subcylindriska, hyalina, släta, fialidiska med periklinal förtjockning. Conidia hyalin, slät, aseptat, subcylindrisk att subclavate, rak eller svagt krökt, apex trubbig, avsmalnande vid basen för att utskjutande trunkera hilum, 1,5–2 occurm diam, framträdande guttulate, (16–)17-18(− 22) × (4.5–)5 -Ja. Appressoria singel eller i lösa grupper, ofta smalcylindrisk, medium till mörkbrun, ofta avsmalnande mot spetsen, kanten hela eller böljande ibland oregelbundet flikiga (6.5–)10.5(− 14.5) × (6–)5(− 9.5) – ja.

odlingsegenskaper: kolonier på PDA 45 mm diam efter 7 d (6,5 mm/d), kolonier platta, med måttligt luftmycelium. På OA yta blek mus-grå. På PDA yta blek mus-grå, omvänd mus-grå. På MEA yta blek mus-grå, omvänd olivgrön grå.

anmärkningar: Den närmaste matchen i en blastn-sökning med gapdh-sekvensen med 99% identitet (2 bp-skillnad) var GenBank KC790761 Colletotrichum sp. stam MTCC 9664 medan den närmaste matchen med act-sekvensen med 99% identitet (2 bp skillnad) var GenBank KY995522 C. siamense stam LJDY1–2. Den närmaste matchningen med tub2-sekvensen med 99% identitet (7 bp-skillnad) var GenBank MF143931 C. siamense stam 31-B-1.

Colletotrichum endophyticum Manamgoda et al., Fung. Mångfald 61: 112 (2013); som ‘endophytica’.

beskrivning: kolonier på PDA 42 mm diam efter 7 d (5,5 mm/d), blekorange till vitt flygmycelium; omvänd blekt vitt till orange och svart i mitten och många orange conidiomata utspridda över ytan. Chlamydospores inte observerats. Conidiomata närvarande, conidiophores bildade direkt på hyphae. Setae närvarande, måttligt brun,47-95 2-6 3-6 m, 3-4-septat, avsmalnande akuta apices. Conidiophores hyalin, slätväggig och oförgrenad. Konidiogena celler hyalin, slätväggiga, aseptat, subcylindriska,12-21 3-4 oc. m. Conidia hyalin, slät vägg, aseptat, rak, cylindrisk med två ändar trubbiga, (10.5–)12.5–13(− 14.5) × (3–)4.5–5(− 6.5) – ja. Appressoria singel eller i lösa grupper, brun, lätt flikad, (10.5–)12(− 15) × (3–)4.5(− 10) – Ja.

anmärkningar: Colletotrichum endophyticum beskrevs först som en gräsendofyt av Pennisetum purpureum från norra Thailand (Manamgoda et al. 2013). Senare rapporterades det från flera andra värdarter inklusive Capsicum i Kina (Diao et al. 2017). Längden av conidia av isolatet från Thailand (UOM 1137) var något kortare än den för ex-typen (LC0324) av C. endophyticum (conidia 13-19(− 21) × (3.5–)4.5–5.5 (t.ex.

material undersökt: Thailand: Kanchanaburi: från fruktskada av Capsicum annuum, 2010, PWJ Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1137 = F5-2D).

Colletotrichum fructicola Prihast. et al., Fung. Mångfald 39: 158 (2009).

beskrivning: Kolonier på PDA 65 mm diam efter 7 d (8,5–11 mm/d), Platt med hela kanten, luftmycelium tätt, bomulligt, ljusgråt till vitt luftmycelium och många svarta stroma spridda över ytan, grå i mitten, vit vid marginalen; omvänd grågrön. Chlamydospores inte observerats. Conidiomata acervular, Setae observerades, brun, slätväggig, 1-2-septat, 60 oc-m lång, avsmalnande akuta apices. Conidiophores hyalin, septat, Grenad. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 oc.m. Conidia hyalin, aseptat, slätväggig, cylindrisk, båda ändarna trubbiga, (10.5–)12.5–13(− 18.5) × (3–) 4–5.5(− 6.5). Appressoria inte observerats.

anmärkningar: den sexuella morfen hos dessa isolat observerades inte i kulturen. Conidial längd isolera CPC-28644 var något längre än ex-typ (ICMP 18581 = BPD-I16) av C. fructicola (conidia 9.7–14 × 3-4.3 µm, x = 11.53 ± 1.03 × 3.55 ± 0.32 µm. Prihastuti et al. 2009).

material undersökt: Thailand: Chiang Mai: från fruktskada av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kulturer CPC 28644 och CPC 28645). Taiwan: Cyonglin, Hsinchu, från fruktskada av mogen röd frukt av Capsicum sp. (paprika), 22 Apr. 2015, Z. M. Sheu (kultur UOM 1139 = coll 1318); Nantou, Renai, från fruktskada av grön frukt av Capsicum sp. (paprika), 4 Sep. 2008, Z. M. Sheu & C. Wang (kultur UOM 1138 = coll-853).

Colletotrichum karsti du L. Yang et al. Cryptogamie, Mycologie 32: 241 (2011); som ‘karstii’.

beskrivning: kolonier på PDA 65 mm diam efter 7 d (6,5–10.5 mm/d), Platt med hela kanten, orange till vitt luftmycelium och många orange konidiala massor utspridda över ytan, vit vid marginalen; omvänd gul till orange. Chlamydospores inte observerats. Conidiomata acervular, setae observerades, brun, slätväggig, 2-4-septat, 60 oc-m lång, bas nedsänkt, avsmalnande mot topp, spets mestadels akut. Conidiophores hyalin, septat, grenade, (10.5–)12-38(− 47.5) × (3–)4-5.5(− 6.5) – ja. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-15, 5 occurm. Conidia hyalin, aseptat, slätväggig, kort, cylindrisk, båda ändarna trubbiga eller ena änden något akut eller trunkera vid basen, (11.5–)12.5–13(− 15.5) × (3–)4-5(− 6.5) – ja. Appressoria singel eller i lösa grupper, brun, subglobose, cirkulär kontur, 6-12, 5 msk 3,5–8 msk.

anmärkningar: de fyra isolaten som identifierades från Indonesien i boninense-komplexet producerade distinkta korta konidier jämfört med ex–epitypkulturen av C. karsti (14,5-17 2-6, 5 5 oc; Yang et al. 2011). Emellertid hög variation av conidia storlek mellan olika stammar av C. karsti rapporterades av Damm et al. (2012a, 2012b) där conidia mätningar av CBS 129833 var (11.5–)12.5–14(− 14.5) × (5–)5.5–6(− 6.5) µm, medel ± SD = 13.1 ± 0.7 × 5.8 ± 0.4 µm, och CBS 111998 hade en conidium längd upp till 18,5 µm, L/W-kvoten = 2.8. Dessa isolat bildade inte en sexuell morf i kulturen. Även om dessa fyra isolat bildade en fullt stödd (100% BS/1 PP) subclade inom C. karsti, alla de enskilda genträden (data visas inte) gav inte signifikant stöd för att motivera att införa en kryptisk art för dessa isolat.

material undersökt: Indonesien: Jeneponto, från fruktskador av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28553, CPC 28554); från fruktskada av mogna röda frukter och peduncle lesioner av Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28601, CPC 28602).

Colletotrichum plurivorum Damm et al., Stud. Mycol. 92: 31 (2019).

beskrivning: kolonier på PDA 63 mm diam efter 7 d (8 mm / d), grå till mörkbrun luftmycelium; omvänd grå till ljusbrun med gul-orange i mitten med riklig acervular conidiomata som sipprar blekorange conidialmassor i mitten, Chlamydosporer observeras inte. Conidiomata närvarande (nära inokulationspunkten) bildades conidiophores direkt på hyphae. Sclerotia närvarande. Setae närvarande, medium brun, 94-125 2-6 4-6 m, 1-4-septat, avsmalnande mot akuta apices, ofta med en förträngning vid toppen. Conidiophores hyaline till blekbrun, slätväggig, septat och Grenad. Konidiogena celler hyalin, slätväggiga, aseptat, subcylindrisk, rakt till försiktigt krökt, 26-48 2-4 oc, phialidic, periclinal förtjockning iögonfallande. Conidia hyalin, slät vägg, aseptat, rak, cylindrisk med två ändar trubbiga eller ena änden något akut, (13.5–)14-16(− 18.5) × (4–)5(− 6.5) – ja. Appressoria enkel eller i lösa grupper, medium brun, oregelbunden form, crenate eller flikiga kontur, (10.5–)12(− 23) × (3.5–)5.5(− 11.5) – ja. Sexuell morph på PDA. Ascomata perithecia, bildad efter 2 veckor., ensam, halv nedsänkt eller nedsänkt i agarmediet, nonstromatisk, subsfärisk till ovoid, ostiolate, glabrous, mediumbrun, 96-130 160-200 160-200 xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx X Peridium 10-12, 5 occurm tjock, bestående av blek till medium brun tillplattad vinkel celler 3,5-10 occurm diam. Ascogen hyphae hyaline, slät vägg, känslig, sällan synlig. Interascal vävnad observeras inte. Asci unitunicate, 8-spored, cylindrisk, avsmalnande till apex och bas, släta väggar, 51-65 2,5–13 2,m, basen trunkera. Ascospores biseriately arrangerade, aseptat, hyalin, släta väggar, fusiform, något krökt, bas rundad, apex akut eller rundad, (13.5–)15-18(− 22) × 5-6(− 6.5) 8580 >

anmärkningar: Den konidiala längden på de undersökta isolaten (CPC 28638, CPC 28639) var variabel och föll inom intervallet för ex-typisolatet (CBS 125474) av C. plurivorum (15-17 GHz 5,5 IE; Damm et al. 2019).

material undersökt: Thailand: Chiang Rai, från bladlesioner av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor (kulturer CPC 28638 och CPC 28639); Bangkok, restaurang i Phaya Thai-området, infekterad vävnad av Capsicum sp. Jun. 2015, P. W. J. Taylor (kultur UOM 1004).

Colletotrichum scovillei Damm et al., Stud. Mycol. 73: 100 (2012).

Decription: kolonier på PDA 20-38 mm diam efter 7 d (5-6, 2 mm/d), Platt med hela marginalen; yta täckt med kort ljusrosa till orange luftmycel, blir grå med tiden, marginal vitaktig till blekrosa, omvänd rosig buff, olivgrå till brungrå i mitten; omvänd orange till lax, mörk i mitten. Chlamydospores inte observerats. Conidiomata acervular, setae inte observerad, Conidiophores hyalin, septat, Grenad. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk eller ampulliform, 7-17, 5 miclm, apex 1-3 miclm diam. Conidia hyaline, aseptat, slätväggig, mest fusiform, en ände rundad, en ände akut, (5.5–)9.5–10(− 12) × (2.5–)3(− 4). Conidia i massa med lax till orange färg. Appressoria singel eller i lösa grupper, medelbrun, äggformad, hel till krenat marginal, (4–)5.5(− 12.5) × (3.5–)4.5–5(− 6.5) – ja.

anmärkningar: majoriteten av isolaten identifierade som C. scovillei hade liknande sporform och sporstorlekar, jämfört med typprovet (10.5–)12.5–15(− 16.5) × (3–)3.5–4(− 4.5) det är inte så. (2012a, 2012b). Vissa isolat hade dock varierande kolonifärg, olika kolonitillväxthastigheter och små skillnader i spormätningar.

material undersökt: Indonesien: Gowa, från fruktskador av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, PWJ Taylor & A. Nasruddin (kulturer CPC 28577 och CPC 28579); västra Java: från fruktskada av Capsicum annuum, Dec. 2014, F. Fitriyah, UOM 1146 / EWINDO 10. Thailand: Chiang Mai: från fruktskador av Capsicum sp. 2008, O. Mongkolporn (kulturer UOM 1101/313, UOM 1111).

Colletotrichum siamense Prihast. et al., Fung. Mångfald 39: 98 (2009)

beskrivning: kolonier på PDA 79 mm diam i 7 d (5,5–6 mm/d). Svagt gulvitt, grått, tätt bomullsmycelium med orange acervular conidiomata i mitten; omvänd blekgul. Chlamydospores inte observerats. Conidiomata acervular, conidiophores bildade på en kudde av runda och medelstora bruna celler. Setae inte observerats. Conidiophores hyaline, Grenad. Konidiogena celler hyalin, cylindrisk till ampulliform, 6,5-16 oc.m. Conidia hyalin, aseptat, slätväggig, fusiform till cylindrisk, båda ändarna helt rundade, (13–)14(− 15.5) × (3–)4(− 5.5) – ja. Appressoria mörkbrun, ensam, cirkulär, hela till crenate marginal, (4.5–)7.5(− 10) × (3.5–)3(− 5.5) – ja.

anmärkningar: Colletotrichum siamense isolat från olika länder visade variation av morfologiska tecken, i tillväxthastigheter och kulturmorfologi på PDA. Representativa konidiala mätningar för isolat som representerar olika underklasser i fylogenetiska träd (fikon. 2, 3) är: CPC-30233 (Gowa, Indonesien), 12.5–17 × 2.5–5.5 µm, UOM 1132 (Ratchaburi, Thailand) 9.5–14.5 × 3.5–5 µm. UOM 1126/ F4-1C (Kanchana Buri, Thailand) 12-15 × 5-7 µm, UOM 1116 (Kandy, Sri Lanka) 10.5–16.5 × 3.5–5.5. Dessa morfologiska tecken inom en underklass var mycket konsekventa inom varje land. Arten beskrevs av Prihastuti et al. (2009); konidier av ex-holotyp-provet (ICMP 18578/ BDP-I2) rapporterades som 7-18.3 msk 3-4, 3 msk (x = 10.18 ± 1.74 × 3.46 ± 0.36), som omfattar det intervall som observerats i våra isolat. Denna art rapporterades vara biologiskt och geografiskt olika och finns på många värdar i flera tropiska och subtropiska regioner (Weir et al. 2012).

material undersökt: Indonesien: Gowa, från fruktskada av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30233); Jeneponto, från fruktskada av Capsicum sp. 7 juni. 2015, P. W. J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 30209). Thailand: Ratchaburi, från fruktskada av Capsicum sp., Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1132); Kanchanaburi, från fruktskada av Capsicum sp. Jan. 2010, P. W. J. Taylor & O. Mongkolporn (kultur UOM 1126 = F4-1C). Sri Lanka: Kandy, från fruktskada av Capsicum sp. Sep. 2013, D. D. De Silva & N. Ranathunge (kultur UOM 1116).

Colletotrichum tropicale E. I. Rojas et al. Mykologi 102: 1331 (2010)

beskrivning: kolonier på PDA 45 mm diam i 7 d (6,5 mm/d). Kolonier platt, spridning, med måttlig antenn mycel, på OA yta rök grå. På PDA-ytan olivgrön grå för att röka grå, omvänd olivgrön grå, många orange conidiomata utspridda över ytan. På MEA yta smutsig vit, omvänd ockra. Asexuell morph på OA. Vegetativt mycel bestående av hyalin till ljusbrun, slätväggig, septat, Grenad, 2-2, 5 occurm diam hyphae. Chlamydospores inte observerats. Setae sällsynta (endast två sett), rak, medium brun, fint verruculose, 2-3-septat, till 120 oc-m lång, apex subobtusely rundad. Conidiomata acervular, 150-250 coridm diam, med orange konidial massa. Conidiophores subcylindrisk, flexuous, 1-3–septat, hyalin, slät, Grenad, 15-25 3,5-4,5 3,5 oc.m. Conidiogenous celler subcylindrical, hyalin, smidig, phialidic med periclinal förtjockning, 7-15 × 3,5 till 4,5 µm. Conidia hyalin, slät, aseptat, subcylindrisk, rak, apex trubbig, avsmalnande vid basen för att utskjutande trunkera hilum, 1,5–2 occurm diam, framträdande guttulate, (13–)14-16(− 17) × (3.5–)4-5(− 6) – Ja. Appressoria inte observerats. Sexuell morph inte observerats.

material undersökt: Indonesien, Makassar, från fruktskada av Capsicum annuum, 7 Jun. 2015, P. W.J. Taylor & A. Nasruddin (kultur CPC 28607).

prevalens av samplade Colletotrichum-arter

sammantaget var C. truncatum den vanligaste arten (44%) isolerad från infekterad chilifrukt (Fig. 9) och identifierades lätt av dess falkatsporer och rikliga setae i de nekrotiska lesionerna. Av arterna med raka konidier var C. scovillei (acutatum complex) den vanligaste arten i de undersökta länderna (35%), förutom Sri Lanka där denna art inte isolerades. Colletotrichum siamense (gloeosporioides complex) var den näst vanligaste arten som inträffade i Thailand, Sri Lanka och Indonesien (11%). De återstående arterna representerades av färre än 10% av det totala antalet isolat.

i Indonesien, C. scovillei isolerades från infekterad chilifrukt i alla undersökta regenser i södra Sulawesi, utom i Makassar, och på fältförsöksplatsen i västra Java. Colletotrichum siamense isolerades också från hela regionen, från Gowa, Jeneponto och Makassar. De två nya arterna, C. makassarense och C. javanense isolerades från Makassar respektive västra Java.

i Thailand isolerades C. scovillei mestadels från de norra provinserna Chiang Mai och Chiang Rai, men erhölls också från infekterad chilifrukt på en provplats vid Kasetsart University i Nakhon Pathom. De västra provinserna hade en hög förekomst av C. siamense och ett isolat av C. endophyticum samlades in från Kanchana Buri. Colletotrichum plurivorum isolerades från chiliblad med nekrotiska lesioner i Chiang Rai och från nekrotiska lesioner av chilifrukt som finns i en restaurang i Phaya Thai-området i Bangkok. Dessutom identifierades C. fructicola från frukt som samlats in från Chiang Mai.

i Taiwan identifierades ett isolat som en ny art, C. tainanense, samlad från infekterad chilifrukt i tainanprovinsen och C. fructicola identifierades från frukt i Hsinchu och Nantou, Taiwan. Colletotrichum plurivorum identifierades också från en frukt samlad i Johor, Malaysia.

patogenicitet

alla Colletotrichum-arter orsakade antracnosymtom på sårad frukt, men det fanns signifikanta skillnader i svårighetsgraden av symtomen. På sårad frukt visade isolat av C. scovillei och C. javanense den högsta sjukdomens svårighetsgrad och producerade stora, nekrotiska lesioner med genomsnittliga lesionsstorlekar 15,6–20,3 mm (Tabell 5). På icke-sårade frukter var alla arter mindre patogena, med genomsnittliga lesionsstorlekar mindre än 10 mm. Colletotrichum makassarense, C. tropicale och C. plurivorum, producerade endast mycket små lesioner eller inga synliga symtom (Genomsnittlig lesionsstorlek < 1 mm) 10 d efter ympning av icke-sårade frukter. Colletotrichum javanense och C. scovillei isolat var de mest patogena I icke-sårade frukter och producerade lesioner med medelstorlekar på 9,4 respektive 9,1 mm. Lesioner orsakade av C. scovillei var signifikant större än de som orsakades av alla andra arter utom C. javanense i sårad frukt och C. endophyticum i ogrundad frukt. Betydelsen av de parvisa t-testerna är starkt beroende av antalet isolat för varje provtagd art, så de grupperingar som visas i Tabell 5 ändras inte bara med storleken på skillnaden mellan medlen; en stor skillnad kanske inte är signifikant om det finns små provstorlekar för båda arterna medan en mindre skillnad kan vara signifikant. I synnerhet är jämförelser som involverar C. javanense och C. endophyticum mycket oprecisa eftersom endast ett isolat av varje art testades.